Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9PE76

Protein Details
Accession R9PE76    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-34VYNTSRTTRQILRRHRKDKPSLILHLHNHydrophilic
387-412ANTSTTKKPPSKKKKKAQREKEEAEAHydrophilic
430-457AAAAAKKPKKKLTKKEREEKERKEKEEKBasic
473-495AANGKGSKPKSKKKQKEEAAAAAHydrophilic
514-535GSPDKDKKSSPKKTAAKKPATAHydrophilic
546-565TPASGKKKTPAKSDKKNAASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
393-536KKPPSKKKKKAQREKEEAEAAAAAEAAKKKAEEEAAAAAAAAKKPKKKLTKKEREEKERKEKEEKEKAEKEEKERKEKEAAANGKGSKPKSKKKQKEEAAAAAAAAEAASKSPAKNAKDAPGSPDKDKKSSPKKTAAKKPATAA
547-561PASGKKKTPAKSDKK
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 9.5, cyto_mito 8.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATTASVYNTSRTTRQILRRHRKDKPSLILHLHNHHFRFERQNGMFLFDSPVKAFLGYIRDQKVPADLIDVLTESGVQFFEGCLLVDVHDHRSHAAASESILGPRELHSISAAGQGRDVVGGTGAEGSGGLASSLFYLQEGGRYGARKLVGGTGSFDPRTGGLGGVEIYRIVLHPTSETLWADIKMLDDMAGGMWTDQEALEVEAKILALTAPPLCLTPDPQATRIANLMLSSTALPSAYIPSHDSPYRSAKKRNANSIEVEKEEANRQRRDKIMRLMQHGHKRGLPTAQAGMPNALARPGSNTVESGGSTSAAATAFVPTFDRMTFIERWRIGRNAALNGGMAAAPLAGAAANGATATNGAAAGTSAKGGKDAAKANDKDEAADAANTSTTKKPPSKKKKKAQREKEEAEAAAAAEAAKKKAEEEAAAAAAAAKKPKKKLTKKEREEKERKEKEEKEKAEKEEKERKEKEAAANGKGSKPKSKKKQKEEAAAAAAAAEAASKSPAKNAKDAPGSPDKDKKSSPKKTAAKKPATAAAATPATSAATPASGKKKTPAKSDKKNAASNANPIAAAGGANGVTDTPTLPNAAVQGTPILGSATPSVQSTPTPAHRAIPSQPQQQQQMQQQQQMQQQLTQQQLQQAALAGMFPNMANQLPFGAAGVSQPGANNGGFGMPMMNGGFPPTSNPQATAAALAAMQGMGLGQFGGAGAGNFGNAAQMQQMMQMMNAGGMVGFNSMPFGAQQGQQGQGQQGQAQQQQGQGQGGDMPVGVGLAGLANWGTGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.49
3 0.56
4 0.64
5 0.71
6 0.79
7 0.85
8 0.88
9 0.9
10 0.9
11 0.9
12 0.89
13 0.86
14 0.83
15 0.81
16 0.8
17 0.75
18 0.73
19 0.71
20 0.68
21 0.61
22 0.58
23 0.54
24 0.5
25 0.54
26 0.5
27 0.53
28 0.47
29 0.52
30 0.47
31 0.49
32 0.44
33 0.35
34 0.36
35 0.28
36 0.29
37 0.23
38 0.24
39 0.19
40 0.18
41 0.17
42 0.15
43 0.19
44 0.21
45 0.28
46 0.3
47 0.32
48 0.32
49 0.33
50 0.33
51 0.29
52 0.25
53 0.21
54 0.18
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.13
59 0.11
60 0.11
61 0.07
62 0.08
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.05
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.12
74 0.14
75 0.17
76 0.19
77 0.19
78 0.19
79 0.2
80 0.2
81 0.18
82 0.18
83 0.13
84 0.12
85 0.16
86 0.16
87 0.16
88 0.17
89 0.15
90 0.14
91 0.15
92 0.17
93 0.13
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.2
99 0.22
100 0.18
101 0.18
102 0.18
103 0.17
104 0.16
105 0.15
106 0.08
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.04
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.09
127 0.11
128 0.12
129 0.15
130 0.16
131 0.17
132 0.19
133 0.2
134 0.18
135 0.17
136 0.2
137 0.19
138 0.18
139 0.21
140 0.21
141 0.24
142 0.24
143 0.23
144 0.18
145 0.17
146 0.18
147 0.15
148 0.12
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.1
163 0.11
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.15
168 0.15
169 0.15
170 0.14
171 0.13
172 0.1
173 0.1
174 0.08
175 0.07
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.06
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.05
196 0.04
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.08
203 0.09
204 0.11
205 0.14
206 0.22
207 0.24
208 0.25
209 0.3
210 0.29
211 0.3
212 0.28
213 0.24
214 0.17
215 0.15
216 0.14
217 0.08
218 0.09
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.08
226 0.07
227 0.09
228 0.12
229 0.13
230 0.17
231 0.18
232 0.19
233 0.21
234 0.31
235 0.38
236 0.41
237 0.47
238 0.52
239 0.61
240 0.66
241 0.73
242 0.69
243 0.64
244 0.63
245 0.62
246 0.57
247 0.47
248 0.42
249 0.32
250 0.28
251 0.31
252 0.33
253 0.33
254 0.36
255 0.38
256 0.41
257 0.47
258 0.52
259 0.52
260 0.54
261 0.56
262 0.55
263 0.59
264 0.61
265 0.62
266 0.65
267 0.62
268 0.55
269 0.49
270 0.45
271 0.41
272 0.37
273 0.3
274 0.23
275 0.21
276 0.21
277 0.21
278 0.19
279 0.18
280 0.15
281 0.14
282 0.12
283 0.1
284 0.08
285 0.06
286 0.09
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.13
291 0.13
292 0.14
293 0.14
294 0.11
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.06
299 0.06
300 0.05
301 0.06
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.07
310 0.09
311 0.08
312 0.12
313 0.16
314 0.17
315 0.23
316 0.24
317 0.27
318 0.28
319 0.29
320 0.26
321 0.25
322 0.26
323 0.21
324 0.2
325 0.17
326 0.14
327 0.13
328 0.12
329 0.09
330 0.06
331 0.04
332 0.03
333 0.03
334 0.02
335 0.02
336 0.02
337 0.02
338 0.02
339 0.02
340 0.02
341 0.02
342 0.02
343 0.02
344 0.02
345 0.02
346 0.03
347 0.03
348 0.02
349 0.02
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.07
359 0.11
360 0.14
361 0.17
362 0.24
363 0.24
364 0.25
365 0.29
366 0.27
367 0.24
368 0.21
369 0.19
370 0.12
371 0.11
372 0.11
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.09
378 0.1
379 0.15
380 0.21
381 0.29
382 0.4
383 0.52
384 0.61
385 0.7
386 0.79
387 0.85
388 0.9
389 0.93
390 0.93
391 0.92
392 0.91
393 0.83
394 0.78
395 0.69
396 0.58
397 0.47
398 0.36
399 0.25
400 0.15
401 0.11
402 0.06
403 0.05
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.07
409 0.09
410 0.09
411 0.08
412 0.09
413 0.1
414 0.1
415 0.1
416 0.09
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.11
421 0.12
422 0.16
423 0.21
424 0.29
425 0.39
426 0.49
427 0.59
428 0.67
429 0.75
430 0.82
431 0.87
432 0.89
433 0.9
434 0.89
435 0.88
436 0.88
437 0.85
438 0.81
439 0.8
440 0.78
441 0.77
442 0.78
443 0.73
444 0.71
445 0.69
446 0.69
447 0.69
448 0.65
449 0.63
450 0.63
451 0.63
452 0.64
453 0.6
454 0.59
455 0.55
456 0.56
457 0.52
458 0.51
459 0.49
460 0.42
461 0.44
462 0.42
463 0.4
464 0.39
465 0.36
466 0.36
467 0.41
468 0.48
469 0.55
470 0.65
471 0.71
472 0.77
473 0.86
474 0.85
475 0.86
476 0.82
477 0.76
478 0.67
479 0.57
480 0.46
481 0.35
482 0.27
483 0.16
484 0.1
485 0.05
486 0.02
487 0.03
488 0.04
489 0.05
490 0.05
491 0.1
492 0.17
493 0.19
494 0.24
495 0.27
496 0.32
497 0.37
498 0.37
499 0.38
500 0.41
501 0.42
502 0.42
503 0.47
504 0.43
505 0.42
506 0.45
507 0.5
508 0.52
509 0.58
510 0.62
511 0.65
512 0.7
513 0.76
514 0.83
515 0.83
516 0.8
517 0.74
518 0.7
519 0.65
520 0.58
521 0.48
522 0.38
523 0.32
524 0.25
525 0.21
526 0.18
527 0.12
528 0.11
529 0.11
530 0.11
531 0.06
532 0.06
533 0.07
534 0.12
535 0.19
536 0.2
537 0.21
538 0.28
539 0.36
540 0.4
541 0.5
542 0.57
543 0.6
544 0.68
545 0.78
546 0.8
547 0.8
548 0.8
549 0.73
550 0.7
551 0.62
552 0.57
553 0.5
554 0.41
555 0.33
556 0.28
557 0.24
558 0.16
559 0.13
560 0.08
561 0.05
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.05
569 0.05
570 0.06
571 0.07
572 0.07
573 0.07
574 0.08
575 0.09
576 0.08
577 0.08
578 0.08
579 0.07
580 0.07
581 0.07
582 0.07
583 0.06
584 0.07
585 0.07
586 0.08
587 0.08
588 0.09
589 0.09
590 0.1
591 0.1
592 0.12
593 0.16
594 0.2
595 0.24
596 0.24
597 0.28
598 0.29
599 0.32
600 0.34
601 0.39
602 0.41
603 0.46
604 0.51
605 0.52
606 0.56
607 0.57
608 0.6
609 0.58
610 0.61
611 0.57
612 0.57
613 0.56
614 0.57
615 0.57
616 0.56
617 0.48
618 0.4
619 0.4
620 0.4
621 0.4
622 0.36
623 0.33
624 0.3
625 0.32
626 0.29
627 0.25
628 0.21
629 0.17
630 0.14
631 0.13
632 0.09
633 0.07
634 0.07
635 0.06
636 0.06
637 0.07
638 0.08
639 0.07
640 0.07
641 0.08
642 0.08
643 0.08
644 0.07
645 0.06
646 0.06
647 0.06
648 0.08
649 0.07
650 0.07
651 0.08
652 0.09
653 0.11
654 0.1
655 0.1
656 0.09
657 0.08
658 0.08
659 0.08
660 0.07
661 0.05
662 0.06
663 0.07
664 0.07
665 0.06
666 0.08
667 0.09
668 0.08
669 0.12
670 0.16
671 0.21
672 0.22
673 0.23
674 0.24
675 0.26
676 0.26
677 0.23
678 0.18
679 0.14
680 0.13
681 0.11
682 0.08
683 0.06
684 0.05
685 0.04
686 0.03
687 0.03
688 0.03
689 0.03
690 0.02
691 0.03
692 0.03
693 0.03
694 0.03
695 0.03
696 0.05
697 0.05
698 0.05
699 0.05
700 0.05
701 0.06
702 0.05
703 0.06
704 0.06
705 0.07
706 0.07
707 0.09
708 0.11
709 0.1
710 0.1
711 0.1
712 0.1
713 0.09
714 0.09
715 0.07
716 0.05
717 0.05
718 0.05
719 0.05
720 0.05
721 0.05
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.06
726 0.09
727 0.11
728 0.13
729 0.18
730 0.2
731 0.23
732 0.25
733 0.27
734 0.26
735 0.27
736 0.26
737 0.24
738 0.25
739 0.29
740 0.31
741 0.33
742 0.33
743 0.33
744 0.35
745 0.35
746 0.33
747 0.26
748 0.23
749 0.21
750 0.19
751 0.15
752 0.12
753 0.09
754 0.07
755 0.07
756 0.06
757 0.04
758 0.04
759 0.03
760 0.03
761 0.04
762 0.04