FuNGI

R9PEC6

Protein Details

Accession

R9PEC6

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
388-416	DVVLVKKSYPERKKRSKHRMWKLKSMAKE	Hydrophilic
464-488	NLYRDAKKEEERKLRKERAAQIKAE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
397-412	PERKKRSKHRMWKLKS
474-481	ERKLRKER

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto 7, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3
CDD	cd22249 UDM1_RNF168_RNF169-like

Amino Acid Sequences

MVLCADCGTPITPNNANLCLSCLRNSVDITESVPKQATVNFCRNCERYLNPPNSWVPARLESRELLAICLKKLKGLNKVRLIDAGFIWTEPHSKRLRVKLTVQKEVFTSTILQQIFEVEFVVQYGQCPDCTRLAAKNTWRAMVQVRQKVQHKRTFLYLEQLILKHNAHQNTISINEKKDGLDFFYTQRSHAIKMVEFLNSVVPIKTTKSEQVISMDVHTSTTNYKFTYSVEIAPICKDDLVCLPPKMAKQLGNIGQLVLCHKVTNSLRFIDPISLQLAEVPAEKYWRDPQPPLATIPEMIEFLVLDIEPTGRYATNTHGVQNRRLEEADAQVSPLNATSFGEADAVYHTRTHLGAILQPGDTVMGYHLRVANFNSATWDTLPADRMPDVVLVKKSYPERKKRSKHRMWKLKSMAKEAEDPSAEGAVGRGAVGRRGGLDSQRVERDYELFLRELEEDEEMRGTVNLYRDAKKEEERKLRKERAAQIKAEREAALANGGMEEDGEFDDGATTDGESEWGDDDAPRVGMDELLDDLEDMAIED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.32
3	0.32
4	0.29
5	0.31
6	0.29
7	0.28
8	0.26
9	0.25
10	0.25
11	0.27
12	0.28
13	0.26
14	0.25
15	0.23
16	0.25
17	0.29
18	0.27
19	0.27
20	0.27
21	0.24
22	0.23
23	0.27
24	0.31
25	0.31
26	0.4
27	0.41
28	0.44
29	0.52
30	0.52
31	0.51
32	0.49
33	0.46
34	0.46
35	0.52
36	0.56
37	0.5
38	0.54
39	0.53
40	0.54
41	0.51
42	0.45
43	0.4
44	0.39
45	0.42
46	0.39
47	0.39
48	0.34
49	0.34
50	0.36
51	0.31
52	0.25
53	0.26
54	0.26
55	0.24
56	0.3
57	0.27
58	0.27
59	0.32
60	0.37
61	0.42
62	0.49
63	0.58
64	0.6
65	0.63
66	0.6
67	0.58
68	0.53
69	0.45
70	0.35
71	0.29
72	0.2
73	0.17
74	0.17
75	0.14
76	0.18
77	0.17
78	0.24
79	0.25
80	0.3
81	0.38
82	0.46
83	0.54
84	0.54
85	0.62
86	0.65
87	0.69
88	0.74
89	0.67
90	0.59
91	0.52
92	0.49
93	0.4
94	0.31
95	0.25
96	0.16
97	0.22
98	0.2
99	0.19
100	0.16
101	0.18
102	0.17
103	0.15
104	0.13
105	0.07
106	0.07
107	0.07
108	0.08
109	0.06
110	0.06
111	0.09
112	0.1
113	0.11
114	0.13
115	0.15
116	0.16
117	0.18
118	0.2
119	0.23
120	0.27
121	0.32
122	0.36
123	0.43
124	0.42
125	0.42
126	0.39
127	0.36
128	0.36
129	0.37
130	0.4
131	0.39
132	0.41
133	0.46
134	0.54
135	0.62
136	0.66
137	0.65
138	0.61
139	0.55
140	0.58
141	0.57
142	0.5
143	0.47
144	0.39
145	0.34
146	0.33
147	0.31
148	0.26
149	0.23
150	0.22
151	0.2
152	0.24
153	0.23
154	0.22
155	0.23
156	0.22
157	0.21
158	0.24
159	0.25
160	0.23
161	0.23
162	0.22
163	0.23
164	0.22
165	0.22
166	0.2
167	0.17
168	0.17
169	0.17
170	0.18
171	0.24
172	0.23
173	0.22
174	0.27
175	0.25
176	0.24
177	0.25
178	0.26
179	0.19
180	0.21
181	0.22
182	0.17
183	0.16
184	0.15
185	0.13
186	0.11
187	0.11
188	0.09
189	0.08
190	0.08
191	0.1
192	0.11
193	0.12
194	0.14
195	0.17
196	0.18
197	0.19
198	0.2
199	0.21
200	0.2
201	0.19
202	0.16
203	0.13
204	0.13
205	0.11
206	0.1
207	0.1
208	0.12
209	0.12
210	0.12
211	0.13
212	0.13
213	0.13
214	0.18
215	0.17
216	0.16
217	0.17
218	0.17
219	0.17
220	0.17
221	0.17
222	0.11
223	0.1
224	0.09
225	0.08
226	0.09
227	0.11
228	0.13
229	0.13
230	0.14
231	0.16
232	0.16
233	0.18
234	0.19
235	0.18
236	0.18
237	0.24
238	0.28
239	0.28
240	0.27
241	0.24
242	0.22
243	0.2
244	0.19
245	0.14
246	0.1
247	0.07
248	0.07
249	0.14
250	0.15
251	0.19
252	0.2
253	0.2
254	0.2
255	0.2
256	0.21
257	0.16
258	0.15
259	0.12
260	0.11
261	0.09
262	0.09
263	0.09
264	0.08
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.06
269	0.07
270	0.07
271	0.09
272	0.14
273	0.19
274	0.21
275	0.21
276	0.28
277	0.32
278	0.34
279	0.33
280	0.3
281	0.25
282	0.23
283	0.22
284	0.16
285	0.11
286	0.09
287	0.08
288	0.06
289	0.05
290	0.05
291	0.04
292	0.03
293	0.03
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.05
298	0.05
299	0.06
300	0.07
301	0.1
302	0.16
303	0.16
304	0.19
305	0.24
306	0.26
307	0.31
308	0.35
309	0.34
310	0.3
311	0.3
312	0.27
313	0.23
314	0.24
315	0.21
316	0.16
317	0.15
318	0.13
319	0.13
320	0.12
321	0.11
322	0.08
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.07
329	0.06
330	0.06
331	0.08
332	0.08
333	0.08
334	0.08
335	0.08
336	0.09
337	0.09
338	0.09
339	0.09
340	0.09
341	0.11
342	0.13
343	0.14
344	0.13
345	0.13
346	0.12
347	0.1
348	0.09
349	0.07
350	0.06
351	0.07
352	0.07
353	0.09
354	0.11
355	0.12
356	0.13
357	0.14
358	0.19
359	0.17
360	0.17
361	0.19
362	0.18
363	0.18
364	0.18
365	0.19
366	0.14
367	0.15
368	0.17
369	0.14
370	0.15
371	0.14
372	0.14
373	0.12
374	0.13
375	0.13
376	0.15
377	0.17
378	0.17
379	0.18
380	0.22
381	0.28
382	0.36
383	0.44
384	0.51
385	0.59
386	0.69
387	0.78
388	0.85
389	0.9
390	0.91
391	0.92
392	0.93
393	0.94
394	0.9
395	0.9
396	0.89
397	0.84
398	0.78
399	0.75
400	0.68
401	0.59
402	0.58
403	0.49
404	0.44
405	0.38
406	0.33
407	0.27
408	0.22
409	0.19
410	0.13
411	0.11
412	0.07
413	0.06
414	0.06
415	0.07
416	0.07
417	0.09
418	0.09
419	0.1
420	0.1
421	0.13
422	0.15
423	0.16
424	0.22
425	0.24
426	0.28
427	0.33
428	0.32
429	0.31
430	0.3
431	0.3
432	0.27
433	0.27
434	0.24
435	0.2
436	0.19
437	0.2
438	0.19
439	0.18
440	0.16
441	0.14
442	0.12
443	0.13
444	0.13
445	0.11
446	0.11
447	0.1
448	0.1
449	0.11
450	0.13
451	0.19
452	0.23
453	0.27
454	0.29
455	0.34
456	0.38
457	0.43
458	0.49
459	0.52
460	0.59
461	0.65
462	0.72
463	0.78
464	0.83
465	0.81
466	0.82
467	0.82
468	0.82
469	0.81
470	0.78
471	0.76
472	0.75
473	0.7
474	0.64
475	0.54
476	0.43
477	0.36
478	0.3
479	0.23
480	0.14
481	0.12
482	0.09
483	0.09
484	0.08
485	0.07
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.07
490	0.06
491	0.06
492	0.07
493	0.07
494	0.08
495	0.07
496	0.07
497	0.06
498	0.07
499	0.08
500	0.07
501	0.08
502	0.08
503	0.08
504	0.09
505	0.09
506	0.1
507	0.11
508	0.11
509	0.1
510	0.11
511	0.11
512	0.11
513	0.11
514	0.11
515	0.1
516	0.1
517	0.1
518	0.09
519	0.08
520	0.08

R9PEC6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer