Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9PJW2

Protein Details
Accession R9PJW2    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-28CGDVVKKPKLQQHYNRCYAPHydrophilic
127-158AAESSSPSKKEKKEKKKKDKKEKKEETGSPVGBasic
364-390VERARVQSDKMERRKRKAEKLGTEVDDHydrophilic
394-414MEKSRTFKQRKVVQKDVRDQAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
134-150SKKEKKEKKKKDKKEKK
373-381KMERRKRKA
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 11.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51804  ZF_C2HC_LYAR  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MVSFNCDGCGDVVKKPKLQQHYNRCYAPVTCLDCSMQFNSPNEFKSHNSCVSEAEKYERSVYRGPKHQQQNGGTPQKGQPQQVGTPARAQQAVAPHEATPSKQEMTGNANGKAKGGEEKEQVASDVAAESSSPSKKEKKEKKKKDKKEKKEETGSPVGVDETAANDDAAESDDAEEHLQDDPMQAAAEEEKIIKPLSTSELEAFKKKQRKLGIIYISRIPPGMTPAKVRHILSNFGELGRIYLQDGSKPGEAKKKHGVAHYTEGWVEFTSKKVAKAAAEMLNAQPIGGLAASSSKKSGSGGGSSKMGKSSKRFQDDVWTMKYLKGFKWHMLSEQMAQERASHAARLRTELSQSAYEQKDYLKKVERARVQSDKMERRKRKAEKLGTEVDDLSGMEKSRTFKQRKVVQKDVRDQA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.48
3 0.55
4 0.58
5 0.66
6 0.7
7 0.72
8 0.78
9 0.81
10 0.77
11 0.71
12 0.64
13 0.55
14 0.5
15 0.47
16 0.42
17 0.35
18 0.35
19 0.34
20 0.33
21 0.35
22 0.33
23 0.3
24 0.29
25 0.3
26 0.35
27 0.37
28 0.36
29 0.36
30 0.36
31 0.34
32 0.37
33 0.41
34 0.41
35 0.4
36 0.38
37 0.4
38 0.41
39 0.41
40 0.35
41 0.35
42 0.31
43 0.31
44 0.36
45 0.34
46 0.35
47 0.38
48 0.45
49 0.47
50 0.54
51 0.58
52 0.62
53 0.69
54 0.7
55 0.72
56 0.68
57 0.69
58 0.7
59 0.72
60 0.63
61 0.57
62 0.55
63 0.55
64 0.55
65 0.48
66 0.43
67 0.39
68 0.41
69 0.46
70 0.45
71 0.37
72 0.38
73 0.4
74 0.37
75 0.33
76 0.3
77 0.24
78 0.28
79 0.29
80 0.26
81 0.24
82 0.21
83 0.24
84 0.24
85 0.22
86 0.19
87 0.2
88 0.18
89 0.19
90 0.2
91 0.19
92 0.25
93 0.31
94 0.31
95 0.32
96 0.34
97 0.32
98 0.32
99 0.3
100 0.25
101 0.23
102 0.23
103 0.24
104 0.23
105 0.26
106 0.26
107 0.26
108 0.26
109 0.2
110 0.17
111 0.12
112 0.1
113 0.07
114 0.05
115 0.05
116 0.06
117 0.09
118 0.11
119 0.12
120 0.16
121 0.24
122 0.31
123 0.42
124 0.52
125 0.6
126 0.7
127 0.8
128 0.87
129 0.91
130 0.95
131 0.96
132 0.97
133 0.96
134 0.96
135 0.95
136 0.93
137 0.92
138 0.85
139 0.81
140 0.76
141 0.65
142 0.54
143 0.43
144 0.34
145 0.24
146 0.19
147 0.11
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.05
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.07
183 0.1
184 0.1
185 0.11
186 0.12
187 0.18
188 0.19
189 0.21
190 0.23
191 0.26
192 0.33
193 0.34
194 0.38
195 0.38
196 0.42
197 0.45
198 0.51
199 0.53
200 0.49
201 0.49
202 0.46
203 0.41
204 0.36
205 0.3
206 0.22
207 0.13
208 0.14
209 0.16
210 0.13
211 0.17
212 0.19
213 0.24
214 0.27
215 0.27
216 0.28
217 0.27
218 0.29
219 0.27
220 0.29
221 0.24
222 0.21
223 0.21
224 0.16
225 0.15
226 0.11
227 0.1
228 0.07
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.13
234 0.14
235 0.16
236 0.18
237 0.24
238 0.25
239 0.29
240 0.36
241 0.39
242 0.41
243 0.44
244 0.45
245 0.42
246 0.46
247 0.43
248 0.36
249 0.3
250 0.27
251 0.23
252 0.19
253 0.17
254 0.11
255 0.1
256 0.15
257 0.17
258 0.17
259 0.18
260 0.2
261 0.19
262 0.21
263 0.25
264 0.23
265 0.22
266 0.23
267 0.21
268 0.21
269 0.2
270 0.17
271 0.12
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.05
276 0.03
277 0.08
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.11
283 0.12
284 0.15
285 0.13
286 0.18
287 0.2
288 0.21
289 0.25
290 0.26
291 0.26
292 0.27
293 0.27
294 0.26
295 0.3
296 0.37
297 0.43
298 0.48
299 0.49
300 0.45
301 0.53
302 0.56
303 0.55
304 0.49
305 0.43
306 0.37
307 0.38
308 0.42
309 0.34
310 0.3
311 0.33
312 0.32
313 0.33
314 0.39
315 0.38
316 0.37
317 0.38
318 0.38
319 0.33
320 0.36
321 0.33
322 0.28
323 0.27
324 0.25
325 0.22
326 0.24
327 0.21
328 0.18
329 0.19
330 0.24
331 0.25
332 0.28
333 0.3
334 0.28
335 0.3
336 0.3
337 0.3
338 0.27
339 0.27
340 0.31
341 0.3
342 0.29
343 0.28
344 0.29
345 0.33
346 0.34
347 0.39
348 0.4
349 0.45
350 0.53
351 0.61
352 0.65
353 0.64
354 0.7
355 0.72
356 0.67
357 0.69
358 0.71
359 0.72
360 0.74
361 0.78
362 0.79
363 0.79
364 0.85
365 0.87
366 0.88
367 0.88
368 0.88
369 0.86
370 0.85
371 0.85
372 0.77
373 0.7
374 0.59
375 0.48
376 0.39
377 0.29
378 0.23
379 0.16
380 0.13
381 0.12
382 0.15
383 0.18
384 0.26
385 0.37
386 0.42
387 0.45
388 0.55
389 0.63
390 0.71
391 0.77
392 0.79
393 0.79
394 0.83