Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9P3D6

Protein Details
Accession R9P3D6    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MKSPKGTTARRSRNPTKLAHDHydrophilic
345-371VETASEREQRHRRERREQQRYKEAKERBasic
1213-1232APKDETPQRRSTRSRQSKSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
356-360RRERR
384-391KKGKGRAR
1063-1064RR
1072-1085KMVKASKEGGGKRK
1184-1211AKRPRRAVAEAKVDAAAPAKRPRRSTSA
1265-1266RR
1274-1274K
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR002931  Transglutaminase-like  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
PF01841  Transglut_core  
Amino Acid Sequences MKSPKGTTARRSRNPTKLAHDWDRPEADPEEVFDVQSISSDDETSTTPSVASIATMPSRTTQAASAPTRASRSKQQPPPEDIIEISTDGSVGQRDQAADDMVMSDFEDVDPAAPAAAASSRAASEDLDMEDVDLDPDQSAQDLQDMYAAAYRDIQAKYGDGTADYDGQGGDDDDQNELGEDPSTSSKPIPIFKDGKGQHRGVEISVGSRTSKQTDSPKQKSNNFLTPRDRQNRTTAHKLLVLSMLAHTRVRNKWCNDAELRDALADSVPDFLITKLRSIHPKKVTEQRERIRMFESFLSELVRWWSSRFRLDPTMVANSALRQPDQDIATGVIPGSGRRVDGWIVETASEREQRHRRERREQQRYKEAKERLSHTDNVAANGSKKGKGRARDTKSSASAATASNPIKPPTKAMEITIFAPGSAIRPIYLRLLPPAEHITSPAGLRERAEERAGSRETSAQLFCALCRSIGIPARLVISPQPLSWSVGASKLANTAQPGSQADKKPNQLRACAKKSTSRRFASKPVNELTSDDDDYNLSEASSAARSMGSRKAISIDSLSSADEATTSDNNNSRRSGNANGSTDLTKRAVLSAAAKRSTDNNRAARRRGDRGQPITVDDTVSDVSSDRTVKGSSKTKAGSNKSTPASANVKGKARQADAIDTEGEESEDYRPEKWKNLKTPLNVEHKVKLRAFRPKQLKDSEVAGDDTTADPVDLQAPPTMWVEVFSKPYQKWITVDPIRSMIRPSGNRHMEPPAFDRQNKLIYVVAFEEDGYARDVTARYTKTLNSRVSRLRPPTRAKGEEDWWSKVVRSIHRPQKLDRDAMEDAELQDNSSREPMPSSMNGFKDHPIYFLERFLKRDEVVFPRRQIATFQGTPVFSKSDVQTLRSSRQWYNEGRVVKDGEVALKFVKSRGYTLANKRAEEQARSEGREVAQEGLYAEFQTQLYVPPAVGADGVIPTNGFGNIDLFVPSMLPANAVHLAYSGVAKVARKLGVPYAEAITGFEFRKQRGMPKITGIVVAQQSAELVEEAFWQQEQEDALKQQTKKMERAMKNWRKLINAVRIARRVKEQYGDKMVKASKEGGGKRKVKETEAEVAQEEEKSRFFAQKSLEALDEDVASDAGGEDLDVELQAEQEAEPAIETAKSTPTKRKKIISLAQLASTSAHPDDDTDSSDASASPPADASPAKRPRRAVAEAKVDAAAPAKRPRRSTSAAAPKDETPQRRSTRSRQSKSLYVEPDSDVDEHDDAAEAADQPEAEHPSSARKSRRITVKLTPKKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.81
3 0.79
4 0.77
5 0.77
6 0.76
7 0.75
8 0.7
9 0.7
10 0.67
11 0.59
12 0.55
13 0.47
14 0.41
15 0.33
16 0.3
17 0.28
18 0.24
19 0.23
20 0.18
21 0.17
22 0.14
23 0.15
24 0.14
25 0.11
26 0.11
27 0.12
28 0.12
29 0.13
30 0.14
31 0.17
32 0.17
33 0.14
34 0.13
35 0.13
36 0.14
37 0.12
38 0.11
39 0.09
40 0.12
41 0.14
42 0.15
43 0.16
44 0.17
45 0.2
46 0.2
47 0.21
48 0.18
49 0.2
50 0.28
51 0.3
52 0.33
53 0.33
54 0.35
55 0.39
56 0.41
57 0.42
58 0.43
59 0.5
60 0.56
61 0.62
62 0.69
63 0.72
64 0.76
65 0.77
66 0.7
67 0.62
68 0.52
69 0.46
70 0.37
71 0.29
72 0.23
73 0.15
74 0.12
75 0.1
76 0.11
77 0.1
78 0.08
79 0.1
80 0.11
81 0.12
82 0.13
83 0.14
84 0.15
85 0.13
86 0.13
87 0.12
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.08
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.06
103 0.07
104 0.08
105 0.07
106 0.09
107 0.09
108 0.1
109 0.11
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.12
114 0.12
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.1
119 0.1
120 0.08
121 0.07
122 0.06
123 0.07
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.13
135 0.13
136 0.11
137 0.12
138 0.13
139 0.17
140 0.17
141 0.19
142 0.17
143 0.17
144 0.18
145 0.18
146 0.18
147 0.13
148 0.14
149 0.15
150 0.15
151 0.14
152 0.13
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.09
157 0.09
158 0.1
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.07
167 0.07
168 0.09
169 0.12
170 0.13
171 0.14
172 0.14
173 0.18
174 0.22
175 0.27
176 0.29
177 0.34
178 0.38
179 0.38
180 0.48
181 0.48
182 0.53
183 0.54
184 0.51
185 0.46
186 0.46
187 0.45
188 0.35
189 0.34
190 0.26
191 0.21
192 0.21
193 0.2
194 0.17
195 0.18
196 0.2
197 0.2
198 0.22
199 0.26
200 0.35
201 0.44
202 0.54
203 0.59
204 0.66
205 0.7
206 0.75
207 0.77
208 0.74
209 0.74
210 0.69
211 0.69
212 0.67
213 0.67
214 0.72
215 0.72
216 0.69
217 0.63
218 0.65
219 0.67
220 0.67
221 0.68
222 0.62
223 0.55
224 0.54
225 0.51
226 0.44
227 0.37
228 0.3
229 0.21
230 0.18
231 0.17
232 0.15
233 0.16
234 0.16
235 0.21
236 0.27
237 0.34
238 0.41
239 0.42
240 0.5
241 0.52
242 0.58
243 0.55
244 0.53
245 0.49
246 0.43
247 0.4
248 0.3
249 0.27
250 0.21
251 0.17
252 0.12
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.13
260 0.13
261 0.15
262 0.17
263 0.21
264 0.31
265 0.36
266 0.46
267 0.48
268 0.53
269 0.58
270 0.65
271 0.7
272 0.7
273 0.75
274 0.73
275 0.75
276 0.71
277 0.66
278 0.59
279 0.51
280 0.44
281 0.36
282 0.32
283 0.23
284 0.22
285 0.23
286 0.19
287 0.19
288 0.19
289 0.18
290 0.14
291 0.15
292 0.21
293 0.22
294 0.28
295 0.29
296 0.31
297 0.36
298 0.37
299 0.38
300 0.36
301 0.37
302 0.31
303 0.3
304 0.25
305 0.21
306 0.24
307 0.22
308 0.18
309 0.14
310 0.15
311 0.18
312 0.19
313 0.18
314 0.14
315 0.14
316 0.15
317 0.14
318 0.12
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.1
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.11
327 0.11
328 0.12
329 0.14
330 0.13
331 0.13
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.16
336 0.21
337 0.2
338 0.27
339 0.34
340 0.43
341 0.53
342 0.61
343 0.66
344 0.72
345 0.82
346 0.84
347 0.88
348 0.88
349 0.86
350 0.87
351 0.85
352 0.81
353 0.79
354 0.73
355 0.69
356 0.66
357 0.61
358 0.58
359 0.56
360 0.52
361 0.44
362 0.46
363 0.4
364 0.35
365 0.32
366 0.25
367 0.22
368 0.24
369 0.25
370 0.22
371 0.23
372 0.29
373 0.33
374 0.39
375 0.48
376 0.54
377 0.59
378 0.64
379 0.68
380 0.66
381 0.63
382 0.57
383 0.48
384 0.38
385 0.33
386 0.24
387 0.2
388 0.2
389 0.18
390 0.2
391 0.21
392 0.23
393 0.25
394 0.25
395 0.26
396 0.25
397 0.3
398 0.28
399 0.28
400 0.3
401 0.27
402 0.28
403 0.27
404 0.22
405 0.16
406 0.16
407 0.13
408 0.1
409 0.1
410 0.09
411 0.06
412 0.07
413 0.09
414 0.12
415 0.13
416 0.12
417 0.14
418 0.16
419 0.16
420 0.18
421 0.21
422 0.19
423 0.17
424 0.18
425 0.17
426 0.16
427 0.15
428 0.15
429 0.13
430 0.12
431 0.13
432 0.15
433 0.17
434 0.18
435 0.19
436 0.17
437 0.17
438 0.23
439 0.23
440 0.2
441 0.18
442 0.19
443 0.19
444 0.2
445 0.19
446 0.13
447 0.14
448 0.14
449 0.13
450 0.13
451 0.12
452 0.1
453 0.1
454 0.1
455 0.12
456 0.17
457 0.17
458 0.15
459 0.16
460 0.18
461 0.17
462 0.17
463 0.14
464 0.14
465 0.14
466 0.13
467 0.15
468 0.14
469 0.16
470 0.15
471 0.15
472 0.12
473 0.13
474 0.14
475 0.12
476 0.11
477 0.12
478 0.12
479 0.12
480 0.12
481 0.12
482 0.11
483 0.13
484 0.14
485 0.16
486 0.22
487 0.24
488 0.28
489 0.32
490 0.39
491 0.42
492 0.49
493 0.47
494 0.48
495 0.54
496 0.58
497 0.59
498 0.56
499 0.52
500 0.53
501 0.6
502 0.62
503 0.62
504 0.58
505 0.59
506 0.58
507 0.65
508 0.67
509 0.61
510 0.57
511 0.5
512 0.47
513 0.41
514 0.38
515 0.34
516 0.27
517 0.24
518 0.18
519 0.16
520 0.14
521 0.14
522 0.14
523 0.1
524 0.06
525 0.05
526 0.05
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.05
531 0.06
532 0.06
533 0.08
534 0.12
535 0.14
536 0.14
537 0.14
538 0.16
539 0.16
540 0.17
541 0.16
542 0.12
543 0.11
544 0.11
545 0.11
546 0.09
547 0.08
548 0.07
549 0.06
550 0.06
551 0.06
552 0.07
553 0.07
554 0.09
555 0.14
556 0.16
557 0.18
558 0.19
559 0.18
560 0.19
561 0.21
562 0.24
563 0.25
564 0.29
565 0.29
566 0.28
567 0.29
568 0.29
569 0.26
570 0.23
571 0.18
572 0.13
573 0.11
574 0.11
575 0.1
576 0.09
577 0.14
578 0.17
579 0.2
580 0.2
581 0.21
582 0.21
583 0.26
584 0.31
585 0.32
586 0.35
587 0.39
588 0.47
589 0.51
590 0.53
591 0.55
592 0.54
593 0.54
594 0.52
595 0.51
596 0.51
597 0.51
598 0.51
599 0.45
600 0.42
601 0.37
602 0.32
603 0.24
604 0.16
605 0.13
606 0.1
607 0.09
608 0.07
609 0.05
610 0.06
611 0.07
612 0.08
613 0.07
614 0.08
615 0.09
616 0.1
617 0.16
618 0.22
619 0.22
620 0.26
621 0.27
622 0.3
623 0.37
624 0.4
625 0.42
626 0.38
627 0.43
628 0.39
629 0.39
630 0.35
631 0.32
632 0.32
633 0.29
634 0.3
635 0.27
636 0.3
637 0.3
638 0.33
639 0.31
640 0.28
641 0.28
642 0.24
643 0.23
644 0.21
645 0.2
646 0.16
647 0.13
648 0.13
649 0.09
650 0.09
651 0.06
652 0.06
653 0.05
654 0.08
655 0.09
656 0.09
657 0.14
658 0.15
659 0.22
660 0.3
661 0.36
662 0.41
663 0.5
664 0.54
665 0.53
666 0.59
667 0.6
668 0.61
669 0.56
670 0.51
671 0.47
672 0.46
673 0.48
674 0.43
675 0.4
676 0.36
677 0.44
678 0.46
679 0.49
680 0.55
681 0.55
682 0.6
683 0.59
684 0.55
685 0.46
686 0.45
687 0.38
688 0.29
689 0.25
690 0.18
691 0.14
692 0.13
693 0.11
694 0.08
695 0.07
696 0.05
697 0.04
698 0.04
699 0.06
700 0.05
701 0.06
702 0.06
703 0.07
704 0.08
705 0.09
706 0.09
707 0.07
708 0.09
709 0.1
710 0.11
711 0.15
712 0.14
713 0.18
714 0.18
715 0.24
716 0.24
717 0.23
718 0.23
719 0.23
720 0.31
721 0.31
722 0.33
723 0.28
724 0.31
725 0.3
726 0.29
727 0.28
728 0.21
729 0.23
730 0.25
731 0.29
732 0.35
733 0.38
734 0.38
735 0.39
736 0.42
737 0.37
738 0.35
739 0.34
740 0.33
741 0.32
742 0.32
743 0.33
744 0.3
745 0.33
746 0.3
747 0.28
748 0.22
749 0.18
750 0.19
751 0.16
752 0.14
753 0.1
754 0.1
755 0.09
756 0.07
757 0.08
758 0.08
759 0.07
760 0.06
761 0.08
762 0.08
763 0.09
764 0.14
765 0.14
766 0.14
767 0.16
768 0.19
769 0.24
770 0.32
771 0.37
772 0.34
773 0.39
774 0.44
775 0.48
776 0.53
777 0.55
778 0.55
779 0.57
780 0.61
781 0.65
782 0.66
783 0.64
784 0.61
785 0.57
786 0.53
787 0.54
788 0.51
789 0.45
790 0.38
791 0.35
792 0.3
793 0.29
794 0.31
795 0.28
796 0.32
797 0.38
798 0.46
799 0.53
800 0.56
801 0.55
802 0.61
803 0.59
804 0.56
805 0.47
806 0.44
807 0.38
808 0.36
809 0.33
810 0.23
811 0.2
812 0.19
813 0.17
814 0.11
815 0.12
816 0.12
817 0.11
818 0.12
819 0.11
820 0.09
821 0.11
822 0.12
823 0.13
824 0.15
825 0.19
826 0.22
827 0.23
828 0.25
829 0.25
830 0.26
831 0.27
832 0.25
833 0.22
834 0.19
835 0.22
836 0.2
837 0.25
838 0.29
839 0.27
840 0.28
841 0.3
842 0.31
843 0.27
844 0.28
845 0.27
846 0.29
847 0.35
848 0.38
849 0.37
850 0.39
851 0.39
852 0.38
853 0.34
854 0.31
855 0.31
856 0.27
857 0.27
858 0.25
859 0.24
860 0.25
861 0.25
862 0.21
863 0.14
864 0.16
865 0.15
866 0.2
867 0.2
868 0.22
869 0.27
870 0.29
871 0.33
872 0.34
873 0.38
874 0.33
875 0.38
876 0.41
877 0.38
878 0.41
879 0.43
880 0.41
881 0.38
882 0.39
883 0.35
884 0.29
885 0.28
886 0.22
887 0.2
888 0.17
889 0.17
890 0.14
891 0.14
892 0.14
893 0.13
894 0.17
895 0.14
896 0.16
897 0.19
898 0.25
899 0.31
900 0.4
901 0.49
902 0.48
903 0.48
904 0.48
905 0.51
906 0.48
907 0.43
908 0.38
909 0.37
910 0.38
911 0.39
912 0.39
913 0.33
914 0.3
915 0.31
916 0.28
917 0.21
918 0.17
919 0.15
920 0.14
921 0.13
922 0.13
923 0.1
924 0.09
925 0.08
926 0.08
927 0.08
928 0.08
929 0.08
930 0.1
931 0.1
932 0.09
933 0.09
934 0.09
935 0.08
936 0.08
937 0.07
938 0.05
939 0.06
940 0.06
941 0.05
942 0.05
943 0.05
944 0.06
945 0.06
946 0.05
947 0.05
948 0.06
949 0.06
950 0.07
951 0.07
952 0.07
953 0.07
954 0.07
955 0.07
956 0.07
957 0.07
958 0.07
959 0.07
960 0.09
961 0.12
962 0.11
963 0.11
964 0.1
965 0.1
966 0.1
967 0.1
968 0.07
969 0.06
970 0.08
971 0.08
972 0.1
973 0.14
974 0.15
975 0.15
976 0.17
977 0.2
978 0.22
979 0.22
980 0.22
981 0.2
982 0.19
983 0.18
984 0.17
985 0.14
986 0.14
987 0.14
988 0.17
989 0.18
990 0.18
991 0.26
992 0.27
993 0.33
994 0.39
995 0.45
996 0.42
997 0.45
998 0.49
999 0.42
1000 0.42
1001 0.35
1002 0.3
1003 0.25
1004 0.23
1005 0.17
1006 0.13
1007 0.12
1008 0.1
1009 0.11
1010 0.06
1011 0.05
1012 0.05
1013 0.06
1014 0.07
1015 0.07
1016 0.07
1017 0.07
1018 0.07
1019 0.08
1020 0.09
1021 0.1
1022 0.12
1023 0.14
1024 0.18
1025 0.25
1026 0.25
1027 0.29
1028 0.36
1029 0.39
1030 0.41
1031 0.49
1032 0.54
1033 0.54
1034 0.63
1035 0.69
1036 0.71
1037 0.75
1038 0.76
1039 0.71
1040 0.64
1041 0.64
1042 0.63
1043 0.62
1044 0.61
1045 0.59
1046 0.59
1047 0.62
1048 0.62
1049 0.59
1050 0.57
1051 0.52
1052 0.47
1053 0.48
1054 0.48
1055 0.48
1056 0.55
1057 0.56
1058 0.49
1059 0.51
1060 0.5
1061 0.43
1062 0.4
1063 0.35
1064 0.29
1065 0.34
1066 0.41
1067 0.43
1068 0.5
1069 0.55
1070 0.56
1071 0.62
1072 0.61
1073 0.56
1074 0.55
1075 0.51
1076 0.5
1077 0.46
1078 0.44
1079 0.36
1080 0.35
1081 0.32
1082 0.29
1083 0.25
1084 0.18
1085 0.16
1086 0.17
1087 0.18
1088 0.22
1089 0.22
1090 0.25
1091 0.28
1092 0.32
1093 0.35
1094 0.34
1095 0.33
1096 0.28
1097 0.28
1098 0.24
1099 0.2
1100 0.14
1101 0.11
1102 0.09
1103 0.07
1104 0.07
1105 0.06
1106 0.05
1107 0.04
1108 0.04
1109 0.04
1110 0.04
1111 0.04
1112 0.04
1113 0.04
1114 0.04
1115 0.05
1116 0.05
1117 0.05
1118 0.05
1119 0.06
1120 0.06
1121 0.06
1122 0.06
1123 0.06
1124 0.07
1125 0.07
1126 0.07
1127 0.08
1128 0.15
1129 0.2
1130 0.24
1131 0.35
1132 0.44
1133 0.54
1134 0.61
1135 0.68
1136 0.69
1137 0.74
1138 0.79
1139 0.77
1140 0.76
1141 0.68
1142 0.64
1143 0.56
1144 0.48
1145 0.4
1146 0.32
1147 0.25
1148 0.16
1149 0.15
1150 0.12
1151 0.13
1152 0.16
1153 0.16
1154 0.19
1155 0.17
1156 0.17
1157 0.16
1158 0.17
1159 0.16
1160 0.13
1161 0.15
1162 0.12
1163 0.11
1164 0.11
1165 0.11
1166 0.14
1167 0.16
1168 0.19
1169 0.26
1170 0.36
1171 0.43
1172 0.48
1173 0.51
1174 0.55
1175 0.62
1176 0.66
1177 0.64
1178 0.63
1179 0.66
1180 0.62
1181 0.6
1182 0.53
1183 0.45
1184 0.37
1185 0.32
1186 0.26
1187 0.22
1188 0.3
1189 0.36
1190 0.42
1191 0.47
1192 0.52
1193 0.57
1194 0.6
1195 0.62
1196 0.63
1197 0.66
1198 0.67
1199 0.66
1200 0.64
1201 0.57
1202 0.6
1203 0.61
1204 0.56
1205 0.51
1206 0.55
1207 0.57
1208 0.63
1209 0.69
1210 0.7
1211 0.74
1212 0.78
1213 0.8
1214 0.8
1215 0.8
1216 0.79
1217 0.78
1218 0.77
1219 0.71
1220 0.64
1221 0.59
1222 0.51
1223 0.46
1224 0.4
1225 0.33
1226 0.25
1227 0.23
1228 0.2
1229 0.17
1230 0.15
1231 0.14
1232 0.11
1233 0.12
1234 0.12
1235 0.09
1236 0.09
1237 0.09
1238 0.09
1239 0.09
1240 0.14
1241 0.17
1242 0.16
1243 0.17
1244 0.17
1245 0.26
1246 0.34
1247 0.41
1248 0.45
1249 0.49
1250 0.55
1251 0.62
1252 0.72
1253 0.69
1254 0.69
1255 0.71
1256 0.75