Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9PCV4

Protein Details
Accession R9PCV4    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MAKDESKKDKKSKRKSDVAAMDIHydrophilic
27-53TDVEATPSKKEKKEKKDKKVKVEVEVDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-15KKDKKSKRK
35-46KKEKKEKKDKKV
80-113MSKKLFKLTKKASKSRGHVKRGVKEVVKALRKGE
Subcellular Location(s) cyto 15.5, cyto_mito 10.333, nucl 7.5, mito_nucl 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002415  H/ACA_rnp_Nhp2-like  
IPR029064  L30e-like  
IPR004038  Ribosomal_L7Ae/L30e/S12e/Gad45  
IPR018492  Ribosomal_L7Ae/L8/Nhp2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01248  Ribosomal_L7Ae  
Amino Acid Sequences MAKDESKKDKKSKRKSDVAAMDIDATTDVEATPSKKEKKEKKDKKVKVEVEVDAAGSDDEDAETSDNISPIAQPLAQPKMSKKLFKLTKKASKSRGHVKRGVKEVVKALRKGEKGLVVLAGDISPIDILSHIPVLCEDTSNPYIFVASKESLGAASATKRPTSVVMIVPGGGKKAASKGKDATKLKEDYMEDYSSLHKQVQGLSDEVAMAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.87
3 0.87
4 0.85
5 0.77
6 0.68
7 0.58
8 0.49
9 0.38
10 0.32
11 0.22
12 0.13
13 0.1
14 0.07
15 0.06
16 0.06
17 0.08
18 0.09
19 0.15
20 0.22
21 0.29
22 0.35
23 0.46
24 0.55
25 0.65
26 0.75
27 0.8
28 0.84
29 0.89
30 0.91
31 0.92
32 0.92
33 0.86
34 0.82
35 0.77
36 0.67
37 0.59
38 0.5
39 0.39
40 0.28
41 0.23
42 0.15
43 0.09
44 0.08
45 0.04
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.05
50 0.05
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.06
57 0.07
58 0.08
59 0.07
60 0.07
61 0.11
62 0.15
63 0.17
64 0.18
65 0.2
66 0.28
67 0.31
68 0.34
69 0.32
70 0.38
71 0.45
72 0.51
73 0.58
74 0.58
75 0.64
76 0.69
77 0.74
78 0.73
79 0.71
80 0.7
81 0.72
82 0.71
83 0.68
84 0.68
85 0.67
86 0.64
87 0.62
88 0.61
89 0.51
90 0.43
91 0.43
92 0.42
93 0.39
94 0.34
95 0.31
96 0.32
97 0.32
98 0.31
99 0.28
100 0.23
101 0.2
102 0.2
103 0.18
104 0.12
105 0.11
106 0.1
107 0.08
108 0.05
109 0.04
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.04
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.09
125 0.13
126 0.15
127 0.15
128 0.15
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.14
133 0.12
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.07
142 0.09
143 0.13
144 0.14
145 0.15
146 0.15
147 0.15
148 0.17
149 0.19
150 0.2
151 0.18
152 0.19
153 0.19
154 0.2
155 0.2
156 0.18
157 0.16
158 0.13
159 0.1
160 0.09
161 0.16
162 0.22
163 0.22
164 0.27
165 0.32
166 0.41
167 0.5
168 0.53
169 0.52
170 0.54
171 0.55
172 0.51
173 0.51
174 0.45
175 0.39
176 0.4
177 0.35
178 0.28
179 0.26
180 0.28
181 0.24
182 0.24
183 0.21
184 0.18
185 0.19
186 0.22
187 0.26
188 0.26
189 0.24
190 0.24
191 0.23