Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9PAM5

Protein Details
Accession R9PAM5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
347-372LVRAQGRKGFRVKHRKPKIILFKAVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
352-364GRKGFRVKHRKPK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 9.5, nucl 9, cyto 8, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR007216  CNOT9  
Gene Ontology GO:0030014  C:CCR4-NOT complex  
GO:0006402  P:mRNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF04078  Rcd1  
Amino Acid Sequences MLQSPGPMLSNGLVDGNNPNGISNGSSGAPPPGMGGSLAGVDLGPSMLSAAGPPPNAGPTMPAGTGPGGTPTTALSVYHLITQLCQRPEPNATNRKQGSASPPTANKATSIPADGTAAKNGDAQSNQSNGDREGATSPSELDNLPGSSAQREHALLELSKKREQYEDLALVLWHSFGVMSSLLQEIVSVYPLLSPPALTAQASNRVCNALALLQCVASHSETRGLFLQAHIPLFLYPFLNTTSKTRPFEYLRLTSLGVIGALVKQNDNSDVITFLLSTEIIPLCLRIMETGSELSKTVAIFIVQKILLDDMGLAYICQTYERFYAVGTVLSNMVSQIVESQAAVSGLVRAQGRKGFRVKHRKPKIILFKAVAEDVIAISRSPRRQSTKFVQCNLILCLQLDSFFWKKLSDVSTLIMSGLVNAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.15
3 0.16
4 0.16
5 0.15
6 0.15
7 0.14
8 0.15
9 0.15
10 0.13
11 0.13
12 0.12
13 0.12
14 0.13
15 0.14
16 0.14
17 0.12
18 0.12
19 0.1
20 0.1
21 0.1
22 0.09
23 0.08
24 0.08
25 0.08
26 0.06
27 0.06
28 0.05
29 0.05
30 0.05
31 0.04
32 0.03
33 0.04
34 0.04
35 0.04
36 0.05
37 0.07
38 0.1
39 0.11
40 0.11
41 0.12
42 0.13
43 0.14
44 0.14
45 0.13
46 0.13
47 0.16
48 0.15
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.15
53 0.13
54 0.13
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.1
63 0.12
64 0.13
65 0.15
66 0.16
67 0.14
68 0.15
69 0.21
70 0.25
71 0.25
72 0.27
73 0.25
74 0.27
75 0.34
76 0.4
77 0.44
78 0.47
79 0.48
80 0.56
81 0.56
82 0.55
83 0.5
84 0.47
85 0.45
86 0.44
87 0.45
88 0.41
89 0.42
90 0.43
91 0.43
92 0.39
93 0.32
94 0.25
95 0.24
96 0.19
97 0.19
98 0.16
99 0.15
100 0.17
101 0.16
102 0.16
103 0.15
104 0.15
105 0.13
106 0.15
107 0.15
108 0.15
109 0.15
110 0.17
111 0.18
112 0.19
113 0.2
114 0.2
115 0.21
116 0.18
117 0.2
118 0.17
119 0.15
120 0.15
121 0.15
122 0.14
123 0.13
124 0.13
125 0.11
126 0.12
127 0.11
128 0.1
129 0.11
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.13
142 0.12
143 0.18
144 0.23
145 0.25
146 0.28
147 0.28
148 0.28
149 0.29
150 0.3
151 0.28
152 0.28
153 0.26
154 0.23
155 0.22
156 0.21
157 0.19
158 0.17
159 0.12
160 0.06
161 0.04
162 0.03
163 0.03
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.07
185 0.06
186 0.07
187 0.09
188 0.18
189 0.18
190 0.18
191 0.17
192 0.17
193 0.17
194 0.16
195 0.15
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.11
208 0.11
209 0.13
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.13
214 0.16
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.11
222 0.07
223 0.06
224 0.07
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.14
229 0.21
230 0.27
231 0.29
232 0.29
233 0.33
234 0.36
235 0.4
236 0.42
237 0.38
238 0.34
239 0.33
240 0.32
241 0.26
242 0.23
243 0.17
244 0.11
245 0.08
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.09
254 0.1
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.07
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.08
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.11
283 0.1
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.1
288 0.1
289 0.13
290 0.11
291 0.12
292 0.11
293 0.11
294 0.1
295 0.09
296 0.08
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.06
306 0.08
307 0.09
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.13
312 0.12
313 0.13
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.08
320 0.08
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.1
335 0.11
336 0.11
337 0.14
338 0.19
339 0.23
340 0.28
341 0.35
342 0.4
343 0.5
344 0.61
345 0.68
346 0.74
347 0.82
348 0.84
349 0.83
350 0.85
351 0.86
352 0.83
353 0.8
354 0.72
355 0.66
356 0.59
357 0.54
358 0.43
359 0.32
360 0.23
361 0.16
362 0.14
363 0.1
364 0.08
365 0.1
366 0.17
367 0.22
368 0.27
369 0.35
370 0.42
371 0.46
372 0.55
373 0.63
374 0.68
375 0.71
376 0.71
377 0.69
378 0.63
379 0.62
380 0.56
381 0.49
382 0.38
383 0.3
384 0.27
385 0.21
386 0.19
387 0.17
388 0.19
389 0.19
390 0.21
391 0.21
392 0.19
393 0.2
394 0.25
395 0.28
396 0.25
397 0.25
398 0.25
399 0.26
400 0.26
401 0.25
402 0.2
403 0.16