Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9PCI9

Protein Details
Accession R9PCI9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
472-499LIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
478-490KGFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MPQINPNSTSVAADEALRNTFQIVHAFLAEHAPQAAQQLAATLPDSPAPPKTLASALVDHVRNSPRRSWPGLVAQQATPSSPTPMDEDTDSDSSDSDSDSDSDSSSSGSSVSSSSGDDSDSDSDSSDSDDDSSDDDDDESDSEEDKQVKAAKPDPPHQDTEAASSTVVSDSQDEAEAALPSNGIATPTRASSVSAAAVVTNKRKREATPSDDSSSDSSSDDSSDDSDDESGDSDSDSSSDDGDDSDDESSDSDDSDSDDEDEEEEDAKEDKATIKKVEVVVKTVESDSDDSDSSSDDSSSSSDDGAEAAVASKDGDDDDGSSDSSSDDSDSSDSDSDSNSDSDDSNSDSSSSSESGFDSDSSSSSSSSSGSSSSPSPKGPPAKRQKVVSPPATPTPAPTVAATTTTTSIASTPTPSTSSARKPHSNSTQNTPFQRVKADKVTYLHEGMKDMSYSGKAGVTGDEYGARASRDLIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDVYGSHSIKFDDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.18
4 0.18
5 0.17
6 0.15
7 0.16
8 0.16
9 0.17
10 0.16
11 0.16
12 0.16
13 0.17
14 0.16
15 0.19
16 0.18
17 0.15
18 0.14
19 0.12
20 0.12
21 0.14
22 0.14
23 0.1
24 0.09
25 0.1
26 0.1
27 0.11
28 0.11
29 0.09
30 0.09
31 0.11
32 0.13
33 0.13
34 0.16
35 0.18
36 0.19
37 0.19
38 0.21
39 0.21
40 0.23
41 0.24
42 0.23
43 0.23
44 0.28
45 0.28
46 0.27
47 0.3
48 0.35
49 0.37
50 0.39
51 0.44
52 0.46
53 0.52
54 0.57
55 0.55
56 0.54
57 0.58
58 0.61
59 0.59
60 0.52
61 0.46
62 0.44
63 0.4
64 0.35
65 0.28
66 0.22
67 0.2
68 0.17
69 0.18
70 0.17
71 0.18
72 0.2
73 0.18
74 0.2
75 0.21
76 0.22
77 0.21
78 0.18
79 0.16
80 0.15
81 0.14
82 0.12
83 0.08
84 0.08
85 0.09
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.07
95 0.06
96 0.07
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.09
103 0.1
104 0.1
105 0.12
106 0.12
107 0.13
108 0.12
109 0.12
110 0.12
111 0.11
112 0.12
113 0.1
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.09
119 0.1
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.12
131 0.13
132 0.12
133 0.15
134 0.19
135 0.22
136 0.26
137 0.3
138 0.34
139 0.39
140 0.46
141 0.51
142 0.5
143 0.5
144 0.47
145 0.46
146 0.39
147 0.38
148 0.32
149 0.24
150 0.2
151 0.17
152 0.15
153 0.12
154 0.11
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.1
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.1
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.1
185 0.12
186 0.19
187 0.22
188 0.23
189 0.25
190 0.27
191 0.28
192 0.35
193 0.41
194 0.41
195 0.44
196 0.47
197 0.47
198 0.46
199 0.46
200 0.37
201 0.3
202 0.24
203 0.16
204 0.12
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.06
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.09
258 0.12
259 0.14
260 0.15
261 0.15
262 0.18
263 0.21
264 0.27
265 0.24
266 0.23
267 0.22
268 0.21
269 0.21
270 0.18
271 0.15
272 0.11
273 0.11
274 0.09
275 0.1
276 0.09
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.08
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.03
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.06
314 0.05
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.1
331 0.11
332 0.1
333 0.1
334 0.11
335 0.1
336 0.11
337 0.12
338 0.12
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.11
343 0.11
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.09
348 0.11
349 0.11
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.09
357 0.09
358 0.11
359 0.13
360 0.18
361 0.2
362 0.2
363 0.23
364 0.29
365 0.38
366 0.42
367 0.5
368 0.56
369 0.64
370 0.68
371 0.7
372 0.71
373 0.71
374 0.73
375 0.7
376 0.63
377 0.57
378 0.56
379 0.56
380 0.48
381 0.4
382 0.37
383 0.32
384 0.28
385 0.25
386 0.22
387 0.19
388 0.21
389 0.19
390 0.15
391 0.15
392 0.14
393 0.14
394 0.12
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.12
399 0.12
400 0.13
401 0.15
402 0.17
403 0.2
404 0.25
405 0.32
406 0.38
407 0.44
408 0.5
409 0.54
410 0.61
411 0.68
412 0.71
413 0.66
414 0.68
415 0.7
416 0.69
417 0.68
418 0.66
419 0.59
420 0.52
421 0.57
422 0.51
423 0.48
424 0.5
425 0.5
426 0.48
427 0.46
428 0.49
429 0.44
430 0.44
431 0.41
432 0.32
433 0.31
434 0.27
435 0.26
436 0.22
437 0.18
438 0.17
439 0.15
440 0.14
441 0.14
442 0.13
443 0.12
444 0.12
445 0.13
446 0.13
447 0.13
448 0.13
449 0.13
450 0.12
451 0.13
452 0.14
453 0.13
454 0.11
455 0.12
456 0.15
457 0.16
458 0.17
459 0.2
460 0.26
461 0.28
462 0.3
463 0.33
464 0.31
465 0.34
466 0.39
467 0.45
468 0.5
469 0.58
470 0.66
471 0.73
472 0.82
473 0.85
474 0.9
475 0.91
476 0.9
477 0.9
478 0.88
479 0.86
480 0.84
481 0.78
482 0.67
483 0.56
484 0.47
485 0.37
486 0.33
487 0.27
488 0.19
489 0.17
490 0.18
491 0.18