FuNGI

R9PBU9

Protein Details

Accession

R9PBU9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
549-568	QHSAARRPSKPRKTNRYGLS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019321 Nucleoporin_Nup88 IPR037700 NUP88/NUP82 IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF10168 Nup88

Amino Acid Sequences

MSHSQSPLGGYPQSPDPTLADPQWLQQLSTHPIFISKRSQNDQTSTSHIEAATQSEIHTRLMTIRGTDLIAIVDNEVRIASLVDAKASASNQPILPSSSSSTRLGSHFAYKVLVPPQGTSIDFDIRNLSINPTGKLLACVGDSQITLLVLPRTGYTKHVDREIACRTVSVAPYYHSAHSNSAVVKVDWHPWGENGTSLLVLTDDGLFREYDVAKDTEEPQQTASFLPRQSSSAGHRSRSRSATPGLAPHTRSSSFAANTTGPSVRGFGLSADDDDATTAVSFSLCVTNTPSPRSSSFDQDADRTWAAEAQRSSGPSDWSPLTVFGLMKNGDVWALCPFLPKSATVPAAYIHNLAKLASYRANTTQSQQTSHVDTQLRYVNALLKQARKESPNDFGERQGSVTPGPERFVRSRSTSTMNLDELTDSPRASVQPEQAGSGAEQMQEGPVQLHPPSWSYRQNLAQGGSAKKAPRPQGPYLLKPAPVELCDERESVACDLIWTWLTDESTQAEASTVVTGVAALSIVGHDGRVDVGLLFESVEAAWDVSTTTQHSAARRPSKPRKTNRYGLSDTEDEADDFEALTLEEPEELPSLLVYETIDLGLLDTAIDNGITSPSAASDLLLSKASSNRPRFVRDPLYGDTVYIYHAFGAQCLGFATWIPKLLDALNKPSQDELDNDAHDDTSRPAAESREQALVKMLHHGQSSEVVWIVNTVAQDSGEGLDLNPVTALEILSDVYLSYAFLAVTADLQVVGVELSLRIEQDAIDSPAAGERSLGLERGGSSDGHKPYVSLLGEGPAFQPPAIFAQSTGTQGLPSHPRRAALSTPNSKSELQITPELLRTLGKTVETYRHEIRTVVSAGNAVQARLDLQVREMTRQLEKLNAIRLRCNDLGTAGTLGERISQIAQTQLQLVARIDKALQRLMDSHQPSLSMYEKKWFEELERIASEVGVARSGGEFKVNTRGMRKSLSAKAKLLEHQLSLLRPQMSALQSQAGAGREEREGMLGGEQLKRVEKMLSGEAAMLAEAKEKVNQLNRKVAQIKPNRDTGTVGGGGFDADSSISFSTVSGGFGGGGAGLPTSSTAANLADFSRSSPFRASHSRTGSSFFA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.27
3	0.26
4	0.28
5	0.32
6	0.29
7	0.28
8	0.26
9	0.28
10	0.35
11	0.32
12	0.29
13	0.27
14	0.32
15	0.33
16	0.35
17	0.33
18	0.25
19	0.31
20	0.32
21	0.33
22	0.37
23	0.37
24	0.43
25	0.49
26	0.57
27	0.56
28	0.6
29	0.59
30	0.53
31	0.53
32	0.5
33	0.45
34	0.4
35	0.34
36	0.31
37	0.28
38	0.28
39	0.23
40	0.18
41	0.17
42	0.19
43	0.21
44	0.2
45	0.19
46	0.16
47	0.17
48	0.21
49	0.22
50	0.18
51	0.19
52	0.19
53	0.19
54	0.18
55	0.16
56	0.13
57	0.12
58	0.11
59	0.1
60	0.1
61	0.1
62	0.1
63	0.09
64	0.08
65	0.07
66	0.08
67	0.08
68	0.11
69	0.11
70	0.12
71	0.12
72	0.13
73	0.15
74	0.15
75	0.17
76	0.15
77	0.18
78	0.19
79	0.21
80	0.22
81	0.22
82	0.23
83	0.22
84	0.24
85	0.25
86	0.27
87	0.27
88	0.27
89	0.27
90	0.27
91	0.28
92	0.27
93	0.29
94	0.27
95	0.26
96	0.26
97	0.23
98	0.27
99	0.27
100	0.28
101	0.22
102	0.22
103	0.24
104	0.25
105	0.25
106	0.23
107	0.22
108	0.25
109	0.24
110	0.24
111	0.24
112	0.21
113	0.23
114	0.21
115	0.21
116	0.21
117	0.24
118	0.24
119	0.23
120	0.24
121	0.22
122	0.23
123	0.21
124	0.16
125	0.15
126	0.14
127	0.13
128	0.13
129	0.13
130	0.12
131	0.12
132	0.1
133	0.09
134	0.1
135	0.1
136	0.09
137	0.09
138	0.1
139	0.12
140	0.13
141	0.16
142	0.2
143	0.27
144	0.29
145	0.34
146	0.37
147	0.36
148	0.42
149	0.45
150	0.42
151	0.35
152	0.32
153	0.29
154	0.3
155	0.3
156	0.25
157	0.2
158	0.19
159	0.23
160	0.26
161	0.25
162	0.23
163	0.24
164	0.24
165	0.25
166	0.26
167	0.23
168	0.24
169	0.23
170	0.21
171	0.22
172	0.22
173	0.24
174	0.23
175	0.24
176	0.22
177	0.21
178	0.24
179	0.21
180	0.19
181	0.16
182	0.14
183	0.12
184	0.11
185	0.1
186	0.08
187	0.07
188	0.07
189	0.06
190	0.06
191	0.07
192	0.08
193	0.07
194	0.08
195	0.11
196	0.11
197	0.11
198	0.14
199	0.14
200	0.14
201	0.17
202	0.19
203	0.23
204	0.25
205	0.24
206	0.23
207	0.23
208	0.23
209	0.22
210	0.24
211	0.21
212	0.2
213	0.22
214	0.21
215	0.21
216	0.22
217	0.25
218	0.26
219	0.32
220	0.35
221	0.38
222	0.43
223	0.47
224	0.52
225	0.54
226	0.51
227	0.46
228	0.44
229	0.45
230	0.41
231	0.41
232	0.39
233	0.38
234	0.37
235	0.35
236	0.36
237	0.31
238	0.31
239	0.29
240	0.29
241	0.26
242	0.25
243	0.26
244	0.23
245	0.23
246	0.24
247	0.21
248	0.17
249	0.16
250	0.16
251	0.13
252	0.13
253	0.12
254	0.1
255	0.12
256	0.11
257	0.11
258	0.11
259	0.11
260	0.1
261	0.1
262	0.09
263	0.07
264	0.06
265	0.05
266	0.04
267	0.04
268	0.04
269	0.05
270	0.08
271	0.08
272	0.08
273	0.13
274	0.19
275	0.22
276	0.25
277	0.26
278	0.27
279	0.29
280	0.34
281	0.32
282	0.33
283	0.35
284	0.35
285	0.35
286	0.33
287	0.33
288	0.32
289	0.3
290	0.23
291	0.19
292	0.18
293	0.17
294	0.2
295	0.18
296	0.16
297	0.18
298	0.19
299	0.21
300	0.2
301	0.22
302	0.18
303	0.21
304	0.18
305	0.18
306	0.17
307	0.16
308	0.15
309	0.14
310	0.14
311	0.11
312	0.14
313	0.14
314	0.13
315	0.12
316	0.11
317	0.1
318	0.1
319	0.1
320	0.07
321	0.08
322	0.08
323	0.11
324	0.11
325	0.13
326	0.14
327	0.13
328	0.14
329	0.17
330	0.19
331	0.17
332	0.17
333	0.16
334	0.18
335	0.18
336	0.17
337	0.13
338	0.12
339	0.12
340	0.12
341	0.12
342	0.11
343	0.13
344	0.14
345	0.14
346	0.16
347	0.19
348	0.23
349	0.23
350	0.25
351	0.29
352	0.28
353	0.29
354	0.3
355	0.29
356	0.31
357	0.31
358	0.33
359	0.28
360	0.27
361	0.28
362	0.3
363	0.27
364	0.22
365	0.22
366	0.21
367	0.2
368	0.26
369	0.25
370	0.25
371	0.27
372	0.32
373	0.35
374	0.32
375	0.35
376	0.33
377	0.37
378	0.37
379	0.39
380	0.36
381	0.35
382	0.34
383	0.31
384	0.28
385	0.21
386	0.18
387	0.13
388	0.15
389	0.15
390	0.14
391	0.15
392	0.15
393	0.19
394	0.2
395	0.22
396	0.23
397	0.25
398	0.28
399	0.3
400	0.33
401	0.32
402	0.33
403	0.33
404	0.3
405	0.26
406	0.23
407	0.2
408	0.16
409	0.16
410	0.13
411	0.1
412	0.09
413	0.1
414	0.1
415	0.11
416	0.14
417	0.14
418	0.16
419	0.17
420	0.17
421	0.17
422	0.17
423	0.15
424	0.14
425	0.12
426	0.08
427	0.08
428	0.07
429	0.07
430	0.07
431	0.07
432	0.06
433	0.05
434	0.07
435	0.07
436	0.08
437	0.08
438	0.1
439	0.13
440	0.17
441	0.22
442	0.24
443	0.29
444	0.32
445	0.35
446	0.35
447	0.33
448	0.32
449	0.31
450	0.29
451	0.26
452	0.25
453	0.22
454	0.22
455	0.27
456	0.28
457	0.31
458	0.36
459	0.37
460	0.45
461	0.48
462	0.49
463	0.5
464	0.47
465	0.42
466	0.36
467	0.34
468	0.25
469	0.21
470	0.22
471	0.16
472	0.17
473	0.17
474	0.17
475	0.16
476	0.15
477	0.16
478	0.13
479	0.13
480	0.09
481	0.07
482	0.07
483	0.08
484	0.08
485	0.06
486	0.06
487	0.07
488	0.08
489	0.08
490	0.08
491	0.09
492	0.09
493	0.09
494	0.08
495	0.07
496	0.07
497	0.07
498	0.07
499	0.05
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.03
504	0.03
505	0.02
506	0.02
507	0.02
508	0.02
509	0.02
510	0.02
511	0.02
512	0.02
513	0.03
514	0.03
515	0.03
516	0.03
517	0.03
518	0.03
519	0.03
520	0.03
521	0.03
522	0.03
523	0.03
524	0.03
525	0.03
526	0.03
527	0.03
528	0.03
529	0.03
530	0.03
531	0.03
532	0.04
533	0.05
534	0.06
535	0.08
536	0.1
537	0.11
538	0.16
539	0.23
540	0.31
541	0.34
542	0.43
543	0.52
544	0.61
545	0.69
546	0.75
547	0.78
548	0.77
549	0.81
550	0.78
551	0.75
552	0.67
553	0.6
554	0.54
555	0.44
556	0.37
557	0.3
558	0.24
559	0.16
560	0.13
561	0.11
562	0.06
563	0.05
564	0.05
565	0.04
566	0.04
567	0.04
568	0.04
569	0.03
570	0.04
571	0.04
572	0.05
573	0.05
574	0.05
575	0.05
576	0.04
577	0.05
578	0.04
579	0.05
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.03
586	0.03
587	0.03
588	0.03
589	0.03
590	0.02
591	0.03
592	0.03
593	0.03
594	0.02
595	0.03
596	0.03
597	0.03
598	0.03
599	0.03
600	0.03
601	0.04
602	0.04
603	0.04
604	0.05
605	0.06
606	0.07
607	0.07
608	0.07
609	0.07
610	0.11
611	0.16
612	0.23
613	0.26
614	0.3
615	0.32
616	0.37
617	0.39
618	0.42
619	0.44
620	0.38
621	0.4
622	0.37
623	0.39
624	0.34
625	0.31
626	0.25
627	0.19
628	0.17
629	0.13
630	0.1
631	0.06
632	0.08
633	0.08
634	0.07
635	0.09
636	0.07
637	0.07
638	0.07
639	0.07
640	0.05
641	0.05
642	0.07
643	0.06
644	0.09
645	0.09
646	0.09
647	0.1
648	0.11
649	0.16
650	0.16
651	0.22
652	0.24
653	0.25
654	0.25
655	0.25
656	0.24
657	0.21
658	0.21
659	0.19
660	0.17
661	0.17
662	0.18
663	0.17
664	0.16
665	0.15
666	0.14
667	0.1
668	0.1
669	0.1
670	0.1
671	0.11
672	0.12
673	0.15
674	0.17
675	0.19
676	0.22
677	0.22
678	0.21
679	0.23
680	0.23
681	0.2
682	0.22
683	0.21
684	0.17
685	0.18
686	0.18
687	0.15
688	0.16
689	0.16
690	0.12
691	0.11
692	0.08
693	0.08
694	0.08
695	0.08
696	0.07
697	0.06
698	0.06
699	0.06
700	0.06
701	0.06
702	0.06
703	0.06
704	0.05
705	0.05
706	0.05
707	0.07
708	0.07
709	0.07
710	0.06
711	0.06
712	0.06
713	0.06
714	0.06
715	0.04
716	0.04
717	0.04
718	0.04
719	0.04
720	0.04
721	0.04
722	0.04
723	0.04
724	0.03
725	0.04
726	0.04
727	0.04
728	0.04
729	0.04
730	0.04
731	0.05
732	0.04
733	0.04
734	0.04
735	0.04
736	0.04
737	0.03
738	0.03
739	0.03
740	0.03
741	0.04
742	0.04
743	0.04
744	0.04
745	0.05
746	0.05
747	0.07
748	0.09
749	0.1
750	0.09
751	0.09
752	0.09
753	0.11
754	0.12
755	0.1
756	0.07
757	0.06
758	0.09
759	0.1
760	0.1
761	0.08
762	0.08
763	0.09
764	0.11
765	0.12
766	0.09
767	0.11
768	0.18
769	0.19
770	0.2
771	0.2
772	0.18
773	0.18
774	0.24
775	0.21
776	0.16
777	0.14
778	0.14
779	0.15
780	0.15
781	0.14
782	0.1
783	0.1
784	0.09
785	0.09
786	0.08
787	0.1
788	0.11
789	0.1
790	0.09
791	0.12
792	0.14
793	0.15
794	0.15
795	0.13
796	0.12
797	0.12
798	0.16
799	0.22
800	0.24
801	0.29
802	0.29
803	0.31
804	0.32
805	0.36
806	0.37
807	0.37
808	0.43
809	0.45
810	0.47
811	0.49
812	0.5
813	0.46
814	0.42
815	0.39
816	0.33
817	0.28
818	0.28
819	0.28
820	0.26
821	0.28
822	0.27
823	0.22
824	0.19
825	0.16
826	0.15
827	0.14
828	0.13
829	0.13
830	0.15
831	0.23
832	0.26
833	0.3
834	0.32
835	0.34
836	0.34
837	0.33
838	0.31
839	0.28
840	0.27
841	0.22
842	0.18
843	0.15
844	0.15
845	0.19
846	0.18
847	0.13
848	0.11
849	0.11
850	0.11
851	0.13
852	0.14
853	0.09
854	0.1
855	0.16
856	0.17
857	0.19
858	0.2
859	0.21
860	0.22
861	0.25
862	0.24
863	0.24
864	0.26
865	0.27
866	0.34
867	0.35
868	0.34
869	0.36
870	0.38
871	0.41
872	0.38
873	0.36
874	0.28
875	0.25
876	0.25
877	0.21
878	0.19
879	0.12
880	0.1
881	0.1
882	0.09
883	0.09
884	0.08
885	0.08
886	0.08
887	0.09
888	0.09
889	0.12
890	0.14
891	0.13
892	0.14
893	0.15
894	0.15
895	0.16
896	0.16
897	0.17
898	0.16
899	0.16
900	0.16
901	0.17
902	0.19
903	0.21
904	0.21
905	0.18
906	0.2
907	0.23
908	0.31
909	0.3
910	0.3
911	0.27
912	0.27
913	0.26
914	0.27
915	0.29
916	0.24
917	0.23
918	0.29
919	0.3
920	0.31
921	0.33
922	0.3
923	0.28
924	0.32
925	0.34
926	0.32
927	0.31
928	0.3
929	0.28
930	0.27
931	0.24
932	0.19
933	0.16
934	0.1
935	0.1
936	0.09
937	0.1
938	0.12
939	0.11
940	0.11
941	0.11
942	0.12
943	0.22
944	0.25
945	0.27
946	0.31
947	0.35
948	0.36
949	0.4
950	0.42
951	0.4
952	0.46
953	0.53
954	0.53
955	0.51
956	0.51
957	0.52
958	0.52
959	0.52
960	0.46
961	0.37
962	0.35
963	0.35
964	0.33
965	0.31
966	0.32
967	0.25
968	0.22
969	0.22
970	0.24
971	0.23
972	0.24
973	0.23
974	0.2
975	0.19
976	0.2
977	0.22
978	0.17
979	0.17
980	0.16
981	0.17
982	0.15
983	0.16
984	0.16
985	0.14
986	0.13
987	0.12
988	0.12
989	0.13
990	0.15
991	0.16
992	0.17
993	0.18
994	0.2
995	0.2
996	0.21
997	0.2
998	0.19
999	0.21
1000	0.23
1001	0.23
1002	0.21
1003	0.2
1004	0.19
1005	0.18
1006	0.15
1007	0.11
1008	0.08
1009	0.09
1010	0.1
1011	0.1
1012	0.12
1013	0.14
1014	0.21
1015	0.29
1016	0.37
1017	0.4
1018	0.49
1019	0.5
1020	0.57
1021	0.61
1022	0.6
1023	0.61
1024	0.64
1025	0.68
1026	0.62
1027	0.69
1028	0.62
1029	0.58
1030	0.56
1031	0.47
1032	0.44
1033	0.36
1034	0.31
1035	0.23
1036	0.2
1037	0.18
1038	0.15
1039	0.13
1040	0.07
1041	0.05
1042	0.05
1043	0.07
1044	0.07
1045	0.07
1046	0.08
1047	0.08
1048	0.1
1049	0.1
1050	0.11
1051	0.09
1052	0.09
1053	0.09
1054	0.08
1055	0.08
1056	0.06
1057	0.05
1058	0.05
1059	0.04
1060	0.04
1061	0.04
1062	0.05
1063	0.06
1064	0.06
1065	0.06
1066	0.08
1067	0.08
1068	0.09
1069	0.11
1070	0.11
1071	0.12
1072	0.12
1073	0.14
1074	0.2
1075	0.21
1076	0.23
1077	0.27
1078	0.28
1079	0.32
1080	0.42
1081	0.48
1082	0.5
1083	0.56
1084	0.59
1085	0.55

R9PBU9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer