FuNGI

R9P8X8

Protein Details

Accession

R9P8X8

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-36	TDPSQKVRTQQTTKAQQQDK	Hydrophilic
89-115	ASDNAAKQPKKQPKKDAPKAQMPRPGQ	Hydrophilic
372-401	AARAEEKAKAKKNKKKEKAKAKEKARAAPG	Basic
410-437	QGGAQEKPLKKDKNKKRKGKAADAADTP	Hydrophilic
483-509	GGGESKAKAKNKPPRKNGAAKDKEKSA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
96-112	QPKKQPKKDAPKAQMPR
308-322	GKEKEKEAKLAAGKA
330-430	RAVKMAKLESAAAIKKAKKMEKAKAKAVAAGNTSGAAAGSSAAARAEEKAKAKKNKKKEKAKAKEKARAAPGVGDGAKGEQGGAQEKPLKKDKNKKRKGKA
484-507	GGESKAKAKNKPPRKNGAAKDKEK

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 13.333, nucl 12, cyto 11.5, mito_nucl 7.499

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MPQSEAGPSAVVYATATDPSQKVRTQQTTKAQQQDKAVDNRAKAQQNKERAAQNRAQKAHKVSFAEDRAVAASNADGAQPSKPTNTTSASDNAAKQPKKQPKKDAPKAQMPRPGQAPSSFKSKVVIRRLPPNLPEEILWKAVSPWIRDAKDCQALDASTAADTPAQAGSETTSPAPPASTAATVDFKKFVAGKLKTDANKQSKHARAYVRFLDPQSLVQFHKAFDGHIFRDSKGKESVAIVEFAPYQKVVLPPAASVQRGRKAKPDPKQGTIEKDADYQSFLERLGNAGDDVKRSEGDLLASLHDPKGKEKEKEAKLAAGKATPLLLHLRAVKMAKLESAAAIKKAKKMEKAKAKAVAAGNTSGAAAGSSAAARAEEKAKAKKNKKKEKAKAKEKARAAPGVGDGAKGEQGGAQEKPLKKDKNKKRKGKAADAADTPPNAAQGSTAKQPSTSKVSKKPDTKPGVVAAAAGAPGKTTDPQGGGGGGESKAKAKNKPPRKNGAAKDKEKSATTSNTGAPAQPAKVQILKRD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.11
3	0.11
4	0.13
5	0.14
6	0.2
7	0.24
8	0.25
9	0.3
10	0.39
11	0.49
12	0.52
13	0.6
14	0.65
15	0.71
16	0.77
17	0.81
18	0.76
19	0.71
20	0.71
21	0.7
22	0.67
23	0.64
24	0.65
25	0.59
26	0.56
27	0.58
28	0.59
29	0.6
30	0.58
31	0.61
32	0.61
33	0.66
34	0.69
35	0.68
36	0.68
37	0.66
38	0.67
39	0.64
40	0.64
41	0.64
42	0.65
43	0.63
44	0.62
45	0.64
46	0.63
47	0.62
48	0.56
49	0.5
50	0.53
51	0.52
52	0.48
53	0.4
54	0.34
55	0.3
56	0.28
57	0.24
58	0.15
59	0.12
60	0.1
61	0.1
62	0.09
63	0.09
64	0.08
65	0.1
66	0.12
67	0.14
68	0.16
69	0.17
70	0.19
71	0.22
72	0.26
73	0.26
74	0.27
75	0.28
76	0.29
77	0.31
78	0.31
79	0.35
80	0.4
81	0.4
82	0.42
83	0.5
84	0.57
85	0.64
86	0.71
87	0.74
88	0.76
89	0.86
90	0.9
91	0.91
92	0.88
93	0.88
94	0.87
95	0.83
96	0.81
97	0.72
98	0.66
99	0.6
100	0.54
101	0.46
102	0.44
103	0.41
104	0.35
105	0.4
106	0.37
107	0.33
108	0.34
109	0.38
110	0.4
111	0.45
112	0.51
113	0.47
114	0.56
115	0.61
116	0.62
117	0.59
118	0.53
119	0.46
120	0.39
121	0.36
122	0.28
123	0.25
124	0.22
125	0.19
126	0.16
127	0.14
128	0.16
129	0.18
130	0.18
131	0.21
132	0.27
133	0.28
134	0.29
135	0.33
136	0.37
137	0.42
138	0.4
139	0.35
140	0.29
141	0.28
142	0.27
143	0.24
144	0.17
145	0.09
146	0.09
147	0.08
148	0.06
149	0.06
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.06
154	0.06
155	0.07
156	0.08
157	0.09
158	0.09
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.08
164	0.09
165	0.09
166	0.09
167	0.09
168	0.11
169	0.15
170	0.15
171	0.16
172	0.16
173	0.14
174	0.15
175	0.15
176	0.16
177	0.22
178	0.23
179	0.25
180	0.28
181	0.34
182	0.34
183	0.39
184	0.45
185	0.43
186	0.45
187	0.46
188	0.51
189	0.52
190	0.53
191	0.53
192	0.52
193	0.48
194	0.5
195	0.51
196	0.46
197	0.43
198	0.4
199	0.37
200	0.3
201	0.28
202	0.24
203	0.22
204	0.18
205	0.19
206	0.2
207	0.16
208	0.19
209	0.17
210	0.15
211	0.16
212	0.19
213	0.17
214	0.21
215	0.22
216	0.2
217	0.26
218	0.26
219	0.25
220	0.24
221	0.23
222	0.19
223	0.18
224	0.21
225	0.16
226	0.17
227	0.13
228	0.12
229	0.12
230	0.11
231	0.11
232	0.07
233	0.06
234	0.07
235	0.08
236	0.08
237	0.09
238	0.09
239	0.09
240	0.12
241	0.13
242	0.12
243	0.14
244	0.17
245	0.23
246	0.25
247	0.26
248	0.3
249	0.38
250	0.45
251	0.51
252	0.58
253	0.55
254	0.57
255	0.63
256	0.59
257	0.55
258	0.52
259	0.46
260	0.35
261	0.33
262	0.3
263	0.23
264	0.21
265	0.16
266	0.12
267	0.11
268	0.1
269	0.08
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.06
275	0.08
276	0.08
277	0.08
278	0.09
279	0.09
280	0.09
281	0.09
282	0.1
283	0.08
284	0.08
285	0.09
286	0.08
287	0.09
288	0.1
289	0.1
290	0.1
291	0.12
292	0.12
293	0.13
294	0.21
295	0.25
296	0.27
297	0.33
298	0.43
299	0.44
300	0.51
301	0.49
302	0.45
303	0.42
304	0.43
305	0.37
306	0.28
307	0.24
308	0.17
309	0.17
310	0.11
311	0.11
312	0.1
313	0.09
314	0.11
315	0.12
316	0.12
317	0.15
318	0.16
319	0.15
320	0.14
321	0.14
322	0.13
323	0.12
324	0.12
325	0.1
326	0.13
327	0.13
328	0.14
329	0.19
330	0.2
331	0.24
332	0.3
333	0.33
334	0.39
335	0.46
336	0.53
337	0.59
338	0.63
339	0.65
340	0.65
341	0.62
342	0.58
343	0.53
344	0.46
345	0.37
346	0.31
347	0.25
348	0.19
349	0.18
350	0.12
351	0.09
352	0.06
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.05
361	0.07
362	0.09
363	0.13
364	0.19
365	0.27
366	0.36
367	0.46
368	0.56
369	0.64
370	0.72
371	0.8
372	0.85
373	0.88
374	0.9
375	0.91
376	0.92
377	0.94
378	0.93
379	0.91
380	0.89
381	0.84
382	0.81
383	0.75
384	0.67
385	0.57
386	0.5
387	0.41
388	0.36
389	0.3
390	0.22
391	0.18
392	0.15
393	0.14
394	0.11
395	0.1
396	0.07
397	0.09
398	0.11
399	0.11
400	0.15
401	0.21
402	0.24
403	0.3
404	0.38
405	0.45
406	0.52
407	0.62
408	0.7
409	0.74
410	0.82
411	0.87
412	0.89
413	0.91
414	0.91
415	0.91
416	0.88
417	0.86
418	0.81
419	0.74
420	0.67
421	0.59
422	0.5
423	0.4
424	0.31
425	0.23
426	0.17
427	0.14
428	0.11
429	0.12
430	0.16
431	0.21
432	0.23
433	0.22
434	0.25
435	0.27
436	0.31
437	0.36
438	0.4
439	0.42
440	0.49
441	0.59
442	0.66
443	0.72
444	0.76
445	0.77
446	0.78
447	0.73
448	0.68
449	0.62
450	0.56
451	0.47
452	0.39
453	0.29
454	0.21
455	0.18
456	0.14
457	0.1
458	0.07
459	0.07
460	0.09
461	0.09
462	0.11
463	0.13
464	0.14
465	0.16
466	0.16
467	0.16
468	0.15
469	0.14
470	0.15
471	0.13
472	0.14
473	0.13
474	0.15
475	0.22
476	0.27
477	0.33
478	0.41
479	0.51
480	0.6
481	0.71
482	0.77
483	0.81
484	0.85
485	0.88
486	0.88
487	0.88
488	0.88
489	0.85
490	0.81
491	0.78
492	0.73
493	0.65
494	0.6
495	0.54
496	0.5
497	0.47
498	0.46
499	0.4
500	0.41
501	0.39
502	0.36
503	0.34
504	0.31
505	0.29
506	0.28
507	0.29
508	0.29
509	0.34

R9P8X8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer