FuNGI

R9PDQ3

Protein Details

Accession

R9PDQ3

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-31	FGFFLSCRLRKHRQRSSRPLTHSLLK	Hydrophilic
48-67	LEDRAKSLHKKEKKAAAKAA	Hydrophilic
71-125	GSPSPASPSKKDKKDKKEKDKKRSADDAADDDEKAAKKRRKEEKKAKKAAAKASA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
52-97	AKSLHKKEKKAAAKAAAAEGSPSPASPSKKDKKDKKEKDKKRSADD
102-122	DEKAAKKRRKEEKKAKKAAAK

Subcellular Location(s)

mito 22, mito_nucl 12.833, cyto_mito 12.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR000629 RNA-helicase_DEAD-box_CS IPR014014 RNA_helicase_DEAD_Q_motif
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0003724 F:RNA helicase activity
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS00039 DEAD_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER PS51195 Q_MOTIF
CDD	cd00268 DEADc cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MEFLLFGFFLSCRLRKHRQRSSRPLTHSLLKTSVNINRMTTSTTEKALEDRAKSLHKKEKKAAAKAAAAEGSPSPASPSKKDKKDKKEKDKKRSADDAADDDEKAAKKRRKEEKKAKKAAAKASAATSIESTPAAAPAPVASSSSSASFAPTNPAAARAFLESNNITIEAPEESNERPPLPMVDFRELEGKIDAAVKKTLDAQGFTTPTPIQACCWPVLLQNKDVVGIAETGSGKTFAFGLPALQHLVTKHKVLDSGKKKAKGAQVNVLVVAPTRELAIQTEENMAKLGKSMGIGMICLYGGVSKQEQVRLLNQTPTVRIVVGTPGRVLDMARDGSLDLSGVSYLVLDEADRMLDKGFEPDIRAIIGMCKSREEGRHTSMFSATWPPAVRGLAESFMNGPVRVTVGSDELSANRRVEQTVEVLADGYAKERRLNDFLRSVNAQRSKDKILIFALYKKEAQRVEQTLRRGGFKVSGIHGDLGQNERIASLERFKSAETPLLVATDVAARGLDIPNVEHVINYTFPLTIEDYVHRIGRTGRGGKTGKSLTFFTEMDKAHAGELIRVLKDADQKVPDDLTKFPTTIKKKTHSSYGDHFKELVPGKAKKITFDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.54
3	0.65
4	0.72
5	0.78
6	0.85
7	0.9
8	0.93
9	0.92
10	0.89
11	0.86
12	0.81
13	0.79
14	0.72
15	0.66
16	0.6
17	0.52
18	0.47
19	0.46
20	0.45
21	0.4
22	0.38
23	0.35
24	0.32
25	0.31
26	0.31
27	0.27
28	0.29
29	0.28
30	0.28
31	0.28
32	0.26
33	0.28
34	0.33
35	0.36
36	0.31
37	0.32
38	0.34
39	0.41
40	0.46
41	0.53
42	0.56
43	0.59
44	0.66
45	0.71
46	0.77
47	0.78
48	0.8
49	0.8
50	0.76
51	0.72
52	0.65
53	0.6
54	0.51
55	0.41
56	0.34
57	0.25
58	0.21
59	0.17
60	0.14
61	0.15
62	0.19
63	0.23
64	0.27
65	0.38
66	0.45
67	0.55
68	0.66
69	0.72
70	0.78
71	0.86
72	0.91
73	0.92
74	0.94
75	0.94
76	0.95
77	0.96
78	0.93
79	0.9
80	0.88
81	0.82
82	0.79
83	0.72
84	0.64
85	0.58
86	0.51
87	0.42
88	0.33
89	0.32
90	0.26
91	0.26
92	0.32
93	0.32
94	0.39
95	0.49
96	0.59
97	0.66
98	0.76
99	0.83
100	0.85
101	0.91
102	0.94
103	0.92
104	0.89
105	0.85
106	0.82
107	0.8
108	0.71
109	0.62
110	0.54
111	0.49
112	0.42
113	0.35
114	0.27
115	0.19
116	0.16
117	0.14
118	0.13
119	0.09
120	0.09
121	0.09
122	0.07
123	0.07
124	0.06
125	0.08
126	0.08
127	0.08
128	0.08
129	0.09
130	0.1
131	0.11
132	0.12
133	0.1
134	0.12
135	0.12
136	0.12
137	0.15
138	0.15
139	0.16
140	0.15
141	0.18
142	0.16
143	0.16
144	0.17
145	0.14
146	0.15
147	0.13
148	0.17
149	0.15
150	0.15
151	0.15
152	0.15
153	0.12
154	0.1
155	0.11
156	0.09
157	0.09
158	0.09
159	0.1
160	0.11
161	0.15
162	0.17
163	0.16
164	0.15
165	0.15
166	0.17
167	0.18
168	0.22
169	0.23
170	0.26
171	0.26
172	0.26
173	0.31
174	0.28
175	0.26
176	0.21
177	0.17
178	0.12
179	0.17
180	0.17
181	0.14
182	0.16
183	0.14
184	0.15
185	0.17
186	0.21
187	0.17
188	0.17
189	0.18
190	0.21
191	0.22
192	0.21
193	0.21
194	0.17
195	0.18
196	0.18
197	0.16
198	0.13
199	0.15
200	0.16
201	0.15
202	0.17
203	0.15
204	0.18
205	0.26
206	0.27
207	0.25
208	0.25
209	0.25
210	0.23
211	0.23
212	0.19
213	0.11
214	0.1
215	0.08
216	0.08
217	0.08
218	0.08
219	0.08
220	0.09
221	0.08
222	0.07
223	0.07
224	0.05
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.07
230	0.08
231	0.08
232	0.09
233	0.09
234	0.14
235	0.14
236	0.15
237	0.15
238	0.15
239	0.19
240	0.2
241	0.3
242	0.32
243	0.4
244	0.45
245	0.48
246	0.48
247	0.49
248	0.54
249	0.52
250	0.49
251	0.46
252	0.44
253	0.41
254	0.41
255	0.35
256	0.27
257	0.2
258	0.16
259	0.08
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.05
265	0.09
266	0.08
267	0.09
268	0.13
269	0.12
270	0.12
271	0.13
272	0.12
273	0.08
274	0.09
275	0.08
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.05
284	0.05
285	0.04
286	0.04
287	0.03
288	0.03
289	0.04
290	0.05
291	0.07
292	0.08
293	0.1
294	0.12
295	0.13
296	0.16
297	0.2
298	0.21
299	0.21
300	0.22
301	0.21
302	0.21
303	0.21
304	0.18
305	0.13
306	0.11
307	0.1
308	0.12
309	0.12
310	0.12
311	0.11
312	0.1
313	0.1
314	0.1
315	0.1
316	0.06
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.08
323	0.08
324	0.07
325	0.04
326	0.04
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.03
332	0.03
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.03
337	0.03
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.05
342	0.05
343	0.07
344	0.08
345	0.08
346	0.1
347	0.1
348	0.1
349	0.1
350	0.1
351	0.08
352	0.09
353	0.12
354	0.13
355	0.13
356	0.13
357	0.15
358	0.18
359	0.22
360	0.27
361	0.28
362	0.3
363	0.34
364	0.34
365	0.34
366	0.31
367	0.27
368	0.22
369	0.21
370	0.16
371	0.16
372	0.15
373	0.15
374	0.16
375	0.16
376	0.15
377	0.12
378	0.13
379	0.12
380	0.11
381	0.11
382	0.1
383	0.12
384	0.13
385	0.11
386	0.09
387	0.08
388	0.09
389	0.09
390	0.08
391	0.07
392	0.08
393	0.08
394	0.09
395	0.09
396	0.1
397	0.13
398	0.15
399	0.14
400	0.15
401	0.15
402	0.15
403	0.16
404	0.16
405	0.15
406	0.14
407	0.14
408	0.12
409	0.12
410	0.11
411	0.1
412	0.09
413	0.09
414	0.1
415	0.1
416	0.13
417	0.15
418	0.19
419	0.24
420	0.27
421	0.29
422	0.32
423	0.33
424	0.34
425	0.35
426	0.34
427	0.36
428	0.4
429	0.39
430	0.37
431	0.4
432	0.4
433	0.42
434	0.4
435	0.35
436	0.3
437	0.31
438	0.3
439	0.31
440	0.3
441	0.28
442	0.3
443	0.29
444	0.33
445	0.3
446	0.32
447	0.34
448	0.37
449	0.42
450	0.44
451	0.46
452	0.47
453	0.47
454	0.46
455	0.39
456	0.34
457	0.3
458	0.28
459	0.28
460	0.24
461	0.25
462	0.24
463	0.24
464	0.23
465	0.21
466	0.2
467	0.19
468	0.18
469	0.15
470	0.13
471	0.13
472	0.12
473	0.14
474	0.14
475	0.17
476	0.18
477	0.2
478	0.21
479	0.21
480	0.24
481	0.23
482	0.27
483	0.21
484	0.21
485	0.19
486	0.19
487	0.19
488	0.15
489	0.14
490	0.1
491	0.09
492	0.08
493	0.07
494	0.06
495	0.08
496	0.09
497	0.09
498	0.08
499	0.09
500	0.11
501	0.13
502	0.13
503	0.11
504	0.12
505	0.13
506	0.13
507	0.14
508	0.12
509	0.1
510	0.11
511	0.13
512	0.14
513	0.14
514	0.15
515	0.16
516	0.19
517	0.21
518	0.23
519	0.2
520	0.2
521	0.21
522	0.24
523	0.31
524	0.34
525	0.34
526	0.41
527	0.44
528	0.44
529	0.5
530	0.49
531	0.44
532	0.41
533	0.4
534	0.35
535	0.37
536	0.35
537	0.3
538	0.31
539	0.29
540	0.29
541	0.3
542	0.27
543	0.22
544	0.24
545	0.22
546	0.17
547	0.21
548	0.22
549	0.2
550	0.2
551	0.21
552	0.22
553	0.29
554	0.31
555	0.31
556	0.3
557	0.31
558	0.34
559	0.36
560	0.35
561	0.29
562	0.29
563	0.3
564	0.3
565	0.29
566	0.3
567	0.37
568	0.42
569	0.48
570	0.55
571	0.56
572	0.62
573	0.67
574	0.72
575	0.69
576	0.69
577	0.7
578	0.72
579	0.68
580	0.62
581	0.58
582	0.48
583	0.5
584	0.46
585	0.43
586	0.4
587	0.4
588	0.43
589	0.5
590	0.5

R9PDQ3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer