Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9PDZ6

Protein Details
Accession R9PDZ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
589-615TRQLQVLRFKEKKKRERAAKRCCVCDCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
596-608RFKEKKKRERAAK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001781  Znf_LIM  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00412  LIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00478  LIM_DOMAIN_1  
PS50023  LIM_DOMAIN_2  
CDD cd08368  LIM  
cd09397  LIM1_UF1  
Amino Acid Sequences MGSDNMAGFGARRFMQDMYQQQHNYPQQSGNDHRHHHHQANHSSTDASYRRNQDRRAHAPFHGNTNHSYHHSPPTQLNALPATTSRSTSSSHHTAAADIPRYPQQARHEVRYAQAAHNHQARAAGDDAAVDSRKDATSAAAWRSDGLDSSATDSTARLAYERSGDSNYSLSEQSNSVQTARPNARAQIPQIRLEDRTTIYDDDYEEPATLPTVDPTDVTANPSHPPAGALLDDVSADASFKIVRATVLEPDLPKAKCADCGEQLDFEELANHTCQPSSAVRPPLLTIQLPASSSDSSVSSSATSSALTTPRSPFFDRYDSLVNDSRPMSPVVFAKATHTDARRGGDPDDATPKAHAVRVVGMQAAFKVSPSKASCSPAQGEISPPLQPPSVQRSASDTQADAVARRKMIEEQRAAKVKHTMTSPIPRAATTSSLVQQSILTEDLSRSASVGASPSAVRTVKAVSPTTSKPRLAESRTSPDAESFEQSGPSAKGSGTSIRASPSPTASKLPRERGHVDLSSIEEMMKDLTASPEPLKRTLVDSPQRLGQKGTVAADASQRPRAAAPSGERSDRERLLELELERMRDRERTRQLQVLRFKEKKKRERAAKRCCVCDCSLSSSRTPFVERDGKLLCARDWKELYLPKCRKCNLIVEKGAVKSSDGALRGVFHRSCFSCAACEAPFTDGSFYVFNNQPYCSRHYHRLNGSLCRECETGIEGDCRQTDAGDRFHPTCFCCQYSSSKRGACAEPLADYYVVGGQRLCERHADKVSRKLVRAGQKQVDLRAQKRMTMLHSLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.22
3 0.29
4 0.36
5 0.37
6 0.45
7 0.45
8 0.44
9 0.53
10 0.55
11 0.51
12 0.46
13 0.46
14 0.42
15 0.49
16 0.56
17 0.56
18 0.58
19 0.59
20 0.6
21 0.64
22 0.68
23 0.66
24 0.66
25 0.66
26 0.67
27 0.69
28 0.67
29 0.58
30 0.51
31 0.44
32 0.45
33 0.38
34 0.34
35 0.35
36 0.41
37 0.5
38 0.57
39 0.65
40 0.65
41 0.72
42 0.77
43 0.78
44 0.74
45 0.68
46 0.7
47 0.65
48 0.64
49 0.6
50 0.52
51 0.47
52 0.46
53 0.45
54 0.4
55 0.41
56 0.36
57 0.39
58 0.41
59 0.41
60 0.4
61 0.44
62 0.44
63 0.41
64 0.41
65 0.34
66 0.31
67 0.28
68 0.25
69 0.24
70 0.21
71 0.22
72 0.2
73 0.2
74 0.22
75 0.24
76 0.31
77 0.32
78 0.32
79 0.33
80 0.32
81 0.31
82 0.34
83 0.37
84 0.32
85 0.27
86 0.28
87 0.29
88 0.33
89 0.33
90 0.34
91 0.35
92 0.43
93 0.47
94 0.51
95 0.52
96 0.5
97 0.51
98 0.52
99 0.48
100 0.42
101 0.44
102 0.41
103 0.42
104 0.46
105 0.44
106 0.37
107 0.37
108 0.33
109 0.3
110 0.27
111 0.21
112 0.15
113 0.15
114 0.15
115 0.14
116 0.14
117 0.1
118 0.1
119 0.11
120 0.11
121 0.12
122 0.11
123 0.1
124 0.15
125 0.2
126 0.22
127 0.21
128 0.21
129 0.22
130 0.23
131 0.21
132 0.17
133 0.14
134 0.13
135 0.11
136 0.15
137 0.15
138 0.14
139 0.14
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.12
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.15
148 0.16
149 0.17
150 0.17
151 0.18
152 0.19
153 0.19
154 0.18
155 0.17
156 0.16
157 0.15
158 0.14
159 0.14
160 0.14
161 0.16
162 0.16
163 0.15
164 0.17
165 0.18
166 0.25
167 0.28
168 0.33
169 0.32
170 0.34
171 0.38
172 0.38
173 0.42
174 0.43
175 0.42
176 0.42
177 0.43
178 0.42
179 0.38
180 0.37
181 0.36
182 0.28
183 0.27
184 0.25
185 0.23
186 0.21
187 0.2
188 0.2
189 0.19
190 0.19
191 0.17
192 0.14
193 0.13
194 0.13
195 0.12
196 0.11
197 0.08
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.1
203 0.13
204 0.12
205 0.15
206 0.15
207 0.15
208 0.16
209 0.17
210 0.16
211 0.12
212 0.13
213 0.11
214 0.11
215 0.1
216 0.09
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.05
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.08
232 0.1
233 0.11
234 0.13
235 0.15
236 0.15
237 0.17
238 0.23
239 0.2
240 0.19
241 0.2
242 0.19
243 0.23
244 0.26
245 0.28
246 0.26
247 0.31
248 0.31
249 0.3
250 0.3
251 0.26
252 0.22
253 0.18
254 0.15
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.1
263 0.12
264 0.17
265 0.22
266 0.26
267 0.26
268 0.27
269 0.28
270 0.27
271 0.27
272 0.21
273 0.16
274 0.15
275 0.15
276 0.15
277 0.15
278 0.14
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.09
293 0.1
294 0.11
295 0.13
296 0.15
297 0.17
298 0.21
299 0.23
300 0.24
301 0.27
302 0.3
303 0.29
304 0.29
305 0.31
306 0.28
307 0.3
308 0.3
309 0.26
310 0.24
311 0.24
312 0.21
313 0.18
314 0.18
315 0.14
316 0.12
317 0.13
318 0.14
319 0.14
320 0.13
321 0.15
322 0.16
323 0.18
324 0.21
325 0.21
326 0.21
327 0.23
328 0.24
329 0.24
330 0.23
331 0.21
332 0.21
333 0.2
334 0.19
335 0.22
336 0.2
337 0.19
338 0.17
339 0.17
340 0.15
341 0.15
342 0.14
343 0.09
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.1
349 0.09
350 0.08
351 0.09
352 0.07
353 0.06
354 0.08
355 0.07
356 0.12
357 0.14
358 0.18
359 0.19
360 0.22
361 0.23
362 0.24
363 0.26
364 0.22
365 0.22
366 0.19
367 0.17
368 0.17
369 0.17
370 0.15
371 0.14
372 0.13
373 0.12
374 0.12
375 0.13
376 0.18
377 0.22
378 0.21
379 0.21
380 0.26
381 0.28
382 0.29
383 0.27
384 0.2
385 0.15
386 0.17
387 0.17
388 0.11
389 0.13
390 0.13
391 0.12
392 0.12
393 0.13
394 0.16
395 0.21
396 0.26
397 0.28
398 0.3
399 0.36
400 0.42
401 0.41
402 0.38
403 0.38
404 0.33
405 0.31
406 0.28
407 0.26
408 0.24
409 0.31
410 0.32
411 0.3
412 0.29
413 0.26
414 0.26
415 0.24
416 0.22
417 0.15
418 0.15
419 0.14
420 0.14
421 0.14
422 0.13
423 0.12
424 0.1
425 0.1
426 0.09
427 0.07
428 0.06
429 0.06
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.07
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.07
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.11
447 0.12
448 0.15
449 0.16
450 0.15
451 0.19
452 0.23
453 0.29
454 0.32
455 0.31
456 0.28
457 0.33
458 0.38
459 0.37
460 0.4
461 0.38
462 0.41
463 0.43
464 0.43
465 0.38
466 0.32
467 0.31
468 0.26
469 0.22
470 0.17
471 0.15
472 0.14
473 0.14
474 0.14
475 0.13
476 0.12
477 0.1
478 0.08
479 0.09
480 0.1
481 0.13
482 0.13
483 0.14
484 0.14
485 0.15
486 0.16
487 0.17
488 0.17
489 0.18
490 0.18
491 0.19
492 0.23
493 0.24
494 0.33
495 0.37
496 0.45
497 0.44
498 0.48
499 0.49
500 0.48
501 0.51
502 0.43
503 0.37
504 0.29
505 0.28
506 0.22
507 0.19
508 0.15
509 0.1
510 0.09
511 0.09
512 0.07
513 0.05
514 0.05
515 0.06
516 0.07
517 0.09
518 0.11
519 0.15
520 0.17
521 0.18
522 0.19
523 0.18
524 0.21
525 0.24
526 0.31
527 0.34
528 0.35
529 0.36
530 0.4
531 0.41
532 0.38
533 0.35
534 0.27
535 0.24
536 0.23
537 0.23
538 0.18
539 0.17
540 0.17
541 0.2
542 0.22
543 0.22
544 0.23
545 0.21
546 0.21
547 0.21
548 0.22
549 0.2
550 0.2
551 0.22
552 0.27
553 0.3
554 0.31
555 0.32
556 0.34
557 0.38
558 0.35
559 0.33
560 0.27
561 0.25
562 0.26
563 0.28
564 0.25
565 0.27
566 0.26
567 0.26
568 0.25
569 0.25
570 0.24
571 0.27
572 0.3
573 0.32
574 0.4
575 0.45
576 0.49
577 0.55
578 0.59
579 0.61
580 0.66
581 0.64
582 0.65
583 0.65
584 0.68
585 0.71
586 0.76
587 0.78
588 0.79
589 0.81
590 0.83
591 0.87
592 0.9
593 0.91
594 0.91
595 0.87
596 0.83
597 0.76
598 0.7
599 0.61
600 0.55
601 0.47
602 0.45
603 0.45
604 0.4
605 0.4
606 0.37
607 0.37
608 0.34
609 0.33
610 0.26
611 0.27
612 0.33
613 0.31
614 0.33
615 0.33
616 0.35
617 0.35
618 0.36
619 0.31
620 0.32
621 0.33
622 0.35
623 0.35
624 0.34
625 0.38
626 0.42
627 0.44
628 0.46
629 0.52
630 0.52
631 0.58
632 0.59
633 0.57
634 0.54
635 0.61
636 0.59
637 0.6
638 0.57
639 0.53
640 0.56
641 0.52
642 0.5
643 0.39
644 0.31
645 0.22
646 0.21
647 0.2
648 0.17
649 0.16
650 0.15
651 0.17
652 0.18
653 0.23
654 0.21
655 0.19
656 0.24
657 0.25
658 0.28
659 0.28
660 0.28
661 0.24
662 0.24
663 0.26
664 0.21
665 0.2
666 0.18
667 0.18
668 0.18
669 0.16
670 0.17
671 0.14
672 0.15
673 0.15
674 0.14
675 0.18
676 0.2
677 0.22
678 0.22
679 0.24
680 0.26
681 0.29
682 0.34
683 0.36
684 0.38
685 0.46
686 0.52
687 0.6
688 0.62
689 0.67
690 0.68
691 0.69
692 0.7
693 0.67
694 0.59
695 0.55
696 0.49
697 0.4
698 0.36
699 0.3
700 0.25
701 0.2
702 0.23
703 0.19
704 0.22
705 0.22
706 0.23
707 0.19
708 0.18
709 0.22
710 0.22
711 0.26
712 0.27
713 0.32
714 0.32
715 0.35
716 0.38
717 0.34
718 0.37
719 0.38
720 0.36
721 0.33
722 0.35
723 0.42
724 0.48
725 0.53
726 0.52
727 0.5
728 0.52
729 0.55
730 0.55
731 0.49
732 0.45
733 0.4
734 0.35
735 0.33
736 0.32
737 0.26
738 0.23
739 0.19
740 0.18
741 0.16
742 0.15
743 0.13
744 0.12
745 0.19
746 0.21
747 0.22
748 0.26
749 0.28
750 0.36
751 0.45
752 0.53
753 0.53
754 0.61
755 0.69
756 0.68
757 0.68
758 0.67
759 0.66
760 0.67
761 0.69
762 0.68
763 0.66
764 0.67
765 0.69
766 0.68
767 0.69
768 0.67
769 0.61
770 0.62
771 0.56
772 0.51
773 0.51
774 0.5
775 0.45