Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4R4I4

Protein Details
Accession F4R4I4    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-36QRASIAPPSTKQKRKKRRRATSVLSTESRHydrophilic
238-260PTPPASFRKKKASKRPKLETFVPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-26TKQKRKKRRR
243-254SFRKKKASKRPK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG mlr:MELLADRAFT_87104  -  
CDD cd22852  SMN_C  
Amino Acid Sequences MTSSIKNQRASIAPPSTKQKRKKRRRATSVLSTESRNRQGSVRPADDELAMVKAAAMKLLDNTSDQIIPNIDLDMVIGPVDLRDRLQDSSLARPIKKIKFEDVSSELDQLTSTHLTHSGSSRDLNDKENQPDPIHKPNNKKKTSCGPSLLRQCIDPLAKSQDEIVSDTYEDKGERFEVKLRDIFAKNAIVNAFQATLNEFRYYHRNRGVSSEASESLLPLTESQRRSTSLLYYGTPRPTPPASFRKKKASKRPKLETFVPNSRTSSENTLPVSAPRQPSPVLSDLDMEEYLEMFGDFIPPEVLNQKNTINTSEKESVEASSSSAVKVTTTPITTLEGTTKEDEEEEMMISQNSSKANSPIPFNHSTLSSSSTTRTTPVPAHPSIIETPINPSLESSLELQKQSLTNALNAQYWAGYYTAIYHQSVGFTLPNAAPIQGASSKSLPCPPDSINKTGWEAGKNAGYHTNPSGSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.58
3 0.63
4 0.68
5 0.74
6 0.76
7 0.78
8 0.86
9 0.92
10 0.93
11 0.94
12 0.95
13 0.95
14 0.94
15 0.93
16 0.91
17 0.87
18 0.78
19 0.72
20 0.68
21 0.65
22 0.63
23 0.54
24 0.46
25 0.43
26 0.47
27 0.52
28 0.54
29 0.5
30 0.45
31 0.45
32 0.45
33 0.41
34 0.35
35 0.26
36 0.18
37 0.14
38 0.11
39 0.09
40 0.1
41 0.1
42 0.1
43 0.09
44 0.09
45 0.11
46 0.13
47 0.13
48 0.12
49 0.14
50 0.15
51 0.16
52 0.16
53 0.15
54 0.15
55 0.15
56 0.14
57 0.13
58 0.11
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.06
64 0.05
65 0.04
66 0.05
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.09
71 0.12
72 0.13
73 0.15
74 0.18
75 0.19
76 0.26
77 0.32
78 0.35
79 0.32
80 0.37
81 0.45
82 0.47
83 0.53
84 0.49
85 0.5
86 0.51
87 0.53
88 0.53
89 0.49
90 0.47
91 0.41
92 0.39
93 0.31
94 0.25
95 0.23
96 0.17
97 0.16
98 0.12
99 0.11
100 0.1
101 0.12
102 0.13
103 0.14
104 0.17
105 0.16
106 0.16
107 0.18
108 0.2
109 0.25
110 0.26
111 0.28
112 0.32
113 0.35
114 0.37
115 0.39
116 0.39
117 0.34
118 0.4
119 0.41
120 0.46
121 0.49
122 0.51
123 0.59
124 0.66
125 0.75
126 0.76
127 0.73
128 0.69
129 0.71
130 0.72
131 0.67
132 0.65
133 0.59
134 0.61
135 0.67
136 0.65
137 0.54
138 0.47
139 0.42
140 0.39
141 0.35
142 0.27
143 0.21
144 0.22
145 0.22
146 0.22
147 0.22
148 0.19
149 0.18
150 0.19
151 0.17
152 0.12
153 0.12
154 0.13
155 0.12
156 0.11
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.11
162 0.12
163 0.17
164 0.19
165 0.22
166 0.24
167 0.24
168 0.28
169 0.28
170 0.28
171 0.25
172 0.25
173 0.22
174 0.22
175 0.21
176 0.15
177 0.14
178 0.14
179 0.12
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.12
188 0.21
189 0.25
190 0.29
191 0.33
192 0.34
193 0.34
194 0.38
195 0.4
196 0.33
197 0.31
198 0.27
199 0.21
200 0.21
201 0.2
202 0.15
203 0.11
204 0.1
205 0.08
206 0.06
207 0.08
208 0.13
209 0.14
210 0.16
211 0.18
212 0.19
213 0.21
214 0.21
215 0.2
216 0.18
217 0.18
218 0.17
219 0.2
220 0.21
221 0.21
222 0.21
223 0.19
224 0.19
225 0.19
226 0.2
227 0.23
228 0.31
229 0.38
230 0.45
231 0.49
232 0.57
233 0.65
234 0.72
235 0.76
236 0.78
237 0.79
238 0.81
239 0.86
240 0.84
241 0.81
242 0.79
243 0.74
244 0.7
245 0.68
246 0.62
247 0.54
248 0.46
249 0.42
250 0.36
251 0.31
252 0.3
253 0.24
254 0.23
255 0.23
256 0.23
257 0.22
258 0.21
259 0.22
260 0.2
261 0.2
262 0.18
263 0.19
264 0.18
265 0.19
266 0.22
267 0.22
268 0.19
269 0.17
270 0.17
271 0.16
272 0.17
273 0.16
274 0.12
275 0.08
276 0.07
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.03
281 0.03
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.11
289 0.12
290 0.12
291 0.15
292 0.16
293 0.18
294 0.19
295 0.22
296 0.22
297 0.21
298 0.27
299 0.3
300 0.28
301 0.27
302 0.27
303 0.24
304 0.21
305 0.21
306 0.15
307 0.12
308 0.13
309 0.11
310 0.11
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.13
318 0.13
319 0.16
320 0.16
321 0.16
322 0.16
323 0.15
324 0.17
325 0.17
326 0.17
327 0.14
328 0.14
329 0.14
330 0.12
331 0.11
332 0.09
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.1
339 0.1
340 0.11
341 0.12
342 0.14
343 0.2
344 0.22
345 0.25
346 0.27
347 0.33
348 0.35
349 0.35
350 0.34
351 0.29
352 0.29
353 0.26
354 0.26
355 0.21
356 0.19
357 0.2
358 0.21
359 0.2
360 0.2
361 0.2
362 0.19
363 0.21
364 0.27
365 0.32
366 0.31
367 0.33
368 0.31
369 0.34
370 0.32
371 0.31
372 0.25
373 0.19
374 0.23
375 0.25
376 0.25
377 0.21
378 0.2
379 0.18
380 0.18
381 0.19
382 0.17
383 0.19
384 0.22
385 0.22
386 0.22
387 0.24
388 0.24
389 0.23
390 0.25
391 0.2
392 0.19
393 0.22
394 0.24
395 0.23
396 0.22
397 0.21
398 0.16
399 0.15
400 0.14
401 0.1
402 0.08
403 0.07
404 0.1
405 0.13
406 0.16
407 0.16
408 0.16
409 0.16
410 0.17
411 0.18
412 0.16
413 0.13
414 0.11
415 0.15
416 0.13
417 0.16
418 0.16
419 0.15
420 0.13
421 0.13
422 0.16
423 0.16
424 0.18
425 0.18
426 0.21
427 0.23
428 0.26
429 0.32
430 0.3
431 0.28
432 0.31
433 0.31
434 0.39
435 0.42
436 0.44
437 0.42
438 0.44
439 0.45
440 0.46
441 0.46
442 0.38
443 0.35
444 0.34
445 0.35
446 0.32
447 0.31
448 0.33
449 0.31
450 0.32
451 0.34