Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9NX28

Protein Details
Accession R9NX28    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-57LLNKDGTRRKSRVLRRKTDHSIIERRRREKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-57RRKSRVLRRKTDHSIIERRRREK
104-115KRDAKRKREAER
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045239  bHLH95_bHLH  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11393  bHLH_AtbHLH_like  
Amino Acid Sequences MVGAKRKTLAGSISPSTTASQIDDGEPLLNKDGTRRKSRVLRRKTDHSIIERRRREKINEKLVALQSIVPACRKECQDLIEKKYVTPLRATDDNEADKNSTAIKRDAKRKREAERLDKAKNEMSEKVRTTMVLEKLCIISHTLDFVVRLQEENKALRALCDCQSERRTSINSTIELEEHYRSAHGNDAVEEGVELQEGERVPGSPSSSSEPNSIPSEEQERPSKRRLHWGSDEVRKASVRSEFCRHRCDVHSHDEARHRERSLSPTISELDCDTAKESKAWVSSASREAPRSALPCSATTSDAGPCSSFCRTQHSCCREEEQGSDTSTDGPDDPTSPPLDPTQRRVLAVGGQHSYFGRQKLPSFVNLGLPKLDAHFPTLRQDAFASLYRRDPPKSSELPAGRRPFRPLSLYTSHAPPSTLPHVNP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.32
3 0.3
4 0.27
5 0.22
6 0.17
7 0.17
8 0.16
9 0.16
10 0.16
11 0.16
12 0.17
13 0.16
14 0.16
15 0.17
16 0.17
17 0.16
18 0.24
19 0.32
20 0.37
21 0.46
22 0.48
23 0.54
24 0.63
25 0.74
26 0.76
27 0.78
28 0.81
29 0.8
30 0.86
31 0.86
32 0.84
33 0.81
34 0.8
35 0.8
36 0.79
37 0.82
38 0.81
39 0.77
40 0.77
41 0.76
42 0.76
43 0.75
44 0.75
45 0.76
46 0.73
47 0.7
48 0.69
49 0.64
50 0.56
51 0.47
52 0.37
53 0.29
54 0.26
55 0.25
56 0.2
57 0.19
58 0.19
59 0.24
60 0.25
61 0.27
62 0.27
63 0.3
64 0.38
65 0.44
66 0.49
67 0.53
68 0.51
69 0.46
70 0.52
71 0.51
72 0.43
73 0.38
74 0.34
75 0.32
76 0.36
77 0.39
78 0.35
79 0.37
80 0.39
81 0.36
82 0.35
83 0.3
84 0.25
85 0.23
86 0.23
87 0.2
88 0.19
89 0.24
90 0.31
91 0.37
92 0.47
93 0.57
94 0.6
95 0.67
96 0.73
97 0.75
98 0.77
99 0.79
100 0.78
101 0.79
102 0.79
103 0.75
104 0.7
105 0.65
106 0.58
107 0.53
108 0.47
109 0.42
110 0.39
111 0.4
112 0.39
113 0.38
114 0.34
115 0.3
116 0.3
117 0.3
118 0.31
119 0.26
120 0.24
121 0.24
122 0.24
123 0.24
124 0.21
125 0.16
126 0.12
127 0.1
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.1
135 0.11
136 0.1
137 0.13
138 0.16
139 0.17
140 0.17
141 0.16
142 0.16
143 0.16
144 0.18
145 0.17
146 0.17
147 0.22
148 0.22
149 0.27
150 0.3
151 0.32
152 0.32
153 0.32
154 0.31
155 0.27
156 0.33
157 0.3
158 0.27
159 0.27
160 0.26
161 0.23
162 0.21
163 0.21
164 0.15
165 0.12
166 0.11
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.09
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.03
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.05
187 0.06
188 0.07
189 0.08
190 0.1
191 0.08
192 0.09
193 0.13
194 0.14
195 0.15
196 0.17
197 0.16
198 0.17
199 0.19
200 0.18
201 0.15
202 0.14
203 0.19
204 0.18
205 0.2
206 0.25
207 0.28
208 0.32
209 0.38
210 0.43
211 0.39
212 0.49
213 0.5
214 0.5
215 0.51
216 0.54
217 0.55
218 0.55
219 0.57
220 0.47
221 0.44
222 0.37
223 0.32
224 0.27
225 0.26
226 0.22
227 0.24
228 0.31
229 0.38
230 0.41
231 0.46
232 0.45
233 0.43
234 0.43
235 0.46
236 0.43
237 0.42
238 0.45
239 0.41
240 0.45
241 0.48
242 0.49
243 0.47
244 0.46
245 0.4
246 0.36
247 0.37
248 0.37
249 0.36
250 0.34
251 0.29
252 0.27
253 0.29
254 0.26
255 0.24
256 0.19
257 0.15
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.12
262 0.13
263 0.12
264 0.13
265 0.13
266 0.14
267 0.14
268 0.15
269 0.15
270 0.18
271 0.22
272 0.25
273 0.25
274 0.25
275 0.25
276 0.25
277 0.25
278 0.24
279 0.22
280 0.21
281 0.2
282 0.2
283 0.23
284 0.22
285 0.2
286 0.19
287 0.19
288 0.17
289 0.16
290 0.16
291 0.12
292 0.12
293 0.14
294 0.16
295 0.18
296 0.17
297 0.25
298 0.29
299 0.36
300 0.46
301 0.49
302 0.49
303 0.49
304 0.53
305 0.49
306 0.46
307 0.41
308 0.34
309 0.31
310 0.29
311 0.27
312 0.22
313 0.19
314 0.17
315 0.16
316 0.13
317 0.11
318 0.11
319 0.12
320 0.13
321 0.14
322 0.16
323 0.16
324 0.17
325 0.2
326 0.29
327 0.3
328 0.35
329 0.42
330 0.42
331 0.42
332 0.42
333 0.38
334 0.33
335 0.34
336 0.32
337 0.25
338 0.23
339 0.23
340 0.22
341 0.25
342 0.25
343 0.23
344 0.23
345 0.25
346 0.27
347 0.34
348 0.36
349 0.35
350 0.35
351 0.34
352 0.38
353 0.36
354 0.35
355 0.29
356 0.27
357 0.24
358 0.22
359 0.25
360 0.17
361 0.2
362 0.23
363 0.23
364 0.29
365 0.33
366 0.3
367 0.28
368 0.28
369 0.25
370 0.25
371 0.3
372 0.27
373 0.25
374 0.3
375 0.35
376 0.39
377 0.41
378 0.41
379 0.41
380 0.46
381 0.5
382 0.49
383 0.52
384 0.55
385 0.59
386 0.64
387 0.68
388 0.65
389 0.63
390 0.65
391 0.62
392 0.59
393 0.57
394 0.51
395 0.49
396 0.49
397 0.5
398 0.46
399 0.45
400 0.43
401 0.39
402 0.36
403 0.29
404 0.31
405 0.35