Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9PCF6

Protein Details
Accession R9PCF6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
293-327PSTPAKPKPSPQKQVKPIKKPKKVLGKRKYREIGPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
296-332PAKPKPSPQKQVKPIKKPKKVLGKRKYREIGPMERRS
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 9.166, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015350  Beta-trefoil_DNA-bd_dom  
IPR036358  BTD_sf  
IPR040159  CLS_fam  
IPR008967  p53-like_TF_DNA-bd_sf  
IPR015351  RBP-J/Cbf11/Cbf12_DNA-bd  
IPR037095  RBP-J/Cbf11_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09270  BTD  
PF09271  LAG1-DNAbind  
Amino Acid Sequences MEAGESIHSAAAGPSAQNCASSALQQYPASGSATDKQQWNGLNAGTSPEHPSPDLTIMDHVPQLEASALADLMSPSKTRDPADPTEPSLEEQIQAFTAGLADQLGSQPEAHFTPMEGSAVNSTYDTPTQGQGTPATAEDISSFETLIASLMPTPQTGSPAPQQPESASAQAGSQPAAAPTTQAASTASEPQASSSLSAANNSAQSFVDNLLRDANLLPPEASAQQQQSASSSYDVADASTTGPSTANEAKSGTVGDDALAASLEQFMASLQERVSSSLATEGTTEFQQPKEAPSTPAKPKPSPQKQVKPIKKPKKVLGKRKYREIGPMERRSRVEKAISEYIASIDTLTKPNTVTGPIPAASKTKMTTIRCSHASVAQKSYGSEKRFFNPPPIISVTGPLRRYAEHGAAVLHTSQTAEDADEEDQCRVSLLVRGDTDEFYSNENVAVLDSRLETKMRSLYVTPTGRSKAFRLQLNLLRPSGLEPHLPIFSPLKKSRASEAVSPAISTESPANEQTDAGSEVLSRLPKGLAWASFESAPVAIISKSSKKTAKPRGQTNQVQNGSLVSLFNRINSQTARTKYMHSSTGGDLTVHSAEWSTYRITLISRPPLAELAGAEEDSVTYGSTIVLTDVNTGFSSDPLVVCKVDKGQVQLPQLDPPAELLTAGSGNKSRRVPIDRALRDKLAAVSRSSSNANASMPGRGGSAFTNGVERPGSSFQSAIKIEGAETGLNSVSAKGASTSANDGSESKEKDDLNLYGPVGQLQKVALMRFVPSDDSETVFGDSEHLESNFSTPRSYLCAMMPDAWKHTSPDKVGQEPLAVDFAQTHEEGLGLGMPPSDTKDRHKTGESNSIVFVTPKTVTASKENGPGIKIVDEVDDAYVWTVIGVSRFEYSYFDTSATQASKDEGPCEVPMTPFPLITSMPTYDQTKHTLVTTVTNFIVPAAITSDPIPLDVWVGSLGPLKVQHTTKPESEVYITVTLPPIRDMLKLALTGKIDNPMSGDTVPPHFLLPLIFVNDSDGTAYHSGRHIVCEDLVQLMKATGHDTTADVLKQLGFGLGDLAGPPKDGAWSLRII
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.14
3 0.14
4 0.14
5 0.15
6 0.18
7 0.18
8 0.2
9 0.22
10 0.22
11 0.27
12 0.26
13 0.27
14 0.25
15 0.25
16 0.24
17 0.21
18 0.2
19 0.2
20 0.26
21 0.3
22 0.31
23 0.31
24 0.35
25 0.37
26 0.36
27 0.34
28 0.29
29 0.26
30 0.23
31 0.26
32 0.22
33 0.21
34 0.25
35 0.24
36 0.25
37 0.24
38 0.25
39 0.24
40 0.27
41 0.26
42 0.21
43 0.22
44 0.22
45 0.23
46 0.23
47 0.2
48 0.16
49 0.15
50 0.14
51 0.11
52 0.1
53 0.08
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.08
60 0.09
61 0.1
62 0.12
63 0.18
64 0.21
65 0.23
66 0.29
67 0.35
68 0.4
69 0.46
70 0.46
71 0.45
72 0.46
73 0.45
74 0.4
75 0.37
76 0.31
77 0.26
78 0.23
79 0.2
80 0.15
81 0.15
82 0.13
83 0.09
84 0.08
85 0.07
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.07
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.12
96 0.13
97 0.14
98 0.13
99 0.12
100 0.14
101 0.14
102 0.15
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.14
107 0.14
108 0.11
109 0.12
110 0.13
111 0.14
112 0.16
113 0.15
114 0.17
115 0.19
116 0.2
117 0.2
118 0.19
119 0.2
120 0.19
121 0.17
122 0.17
123 0.15
124 0.14
125 0.12
126 0.12
127 0.13
128 0.12
129 0.12
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.05
136 0.06
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.1
141 0.1
142 0.14
143 0.15
144 0.18
145 0.23
146 0.3
147 0.33
148 0.33
149 0.33
150 0.3
151 0.34
152 0.33
153 0.29
154 0.21
155 0.18
156 0.17
157 0.19
158 0.18
159 0.15
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.12
164 0.11
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.12
172 0.14
173 0.18
174 0.18
175 0.18
176 0.18
177 0.18
178 0.19
179 0.17
180 0.16
181 0.11
182 0.15
183 0.13
184 0.14
185 0.14
186 0.14
187 0.16
188 0.15
189 0.16
190 0.12
191 0.12
192 0.13
193 0.13
194 0.16
195 0.14
196 0.15
197 0.15
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.17
202 0.14
203 0.14
204 0.14
205 0.12
206 0.14
207 0.14
208 0.15
209 0.15
210 0.15
211 0.18
212 0.18
213 0.18
214 0.18
215 0.19
216 0.19
217 0.16
218 0.15
219 0.12
220 0.13
221 0.13
222 0.11
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.08
230 0.08
231 0.12
232 0.17
233 0.17
234 0.17
235 0.18
236 0.18
237 0.18
238 0.18
239 0.14
240 0.09
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.06
255 0.07
256 0.08
257 0.07
258 0.1
259 0.11
260 0.13
261 0.14
262 0.12
263 0.11
264 0.13
265 0.13
266 0.11
267 0.11
268 0.1
269 0.11
270 0.12
271 0.14
272 0.12
273 0.12
274 0.15
275 0.15
276 0.18
277 0.21
278 0.22
279 0.24
280 0.29
281 0.36
282 0.41
283 0.48
284 0.51
285 0.5
286 0.56
287 0.63
288 0.67
289 0.7
290 0.72
291 0.75
292 0.79
293 0.87
294 0.89
295 0.89
296 0.9
297 0.9
298 0.89
299 0.86
300 0.85
301 0.85
302 0.85
303 0.85
304 0.85
305 0.85
306 0.81
307 0.84
308 0.8
309 0.71
310 0.7
311 0.65
312 0.66
313 0.64
314 0.69
315 0.62
316 0.61
317 0.61
318 0.57
319 0.54
320 0.47
321 0.42
322 0.35
323 0.38
324 0.38
325 0.37
326 0.32
327 0.29
328 0.25
329 0.21
330 0.17
331 0.11
332 0.08
333 0.09
334 0.11
335 0.11
336 0.12
337 0.11
338 0.13
339 0.13
340 0.14
341 0.13
342 0.13
343 0.14
344 0.14
345 0.15
346 0.15
347 0.16
348 0.15
349 0.16
350 0.15
351 0.18
352 0.24
353 0.26
354 0.34
355 0.36
356 0.4
357 0.41
358 0.42
359 0.38
360 0.36
361 0.41
362 0.35
363 0.34
364 0.31
365 0.29
366 0.28
367 0.33
368 0.34
369 0.3
370 0.32
371 0.31
372 0.32
373 0.38
374 0.39
375 0.39
376 0.39
377 0.36
378 0.35
379 0.36
380 0.35
381 0.29
382 0.31
383 0.29
384 0.29
385 0.29
386 0.25
387 0.23
388 0.21
389 0.24
390 0.24
391 0.22
392 0.17
393 0.17
394 0.16
395 0.15
396 0.15
397 0.12
398 0.09
399 0.07
400 0.06
401 0.05
402 0.06
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.07
407 0.07
408 0.09
409 0.1
410 0.09
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.07
415 0.07
416 0.09
417 0.1
418 0.13
419 0.13
420 0.14
421 0.15
422 0.15
423 0.16
424 0.14
425 0.13
426 0.12
427 0.13
428 0.11
429 0.1
430 0.1
431 0.09
432 0.07
433 0.07
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.07
438 0.07
439 0.08
440 0.08
441 0.09
442 0.12
443 0.12
444 0.13
445 0.13
446 0.15
447 0.23
448 0.25
449 0.23
450 0.24
451 0.26
452 0.26
453 0.27
454 0.27
455 0.26
456 0.29
457 0.31
458 0.32
459 0.35
460 0.39
461 0.42
462 0.42
463 0.35
464 0.3
465 0.27
466 0.24
467 0.21
468 0.17
469 0.13
470 0.11
471 0.13
472 0.13
473 0.13
474 0.13
475 0.13
476 0.15
477 0.22
478 0.23
479 0.25
480 0.27
481 0.28
482 0.3
483 0.33
484 0.32
485 0.29
486 0.31
487 0.3
488 0.28
489 0.27
490 0.24
491 0.18
492 0.15
493 0.12
494 0.09
495 0.07
496 0.08
497 0.09
498 0.1
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.08
505 0.07
506 0.06
507 0.06
508 0.08
509 0.08
510 0.07
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.08
515 0.1
516 0.09
517 0.12
518 0.13
519 0.13
520 0.13
521 0.13
522 0.12
523 0.1
524 0.09
525 0.05
526 0.05
527 0.04
528 0.05
529 0.07
530 0.11
531 0.12
532 0.16
533 0.2
534 0.24
535 0.34
536 0.44
537 0.51
538 0.54
539 0.62
540 0.66
541 0.71
542 0.73
543 0.71
544 0.7
545 0.62
546 0.55
547 0.46
548 0.38
549 0.29
550 0.23
551 0.16
552 0.06
553 0.09
554 0.08
555 0.09
556 0.1
557 0.1
558 0.12
559 0.12
560 0.16
561 0.18
562 0.21
563 0.25
564 0.25
565 0.27
566 0.29
567 0.31
568 0.29
569 0.24
570 0.25
571 0.21
572 0.22
573 0.19
574 0.16
575 0.13
576 0.12
577 0.11
578 0.09
579 0.08
580 0.06
581 0.05
582 0.06
583 0.07
584 0.06
585 0.06
586 0.07
587 0.07
588 0.08
589 0.12
590 0.15
591 0.19
592 0.19
593 0.19
594 0.19
595 0.19
596 0.19
597 0.15
598 0.11
599 0.09
600 0.09
601 0.08
602 0.07
603 0.07
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.03
608 0.03
609 0.03
610 0.03
611 0.04
612 0.04
613 0.04
614 0.05
615 0.05
616 0.06
617 0.06
618 0.07
619 0.07
620 0.08
621 0.07
622 0.07
623 0.08
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.08
628 0.08
629 0.08
630 0.09
631 0.09
632 0.13
633 0.14
634 0.16
635 0.19
636 0.24
637 0.26
638 0.27
639 0.26
640 0.25
641 0.25
642 0.22
643 0.18
644 0.14
645 0.13
646 0.1
647 0.09
648 0.07
649 0.06
650 0.07
651 0.07
652 0.07
653 0.09
654 0.11
655 0.16
656 0.17
657 0.18
658 0.23
659 0.29
660 0.31
661 0.36
662 0.45
663 0.46
664 0.51
665 0.52
666 0.47
667 0.42
668 0.4
669 0.35
670 0.29
671 0.25
672 0.2
673 0.19
674 0.19
675 0.21
676 0.21
677 0.18
678 0.15
679 0.15
680 0.14
681 0.15
682 0.14
683 0.13
684 0.13
685 0.12
686 0.11
687 0.1
688 0.1
689 0.08
690 0.1
691 0.1
692 0.1
693 0.12
694 0.11
695 0.13
696 0.12
697 0.11
698 0.12
699 0.14
700 0.16
701 0.13
702 0.14
703 0.14
704 0.2
705 0.2
706 0.18
707 0.16
708 0.14
709 0.14
710 0.14
711 0.15
712 0.08
713 0.08
714 0.08
715 0.07
716 0.07
717 0.07
718 0.06
719 0.05
720 0.05
721 0.06
722 0.05
723 0.07
724 0.07
725 0.08
726 0.11
727 0.11
728 0.12
729 0.12
730 0.12
731 0.15
732 0.2
733 0.2
734 0.19
735 0.23
736 0.22
737 0.23
738 0.26
739 0.24
740 0.21
741 0.22
742 0.2
743 0.17
744 0.17
745 0.18
746 0.16
747 0.15
748 0.12
749 0.1
750 0.13
751 0.13
752 0.14
753 0.13
754 0.12
755 0.12
756 0.13
757 0.14
758 0.12
759 0.11
760 0.15
761 0.14
762 0.15
763 0.15
764 0.15
765 0.15
766 0.14
767 0.13
768 0.1
769 0.1
770 0.09
771 0.1
772 0.09
773 0.09
774 0.09
775 0.12
776 0.14
777 0.14
778 0.14
779 0.13
780 0.14
781 0.18
782 0.19
783 0.19
784 0.16
785 0.19
786 0.2
787 0.24
788 0.26
789 0.22
790 0.24
791 0.24
792 0.24
793 0.23
794 0.26
795 0.27
796 0.27
797 0.34
798 0.35
799 0.36
800 0.37
801 0.36
802 0.33
803 0.29
804 0.26
805 0.2
806 0.15
807 0.12
808 0.1
809 0.1
810 0.11
811 0.1
812 0.09
813 0.07
814 0.07
815 0.07
816 0.07
817 0.07
818 0.05
819 0.05
820 0.05
821 0.05
822 0.06
823 0.09
824 0.14
825 0.15
826 0.22
827 0.32
828 0.36
829 0.4
830 0.45
831 0.47
832 0.48
833 0.56
834 0.52
835 0.44
836 0.4
837 0.38
838 0.33
839 0.28
840 0.22
841 0.15
842 0.13
843 0.13
844 0.16
845 0.17
846 0.19
847 0.24
848 0.28
849 0.28
850 0.34
851 0.35
852 0.32
853 0.31
854 0.29
855 0.26
856 0.22
857 0.19
858 0.13
859 0.12
860 0.11
861 0.11
862 0.11
863 0.09
864 0.08
865 0.08
866 0.08
867 0.06
868 0.05
869 0.05
870 0.05
871 0.06
872 0.07
873 0.08
874 0.09
875 0.1
876 0.1
877 0.12
878 0.16
879 0.17
880 0.18
881 0.18
882 0.17
883 0.18
884 0.22
885 0.2
886 0.17
887 0.15
888 0.16
889 0.2
890 0.2
891 0.21
892 0.18
893 0.19
894 0.19
895 0.21
896 0.2
897 0.16
898 0.16
899 0.2
900 0.19
901 0.17
902 0.16
903 0.16
904 0.15
905 0.16
906 0.18
907 0.16
908 0.17
909 0.2
910 0.23
911 0.24
912 0.26
913 0.29
914 0.28
915 0.27
916 0.25
917 0.26
918 0.24
919 0.28
920 0.27
921 0.25
922 0.24
923 0.23
924 0.22
925 0.18
926 0.18
927 0.11
928 0.09
929 0.09
930 0.08
931 0.09
932 0.1
933 0.12
934 0.11
935 0.12
936 0.12
937 0.09
938 0.11
939 0.1
940 0.1
941 0.08
942 0.08
943 0.08
944 0.11
945 0.11
946 0.12
947 0.14
948 0.15
949 0.21
950 0.23
951 0.27
952 0.31
953 0.36
954 0.36
955 0.4
956 0.4
957 0.37
958 0.37
959 0.33
960 0.3
961 0.27
962 0.25
963 0.21
964 0.24
965 0.22
966 0.2
967 0.2
968 0.18
969 0.17
970 0.17
971 0.19
972 0.18
973 0.2
974 0.22
975 0.22
976 0.24
977 0.24
978 0.25
979 0.24
980 0.27
981 0.24
982 0.22
983 0.23
984 0.2
985 0.21
986 0.2
987 0.2
988 0.16
989 0.19
990 0.21
991 0.19
992 0.19
993 0.16
994 0.16
995 0.15
996 0.16
997 0.15
998 0.17
999 0.17
1000 0.16
1001 0.19
1002 0.19
1003 0.19
1004 0.16
1005 0.13
1006 0.14
1007 0.16
1008 0.16
1009 0.15
1010 0.17
1011 0.21
1012 0.2
1013 0.24
1014 0.21
1015 0.21
1016 0.21
1017 0.21
1018 0.2
1019 0.2
1020 0.2
1021 0.17
1022 0.16
1023 0.14
1024 0.15
1025 0.13
1026 0.15
1027 0.11
1028 0.11
1029 0.12
1030 0.12
1031 0.14
1032 0.17
1033 0.16
1034 0.15
1035 0.15
1036 0.14
1037 0.14
1038 0.13
1039 0.12
1040 0.09
1041 0.08
1042 0.09
1043 0.08
1044 0.08
1045 0.08
1046 0.11
1047 0.09
1048 0.1
1049 0.1
1050 0.09
1051 0.1
1052 0.12
1053 0.14