Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9PCP0

Protein Details
Accession R9PCP0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
140-166KTEGAEAKPKPKKPKKKPADASNNDAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
127-157KPSAPKAKKPAKPKTEGAEAKPKPKKPKKKP
183-194APKAKKASKKKA
217-243SKDAKPKSKKAGASRAGAKAGGKARSS
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 10, nucl 8.5, mito 3, pero 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MSSSQLPDDGSLPNMAGEGVIPASFFDMPIEYGAGDANMNMDFGSMPGFPAPDATMTDASDFDAMTAQIAATMPSLNDASSFSMPGPSYVAQAPQPYPSGVPIKMEIDNPGSFAASPSATSESSMHKPSAPKAKKPAKPKTEGAEAKPKPKKPKKKPADASNNDAVASSSTEQSSKDAAASPAPKAKKASKKKAADPAQTSSATASPAPFATPASPSKDAKPKSKKAGASRAGAKAGGKARSSTARSASRMSSIGRDGATPGASRVSSQRPHDEGNDDDEPAPNPQAAAPEEDEEGEDEEADPDDGVEELGRDHFSTQEAIYAAQQRNMGLLSMVMDEDQLDRHMASRRGALNKTSVRKLVNHVLSQSVSQHVAMVVSGVAKIFVGEIIEKAREIQSVRGESGPLRPNHLREAHRQYYLKRERPGHYPPGTNAGLPGLGKRRRLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.08
4 0.07
5 0.07
6 0.06
7 0.06
8 0.06
9 0.06
10 0.09
11 0.09
12 0.09
13 0.08
14 0.09
15 0.1
16 0.11
17 0.11
18 0.08
19 0.09
20 0.09
21 0.08
22 0.07
23 0.06
24 0.07
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.06
29 0.05
30 0.06
31 0.08
32 0.07
33 0.07
34 0.08
35 0.09
36 0.08
37 0.1
38 0.11
39 0.1
40 0.11
41 0.14
42 0.15
43 0.15
44 0.16
45 0.15
46 0.15
47 0.14
48 0.12
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.07
54 0.06
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.06
59 0.07
60 0.06
61 0.08
62 0.09
63 0.07
64 0.08
65 0.09
66 0.12
67 0.12
68 0.13
69 0.12
70 0.15
71 0.15
72 0.15
73 0.17
74 0.14
75 0.16
76 0.16
77 0.18
78 0.16
79 0.2
80 0.2
81 0.19
82 0.2
83 0.19
84 0.18
85 0.21
86 0.23
87 0.2
88 0.21
89 0.2
90 0.22
91 0.23
92 0.23
93 0.22
94 0.21
95 0.21
96 0.2
97 0.18
98 0.15
99 0.13
100 0.13
101 0.12
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.12
106 0.11
107 0.13
108 0.14
109 0.17
110 0.21
111 0.23
112 0.22
113 0.22
114 0.25
115 0.3
116 0.39
117 0.4
118 0.42
119 0.51
120 0.6
121 0.63
122 0.71
123 0.76
124 0.73
125 0.75
126 0.74
127 0.69
128 0.69
129 0.67
130 0.62
131 0.62
132 0.56
133 0.59
134 0.61
135 0.61
136 0.62
137 0.69
138 0.75
139 0.75
140 0.84
141 0.84
142 0.88
143 0.91
144 0.91
145 0.92
146 0.85
147 0.81
148 0.74
149 0.65
150 0.53
151 0.44
152 0.33
153 0.22
154 0.19
155 0.13
156 0.09
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.11
162 0.1
163 0.09
164 0.1
165 0.1
166 0.14
167 0.15
168 0.15
169 0.2
170 0.21
171 0.22
172 0.24
173 0.32
174 0.38
175 0.47
176 0.57
177 0.61
178 0.66
179 0.71
180 0.78
181 0.78
182 0.75
183 0.68
184 0.61
185 0.55
186 0.49
187 0.42
188 0.33
189 0.25
190 0.19
191 0.15
192 0.11
193 0.08
194 0.07
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.09
200 0.11
201 0.16
202 0.19
203 0.19
204 0.24
205 0.31
206 0.34
207 0.41
208 0.49
209 0.5
210 0.55
211 0.6
212 0.61
213 0.61
214 0.67
215 0.62
216 0.58
217 0.56
218 0.5
219 0.44
220 0.39
221 0.32
222 0.26
223 0.25
224 0.24
225 0.19
226 0.18
227 0.19
228 0.24
229 0.26
230 0.24
231 0.26
232 0.27
233 0.28
234 0.3
235 0.29
236 0.26
237 0.25
238 0.23
239 0.2
240 0.16
241 0.16
242 0.14
243 0.14
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.08
251 0.09
252 0.12
253 0.17
254 0.21
255 0.24
256 0.29
257 0.31
258 0.33
259 0.34
260 0.34
261 0.29
262 0.3
263 0.28
264 0.24
265 0.21
266 0.2
267 0.19
268 0.17
269 0.16
270 0.1
271 0.09
272 0.08
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.12
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.13
281 0.11
282 0.11
283 0.08
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.08
303 0.1
304 0.09
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.13
309 0.2
310 0.2
311 0.21
312 0.22
313 0.19
314 0.2
315 0.2
316 0.17
317 0.09
318 0.09
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.1
331 0.16
332 0.18
333 0.2
334 0.25
335 0.3
336 0.36
337 0.38
338 0.37
339 0.4
340 0.45
341 0.49
342 0.48
343 0.46
344 0.42
345 0.43
346 0.48
347 0.49
348 0.47
349 0.43
350 0.4
351 0.4
352 0.38
353 0.36
354 0.31
355 0.24
356 0.18
357 0.16
358 0.15
359 0.12
360 0.12
361 0.1
362 0.09
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.06
374 0.08
375 0.1
376 0.11
377 0.11
378 0.13
379 0.14
380 0.16
381 0.17
382 0.21
383 0.26
384 0.29
385 0.31
386 0.3
387 0.3
388 0.29
389 0.36
390 0.38
391 0.31
392 0.36
393 0.38
394 0.4
395 0.47
396 0.54
397 0.5
398 0.52
399 0.61
400 0.59
401 0.63
402 0.64
403 0.6
404 0.63
405 0.69
406 0.67
407 0.66
408 0.68
409 0.64
410 0.68
411 0.72
412 0.71
413 0.67
414 0.65
415 0.59
416 0.59
417 0.56
418 0.48
419 0.4
420 0.32
421 0.27
422 0.22
423 0.25
424 0.27
425 0.31