FuNGI

R9P127

Protein Details

Accession

R9P127

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
85-109	RTSPGSKKKGLGKKEKKSKEVDFTS	Basic
662-685	AENTGKRRADRKAEQQQQHEKEHT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
89-103	GSKKKGLGKKEKKSK

Subcellular Location(s)

mito 19.5, cyto_mito 12.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR001406 PsdUridine_synth_TruA IPR020097 PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom IPR020095 PsdUridine_synth_TruA_C IPR020094 TruA/RsuA/RluB/E/F_N
Gene Ontology	GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01416 PseudoU_synth_1

Amino Acid Sequences

MAHLLTRIQVIRPRLVPAVRSLHLTAPLFRTDTALRIWQRKMEVKDRYRSWTKDSLISRIAELEAQTKSERAAQAGIDTAAFVERTSPGSKKKGLGKKEKKSKEVDFTSAGCRKIALRFSYDGAGYAGLAAQNGEGAGSSLPTVEGVLWEALCTARLVDAKAGMDGAGFSRCGRTDRGVSAAGQVVALWVRSRKLNQWEQRLTHQEQFSLSTPLASRPSGEEWRELEDKRNSKLEEHELPYVQILNRILPATIRIQAWSPVRSDFSSRFDCVYRHYKYFFPSGPPNIFYPPTTTSTATNLGIGGGQDAGATRLDIDLMRDAASRLLGEHDFRNLCKIDASKQITNFRRRIDGVSIDRVSSHWPSNHDVVPDDGDGEKENMYVLNLRGTAFLYHQVRNIMAILFLVGARLESPSIVEELMNVSTGRIAADRVQMRLAAETGTRATANSTSPSDREAGLKWWLPVNATSSSDCNSTPTGLPMWMHTALSTHPSDFARSDAELEIYATKPNYEMAADRPLVLWECGFLPSDIEWRVGAYDGPLSSISPPEQQDNNVSASNSLLRVHKTWTQMAISTELSRHFVLASPSAKTGTLASRTDFADAAYPCLQSTKEQRSSEEEETRKERLKSGVIPLGNGTGRGAMNYVPLGQRPREETYEVKNRRWAENTGKRRADRKAEQQQQHEKEHTVNGGGSGPGAEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.41
3	0.39
4	0.41
5	0.43
6	0.38
7	0.4
8	0.38
9	0.35
10	0.39
11	0.39
12	0.35
13	0.31
14	0.33
15	0.3
16	0.28
17	0.29
18	0.24
19	0.25
20	0.24
21	0.29
22	0.32
23	0.38
24	0.4
25	0.41
26	0.47
27	0.53
28	0.57
29	0.58
30	0.63
31	0.65
32	0.71
33	0.71
34	0.73
35	0.73
36	0.7
37	0.67
38	0.66
39	0.61
40	0.59
41	0.58
42	0.56
43	0.51
44	0.48
45	0.42
46	0.34
47	0.32
48	0.25
49	0.23
50	0.2
51	0.17
52	0.18
53	0.18
54	0.17
55	0.17
56	0.22
57	0.22
58	0.19
59	0.2
60	0.18
61	0.19
62	0.21
63	0.2
64	0.14
65	0.12
66	0.11
67	0.1
68	0.09
69	0.07
70	0.07
71	0.08
72	0.12
73	0.15
74	0.2
75	0.26
76	0.32
77	0.37
78	0.42
79	0.51
80	0.56
81	0.63
82	0.7
83	0.74
84	0.78
85	0.85
86	0.87
87	0.84
88	0.84
89	0.82
90	0.8
91	0.75
92	0.69
93	0.62
94	0.55
95	0.57
96	0.54
97	0.46
98	0.36
99	0.31
100	0.29
101	0.31
102	0.35
103	0.29
104	0.29
105	0.31
106	0.33
107	0.34
108	0.32
109	0.27
110	0.2
111	0.17
112	0.12
113	0.1
114	0.09
115	0.06
116	0.06
117	0.05
118	0.04
119	0.04
120	0.04
121	0.04
122	0.03
123	0.04
124	0.04
125	0.04
126	0.04
127	0.04
128	0.05
129	0.05
130	0.05
131	0.04
132	0.05
133	0.06
134	0.07
135	0.06
136	0.06
137	0.07
138	0.07
139	0.07
140	0.07
141	0.05
142	0.08
143	0.09
144	0.1
145	0.11
146	0.13
147	0.13
148	0.13
149	0.13
150	0.1
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.07
155	0.07
156	0.07
157	0.09
158	0.1
159	0.12
160	0.15
161	0.18
162	0.21
163	0.22
164	0.26
165	0.25
166	0.24
167	0.25
168	0.24
169	0.19
170	0.15
171	0.13
172	0.1
173	0.09
174	0.09
175	0.08
176	0.07
177	0.09
178	0.12
179	0.15
180	0.21
181	0.29
182	0.39
183	0.46
184	0.54
185	0.6
186	0.6
187	0.65
188	0.66
189	0.61
190	0.58
191	0.51
192	0.42
193	0.36
194	0.37
195	0.31
196	0.26
197	0.22
198	0.17
199	0.16
200	0.18
201	0.2
202	0.16
203	0.15
204	0.15
205	0.21
206	0.25
207	0.25
208	0.26
209	0.25
210	0.3
211	0.33
212	0.31
213	0.33
214	0.36
215	0.38
216	0.38
217	0.42
218	0.38
219	0.37
220	0.41
221	0.4
222	0.39
223	0.39
224	0.38
225	0.33
226	0.32
227	0.31
228	0.28
229	0.21
230	0.17
231	0.14
232	0.12
233	0.13
234	0.13
235	0.12
236	0.1
237	0.12
238	0.11
239	0.14
240	0.13
241	0.12
242	0.13
243	0.18
244	0.21
245	0.2
246	0.19
247	0.17
248	0.19
249	0.2
250	0.22
251	0.21
252	0.23
253	0.26
254	0.25
255	0.26
256	0.25
257	0.25
258	0.26
259	0.32
260	0.3
261	0.29
262	0.3
263	0.31
264	0.32
265	0.37
266	0.33
267	0.3
268	0.32
269	0.34
270	0.34
271	0.34
272	0.33
273	0.3
274	0.29
275	0.24
276	0.22
277	0.2
278	0.22
279	0.22
280	0.22
281	0.2
282	0.22
283	0.24
284	0.2
285	0.17
286	0.14
287	0.11
288	0.1
289	0.09
290	0.07
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.05
303	0.05
304	0.06
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.06
311	0.05
312	0.07
313	0.07
314	0.08
315	0.09
316	0.12
317	0.13
318	0.13
319	0.16
320	0.14
321	0.14
322	0.14
323	0.15
324	0.15
325	0.23
326	0.28
327	0.27
328	0.31
329	0.39
330	0.44
331	0.5
332	0.5
333	0.43
334	0.41
335	0.4
336	0.38
337	0.32
338	0.32
339	0.28
340	0.3
341	0.29
342	0.26
343	0.25
344	0.22
345	0.22
346	0.18
347	0.18
348	0.14
349	0.16
350	0.19
351	0.22
352	0.23
353	0.21
354	0.19
355	0.17
356	0.17
357	0.14
358	0.12
359	0.09
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.06
365	0.06
366	0.05
367	0.06
368	0.07
369	0.07
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.09
374	0.09
375	0.1
376	0.09
377	0.14
378	0.16
379	0.16
380	0.17
381	0.18
382	0.17
383	0.17
384	0.17
385	0.11
386	0.08
387	0.07
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.04
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.04
396	0.04
397	0.03
398	0.04
399	0.04
400	0.05
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.06
405	0.06
406	0.07
407	0.06
408	0.05
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.05
413	0.06
414	0.07
415	0.13
416	0.15
417	0.15
418	0.16
419	0.16
420	0.16
421	0.16
422	0.14
423	0.09
424	0.08
425	0.08
426	0.08
427	0.08
428	0.08
429	0.07
430	0.08
431	0.09
432	0.1
433	0.12
434	0.14
435	0.14
436	0.15
437	0.16
438	0.16
439	0.15
440	0.16
441	0.15
442	0.15
443	0.18
444	0.19
445	0.18
446	0.19
447	0.19
448	0.18
449	0.18
450	0.19
451	0.17
452	0.17
453	0.18
454	0.17
455	0.17
456	0.18
457	0.17
458	0.15
459	0.14
460	0.14
461	0.13
462	0.13
463	0.13
464	0.13
465	0.13
466	0.12
467	0.16
468	0.14
469	0.14
470	0.12
471	0.12
472	0.12
473	0.16
474	0.15
475	0.11
476	0.14
477	0.14
478	0.16
479	0.16
480	0.17
481	0.15
482	0.14
483	0.16
484	0.13
485	0.13
486	0.11
487	0.12
488	0.12
489	0.1
490	0.12
491	0.1
492	0.1
493	0.09
494	0.1
495	0.1
496	0.09
497	0.1
498	0.12
499	0.18
500	0.18
501	0.18
502	0.18
503	0.18
504	0.18
505	0.17
506	0.14
507	0.08
508	0.09
509	0.1
510	0.1
511	0.09
512	0.09
513	0.09
514	0.13
515	0.14
516	0.14
517	0.13
518	0.12
519	0.13
520	0.12
521	0.11
522	0.08
523	0.1
524	0.09
525	0.1
526	0.1
527	0.1
528	0.1
529	0.13
530	0.13
531	0.15
532	0.17
533	0.2
534	0.21
535	0.23
536	0.26
537	0.26
538	0.28
539	0.25
540	0.23
541	0.19
542	0.19
543	0.19
544	0.16
545	0.15
546	0.15
547	0.16
548	0.18
549	0.22
550	0.26
551	0.28
552	0.3
553	0.32
554	0.31
555	0.31
556	0.31
557	0.3
558	0.26
559	0.23
560	0.22
561	0.2
562	0.21
563	0.18
564	0.17
565	0.14
566	0.15
567	0.16
568	0.21
569	0.21
570	0.2
571	0.21
572	0.22
573	0.22
574	0.2
575	0.2
576	0.19
577	0.23
578	0.22
579	0.23
580	0.25
581	0.26
582	0.27
583	0.24
584	0.19
585	0.2
586	0.18
587	0.22
588	0.2
589	0.2
590	0.19
591	0.2
592	0.21
593	0.19
594	0.28
595	0.34
596	0.41
597	0.42
598	0.45
599	0.51
600	0.58
601	0.6
602	0.6
603	0.53
604	0.51
605	0.54
606	0.57
607	0.56
608	0.5
609	0.47
610	0.44
611	0.47
612	0.46
613	0.49
614	0.5
615	0.44
616	0.44
617	0.4
618	0.4
619	0.33
620	0.28
621	0.21
622	0.17
623	0.16
624	0.16
625	0.15
626	0.11
627	0.13
628	0.13
629	0.15
630	0.13
631	0.17
632	0.22
633	0.24
634	0.27
635	0.3
636	0.35
637	0.37
638	0.39
639	0.4
640	0.45
641	0.53
642	0.55
643	0.54
644	0.56
645	0.56
646	0.58
647	0.58
648	0.56
649	0.56
650	0.61
651	0.67
652	0.7
653	0.74
654	0.73
655	0.75
656	0.77
657	0.76
658	0.74
659	0.76
660	0.76
661	0.79
662	0.81
663	0.85
664	0.87
665	0.84
666	0.82
667	0.75
668	0.66
669	0.6
670	0.56
671	0.49
672	0.4
673	0.34
674	0.27
675	0.25
676	0.22
677	0.19

R9P127

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer