Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9PCH1

Protein Details
Accession R9PCH1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
379-403EDAGPVQKKKEKKINPRNAHFYTKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
387-391KKEKK
422-429KKQKAAAK
Subcellular Location(s) cyto 20, cyto_nucl 12.666, cyto_mito 12.166, mito_nucl 4.166, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR002307  Tyr-tRNA-ligase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004831  F:tyrosine-tRNA ligase activity  
GO:0006437  P:tyrosyl-tRNA aminoacylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
Amino Acid Sequences MSSQATLSAAERFSLITRDLDEVLGADIIKSVLEKDERPLSAYWGTAPTGRPHVGYLVPLTKIADFLRAGVEVKILLADIHAFLDNLKAPIELVRHRVNYYRHVLTAVFKAIGVPTDRLVFVVGSSYQLTEAYNMDNYRLCASVTEHDAKKAGAEVVKQVASPLLSGLLYPGLQALDEQYLGVDMQFGGVDQRKIFTFAEQYLPKLGYTKRAHLMNAMVPGLKGSKMSSSDNSSKIDFLDTPKEVSKKIADAVCAPGEIDGNGVLGFVRAVLFPIARLRVESETMGTPVSEAQGASRSFVAQDAPKGTMFSIVRSEKYGGSLHYDDYSKLESDYATGAIHPADLKKAVAEAISTLLEPVQKLFETDAEFKKAKEDAYPEDAGPVQKKKEKKINPRNAHFYTKEEGGTAETKEEALRNQKEDKKQKAAAKAQKQPEPRLPADKDEAKATPKDEENETFVEATRAGLDNVDLNKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.15
4 0.16
5 0.19
6 0.19
7 0.18
8 0.17
9 0.14
10 0.14
11 0.13
12 0.1
13 0.08
14 0.07
15 0.07
16 0.07
17 0.07
18 0.07
19 0.11
20 0.14
21 0.16
22 0.2
23 0.28
24 0.29
25 0.31
26 0.31
27 0.31
28 0.3
29 0.29
30 0.26
31 0.21
32 0.22
33 0.22
34 0.23
35 0.23
36 0.27
37 0.27
38 0.26
39 0.25
40 0.27
41 0.25
42 0.24
43 0.25
44 0.23
45 0.22
46 0.22
47 0.22
48 0.19
49 0.21
50 0.19
51 0.19
52 0.15
53 0.15
54 0.16
55 0.16
56 0.17
57 0.15
58 0.15
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.07
63 0.06
64 0.05
65 0.06
66 0.06
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.1
76 0.1
77 0.13
78 0.17
79 0.18
80 0.22
81 0.28
82 0.29
83 0.31
84 0.38
85 0.38
86 0.41
87 0.45
88 0.42
89 0.36
90 0.35
91 0.35
92 0.31
93 0.31
94 0.26
95 0.19
96 0.16
97 0.16
98 0.15
99 0.16
100 0.15
101 0.13
102 0.12
103 0.13
104 0.13
105 0.13
106 0.14
107 0.11
108 0.09
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.12
121 0.11
122 0.13
123 0.14
124 0.14
125 0.15
126 0.14
127 0.13
128 0.11
129 0.13
130 0.15
131 0.19
132 0.24
133 0.23
134 0.24
135 0.25
136 0.23
137 0.21
138 0.2
139 0.17
140 0.12
141 0.13
142 0.14
143 0.16
144 0.17
145 0.16
146 0.15
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.08
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.05
176 0.07
177 0.09
178 0.08
179 0.1
180 0.1
181 0.13
182 0.13
183 0.12
184 0.13
185 0.14
186 0.2
187 0.2
188 0.2
189 0.19
190 0.19
191 0.18
192 0.19
193 0.18
194 0.21
195 0.23
196 0.27
197 0.3
198 0.31
199 0.31
200 0.29
201 0.31
202 0.23
203 0.23
204 0.19
205 0.14
206 0.12
207 0.12
208 0.11
209 0.09
210 0.07
211 0.06
212 0.08
213 0.1
214 0.12
215 0.14
216 0.19
217 0.23
218 0.25
219 0.26
220 0.24
221 0.22
222 0.2
223 0.19
224 0.15
225 0.13
226 0.16
227 0.15
228 0.16
229 0.19
230 0.19
231 0.18
232 0.2
233 0.18
234 0.15
235 0.18
236 0.17
237 0.15
238 0.15
239 0.18
240 0.16
241 0.15
242 0.13
243 0.1
244 0.09
245 0.08
246 0.07
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.07
262 0.09
263 0.08
264 0.09
265 0.11
266 0.12
267 0.13
268 0.13
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.13
288 0.09
289 0.11
290 0.12
291 0.14
292 0.14
293 0.14
294 0.14
295 0.18
296 0.17
297 0.16
298 0.21
299 0.21
300 0.22
301 0.23
302 0.25
303 0.19
304 0.22
305 0.22
306 0.15
307 0.19
308 0.2
309 0.18
310 0.19
311 0.19
312 0.17
313 0.18
314 0.19
315 0.14
316 0.13
317 0.13
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.1
322 0.08
323 0.07
324 0.08
325 0.07
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.09
336 0.08
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.09
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.12
351 0.16
352 0.22
353 0.24
354 0.28
355 0.29
356 0.28
357 0.31
358 0.3
359 0.26
360 0.25
361 0.27
362 0.26
363 0.32
364 0.34
365 0.3
366 0.3
367 0.31
368 0.29
369 0.3
370 0.29
371 0.29
372 0.33
373 0.39
374 0.46
375 0.55
376 0.63
377 0.69
378 0.76
379 0.81
380 0.86
381 0.89
382 0.89
383 0.84
384 0.82
385 0.73
386 0.66
387 0.59
388 0.51
389 0.43
390 0.34
391 0.29
392 0.24
393 0.24
394 0.2
395 0.17
396 0.14
397 0.14
398 0.15
399 0.16
400 0.18
401 0.25
402 0.29
403 0.33
404 0.42
405 0.49
406 0.58
407 0.67
408 0.71
409 0.7
410 0.73
411 0.76
412 0.77
413 0.8
414 0.8
415 0.8
416 0.8
417 0.79
418 0.79
419 0.79
420 0.77
421 0.75
422 0.73
423 0.68
424 0.68
425 0.63
426 0.62
427 0.63
428 0.61
429 0.54
430 0.51
431 0.49
432 0.44
433 0.44
434 0.4
435 0.38
436 0.37
437 0.38
438 0.39
439 0.39
440 0.39
441 0.38
442 0.38
443 0.32
444 0.27
445 0.25
446 0.2
447 0.17
448 0.15
449 0.14
450 0.12
451 0.12
452 0.12
453 0.16