Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R8BBZ0

Protein Details
Accession R8BBZ0    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-41GTDKRVKKAAFEPKRKPFEEABasic
120-148ADELHRTKKLWERLRRKSHVPKEERQKLVBasic
636-659TEELRGNLRKNKKALKKAASEETAHydrophilic
671-692ADATKKTSGKGKKSAGKQERAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-16KRKASA
19-36HNGTDKRVKKAAFEPKRK
123-140LHRTKKLWERLRRKSHVP
644-655RKNKKALKKAAS
662-665KAKR
674-687TKKTSGKGKKSAGK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012959  CPL_dom  
IPR033133  PUM-HD  
IPR040059  PUM3  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG tmn:UCRPA7_7626  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08144  CPL  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50303  PUM_HD  
Amino Acid Sequences MATKGAKVGDKRKASAVHHNGTDKRVKKAAFEPKRKPFEEADGSDEANDFESFSDEEDGGAKLNDNKAGQKDYKKNDKFEANGKSQADNGKTFERGQNSRESHIKQKQLAQERKAAKPLADELHRTKKLWERLRRKSHVPKEERQKLVDELFEIITGRIKDFVLKHDAVRAVQTAIKYSTPIQRKQIAKELSGTYAQLAESRYAKFLIGKLLVQNDDEIRDLIVPEFYGKVRKLINHPEASWILDDIYRGVATKEQKAKLLREWYGPEFALFKDSGDGEVTGELSKILEAEPGKRGPIMKYLIDMVNQLVQKKLTGFTILHDAMLQYYLNVKPETEEHKEFLEMIKEDEGGDLLKNMAFTKSGARLSCLLLAYGSAKDRKQILKTYKDTFQLMCGDPYGHVVILTAYDVIDDTVLSSKAIFPEILGKNDQKEVENVIFCANDPFARTTIRYLFEGLSKTLFPPNLSSDLEILKEVHEIRKTTSKKDAETRRKELVTALSPQLLAAIAASPNELVSSSFGCQLVTDVLLDAVGDKTAALDAIAATAAGNPQPEDSKETYPPPMPHISQTPHGGRMFKTLIQGGRFDRESGQVKPVDPPLNFANILYPVIKDHIVAWATGSSSFVALALLESKSFSETEELRGNLRKNKKALKKAASEETAEQKAKREATEQADATKKTSGKGKKSAGKQERAVGNQGSKLLLEKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.63
3 0.64
4 0.61
5 0.61
6 0.66
7 0.62
8 0.62
9 0.66
10 0.58
11 0.56
12 0.55
13 0.5
14 0.49
15 0.55
16 0.6
17 0.62
18 0.68
19 0.72
20 0.76
21 0.84
22 0.8
23 0.75
24 0.68
25 0.67
26 0.66
27 0.58
28 0.53
29 0.46
30 0.45
31 0.4
32 0.36
33 0.27
34 0.2
35 0.16
36 0.11
37 0.09
38 0.11
39 0.1
40 0.11
41 0.13
42 0.11
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.13
50 0.16
51 0.2
52 0.21
53 0.26
54 0.29
55 0.36
56 0.41
57 0.47
58 0.54
59 0.59
60 0.68
61 0.7
62 0.71
63 0.71
64 0.72
65 0.67
66 0.66
67 0.65
68 0.59
69 0.6
70 0.57
71 0.5
72 0.46
73 0.48
74 0.43
75 0.37
76 0.36
77 0.32
78 0.33
79 0.35
80 0.36
81 0.38
82 0.37
83 0.37
84 0.44
85 0.43
86 0.46
87 0.5
88 0.49
89 0.52
90 0.56
91 0.61
92 0.56
93 0.6
94 0.64
95 0.67
96 0.71
97 0.65
98 0.66
99 0.65
100 0.65
101 0.64
102 0.57
103 0.47
104 0.42
105 0.43
106 0.41
107 0.38
108 0.39
109 0.4
110 0.49
111 0.51
112 0.48
113 0.48
114 0.49
115 0.56
116 0.6
117 0.64
118 0.64
119 0.72
120 0.82
121 0.83
122 0.85
123 0.86
124 0.86
125 0.86
126 0.83
127 0.82
128 0.82
129 0.86
130 0.8
131 0.71
132 0.64
133 0.57
134 0.52
135 0.44
136 0.33
137 0.26
138 0.22
139 0.2
140 0.17
141 0.13
142 0.14
143 0.13
144 0.13
145 0.12
146 0.12
147 0.16
148 0.16
149 0.21
150 0.24
151 0.25
152 0.25
153 0.29
154 0.31
155 0.27
156 0.27
157 0.24
158 0.18
159 0.19
160 0.19
161 0.16
162 0.16
163 0.16
164 0.16
165 0.18
166 0.24
167 0.29
168 0.34
169 0.37
170 0.43
171 0.47
172 0.5
173 0.56
174 0.51
175 0.46
176 0.46
177 0.42
178 0.37
179 0.33
180 0.29
181 0.2
182 0.17
183 0.16
184 0.13
185 0.12
186 0.12
187 0.13
188 0.14
189 0.15
190 0.14
191 0.15
192 0.15
193 0.15
194 0.18
195 0.17
196 0.17
197 0.18
198 0.21
199 0.21
200 0.19
201 0.19
202 0.15
203 0.15
204 0.14
205 0.12
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.06
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.13
216 0.13
217 0.16
218 0.18
219 0.22
220 0.27
221 0.36
222 0.43
223 0.42
224 0.42
225 0.43
226 0.41
227 0.39
228 0.32
229 0.23
230 0.16
231 0.13
232 0.12
233 0.08
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.1
239 0.12
240 0.2
241 0.26
242 0.27
243 0.32
244 0.36
245 0.38
246 0.4
247 0.45
248 0.4
249 0.37
250 0.4
251 0.37
252 0.36
253 0.33
254 0.27
255 0.21
256 0.19
257 0.17
258 0.13
259 0.11
260 0.09
261 0.09
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.07
276 0.07
277 0.09
278 0.13
279 0.13
280 0.14
281 0.15
282 0.16
283 0.14
284 0.19
285 0.2
286 0.17
287 0.18
288 0.2
289 0.19
290 0.19
291 0.18
292 0.12
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.12
300 0.12
301 0.09
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.16
306 0.15
307 0.14
308 0.14
309 0.13
310 0.11
311 0.11
312 0.1
313 0.04
314 0.07
315 0.07
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.12
321 0.18
322 0.21
323 0.22
324 0.21
325 0.22
326 0.22
327 0.22
328 0.19
329 0.17
330 0.12
331 0.11
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.09
336 0.09
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.08
348 0.12
349 0.14
350 0.14
351 0.15
352 0.16
353 0.17
354 0.19
355 0.16
356 0.13
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.09
361 0.1
362 0.1
363 0.1
364 0.12
365 0.17
366 0.2
367 0.22
368 0.29
369 0.35
370 0.41
371 0.46
372 0.48
373 0.48
374 0.47
375 0.46
376 0.38
377 0.33
378 0.28
379 0.24
380 0.21
381 0.17
382 0.14
383 0.13
384 0.14
385 0.12
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.04
393 0.03
394 0.03
395 0.04
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.07
406 0.08
407 0.07
408 0.06
409 0.15
410 0.17
411 0.18
412 0.2
413 0.21
414 0.21
415 0.24
416 0.25
417 0.17
418 0.16
419 0.18
420 0.18
421 0.18
422 0.17
423 0.15
424 0.14
425 0.13
426 0.14
427 0.1
428 0.08
429 0.09
430 0.1
431 0.11
432 0.12
433 0.13
434 0.15
435 0.18
436 0.2
437 0.19
438 0.19
439 0.19
440 0.2
441 0.21
442 0.18
443 0.16
444 0.14
445 0.15
446 0.16
447 0.16
448 0.14
449 0.15
450 0.17
451 0.2
452 0.2
453 0.2
454 0.18
455 0.18
456 0.18
457 0.16
458 0.13
459 0.1
460 0.11
461 0.12
462 0.15
463 0.17
464 0.17
465 0.2
466 0.29
467 0.31
468 0.33
469 0.41
470 0.41
471 0.42
472 0.51
473 0.59
474 0.6
475 0.67
476 0.69
477 0.66
478 0.63
479 0.59
480 0.52
481 0.47
482 0.39
483 0.35
484 0.3
485 0.24
486 0.23
487 0.23
488 0.2
489 0.14
490 0.1
491 0.06
492 0.06
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.06
502 0.08
503 0.09
504 0.11
505 0.11
506 0.11
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.09
511 0.08
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.05
517 0.05
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.04
522 0.04
523 0.04
524 0.03
525 0.04
526 0.03
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.05
533 0.06
534 0.06
535 0.06
536 0.07
537 0.1
538 0.11
539 0.16
540 0.2
541 0.23
542 0.26
543 0.29
544 0.33
545 0.36
546 0.37
547 0.36
548 0.38
549 0.35
550 0.36
551 0.39
552 0.38
553 0.37
554 0.43
555 0.4
556 0.4
557 0.41
558 0.4
559 0.34
560 0.37
561 0.35
562 0.31
563 0.31
564 0.29
565 0.31
566 0.3
567 0.33
568 0.29
569 0.32
570 0.31
571 0.29
572 0.26
573 0.29
574 0.32
575 0.3
576 0.34
577 0.31
578 0.31
579 0.34
580 0.39
581 0.39
582 0.34
583 0.36
584 0.32
585 0.34
586 0.33
587 0.29
588 0.25
589 0.2
590 0.22
591 0.18
592 0.16
593 0.13
594 0.15
595 0.15
596 0.13
597 0.12
598 0.16
599 0.16
600 0.15
601 0.16
602 0.14
603 0.15
604 0.15
605 0.15
606 0.09
607 0.09
608 0.09
609 0.08
610 0.06
611 0.06
612 0.06
613 0.08
614 0.07
615 0.07
616 0.08
617 0.09
618 0.1
619 0.1
620 0.1
621 0.13
622 0.14
623 0.2
624 0.25
625 0.25
626 0.28
627 0.34
628 0.39
629 0.43
630 0.51
631 0.53
632 0.56
633 0.66
634 0.72
635 0.77
636 0.82
637 0.82
638 0.81
639 0.81
640 0.82
641 0.75
642 0.68
643 0.62
644 0.59
645 0.57
646 0.51
647 0.45
648 0.41
649 0.44
650 0.43
651 0.4
652 0.36
653 0.36
654 0.4
655 0.47
656 0.43
657 0.44
658 0.48
659 0.46
660 0.45
661 0.44
662 0.38
663 0.34
664 0.41
665 0.44
666 0.46
667 0.55
668 0.63
669 0.66
670 0.74
671 0.82
672 0.83
673 0.82
674 0.78
675 0.77
676 0.75
677 0.7
678 0.67
679 0.61
680 0.55
681 0.49
682 0.45
683 0.37
684 0.3