FuNGI

R9PF38

Protein Details

Accession

R9PF38

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
25-44	DLDRRDSKIQKLKDTRQNLA	Hydrophilic
127-155	QGADDLPQKNKRKRTGRTKSDKRQDGSRE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
135-147	KNKRKRTGRTKSD

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, mito 5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR022042 snRNA-activating_su3
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF12251 SNAPC3

Amino Acid Sequences

MTRQRPETGVTTAIASEPFNTSALDLDRRDSKIQKLKDTRQNLASIAGPSTIEYEVERIRDVIRGKALDEDFSTAVRERWQTWSRNANPFRSDLGSSAASELKGADDSASESDAPSEDSAAEDPDNQGADDLPQKNKRKRTGRTKSDKRQDGSREVNIIEEWEGIRTQREVLLKDMDAVLPSAFRFTERQLKVYANRLKSKYINSLDRPFESTDIHRLLHHAPPRNKPTAARASEAGSSSSTVVGSSSAPLVFTISFFSSNIDGSREDAAAKRDADPSTTNDDTDGDNARDEYVKRICGDGLGGMKRAQTVRLLSNQTLSDLQTSLCCWSDELPERFGWRSRLQRHEQRRILSGSTHHFPVSGVGVEESTDVRLARYTGKRRQTDTALIIEDKLYTKGVHHGESSHEVDYATLFDQWKQSTGNTDAKVGWSERGGNLDLRLDQISALRAGQPYWLLHQGDCVHCFVIEQVRALRPSEQRALRKNAAGVNVESAPKGTEFVPFPRVTWLSTPAMLRFAADHNHNYGLGHHILRWEGTLPPSQPSQLREHVAPEASGSKQGDATPQTSWQIANLRTRRKDEGLLRKKQGKCLACSLRKAQVGILGGDSVRLPLAPTDPDKDDGTQDTPAIDGLDDHLTSICTPCAAILGLPTKSTSTGTSAELDWDQIAAMDHRTGWTVFPLY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.16
3	0.14
4	0.14
5	0.14
6	0.14
7	0.14
8	0.13
9	0.15
10	0.19
11	0.23
12	0.21
13	0.24
14	0.29
15	0.33
16	0.38
17	0.39
18	0.45
19	0.49
20	0.55
21	0.62
22	0.66
23	0.72
24	0.77
25	0.8
26	0.77
27	0.73
28	0.69
29	0.59
30	0.51
31	0.44
32	0.36
33	0.29
34	0.23
35	0.18
36	0.16
37	0.17
38	0.15
39	0.12
40	0.11
41	0.14
42	0.16
43	0.17
44	0.17
45	0.16
46	0.16
47	0.21
48	0.22
49	0.23
50	0.27
51	0.27
52	0.27
53	0.33
54	0.33
55	0.3
56	0.29
57	0.28
58	0.23
59	0.22
60	0.24
61	0.17
62	0.17
63	0.2
64	0.21
65	0.2
66	0.29
67	0.35
68	0.38
69	0.45
70	0.55
71	0.57
72	0.65
73	0.68
74	0.65
75	0.61
76	0.58
77	0.54
78	0.47
79	0.41
80	0.31
81	0.31
82	0.25
83	0.23
84	0.23
85	0.21
86	0.17
87	0.16
88	0.15
89	0.11
90	0.1
91	0.1
92	0.08
93	0.07
94	0.09
95	0.1
96	0.11
97	0.1
98	0.09
99	0.1
100	0.1
101	0.11
102	0.1
103	0.09
104	0.08
105	0.09
106	0.1
107	0.11
108	0.11
109	0.1
110	0.11
111	0.12
112	0.12
113	0.11
114	0.1
115	0.09
116	0.1
117	0.17
118	0.2
119	0.26
120	0.35
121	0.44
122	0.52
123	0.61
124	0.69
125	0.72
126	0.78
127	0.82
128	0.84
129	0.86
130	0.9
131	0.92
132	0.93
133	0.93
134	0.91
135	0.83
136	0.81
137	0.77
138	0.74
139	0.7
140	0.63
141	0.55
142	0.47
143	0.45
144	0.36
145	0.3
146	0.22
147	0.16
148	0.12
149	0.1
150	0.1
151	0.09
152	0.11
153	0.1
154	0.1
155	0.13
156	0.17
157	0.17
158	0.2
159	0.23
160	0.21
161	0.22
162	0.22
163	0.18
164	0.15
165	0.14
166	0.11
167	0.08
168	0.08
169	0.08
170	0.07
171	0.08
172	0.1
173	0.13
174	0.23
175	0.24
176	0.26
177	0.27
178	0.32
179	0.34
180	0.42
181	0.46
182	0.42
183	0.49
184	0.49
185	0.52
186	0.51
187	0.52
188	0.52
189	0.51
190	0.52
191	0.5
192	0.55
193	0.54
194	0.51
195	0.5
196	0.41
197	0.36
198	0.31
199	0.27
200	0.26
201	0.25
202	0.24
203	0.21
204	0.22
205	0.24
206	0.27
207	0.31
208	0.34
209	0.38
210	0.46
211	0.53
212	0.55
213	0.53
214	0.49
215	0.52
216	0.52
217	0.49
218	0.42
219	0.37
220	0.34
221	0.35
222	0.34
223	0.26
224	0.16
225	0.14
226	0.13
227	0.12
228	0.09
229	0.07
230	0.06
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.07
239	0.06
240	0.06
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.1
246	0.09
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.09
251	0.1
252	0.12
253	0.1
254	0.11
255	0.12
256	0.14
257	0.15
258	0.16
259	0.16
260	0.18
261	0.18
262	0.2
263	0.2
264	0.21
265	0.25
266	0.24
267	0.22
268	0.19
269	0.2
270	0.18
271	0.18
272	0.17
273	0.11
274	0.11
275	0.11
276	0.11
277	0.12
278	0.12
279	0.14
280	0.14
281	0.16
282	0.16
283	0.16
284	0.16
285	0.14
286	0.14
287	0.11
288	0.13
289	0.12
290	0.13
291	0.13
292	0.13
293	0.14
294	0.14
295	0.13
296	0.11
297	0.13
298	0.14
299	0.19
300	0.22
301	0.21
302	0.23
303	0.22
304	0.21
305	0.19
306	0.17
307	0.12
308	0.1
309	0.1
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.07
316	0.08
317	0.13
318	0.19
319	0.21
320	0.21
321	0.21
322	0.23
323	0.23
324	0.24
325	0.24
326	0.22
327	0.29
328	0.34
329	0.41
330	0.47
331	0.55
332	0.62
333	0.68
334	0.68
335	0.61
336	0.59
337	0.53
338	0.47
339	0.39
340	0.33
341	0.27
342	0.24
343	0.23
344	0.19
345	0.16
346	0.15
347	0.15
348	0.13
349	0.09
350	0.07
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.07
355	0.06
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.06
361	0.06
362	0.12
363	0.2
364	0.27
365	0.34
366	0.43
367	0.47
368	0.5
369	0.53
370	0.5
371	0.48
372	0.43
373	0.38
374	0.31
375	0.28
376	0.25
377	0.21
378	0.17
379	0.13
380	0.11
381	0.09
382	0.07
383	0.08
384	0.14
385	0.16
386	0.17
387	0.16
388	0.17
389	0.18
390	0.23
391	0.24
392	0.18
393	0.17
394	0.15
395	0.15
396	0.14
397	0.12
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.09
402	0.12
403	0.12
404	0.13
405	0.13
406	0.13
407	0.15
408	0.2
409	0.25
410	0.23
411	0.25
412	0.23
413	0.23
414	0.25
415	0.21
416	0.17
417	0.12
418	0.13
419	0.12
420	0.14
421	0.14
422	0.13
423	0.13
424	0.14
425	0.13
426	0.13
427	0.13
428	0.1
429	0.09
430	0.1
431	0.1
432	0.09
433	0.09
434	0.09
435	0.09
436	0.09
437	0.1
438	0.11
439	0.11
440	0.13
441	0.17
442	0.16
443	0.16
444	0.2
445	0.22
446	0.23
447	0.24
448	0.22
449	0.17
450	0.16
451	0.16
452	0.14
453	0.16
454	0.14
455	0.14
456	0.16
457	0.19
458	0.2
459	0.21
460	0.25
461	0.23
462	0.27
463	0.34
464	0.38
465	0.42
466	0.48
467	0.55
468	0.53
469	0.52
470	0.49
471	0.45
472	0.42
473	0.37
474	0.31
475	0.26
476	0.24
477	0.23
478	0.19
479	0.16
480	0.13
481	0.11
482	0.12
483	0.09
484	0.11
485	0.13
486	0.16
487	0.22
488	0.22
489	0.22
490	0.27
491	0.27
492	0.25
493	0.25
494	0.27
495	0.23
496	0.25
497	0.26
498	0.21
499	0.22
500	0.2
501	0.18
502	0.14
503	0.15
504	0.16
505	0.18
506	0.19
507	0.2
508	0.21
509	0.21
510	0.2
511	0.18
512	0.19
513	0.18
514	0.17
515	0.15
516	0.15
517	0.16
518	0.16
519	0.16
520	0.13
521	0.12
522	0.14
523	0.18
524	0.17
525	0.19
526	0.2
527	0.22
528	0.24
529	0.26
530	0.3
531	0.31
532	0.33
533	0.32
534	0.33
535	0.34
536	0.32
537	0.28
538	0.23
539	0.21
540	0.18
541	0.22
542	0.2
543	0.17
544	0.18
545	0.18
546	0.21
547	0.21
548	0.22
549	0.19
550	0.21
551	0.22
552	0.22
553	0.21
554	0.2
555	0.24
556	0.26
557	0.35
558	0.4
559	0.48
560	0.52
561	0.58
562	0.6
563	0.57
564	0.61
565	0.61
566	0.65
567	0.65
568	0.69
569	0.72
570	0.75
571	0.75
572	0.75
573	0.74
574	0.68
575	0.63
576	0.64
577	0.67
578	0.65
579	0.67
580	0.64
581	0.63
582	0.6
583	0.55
584	0.46
585	0.4
586	0.36
587	0.3
588	0.26
589	0.19
590	0.16
591	0.16
592	0.15
593	0.1
594	0.08
595	0.07
596	0.07
597	0.07
598	0.1
599	0.14
600	0.17
601	0.22
602	0.24
603	0.28
604	0.29
605	0.29
606	0.29
607	0.29
608	0.28
609	0.25
610	0.23
611	0.2
612	0.18
613	0.17
614	0.15
615	0.11
616	0.08
617	0.09
618	0.12
619	0.11
620	0.12
621	0.12
622	0.12
623	0.13
624	0.14
625	0.12
626	0.09
627	0.09
628	0.08
629	0.09
630	0.09
631	0.09
632	0.12
633	0.17
634	0.18
635	0.19
636	0.2
637	0.19
638	0.2
639	0.22
640	0.19
641	0.17
642	0.19
643	0.2
644	0.22
645	0.21
646	0.23
647	0.22
648	0.21
649	0.17
650	0.14
651	0.12
652	0.11
653	0.12
654	0.1
655	0.11
656	0.11
657	0.12
658	0.12
659	0.15
660	0.15
661	0.14

R9PF38

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer