Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9PAC9

Protein Details
Accession R9PAC9    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
196-217DEHEREEKRRRKEERARIRAERBasic
234-255RSHRDDRERKHHRSSRRDHEEEBasic
274-329ADRLSSRSRSRSRSRSPQRSTRHREDRSRRDDDRDTTHSHHRRRRDEHRTQPSTSSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
201-250EEKRRRKEERARIRAEREERRRAASESDRHKYGRSHRDDRERKHHRSSRR
278-303SSRSRSRSRSRSPQRSTRHREDRSRR
316-317RR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR045844  RRM_Ist3-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF16367  RRM_7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12411  RRM_ist3_like  
Amino Acid Sequences MNVVREISRINQTELDIAIKTPSASWHQQYADSAYIFIGGLPYDLTEGDVITIFSQYGEIVDVNLPRANNPKQDDRAESSSSSQQKQPVSGKGKHRGFGFLMYEDQRSTVLAVDNLNGAQVLGRTLRVDHVSGYKQPKVVDDEGNKVDADVKSFNAAPVETGLSATEEAEADLEDPMAAYIQRQRRDESSSSRHDDEHEREEKRRRKEERARIRAEREERRRAASESDRHKYGRSHRDDRERKHHRSSRRDHEEEEEGVNRYERMKKSRSVLDADRLSSRSRSRSRSRSPQRSTRHREDRSRRDDDRDTTHSHHRRRRDEHRTQPSTSSSDPHRRTGTSRRRSRSPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.28
3 0.2
4 0.18
5 0.16
6 0.14
7 0.13
8 0.12
9 0.14
10 0.19
11 0.24
12 0.27
13 0.32
14 0.33
15 0.35
16 0.37
17 0.37
18 0.35
19 0.29
20 0.26
21 0.2
22 0.19
23 0.16
24 0.14
25 0.1
26 0.06
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.07
33 0.06
34 0.06
35 0.06
36 0.07
37 0.07
38 0.06
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.05
44 0.05
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.09
49 0.1
50 0.12
51 0.14
52 0.13
53 0.14
54 0.22
55 0.25
56 0.3
57 0.34
58 0.41
59 0.44
60 0.49
61 0.52
62 0.51
63 0.52
64 0.48
65 0.44
66 0.39
67 0.41
68 0.42
69 0.39
70 0.36
71 0.36
72 0.35
73 0.4
74 0.41
75 0.43
76 0.45
77 0.5
78 0.55
79 0.61
80 0.63
81 0.6
82 0.56
83 0.51
84 0.45
85 0.43
86 0.36
87 0.27
88 0.27
89 0.25
90 0.25
91 0.21
92 0.2
93 0.15
94 0.12
95 0.12
96 0.1
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.07
105 0.06
106 0.05
107 0.04
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.09
114 0.1
115 0.1
116 0.11
117 0.14
118 0.16
119 0.22
120 0.26
121 0.27
122 0.27
123 0.27
124 0.28
125 0.3
126 0.3
127 0.31
128 0.28
129 0.31
130 0.3
131 0.31
132 0.28
133 0.22
134 0.23
135 0.17
136 0.17
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.13
142 0.1
143 0.09
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.09
168 0.15
169 0.2
170 0.21
171 0.23
172 0.25
173 0.31
174 0.34
175 0.36
176 0.38
177 0.39
178 0.42
179 0.42
180 0.4
181 0.37
182 0.39
183 0.36
184 0.36
185 0.36
186 0.35
187 0.39
188 0.48
189 0.53
190 0.56
191 0.62
192 0.6
193 0.65
194 0.73
195 0.79
196 0.8
197 0.83
198 0.81
199 0.78
200 0.77
201 0.74
202 0.72
203 0.71
204 0.68
205 0.68
206 0.62
207 0.61
208 0.58
209 0.51
210 0.5
211 0.48
212 0.48
213 0.47
214 0.49
215 0.48
216 0.46
217 0.47
218 0.46
219 0.47
220 0.5
221 0.5
222 0.54
223 0.59
224 0.69
225 0.76
226 0.78
227 0.79
228 0.79
229 0.77
230 0.79
231 0.79
232 0.78
233 0.79
234 0.81
235 0.81
236 0.82
237 0.78
238 0.7
239 0.68
240 0.62
241 0.53
242 0.47
243 0.38
244 0.29
245 0.27
246 0.25
247 0.2
248 0.19
249 0.25
250 0.26
251 0.31
252 0.34
253 0.38
254 0.44
255 0.51
256 0.52
257 0.51
258 0.5
259 0.52
260 0.51
261 0.48
262 0.45
263 0.39
264 0.37
265 0.36
266 0.36
267 0.37
268 0.4
269 0.47
270 0.53
271 0.62
272 0.7
273 0.76
274 0.83
275 0.84
276 0.86
277 0.87
278 0.88
279 0.89
280 0.89
281 0.88
282 0.88
283 0.86
284 0.88
285 0.89
286 0.9
287 0.88
288 0.87
289 0.81
290 0.78
291 0.76
292 0.71
293 0.69
294 0.63
295 0.6
296 0.56
297 0.63
298 0.64
299 0.66
300 0.68
301 0.7
302 0.75
303 0.78
304 0.84
305 0.84
306 0.86
307 0.88
308 0.91
309 0.87
310 0.8
311 0.76
312 0.7
313 0.65
314 0.55
315 0.5
316 0.48
317 0.52
318 0.53
319 0.54
320 0.54
321 0.51
322 0.56
323 0.62
324 0.64
325 0.64
326 0.7
327 0.71