FuNGI

R9P1Q4

Protein Details

Accession

R9P1Q4

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
87-114	TAQFIPPLKLNRKNPPRLKLPRPNPGDP	Hydrophilic
166-189	GGSARPPKAKLFKKKVREIHKAAD	Basic
754-773	LVQHFRKRLKSEPHIKDQLS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
168-188	SARPPKAKLFKKKVREIHKAA
562-566	RKEKE

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MPPVKAEPGTAGVKTENGRAAAPRPQPANGTSNNARSNLNSEEDKKDLPPPPPTTYRDIPLLSTDCGQWLTHLMKFAHHTRVDPNDTAQFIPPLKLNRKNPPRLKLPRPNPGDPITDKYNRPMMGKDGQPLTWPGPDDDLQRIEEVIKRDNAPKGPGADQSLIAPGGSARPPKAKLFKKKVREIHKAADSARKTMKEEHFPWVLEDFETSEDWESVRTPFPTGARALQDHIDELKAKRSGSSGTDANGDVKMNDTNTKVKAEGGIKHESGASASASSSTSHAPWIGKLEGDSSSEASSLHVLFVFDERDAGGFKVVPVSRMYKFLQKPKHSTMTNEQVEQEYQKYQKTKEMDRWALRNKPVSAGASVSKHEDNATWRSWPQVNRLSLPTGMSFGAGRRRNLMAVHGGELLRDDDDDDASASRRRKREDSPGAGYDELDFEEEFADDEELHDPEADVAEDEEAKELEERLKREMARANHVGDEEDAAEEASAPEDEDQILTGSGKQMMKIMRALAKREGNEVYDKDDDGRNPYATDDSEEDEEESYVANPEKAIQLAREERERKEKEAAKNKDKTTPGSASGSNTPSNRPEKRPVPPAASSASQTQRPGAGHASLAHRATSPTRGASKIGSKQVSRSSSPSLARSVSPGRAESPPLATSDASAANSGLKRRADSPASSATTLAGGSNASSSHPEAKRVKTGSTGSRAGSPSGSPPGSKPASRAGSPGAPRVPANAVEAEIIQLIREGKIANTSELVQHFRKRLKSEPHIKDQLSAAVRKVAVMDKATNRLKLKDGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.27
3	0.26
4	0.24
5	0.25
6	0.26
7	0.29
8	0.34
9	0.38
10	0.4
11	0.39
12	0.4
13	0.42
14	0.43
15	0.45
16	0.4
17	0.43
18	0.42
19	0.47
20	0.48
21	0.47
22	0.44
23	0.39
24	0.41
25	0.36
26	0.35
27	0.33
28	0.34
29	0.37
30	0.39
31	0.39
32	0.37
33	0.41
34	0.42
35	0.42
36	0.47
37	0.48
38	0.52
39	0.57
40	0.59
41	0.59
42	0.58
43	0.55
44	0.52
45	0.47
46	0.41
47	0.4
48	0.38
49	0.32
50	0.29
51	0.26
52	0.21
53	0.22
54	0.2
55	0.15
56	0.17
57	0.19
58	0.19
59	0.25
60	0.23
61	0.25
62	0.31
63	0.35
64	0.39
65	0.37
66	0.38
67	0.38
68	0.46
69	0.49
70	0.45
71	0.43
72	0.39
73	0.4
74	0.39
75	0.34
76	0.3
77	0.26
78	0.26
79	0.26
80	0.3
81	0.37
82	0.44
83	0.51
84	0.57
85	0.67
86	0.76
87	0.81
88	0.8
89	0.83
90	0.83
91	0.86
92	0.86
93	0.85
94	0.84
95	0.83
96	0.8
97	0.75
98	0.69
99	0.64
100	0.57
101	0.54
102	0.51
103	0.49
104	0.46
105	0.45
106	0.47
107	0.43
108	0.41
109	0.38
110	0.36
111	0.37
112	0.39
113	0.39
114	0.35
115	0.33
116	0.33
117	0.34
118	0.31
119	0.27
120	0.25
121	0.2
122	0.22
123	0.23
124	0.24
125	0.26
126	0.25
127	0.23
128	0.22
129	0.22
130	0.19
131	0.21
132	0.21
133	0.22
134	0.23
135	0.25
136	0.29
137	0.34
138	0.36
139	0.35
140	0.36
141	0.35
142	0.34
143	0.35
144	0.34
145	0.3
146	0.27
147	0.25
148	0.23
149	0.19
150	0.16
151	0.13
152	0.09
153	0.1
154	0.13
155	0.15
156	0.16
157	0.21
158	0.24
159	0.32
160	0.42
161	0.48
162	0.56
163	0.64
164	0.72
165	0.76
166	0.83
167	0.85
168	0.85
169	0.85
170	0.81
171	0.79
172	0.75
173	0.69
174	0.62
175	0.63
176	0.54
177	0.49
178	0.48
179	0.41
180	0.38
181	0.43
182	0.46
183	0.46
184	0.48
185	0.48
186	0.46
187	0.44
188	0.43
189	0.36
190	0.3
191	0.21
192	0.18
193	0.14
194	0.12
195	0.12
196	0.11
197	0.1
198	0.1
199	0.1
200	0.1
201	0.1
202	0.1
203	0.12
204	0.12
205	0.13
206	0.15
207	0.16
208	0.18
209	0.19
210	0.21
211	0.21
212	0.22
213	0.22
214	0.22
215	0.21
216	0.2
217	0.18
218	0.16
219	0.16
220	0.16
221	0.2
222	0.2
223	0.2
224	0.2
225	0.2
226	0.21
227	0.21
228	0.25
229	0.2
230	0.18
231	0.2
232	0.2
233	0.2
234	0.18
235	0.15
236	0.11
237	0.11
238	0.11
239	0.1
240	0.13
241	0.14
242	0.17
243	0.19
244	0.2
245	0.19
246	0.18
247	0.22
248	0.23
249	0.26
250	0.27
251	0.3
252	0.28
253	0.28
254	0.28
255	0.23
256	0.2
257	0.15
258	0.11
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.08
264	0.09
265	0.09
266	0.09
267	0.09
268	0.11
269	0.11
270	0.11
271	0.14
272	0.13
273	0.13
274	0.12
275	0.13
276	0.12
277	0.13
278	0.13
279	0.11
280	0.1
281	0.1
282	0.1
283	0.09
284	0.09
285	0.08
286	0.07
287	0.07
288	0.06
289	0.07
290	0.08
291	0.08
292	0.06
293	0.07
294	0.06
295	0.06
296	0.07
297	0.07
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.11
302	0.11
303	0.12
304	0.13
305	0.17
306	0.17
307	0.21
308	0.23
309	0.26
310	0.31
311	0.38
312	0.45
313	0.47
314	0.53
315	0.55
316	0.62
317	0.54
318	0.54
319	0.53
320	0.54
321	0.5
322	0.44
323	0.39
324	0.32
325	0.32
326	0.28
327	0.22
328	0.15
329	0.15
330	0.18
331	0.2
332	0.2
333	0.25
334	0.29
335	0.32
336	0.37
337	0.45
338	0.49
339	0.49
340	0.55
341	0.56
342	0.57
343	0.55
344	0.52
345	0.43
346	0.38
347	0.36
348	0.31
349	0.25
350	0.21
351	0.2
352	0.16
353	0.16
354	0.17
355	0.15
356	0.14
357	0.13
358	0.13
359	0.14
360	0.16
361	0.17
362	0.16
363	0.16
364	0.19
365	0.22
366	0.23
367	0.26
368	0.29
369	0.3
370	0.3
371	0.32
372	0.31
373	0.27
374	0.26
375	0.2
376	0.14
377	0.12
378	0.1
379	0.09
380	0.08
381	0.16
382	0.18
383	0.18
384	0.19
385	0.2
386	0.21
387	0.21
388	0.21
389	0.17
390	0.15
391	0.16
392	0.15
393	0.14
394	0.13
395	0.13
396	0.12
397	0.07
398	0.07
399	0.06
400	0.04
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.06
406	0.1
407	0.14
408	0.2
409	0.23
410	0.27
411	0.32
412	0.37
413	0.47
414	0.52
415	0.55
416	0.55
417	0.53
418	0.51
419	0.46
420	0.41
421	0.3
422	0.21
423	0.14
424	0.09
425	0.07
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.04
433	0.05
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.05
440	0.06
441	0.05
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.05
448	0.04
449	0.05
450	0.05
451	0.05
452	0.1
453	0.13
454	0.15
455	0.17
456	0.21
457	0.21
458	0.25
459	0.31
460	0.29
461	0.33
462	0.34
463	0.33
464	0.3
465	0.3
466	0.27
467	0.21
468	0.18
469	0.12
470	0.09
471	0.07
472	0.06
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.04
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.05
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.06
489	0.1
490	0.1
491	0.1
492	0.13
493	0.14
494	0.16
495	0.17
496	0.19
497	0.21
498	0.23
499	0.26
500	0.29
501	0.32
502	0.31
503	0.33
504	0.31
505	0.27
506	0.29
507	0.27
508	0.25
509	0.22
510	0.21
511	0.2
512	0.21
513	0.2
514	0.2
515	0.22
516	0.18
517	0.18
518	0.18
519	0.18
520	0.16
521	0.18
522	0.14
523	0.14
524	0.14
525	0.14
526	0.14
527	0.13
528	0.12
529	0.1
530	0.09
531	0.07
532	0.08
533	0.08
534	0.07
535	0.07
536	0.08
537	0.09
538	0.09
539	0.1
540	0.09
541	0.14
542	0.19
543	0.22
544	0.3
545	0.32
546	0.35
547	0.44
548	0.47
549	0.44
550	0.49
551	0.53
552	0.55
553	0.63
554	0.68
555	0.68
556	0.73
557	0.72
558	0.7
559	0.66
560	0.6
561	0.56
562	0.5
563	0.43
564	0.39
565	0.37
566	0.33
567	0.35
568	0.33
569	0.3
570	0.28
571	0.27
572	0.3
573	0.38
574	0.4
575	0.41
576	0.47
577	0.51
578	0.58
579	0.64
580	0.63
581	0.6
582	0.57
583	0.54
584	0.49
585	0.43
586	0.37
587	0.35
588	0.33
589	0.3
590	0.29
591	0.27
592	0.27
593	0.25
594	0.26
595	0.22
596	0.19
597	0.17
598	0.2
599	0.23
600	0.23
601	0.23
602	0.21
603	0.19
604	0.2
605	0.21
606	0.22
607	0.21
608	0.21
609	0.24
610	0.25
611	0.25
612	0.28
613	0.34
614	0.36
615	0.42
616	0.42
617	0.4
618	0.43
619	0.5
620	0.5
621	0.45
622	0.42
623	0.4
624	0.42
625	0.44
626	0.42
627	0.38
628	0.34
629	0.32
630	0.33
631	0.32
632	0.3
633	0.29
634	0.28
635	0.28
636	0.28
637	0.3
638	0.27
639	0.27
640	0.23
641	0.22
642	0.23
643	0.19
644	0.18
645	0.18
646	0.18
647	0.14
648	0.14
649	0.13
650	0.15
651	0.17
652	0.19
653	0.22
654	0.21
655	0.23
656	0.25
657	0.32
658	0.32
659	0.32
660	0.35
661	0.38
662	0.4
663	0.38
664	0.35
665	0.29
666	0.25
667	0.23
668	0.18
669	0.1
670	0.07
671	0.06
672	0.07
673	0.07
674	0.07
675	0.09
676	0.12
677	0.2
678	0.22
679	0.3
680	0.35
681	0.4
682	0.48
683	0.48
684	0.47
685	0.45
686	0.5
687	0.49
688	0.5
689	0.48
690	0.41
691	0.44
692	0.44
693	0.39
694	0.34
695	0.27
696	0.25
697	0.28
698	0.28
699	0.23
700	0.23
701	0.31
702	0.34
703	0.34
704	0.32
705	0.35
706	0.39
707	0.39
708	0.4
709	0.36
710	0.39
711	0.41
712	0.45
713	0.39
714	0.35
715	0.35
716	0.35
717	0.33
718	0.27
719	0.27
720	0.22
721	0.2
722	0.19
723	0.18
724	0.16
725	0.14
726	0.12
727	0.09
728	0.1
729	0.1
730	0.09
731	0.11
732	0.11
733	0.1
734	0.17
735	0.19
736	0.19
737	0.2
738	0.2
739	0.24
740	0.27
741	0.32
742	0.3
743	0.35
744	0.4
745	0.46
746	0.52
747	0.53
748	0.59
749	0.64
750	0.7
751	0.74
752	0.76
753	0.8
754	0.81
755	0.76
756	0.7
757	0.62
758	0.59
759	0.53
760	0.47
761	0.38
762	0.35
763	0.34
764	0.31
765	0.31
766	0.27
767	0.26
768	0.27
769	0.33
770	0.32
771	0.42
772	0.46
773	0.51
774	0.5
775	0.49

R9P1Q4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer