FuNGI

R9PMW1

Protein Details

Accession

R9PMW1

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-22	MPAKSKTKNKSIWRSDNAQHFQ	Hydrophilic
673-730	VTAKRDRNESKEDRKARKEAFKANKKERKQRKMKTKEAFASEKKKQAKAEKGRKETEG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
330-334	KGRPG
677-727	RDRNESKEDRKARKEAFKANKKERKQRKMKTKEAFASEKKKQAKAEKGRKE

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPAKSKTKNKSIWRSDNAQHFQLVHRSQRDPLINDPDAGSHVLLSYDPANQSRAKGKTRAELEADATVIRDKFGKPIRQNIGEAANYGIYFDDTEYDYMQHLRPINDDENVKRGGENVDETVDTILVSSDANGKAKGKGKESFALKEGDDLGKKQPGLNLPASVLPSQKEMPFSFTSHLAVEPSLQGFQPDMDPHLRQALEALDDEAFVDDDLDDDFFGEVVHDGEWDGVVREEDQWREQAPEGDEAIYADAATRAQKELEQNGVENMSLEARVALFKQQQQLARNSRQASDDGAEDDEDEEDRDQLASLRGGSRAGTMYTAGGSAIGKKGRPGALARRAASTKAPSIGGGSTAWSMSSSAMFRNKGLSDLDDRFAQLGRKYGIREDFDPSLEALEDEEFVDSDGDEAGEPVTREDFEGIMDDFLAKYETKHGKLREALGGVDSTSVEKLTILRQALGKARINGREWAGKDNDEGKGAGDLGEYEDYESPDEEIVDPIPRSHMREKWDVESIQSTKTNLENHPRTISAKESVFGGSNASAFRPGSVAGGSAVNRTMLGNGMAPSMTSYTSQRPSASAFLNDEERLPKIRINPRTGFPEIVGYSKPRGVNGKKKTSSSLNGVNEEDDDDDGRGPPSGSDSGSDTEDGEKHDGSEYDSDATEGGELARHMSTIAVTAKRDRNESKEDRKARKEAFKANKKERKQRKMKTKEAFASEKKKQAKAEKGRKETEGGPAGMRLL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.83
2	0.8
3	0.81
4	0.76
5	0.67
6	0.59
7	0.5
8	0.47
9	0.48
10	0.47
11	0.45
12	0.45
13	0.45
14	0.46
15	0.53
16	0.56
17	0.5
18	0.52
19	0.53
20	0.48
21	0.46
22	0.44
23	0.36
24	0.32
25	0.29
26	0.21
27	0.12
28	0.11
29	0.11
30	0.1
31	0.11
32	0.1
33	0.13
34	0.15
35	0.16
36	0.19
37	0.21
38	0.25
39	0.31
40	0.37
41	0.39
42	0.44
43	0.47
44	0.53
45	0.56
46	0.58
47	0.54
48	0.49
49	0.46
50	0.4
51	0.36
52	0.27
53	0.24
54	0.21
55	0.17
56	0.15
57	0.15
58	0.13
59	0.21
60	0.3
61	0.39
62	0.41
63	0.51
64	0.58
65	0.61
66	0.61
67	0.57
68	0.55
69	0.45
70	0.41
71	0.32
72	0.25
73	0.2
74	0.19
75	0.15
76	0.09
77	0.09
78	0.09
79	0.09
80	0.09
81	0.1
82	0.11
83	0.12
84	0.12
85	0.15
86	0.15
87	0.18
88	0.2
89	0.2
90	0.22
91	0.28
92	0.29
93	0.31
94	0.35
95	0.32
96	0.33
97	0.34
98	0.32
99	0.25
100	0.24
101	0.22
102	0.2
103	0.21
104	0.17
105	0.18
106	0.17
107	0.18
108	0.16
109	0.14
110	0.11
111	0.08
112	0.07
113	0.05
114	0.05
115	0.05
116	0.1
117	0.12
118	0.14
119	0.15
120	0.17
121	0.22
122	0.3
123	0.34
124	0.34
125	0.36
126	0.4
127	0.45
128	0.49
129	0.46
130	0.42
131	0.4
132	0.34
133	0.32
134	0.3
135	0.27
136	0.24
137	0.22
138	0.24
139	0.25
140	0.26
141	0.25
142	0.27
143	0.27
144	0.31
145	0.31
146	0.28
147	0.25
148	0.27
149	0.28
150	0.25
151	0.21
152	0.17
153	0.18
154	0.19
155	0.19
156	0.21
157	0.2
158	0.24
159	0.25
160	0.26
161	0.25
162	0.24
163	0.24
164	0.2
165	0.2
166	0.15
167	0.13
168	0.12
169	0.12
170	0.11
171	0.11
172	0.1
173	0.09
174	0.09
175	0.09
176	0.11
177	0.1
178	0.12
179	0.15
180	0.16
181	0.16
182	0.21
183	0.2
184	0.17
185	0.18
186	0.16
187	0.14
188	0.14
189	0.14
190	0.09
191	0.09
192	0.1
193	0.08
194	0.07
195	0.05
196	0.05
197	0.04
198	0.04
199	0.05
200	0.05
201	0.04
202	0.05
203	0.05
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.05
209	0.05
210	0.04
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.06
219	0.08
220	0.11
221	0.12
222	0.14
223	0.15
224	0.15
225	0.17
226	0.18
227	0.19
228	0.18
229	0.19
230	0.18
231	0.17
232	0.16
233	0.14
234	0.14
235	0.09
236	0.07
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.06
241	0.07
242	0.07
243	0.08
244	0.1
245	0.13
246	0.15
247	0.19
248	0.19
249	0.18
250	0.19
251	0.19
252	0.16
253	0.13
254	0.11
255	0.07
256	0.06
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.09
263	0.12
264	0.15
265	0.19
266	0.23
267	0.27
268	0.3
269	0.38
270	0.42
271	0.44
272	0.47
273	0.45
274	0.42
275	0.39
276	0.36
277	0.3
278	0.24
279	0.19
280	0.14
281	0.13
282	0.12
283	0.1
284	0.1
285	0.08
286	0.07
287	0.07
288	0.06
289	0.05
290	0.06
291	0.05
292	0.05
293	0.06
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.08
298	0.08
299	0.09
300	0.09
301	0.09
302	0.08
303	0.08
304	0.08
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.06
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.08
314	0.09
315	0.09
316	0.09
317	0.13
318	0.13
319	0.15
320	0.18
321	0.24
322	0.31
323	0.36
324	0.36
325	0.36
326	0.36
327	0.35
328	0.34
329	0.28
330	0.2
331	0.17
332	0.16
333	0.13
334	0.14
335	0.13
336	0.11
337	0.09
338	0.08
339	0.07
340	0.06
341	0.06
342	0.05
343	0.06
344	0.05
345	0.06
346	0.06
347	0.08
348	0.12
349	0.12
350	0.12
351	0.14
352	0.14
353	0.15
354	0.15
355	0.14
356	0.15
357	0.16
358	0.17
359	0.15
360	0.15
361	0.14
362	0.14
363	0.15
364	0.11
365	0.12
366	0.12
367	0.14
368	0.14
369	0.17
370	0.21
371	0.21
372	0.22
373	0.22
374	0.22
375	0.21
376	0.21
377	0.18
378	0.13
379	0.11
380	0.1
381	0.06
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.04
387	0.05
388	0.05
389	0.04
390	0.04
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.04
397	0.04
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.06
402	0.06
403	0.06
404	0.05
405	0.07
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.05
411	0.05
412	0.06
413	0.05
414	0.05
415	0.13
416	0.18
417	0.21
418	0.27
419	0.28
420	0.32
421	0.35
422	0.37
423	0.32
424	0.29
425	0.26
426	0.21
427	0.19
428	0.14
429	0.12
430	0.09
431	0.07
432	0.06
433	0.06
434	0.05
435	0.05
436	0.06
437	0.07
438	0.11
439	0.11
440	0.12
441	0.13
442	0.16
443	0.2
444	0.25
445	0.26
446	0.25
447	0.29
448	0.32
449	0.33
450	0.33
451	0.31
452	0.31
453	0.3
454	0.31
455	0.28
456	0.25
457	0.25
458	0.26
459	0.24
460	0.2
461	0.19
462	0.14
463	0.13
464	0.12
465	0.1
466	0.07
467	0.06
468	0.07
469	0.07
470	0.06
471	0.07
472	0.08
473	0.08
474	0.09
475	0.09
476	0.08
477	0.08
478	0.08
479	0.07
480	0.07
481	0.08
482	0.09
483	0.09
484	0.09
485	0.13
486	0.14
487	0.19
488	0.23
489	0.27
490	0.3
491	0.37
492	0.4
493	0.4
494	0.44
495	0.39
496	0.35
497	0.37
498	0.33
499	0.29
500	0.28
501	0.25
502	0.21
503	0.25
504	0.27
505	0.25
506	0.34
507	0.35
508	0.36
509	0.38
510	0.38
511	0.37
512	0.34
513	0.33
514	0.28
515	0.24
516	0.21
517	0.2
518	0.2
519	0.18
520	0.16
521	0.15
522	0.1
523	0.11
524	0.11
525	0.1
526	0.11
527	0.1
528	0.1
529	0.09
530	0.09
531	0.09
532	0.08
533	0.08
534	0.08
535	0.1
536	0.1
537	0.1
538	0.1
539	0.09
540	0.09
541	0.09
542	0.09
543	0.07
544	0.08
545	0.08
546	0.08
547	0.09
548	0.08
549	0.08
550	0.09
551	0.09
552	0.09
553	0.09
554	0.11
555	0.16
556	0.2
557	0.22
558	0.22
559	0.23
560	0.25
561	0.27
562	0.27
563	0.24
564	0.22
565	0.23
566	0.25
567	0.24
568	0.23
569	0.21
570	0.2
571	0.21
572	0.2
573	0.21
574	0.27
575	0.36
576	0.42
577	0.48
578	0.51
579	0.52
580	0.57
581	0.57
582	0.49
583	0.41
584	0.39
585	0.32
586	0.3
587	0.28
588	0.23
589	0.23
590	0.26
591	0.26
592	0.23
593	0.31
594	0.38
595	0.46
596	0.53
597	0.62
598	0.62
599	0.64
600	0.67
601	0.64
602	0.61
603	0.58
604	0.57
605	0.51
606	0.5
607	0.48
608	0.43
609	0.37
610	0.32
611	0.26
612	0.17
613	0.14
614	0.11
615	0.11
616	0.11
617	0.11
618	0.11
619	0.1
620	0.09
621	0.13
622	0.14
623	0.13
624	0.14
625	0.16
626	0.18
627	0.19
628	0.19
629	0.16
630	0.16
631	0.17
632	0.19
633	0.19
634	0.17
635	0.16
636	0.18
637	0.18
638	0.18
639	0.19
640	0.18
641	0.17
642	0.17
643	0.16
644	0.14
645	0.13
646	0.11
647	0.08
648	0.07
649	0.07
650	0.07
651	0.09
652	0.09
653	0.08
654	0.08
655	0.09
656	0.08
657	0.11
658	0.16
659	0.17
660	0.2
661	0.28
662	0.34
663	0.37
664	0.44
665	0.45
666	0.47
667	0.54
668	0.61
669	0.64
670	0.68
671	0.75
672	0.78
673	0.81
674	0.83
675	0.82
676	0.82
677	0.8
678	0.8
679	0.81
680	0.82
681	0.85
682	0.87
683	0.88
684	0.88
685	0.9
686	0.91
687	0.91
688	0.92
689	0.92
690	0.92
691	0.93
692	0.93
693	0.93
694	0.92
695	0.89
696	0.86
697	0.84
698	0.82
699	0.81
700	0.78
701	0.77
702	0.74
703	0.71
704	0.72
705	0.72
706	0.74
707	0.76
708	0.79
709	0.81
710	0.83
711	0.83
712	0.77
713	0.72
714	0.64
715	0.62
716	0.57
717	0.48
718	0.4

R9PMW1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer