Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9PBU0

Protein Details
Accession R9PBU0    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-122AALDTPSKEKKKKDQKEKKDKKDRKSKEDKTEDDDBasic
185-206LLKLKAKKAKNEESKKRFQRMTHydrophilic
484-506DGEAKADKREGKRLKKDAKVVSFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
95-114KEKKKKDQKEKKDKKDRKSK
180-201LKRAKLLKLKAKKAKNEESKKR
488-500KADKREGKRLKKD
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042246  ZCCHC9  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MRCRFCEGNFGLAERLSSHRNFAGGEQHFNVPFNNHQRPSYTMTRYTKLDGRRSLAKKTVDSDSEPELESTAPVTPAKVEVQPPVSEAALDTPSKEKKKKDQKEKKDKKDRKSKEDKTEDDDATAAADDAEPRDDVESAEPVASTSASASTEVDADTTTVAADPTTPAADAEPPTIEKLLKRAKLLKLKAKKAKNEESKKRFQRMTRDIERQVEQMFGSFEYGPKGQLIRLGAAQSDTMWQSRQKGGDWSAPASSHSLGGDGGWGARGGQHSSSSNNNFNSDRSWGNNKTDDERRMDRRDARREERAEQRQSKLKCFACRGMGHSAKDCPNALDAQSISLKSDTGGTTTDSPMIGRDAVGICFRCGSTEHTLSKCRKPALKNDELPYATCFICHSKGHLSSKCPNNAGRGVYPEGGSCKLCSSVEHLAKDCPLALRNEGKSHKMDREAKSLVNQVIVGSTKDSSQAGGDEDDFHSFARKRAQVDGEAKADKREGKRLKKDAKVVSF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.24
3 0.22
4 0.21
5 0.24
6 0.24
7 0.25
8 0.25
9 0.25
10 0.31
11 0.29
12 0.33
13 0.32
14 0.35
15 0.34
16 0.34
17 0.33
18 0.27
19 0.32
20 0.37
21 0.43
22 0.42
23 0.43
24 0.45
25 0.48
26 0.52
27 0.53
28 0.49
29 0.49
30 0.52
31 0.55
32 0.54
33 0.55
34 0.54
35 0.53
36 0.56
37 0.53
38 0.52
39 0.58
40 0.59
41 0.61
42 0.63
43 0.6
44 0.55
45 0.53
46 0.54
47 0.47
48 0.47
49 0.43
50 0.4
51 0.36
52 0.33
53 0.29
54 0.23
55 0.2
56 0.16
57 0.14
58 0.11
59 0.11
60 0.1
61 0.11
62 0.1
63 0.13
64 0.15
65 0.17
66 0.18
67 0.21
68 0.25
69 0.25
70 0.25
71 0.25
72 0.22
73 0.18
74 0.16
75 0.15
76 0.14
77 0.14
78 0.14
79 0.19
80 0.26
81 0.35
82 0.4
83 0.44
84 0.52
85 0.64
86 0.73
87 0.79
88 0.82
89 0.86
90 0.91
91 0.95
92 0.96
93 0.96
94 0.94
95 0.94
96 0.94
97 0.92
98 0.91
99 0.91
100 0.9
101 0.89
102 0.9
103 0.84
104 0.79
105 0.77
106 0.66
107 0.55
108 0.46
109 0.34
110 0.25
111 0.2
112 0.14
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.1
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.06
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.09
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.18
166 0.24
167 0.27
168 0.3
169 0.36
170 0.42
171 0.51
172 0.57
173 0.59
174 0.61
175 0.68
176 0.73
177 0.73
178 0.73
179 0.73
180 0.76
181 0.77
182 0.78
183 0.8
184 0.79
185 0.82
186 0.82
187 0.81
188 0.76
189 0.7
190 0.71
191 0.68
192 0.7
193 0.67
194 0.67
195 0.62
196 0.61
197 0.57
198 0.48
199 0.4
200 0.31
201 0.23
202 0.17
203 0.14
204 0.1
205 0.1
206 0.09
207 0.08
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.08
214 0.11
215 0.11
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.08
227 0.09
228 0.12
229 0.15
230 0.16
231 0.15
232 0.18
233 0.2
234 0.23
235 0.23
236 0.22
237 0.2
238 0.19
239 0.18
240 0.16
241 0.14
242 0.1
243 0.09
244 0.08
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.03
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.09
258 0.09
259 0.12
260 0.17
261 0.2
262 0.23
263 0.23
264 0.25
265 0.24
266 0.24
267 0.24
268 0.21
269 0.19
270 0.18
271 0.24
272 0.25
273 0.28
274 0.32
275 0.32
276 0.35
277 0.4
278 0.39
279 0.38
280 0.41
281 0.45
282 0.44
283 0.48
284 0.51
285 0.54
286 0.61
287 0.64
288 0.64
289 0.65
290 0.64
291 0.65
292 0.66
293 0.66
294 0.66
295 0.62
296 0.61
297 0.6
298 0.58
299 0.57
300 0.55
301 0.51
302 0.48
303 0.47
304 0.46
305 0.45
306 0.45
307 0.43
308 0.44
309 0.44
310 0.4
311 0.38
312 0.38
313 0.35
314 0.35
315 0.32
316 0.23
317 0.2
318 0.2
319 0.18
320 0.16
321 0.13
322 0.13
323 0.14
324 0.14
325 0.13
326 0.12
327 0.12
328 0.09
329 0.12
330 0.1
331 0.09
332 0.1
333 0.11
334 0.13
335 0.13
336 0.14
337 0.12
338 0.12
339 0.11
340 0.12
341 0.1
342 0.08
343 0.09
344 0.09
345 0.1
346 0.13
347 0.13
348 0.12
349 0.13
350 0.13
351 0.12
352 0.12
353 0.16
354 0.2
355 0.26
356 0.3
357 0.33
358 0.41
359 0.45
360 0.51
361 0.51
362 0.5
363 0.51
364 0.51
365 0.58
366 0.61
367 0.65
368 0.65
369 0.63
370 0.65
371 0.58
372 0.55
373 0.46
374 0.39
375 0.29
376 0.22
377 0.2
378 0.16
379 0.2
380 0.19
381 0.21
382 0.25
383 0.33
384 0.41
385 0.44
386 0.47
387 0.51
388 0.59
389 0.61
390 0.58
391 0.53
392 0.5
393 0.5
394 0.48
395 0.42
396 0.38
397 0.36
398 0.33
399 0.31
400 0.27
401 0.25
402 0.24
403 0.22
404 0.18
405 0.16
406 0.17
407 0.17
408 0.16
409 0.2
410 0.27
411 0.32
412 0.35
413 0.35
414 0.35
415 0.35
416 0.35
417 0.3
418 0.23
419 0.2
420 0.19
421 0.23
422 0.29
423 0.31
424 0.39
425 0.41
426 0.43
427 0.45
428 0.49
429 0.5
430 0.52
431 0.57
432 0.54
433 0.59
434 0.58
435 0.54
436 0.53
437 0.54
438 0.45
439 0.38
440 0.33
441 0.25
442 0.24
443 0.23
444 0.19
445 0.15
446 0.14
447 0.13
448 0.15
449 0.15
450 0.13
451 0.12
452 0.13
453 0.13
454 0.15
455 0.15
456 0.16
457 0.17
458 0.18
459 0.17
460 0.16
461 0.21
462 0.21
463 0.24
464 0.3
465 0.33
466 0.34
467 0.41
468 0.46
469 0.48
470 0.52
471 0.54
472 0.52
473 0.53
474 0.51
475 0.46
476 0.46
477 0.44
478 0.44
479 0.48
480 0.52
481 0.58
482 0.68
483 0.76
484 0.81
485 0.83
486 0.87