Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9P9S4

Protein Details
Accession R9P9S4    Localization Confidence Low Confidence Score 7.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
916-939GPKCQNLKVKQPKKVSFEPRNLLRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 9.833, cyto 8, cyto_mito 5.833, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MPTSFEQWQHTAVSNIFNVTLDRREAESSGWEKTFLKELADELAPGSAAPPPLSASVADQILIARLSLDPHGDVMSDDAEHITILASLPKGQTSWDYLVACWKKARSEESRLRKSLPAADQPKALAVLEEIRALLVSYAGLVLQTPDMFPNAAKPNGTPVSPLVLVDSLTRVSSSISSFGFSSSEPSSSHSTADLTTRFETIDGDDLPVFLNELAARFGSDEGLDEILGPAFTELTRRIRDGDRGSDAPASSSPAPSQSPNAAGAPAGGAGGVNPAALNQALANQDVQSVIAQLLAGRMPGAPQAAGSLGADAKSSEGLTITGLEWRPYVNAIVEAVEIKPIANMLAHLPNFDPSNTTGARIELDSLLGPVLRLSAFPDAYPSITQHYFPNAATQNQQEADSNFRSIQSTMEIVHTLNFRIFNAVVRSGAPAREKVLAYWARACALNAKRGAMQVRQELVASDGYMVNLYEMLLRFADPFMDAGFTKIDRIDLEYLRKQTRFDILELTRINATEAEAKEWTEQGRAEPAGASANFITEVFYLAVRLNNLGLGKAVRRIDEKEKEMGRFKKRIAETEADRAMWSAMPQAPQYETFLKRAKAEVERLHGEIYAAQSQLMAPEFLQKVITFNCFLMAWLIRVAEPKATHPHPQVTLPLPQEVPTRFRMLPEHMFEDICDVMLFVSRVSAPLSESAKNDLVTFCTTFLSSGWYIKNPFLKAKLAEILFYNVIPWGRHTNGVLSDTLNIHGLALQHLVPALMSFWIEAENTGSHTQFYDKFNMRYHLSQIFKSVWSNPKHKEQIHRQAQASGSDFVVFINRLMNDVTYLLDDALDKLQELHTKQSESEETPESGSSAQEQQEREGHIRQLEGMIKSDLQLGTEFMRLLIDFTAETADAFMTPEVVDRLAAMLDYNLDLMAGPKCQNLKVKQPKKVSFEPRNLLRMIMSVYLNLCSKGEFVAAIARDGRSYSKSVFEKAGWIAEKYMLKSPPELEAWAGMIAQVEEKKQMEQDEEEDLGEVPDEYLDPLMATVMKDPVLLPRSKTVVDRSTIKAHLLSDSTDPFNRSPLKIEDVIPDTELKAKIEAFIAERRRKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.21
4 0.19
5 0.19
6 0.19
7 0.21
8 0.19
9 0.2
10 0.21
11 0.23
12 0.24
13 0.23
14 0.28
15 0.28
16 0.31
17 0.29
18 0.29
19 0.28
20 0.29
21 0.35
22 0.27
23 0.27
24 0.22
25 0.23
26 0.25
27 0.24
28 0.22
29 0.16
30 0.15
31 0.13
32 0.11
33 0.11
34 0.09
35 0.1
36 0.1
37 0.1
38 0.12
39 0.13
40 0.14
41 0.14
42 0.15
43 0.17
44 0.17
45 0.16
46 0.15
47 0.14
48 0.14
49 0.14
50 0.11
51 0.08
52 0.08
53 0.1
54 0.11
55 0.12
56 0.11
57 0.12
58 0.12
59 0.12
60 0.11
61 0.11
62 0.11
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.08
73 0.09
74 0.11
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.13
79 0.15
80 0.19
81 0.22
82 0.25
83 0.25
84 0.25
85 0.35
86 0.36
87 0.36
88 0.35
89 0.34
90 0.33
91 0.38
92 0.45
93 0.43
94 0.51
95 0.59
96 0.65
97 0.73
98 0.71
99 0.69
100 0.65
101 0.61
102 0.59
103 0.56
104 0.56
105 0.52
106 0.51
107 0.5
108 0.46
109 0.44
110 0.36
111 0.28
112 0.18
113 0.14
114 0.15
115 0.14
116 0.14
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.09
122 0.06
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.16
138 0.2
139 0.22
140 0.22
141 0.22
142 0.29
143 0.31
144 0.31
145 0.25
146 0.21
147 0.24
148 0.24
149 0.23
150 0.17
151 0.15
152 0.16
153 0.15
154 0.15
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.11
161 0.11
162 0.13
163 0.12
164 0.13
165 0.14
166 0.14
167 0.14
168 0.12
169 0.15
170 0.13
171 0.15
172 0.14
173 0.17
174 0.22
175 0.22
176 0.23
177 0.2
178 0.19
179 0.19
180 0.23
181 0.21
182 0.19
183 0.19
184 0.19
185 0.18
186 0.17
187 0.17
188 0.14
189 0.17
190 0.13
191 0.14
192 0.14
193 0.14
194 0.14
195 0.13
196 0.12
197 0.07
198 0.08
199 0.06
200 0.07
201 0.08
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.07
221 0.1
222 0.16
223 0.19
224 0.2
225 0.23
226 0.26
227 0.34
228 0.36
229 0.39
230 0.39
231 0.38
232 0.39
233 0.38
234 0.34
235 0.29
236 0.24
237 0.23
238 0.17
239 0.18
240 0.16
241 0.17
242 0.18
243 0.18
244 0.21
245 0.18
246 0.2
247 0.2
248 0.2
249 0.17
250 0.16
251 0.14
252 0.11
253 0.09
254 0.07
255 0.04
256 0.04
257 0.03
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.03
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.07
268 0.08
269 0.09
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.1
310 0.1
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.08
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.04
331 0.05
332 0.07
333 0.13
334 0.13
335 0.14
336 0.14
337 0.15
338 0.16
339 0.15
340 0.15
341 0.1
342 0.15
343 0.15
344 0.16
345 0.15
346 0.14
347 0.15
348 0.14
349 0.14
350 0.09
351 0.09
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.04
358 0.05
359 0.04
360 0.04
361 0.06
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.12
366 0.12
367 0.13
368 0.14
369 0.13
370 0.14
371 0.14
372 0.16
373 0.14
374 0.17
375 0.17
376 0.17
377 0.22
378 0.2
379 0.21
380 0.23
381 0.23
382 0.23
383 0.22
384 0.23
385 0.17
386 0.16
387 0.2
388 0.19
389 0.19
390 0.16
391 0.16
392 0.16
393 0.15
394 0.15
395 0.11
396 0.11
397 0.1
398 0.11
399 0.11
400 0.1
401 0.12
402 0.12
403 0.1
404 0.11
405 0.1
406 0.09
407 0.11
408 0.11
409 0.12
410 0.14
411 0.14
412 0.13
413 0.13
414 0.15
415 0.14
416 0.16
417 0.15
418 0.13
419 0.14
420 0.17
421 0.17
422 0.15
423 0.22
424 0.22
425 0.22
426 0.24
427 0.23
428 0.2
429 0.21
430 0.21
431 0.21
432 0.21
433 0.24
434 0.22
435 0.23
436 0.23
437 0.25
438 0.27
439 0.22
440 0.23
441 0.22
442 0.22
443 0.21
444 0.2
445 0.18
446 0.17
447 0.14
448 0.1
449 0.08
450 0.07
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.05
455 0.04
456 0.04
457 0.05
458 0.05
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.07
463 0.06
464 0.07
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.08
476 0.06
477 0.09
478 0.12
479 0.13
480 0.18
481 0.21
482 0.25
483 0.28
484 0.29
485 0.26
486 0.25
487 0.29
488 0.26
489 0.23
490 0.26
491 0.23
492 0.29
493 0.28
494 0.27
495 0.21
496 0.2
497 0.19
498 0.12
499 0.12
500 0.12
501 0.12
502 0.13
503 0.13
504 0.13
505 0.13
506 0.14
507 0.14
508 0.1
509 0.1
510 0.08
511 0.11
512 0.1
513 0.1
514 0.09
515 0.09
516 0.1
517 0.09
518 0.1
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.05
525 0.06
526 0.05
527 0.05
528 0.06
529 0.06
530 0.07
531 0.07
532 0.07
533 0.06
534 0.07
535 0.07
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.11
541 0.11
542 0.11
543 0.13
544 0.17
545 0.24
546 0.29
547 0.31
548 0.33
549 0.35
550 0.37
551 0.42
552 0.46
553 0.45
554 0.44
555 0.42
556 0.44
557 0.43
558 0.44
559 0.42
560 0.39
561 0.36
562 0.38
563 0.38
564 0.31
565 0.29
566 0.25
567 0.2
568 0.15
569 0.12
570 0.09
571 0.09
572 0.1
573 0.1
574 0.11
575 0.11
576 0.12
577 0.15
578 0.17
579 0.17
580 0.2
581 0.24
582 0.24
583 0.24
584 0.25
585 0.27
586 0.25
587 0.29
588 0.28
589 0.29
590 0.3
591 0.3
592 0.29
593 0.24
594 0.21
595 0.16
596 0.15
597 0.12
598 0.1
599 0.09
600 0.08
601 0.08
602 0.09
603 0.08
604 0.06
605 0.05
606 0.1
607 0.1
608 0.11
609 0.11
610 0.1
611 0.12
612 0.13
613 0.15
614 0.1
615 0.1
616 0.11
617 0.1
618 0.1
619 0.1
620 0.09
621 0.08
622 0.08
623 0.08
624 0.08
625 0.09
626 0.09
627 0.1
628 0.11
629 0.13
630 0.18
631 0.21
632 0.25
633 0.26
634 0.3
635 0.28
636 0.29
637 0.3
638 0.26
639 0.29
640 0.26
641 0.25
642 0.21
643 0.21
644 0.24
645 0.22
646 0.23
647 0.2
648 0.23
649 0.22
650 0.23
651 0.24
652 0.26
653 0.29
654 0.29
655 0.3
656 0.26
657 0.26
658 0.24
659 0.23
660 0.18
661 0.13
662 0.1
663 0.06
664 0.05
665 0.07
666 0.07
667 0.04
668 0.05
669 0.05
670 0.06
671 0.06
672 0.07
673 0.06
674 0.11
675 0.14
676 0.15
677 0.16
678 0.19
679 0.2
680 0.2
681 0.2
682 0.16
683 0.15
684 0.16
685 0.15
686 0.12
687 0.11
688 0.11
689 0.1
690 0.1
691 0.12
692 0.11
693 0.13
694 0.14
695 0.16
696 0.17
697 0.2
698 0.25
699 0.23
700 0.25
701 0.25
702 0.27
703 0.26
704 0.27
705 0.29
706 0.24
707 0.23
708 0.21
709 0.21
710 0.18
711 0.16
712 0.14
713 0.1
714 0.11
715 0.1
716 0.12
717 0.14
718 0.15
719 0.17
720 0.17
721 0.18
722 0.2
723 0.21
724 0.19
725 0.15
726 0.15
727 0.14
728 0.15
729 0.12
730 0.1
731 0.08
732 0.09
733 0.09
734 0.08
735 0.09
736 0.08
737 0.07
738 0.07
739 0.07
740 0.06
741 0.05
742 0.05
743 0.04
744 0.04
745 0.04
746 0.04
747 0.05
748 0.05
749 0.05
750 0.07
751 0.07
752 0.1
753 0.11
754 0.11
755 0.1
756 0.11
757 0.14
758 0.16
759 0.19
760 0.24
761 0.27
762 0.29
763 0.33
764 0.36
765 0.37
766 0.35
767 0.36
768 0.36
769 0.34
770 0.32
771 0.32
772 0.3
773 0.28
774 0.28
775 0.3
776 0.3
777 0.34
778 0.4
779 0.41
780 0.49
781 0.55
782 0.58
783 0.62
784 0.64
785 0.69
786 0.72
787 0.74
788 0.66
789 0.62
790 0.59
791 0.53
792 0.46
793 0.36
794 0.26
795 0.2
796 0.19
797 0.15
798 0.15
799 0.11
800 0.09
801 0.11
802 0.1
803 0.11
804 0.11
805 0.11
806 0.1
807 0.1
808 0.1
809 0.08
810 0.08
811 0.07
812 0.07
813 0.07
814 0.08
815 0.08
816 0.08
817 0.07
818 0.08
819 0.1
820 0.14
821 0.16
822 0.21
823 0.23
824 0.24
825 0.25
826 0.28
827 0.29
828 0.28
829 0.3
830 0.26
831 0.24
832 0.24
833 0.24
834 0.2
835 0.17
836 0.15
837 0.13
838 0.14
839 0.17
840 0.2
841 0.2
842 0.23
843 0.26
844 0.29
845 0.3
846 0.29
847 0.29
848 0.27
849 0.26
850 0.24
851 0.24
852 0.25
853 0.23
854 0.22
855 0.2
856 0.19
857 0.19
858 0.22
859 0.18
860 0.14
861 0.13
862 0.13
863 0.13
864 0.14
865 0.14
866 0.1
867 0.11
868 0.1
869 0.1
870 0.09
871 0.08
872 0.06
873 0.07
874 0.08
875 0.07
876 0.07
877 0.07
878 0.06
879 0.06
880 0.07
881 0.06
882 0.06
883 0.06
884 0.07
885 0.08
886 0.08
887 0.07
888 0.07
889 0.07
890 0.07
891 0.07
892 0.06
893 0.05
894 0.05
895 0.06
896 0.06
897 0.05
898 0.05
899 0.05
900 0.06
901 0.08
902 0.09
903 0.1
904 0.13
905 0.15
906 0.2
907 0.28
908 0.31
909 0.41
910 0.5
911 0.58
912 0.65
913 0.73
914 0.77
915 0.77
916 0.82
917 0.82
918 0.8
919 0.81
920 0.8
921 0.76
922 0.72
923 0.65
924 0.56
925 0.45
926 0.37
927 0.3
928 0.24
929 0.18
930 0.15
931 0.15
932 0.17
933 0.18
934 0.17
935 0.14
936 0.12
937 0.12
938 0.11
939 0.11
940 0.08
941 0.08
942 0.13
943 0.13
944 0.15
945 0.16
946 0.15
947 0.15
948 0.17
949 0.19
950 0.16
951 0.19
952 0.19
953 0.26
954 0.28
955 0.31
956 0.33
957 0.31
958 0.33
959 0.31
960 0.36
961 0.29
962 0.28
963 0.26
964 0.28
965 0.31
966 0.29
967 0.33
968 0.3
969 0.3
970 0.32
971 0.32
972 0.31
973 0.3
974 0.28
975 0.23
976 0.2
977 0.2
978 0.18
979 0.16
980 0.11
981 0.1
982 0.09
983 0.11
984 0.12
985 0.11
986 0.15
987 0.16
988 0.18
989 0.2
990 0.22
991 0.23
992 0.24
993 0.26
994 0.26
995 0.26
996 0.25
997 0.23
998 0.2
999 0.17
1000 0.14
1001 0.12
1002 0.07
1003 0.06
1004 0.06
1005 0.06
1006 0.06
1007 0.06
1008 0.06
1009 0.06
1010 0.07
1011 0.07
1012 0.08
1013 0.09
1014 0.1
1015 0.11
1016 0.11
1017 0.11
1018 0.18
1019 0.23
1020 0.25
1021 0.26
1022 0.3
1023 0.33
1024 0.35
1025 0.39
1026 0.39
1027 0.39
1028 0.42
1029 0.45
1030 0.44
1031 0.48
1032 0.47
1033 0.45
1034 0.4
1035 0.35
1036 0.34
1037 0.3
1038 0.27
1039 0.24
1040 0.27
1041 0.29
1042 0.29
1043 0.31
1044 0.28
1045 0.34
1046 0.36
1047 0.33
1048 0.35
1049 0.36
1050 0.39
1051 0.39
1052 0.41
1053 0.41
1054 0.39
1055 0.39
1056 0.35
1057 0.31
1058 0.26
1059 0.29
1060 0.28
1061 0.22
1062 0.21
1063 0.2
1064 0.2
1065 0.21
1066 0.22
1067 0.2
1068 0.27
1069 0.36