FuNGI

R9PB65

Protein Details

Accession

R9PB65

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-27	AVVGTVKKRSKREAGKWSKVTLN	Hydrophilic
37-61	LLLHHLYRLKRKRGAVKPSHFRLFG	Hydrophilic
649-668	DAKQREKEDARRKREEEKAE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
12-16	KRSKR
254-263	GRGRGRGGAR
366-397	AEKESKKDKQKAADARQKKMDGRIRKDDRDAK
660-661	RK

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MRKDAVVGTVKKRSKREAGKWSKVTLNPRFAYISFSLLLHHLYRLKRKRGAVKPSHFRLFGFVGSCLHEISVRSNADRASLRKSAINREGLEIFSRERPSSQTNTRNSASTLHSSTFFLAARLQPIMSDPSQQPSGSSSAGQDATSSGRPAQPARPLRGAASLRGAASLRGTPGRGASTSSSASMVPSRSSYASSGSAAGSAGPGSGVRMQFRPVMPQRRKASESPAPTSSNTVESSTASPLSVPSSSTSSRGGRGRGRGGARPPRQQTQMTASGPFALGPSARSTAKKVAPIGPGGSSLTAAESVDSSRSNTPKADPDRASYRNPDKLKDAEQYSDPEDGGVEIVDLDEVHVLDELAPRALPRVAEKESKKDKQKAADARQKKMDGRIRKDDRDAKGAIRVKSEDPDDMMIDLDPTASSTLNGTSTAISSASPTPQPADTSRINTADALDLSESEGEELMDDLVDDFVFHDQDDIGPENLLYLFQFPQLFPKFKAPKEVKGTAKAAAASASETAAKRRSVSFAAGTTGGAGQAGKDDLPSSSEIDSDDSSGVDSDTEDKKDSKLFSSTSFSAEGLVGKLNVYRDGRVFLRFGDDLVMEVTGGSQSTFLQQVMLLDPSNRTATSLGELHRKFIVSPEIDCMLNDISLHDAKQREKEDARRKREEEKAEADRLKYGGGVGSGFGGLGGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.71
3	0.75
4	0.76
5	0.81
6	0.85
7	0.84
8	0.81
9	0.78
10	0.73
11	0.73
12	0.71
13	0.69
14	0.6
15	0.57
16	0.56
17	0.48
18	0.48
19	0.39
20	0.34
21	0.25
22	0.24
23	0.22
24	0.19
25	0.22
26	0.17
27	0.19
28	0.22
29	0.27
30	0.38
31	0.46
32	0.55
33	0.59
34	0.67
35	0.74
36	0.78
37	0.82
38	0.83
39	0.84
40	0.85
41	0.86
42	0.84
43	0.74
44	0.65
45	0.59
46	0.51
47	0.43
48	0.35
49	0.28
50	0.23
51	0.25
52	0.25
53	0.2
54	0.17
55	0.16
56	0.15
57	0.17
58	0.23
59	0.21
60	0.22
61	0.24
62	0.24
63	0.27
64	0.31
65	0.3
66	0.3
67	0.32
68	0.33
69	0.35
70	0.39
71	0.44
72	0.46
73	0.5
74	0.44
75	0.44
76	0.44
77	0.41
78	0.39
79	0.31
80	0.27
81	0.26
82	0.28
83	0.25
84	0.25
85	0.28
86	0.31
87	0.37
88	0.44
89	0.47
90	0.5
91	0.55
92	0.56
93	0.53
94	0.48
95	0.44
96	0.39
97	0.36
98	0.33
99	0.28
100	0.28
101	0.27
102	0.27
103	0.26
104	0.21
105	0.16
106	0.16
107	0.16
108	0.17
109	0.17
110	0.16
111	0.13
112	0.15
113	0.19
114	0.16
115	0.2
116	0.18
117	0.22
118	0.24
119	0.24
120	0.23
121	0.21
122	0.23
123	0.19
124	0.19
125	0.15
126	0.17
127	0.18
128	0.17
129	0.14
130	0.13
131	0.15
132	0.16
133	0.16
134	0.14
135	0.15
136	0.17
137	0.2
138	0.24
139	0.3
140	0.36
141	0.4
142	0.43
143	0.42
144	0.41
145	0.47
146	0.43
147	0.35
148	0.33
149	0.29
150	0.24
151	0.25
152	0.24
153	0.16
154	0.16
155	0.15
156	0.13
157	0.13
158	0.13
159	0.13
160	0.14
161	0.16
162	0.14
163	0.16
164	0.15
165	0.17
166	0.18
167	0.18
168	0.17
169	0.15
170	0.16
171	0.16
172	0.15
173	0.13
174	0.13
175	0.14
176	0.14
177	0.16
178	0.15
179	0.16
180	0.16
181	0.16
182	0.16
183	0.14
184	0.13
185	0.11
186	0.11
187	0.08
188	0.06
189	0.05
190	0.04
191	0.04
192	0.05
193	0.08
194	0.1
195	0.11
196	0.12
197	0.14
198	0.18
199	0.19
200	0.27
201	0.31
202	0.41
203	0.44
204	0.53
205	0.57
206	0.59
207	0.63
208	0.56
209	0.56
210	0.53
211	0.54
212	0.49
213	0.48
214	0.44
215	0.4
216	0.41
217	0.33
218	0.29
219	0.24
220	0.2
221	0.17
222	0.16
223	0.17
224	0.15
225	0.15
226	0.12
227	0.1
228	0.1
229	0.11
230	0.1
231	0.09
232	0.09
233	0.13
234	0.14
235	0.15
236	0.19
237	0.18
238	0.23
239	0.25
240	0.28
241	0.29
242	0.33
243	0.34
244	0.37
245	0.38
246	0.38
247	0.44
248	0.49
249	0.51
250	0.54
251	0.55
252	0.54
253	0.56
254	0.52
255	0.47
256	0.43
257	0.45
258	0.37
259	0.34
260	0.29
261	0.25
262	0.24
263	0.21
264	0.14
265	0.07
266	0.06
267	0.06
268	0.08
269	0.1
270	0.11
271	0.12
272	0.15
273	0.21
274	0.23
275	0.26
276	0.26
277	0.29
278	0.3
279	0.3
280	0.28
281	0.22
282	0.2
283	0.17
284	0.15
285	0.1
286	0.08
287	0.07
288	0.06
289	0.05
290	0.04
291	0.04
292	0.05
293	0.06
294	0.06
295	0.08
296	0.11
297	0.12
298	0.14
299	0.14
300	0.16
301	0.23
302	0.27
303	0.32
304	0.3
305	0.33
306	0.39
307	0.41
308	0.42
309	0.4
310	0.41
311	0.42
312	0.43
313	0.4
314	0.37
315	0.36
316	0.38
317	0.36
318	0.32
319	0.26
320	0.26
321	0.26
322	0.24
323	0.22
324	0.18
325	0.13
326	0.11
327	0.1
328	0.08
329	0.06
330	0.04
331	0.03
332	0.03
333	0.03
334	0.02
335	0.02
336	0.03
337	0.03
338	0.03
339	0.03
340	0.03
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.06
348	0.07
349	0.07
350	0.08
351	0.12
352	0.15
353	0.22
354	0.24
355	0.32
356	0.4
357	0.47
358	0.53
359	0.56
360	0.57
361	0.57
362	0.64
363	0.64
364	0.65
365	0.68
366	0.66
367	0.63
368	0.65
369	0.61
370	0.54
371	0.53
372	0.52
373	0.51
374	0.52
375	0.58
376	0.59
377	0.59
378	0.64
379	0.63
380	0.58
381	0.54
382	0.49
383	0.39
384	0.41
385	0.43
386	0.37
387	0.32
388	0.31
389	0.27
390	0.28
391	0.29
392	0.21
393	0.17
394	0.16
395	0.14
396	0.12
397	0.11
398	0.09
399	0.07
400	0.07
401	0.06
402	0.04
403	0.04
404	0.05
405	0.04
406	0.05
407	0.05
408	0.06
409	0.06
410	0.07
411	0.07
412	0.06
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.06
417	0.08
418	0.08
419	0.1
420	0.1
421	0.1
422	0.11
423	0.12
424	0.14
425	0.14
426	0.18
427	0.19
428	0.22
429	0.25
430	0.24
431	0.24
432	0.22
433	0.21
434	0.17
435	0.15
436	0.12
437	0.09
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.07
442	0.05
443	0.05
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.04
448	0.03
449	0.03
450	0.03
451	0.04
452	0.04
453	0.03
454	0.04
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.05
460	0.06
461	0.08
462	0.09
463	0.09
464	0.09
465	0.09
466	0.09
467	0.09
468	0.09
469	0.06
470	0.06
471	0.07
472	0.09
473	0.1
474	0.09
475	0.18
476	0.22
477	0.25
478	0.25
479	0.35
480	0.4
481	0.4
482	0.51
483	0.47
484	0.51
485	0.56
486	0.62
487	0.56
488	0.56
489	0.57
490	0.49
491	0.46
492	0.38
493	0.3
494	0.23
495	0.19
496	0.13
497	0.11
498	0.09
499	0.1
500	0.1
501	0.13
502	0.16
503	0.17
504	0.18
505	0.19
506	0.22
507	0.21
508	0.24
509	0.24
510	0.21
511	0.23
512	0.21
513	0.2
514	0.17
515	0.14
516	0.11
517	0.08
518	0.07
519	0.05
520	0.06
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.06
525	0.07
526	0.09
527	0.1
528	0.11
529	0.11
530	0.11
531	0.12
532	0.13
533	0.14
534	0.13
535	0.12
536	0.1
537	0.1
538	0.1
539	0.09
540	0.07
541	0.07
542	0.1
543	0.13
544	0.15
545	0.17
546	0.18
547	0.19
548	0.24
549	0.25
550	0.24
551	0.25
552	0.25
553	0.27
554	0.33
555	0.33
556	0.31
557	0.3
558	0.26
559	0.23
560	0.22
561	0.19
562	0.13
563	0.13
564	0.1
565	0.09
566	0.12
567	0.12
568	0.17
569	0.18
570	0.19
571	0.19
572	0.23
573	0.25
574	0.25
575	0.25
576	0.2
577	0.23
578	0.21
579	0.2
580	0.19
581	0.17
582	0.15
583	0.14
584	0.14
585	0.08
586	0.08
587	0.08
588	0.06
589	0.06
590	0.05
591	0.05
592	0.05
593	0.08
594	0.09
595	0.09
596	0.09
597	0.1
598	0.11
599	0.13
600	0.14
601	0.13
602	0.12
603	0.14
604	0.16
605	0.18
606	0.16
607	0.16
608	0.15
609	0.15
610	0.19
611	0.22
612	0.22
613	0.3
614	0.3
615	0.31
616	0.33
617	0.32
618	0.28
619	0.28
620	0.33
621	0.26
622	0.27
623	0.29
624	0.29
625	0.29
626	0.28
627	0.27
628	0.19
629	0.17
630	0.16
631	0.12
632	0.14
633	0.15
634	0.16
635	0.18
636	0.22
637	0.26
638	0.34
639	0.36
640	0.4
641	0.47
642	0.57
643	0.63
644	0.69
645	0.74
646	0.75
647	0.77
648	0.78
649	0.8
650	0.78
651	0.75
652	0.74
653	0.72
654	0.72
655	0.71
656	0.63
657	0.57
658	0.49
659	0.41
660	0.32
661	0.25
662	0.18
663	0.15
664	0.14
665	0.11
666	0.11
667	0.1
668	0.1

R9PB65

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer