Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9P847

Protein Details
Accession R9P847    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
401-429KYVSCFRRHQHLRQQQQQQQHQQHQQRTFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
281-290RASRAKARKK
Subcellular Location(s) nucl 10, mito_nucl 9.833, cyto_nucl 8.833, mito 8.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015946  KH_dom-like_a/b  
IPR004044  KH_dom_type_2  
IPR009019  KH_sf_prok-type  
IPR001351  Ribosomal_S3_C  
IPR036419  Ribosomal_S3_C_sf  
IPR018280  Ribosomal_S3_CS  
IPR005703  Ribosomal_S3_euk/arc  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0015935  C:small ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF07650  KH_2  
PF00189  Ribosomal_S3_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50823  KH_TYPE_2  
PS00548  RIBOSOMAL_S3  
CDD cd02413  KH-II_40S_S3  
Amino Acid Sequences MQASKGESGTALSKPSKNIEAQRQSSRVHVEFVADGVFAAELNEFFTRELSEEGYSGCEVRVTHARTEIIIRATHTQEVLGDKGRRIRELTALVQKRFKFPDNSLELYAEKVQNRGLHAVAQCESLRYKLLGGLAVRRAAYGVLRFVMESGAKGCEVVISGKLRAARAKSMKFTDGFMIHSGQPVKDFVDEAVRHVLMKQGVLGIKVKIMQGWDPEGRAGKPFPLPDAVTILEPKEEAPILAPVSDANITKVIARPEGDSYEENLIDCCRNASGSQTWEKRASRAKARKKNELADEQSLARRIQIRVILKSNRTVAVKLYSKRRKASADSGLNKEREEERRSLRLQIEQKNSKMADEPTMALGRVRRRRESTAEPAKASKQQRLGLAVARRRFVSGSYYGKYVSCFRRHQHLRQQQQQQQHQQHQQRTFWQTWFRQCASTCGIAMIDGASQSIDARSSLFDFRDCSNLRLKGSKTTVRNVGRKQEPFRHPWWPAYHYIYERRKY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.35
3 0.38
4 0.41
5 0.48
6 0.53
7 0.58
8 0.62
9 0.67
10 0.67
11 0.63
12 0.62
13 0.61
14 0.51
15 0.44
16 0.38
17 0.32
18 0.28
19 0.27
20 0.22
21 0.14
22 0.12
23 0.09
24 0.09
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.05
29 0.08
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.1
34 0.11
35 0.12
36 0.13
37 0.13
38 0.13
39 0.13
40 0.13
41 0.15
42 0.14
43 0.13
44 0.12
45 0.11
46 0.11
47 0.15
48 0.23
49 0.24
50 0.26
51 0.29
52 0.3
53 0.29
54 0.33
55 0.33
56 0.27
57 0.25
58 0.25
59 0.26
60 0.27
61 0.28
62 0.24
63 0.2
64 0.19
65 0.21
66 0.21
67 0.23
68 0.24
69 0.25
70 0.32
71 0.34
72 0.34
73 0.34
74 0.34
75 0.33
76 0.36
77 0.4
78 0.43
79 0.48
80 0.49
81 0.53
82 0.52
83 0.51
84 0.5
85 0.49
86 0.44
87 0.41
88 0.48
89 0.47
90 0.49
91 0.45
92 0.42
93 0.37
94 0.34
95 0.35
96 0.29
97 0.24
98 0.21
99 0.23
100 0.23
101 0.25
102 0.25
103 0.21
104 0.22
105 0.23
106 0.25
107 0.22
108 0.23
109 0.21
110 0.2
111 0.2
112 0.16
113 0.16
114 0.14
115 0.13
116 0.12
117 0.13
118 0.15
119 0.15
120 0.19
121 0.2
122 0.21
123 0.21
124 0.18
125 0.18
126 0.15
127 0.16
128 0.12
129 0.11
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.1
146 0.11
147 0.12
148 0.14
149 0.15
150 0.16
151 0.19
152 0.2
153 0.25
154 0.31
155 0.34
156 0.37
157 0.39
158 0.41
159 0.38
160 0.37
161 0.33
162 0.26
163 0.24
164 0.2
165 0.19
166 0.16
167 0.19
168 0.18
169 0.15
170 0.15
171 0.14
172 0.13
173 0.11
174 0.12
175 0.09
176 0.16
177 0.16
178 0.17
179 0.19
180 0.18
181 0.18
182 0.17
183 0.2
184 0.12
185 0.12
186 0.11
187 0.1
188 0.11
189 0.12
190 0.13
191 0.1
192 0.11
193 0.12
194 0.12
195 0.1
196 0.1
197 0.11
198 0.11
199 0.15
200 0.15
201 0.14
202 0.15
203 0.16
204 0.15
205 0.15
206 0.14
207 0.12
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.16
212 0.16
213 0.14
214 0.16
215 0.15
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.07
223 0.06
224 0.05
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.05
231 0.07
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.11
242 0.11
243 0.12
244 0.13
245 0.14
246 0.13
247 0.14
248 0.14
249 0.14
250 0.12
251 0.11
252 0.11
253 0.09
254 0.09
255 0.07
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.09
260 0.11
261 0.14
262 0.22
263 0.24
264 0.26
265 0.31
266 0.32
267 0.33
268 0.39
269 0.4
270 0.44
271 0.52
272 0.6
273 0.64
274 0.7
275 0.75
276 0.73
277 0.74
278 0.7
279 0.68
280 0.62
281 0.55
282 0.51
283 0.42
284 0.38
285 0.33
286 0.26
287 0.2
288 0.19
289 0.16
290 0.18
291 0.22
292 0.24
293 0.26
294 0.33
295 0.36
296 0.34
297 0.37
298 0.36
299 0.34
300 0.31
301 0.28
302 0.23
303 0.26
304 0.3
305 0.31
306 0.4
307 0.45
308 0.5
309 0.53
310 0.55
311 0.53
312 0.53
313 0.57
314 0.56
315 0.57
316 0.56
317 0.59
318 0.6
319 0.56
320 0.5
321 0.44
322 0.4
323 0.36
324 0.36
325 0.35
326 0.35
327 0.41
328 0.43
329 0.46
330 0.43
331 0.45
332 0.48
333 0.51
334 0.56
335 0.55
336 0.54
337 0.54
338 0.52
339 0.45
340 0.4
341 0.33
342 0.28
343 0.24
344 0.23
345 0.2
346 0.21
347 0.2
348 0.18
349 0.2
350 0.25
351 0.32
352 0.36
353 0.4
354 0.45
355 0.51
356 0.56
357 0.6
358 0.62
359 0.64
360 0.63
361 0.58
362 0.56
363 0.54
364 0.54
365 0.5
366 0.46
367 0.42
368 0.41
369 0.42
370 0.43
371 0.42
372 0.4
373 0.44
374 0.44
375 0.41
376 0.39
377 0.36
378 0.34
379 0.32
380 0.27
381 0.25
382 0.25
383 0.28
384 0.29
385 0.29
386 0.29
387 0.29
388 0.3
389 0.32
390 0.33
391 0.35
392 0.39
393 0.41
394 0.51
395 0.59
396 0.66
397 0.7
398 0.72
399 0.75
400 0.78
401 0.85
402 0.8
403 0.83
404 0.83
405 0.82
406 0.81
407 0.8
408 0.8
409 0.78
410 0.8
411 0.77
412 0.72
413 0.7
414 0.67
415 0.62
416 0.58
417 0.58
418 0.57
419 0.59
420 0.62
421 0.56
422 0.55
423 0.51
424 0.51
425 0.47
426 0.43
427 0.34
428 0.27
429 0.25
430 0.2
431 0.19
432 0.14
433 0.09
434 0.07
435 0.06
436 0.05
437 0.05
438 0.06
439 0.06
440 0.07
441 0.06
442 0.07
443 0.09
444 0.12
445 0.15
446 0.16
447 0.17
448 0.19
449 0.21
450 0.29
451 0.29
452 0.29
453 0.35
454 0.38
455 0.4
456 0.45
457 0.45
458 0.46
459 0.51
460 0.57
461 0.54
462 0.57
463 0.63
464 0.65
465 0.72
466 0.69
467 0.72
468 0.73
469 0.76
470 0.77
471 0.78
472 0.76
473 0.75
474 0.73
475 0.72
476 0.67
477 0.67
478 0.65
479 0.6
480 0.58
481 0.58
482 0.6
483 0.56
484 0.63