Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9PDZ1

Protein Details
Accession R9PDZ1    Localization Confidence Low Confidence Score 7.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-38ASPQHQPTRPTRQSRAHADDCKPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 7, cyto 6, extr 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00780  CNH  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MEKSLVVPAHLYLSYASPQHQPTRPTRQSRAHADDCKPSLIAGKPPTRGKHGPALPIMASPQAPASQEPVPPYSLTPLLFPTLPSEDVADQANQSSPTAIQQSSQRAIRCSESDGSFLYIGASDGLIHSFEIVSPAPSQASSSRIILPTTVSYRLKYSRSISNHAKPVEKIVLLRPFNAAAVLCEGVVSFFSLPHWSPIRSLPSTRAVSTIVLDDEESDNGSGTDAAGMISICLVRRKNIILGKIGAEGQSGLLWATIKDIQLPGGAIFARRFADTLCIANATEYSLVNLSSGHVTPLQLPISQTGESPSAQVRPSIVTIAATAASSREGSTSPVTSRSTSVPASTAKCEFLVTSHTGSITLGVFVKPSGEPAPKLLEWPSHPRSVTYDGEHLVSLLRNDTLEVHHLGANSVDRVQTLQLPPGLDPRFLHVVQDPASQPRPSSSEQLKAVTDAHDEFDMVKVPLNAFTSDSASVLHRASEQDGATSSQRRQILLCGKNSTSAIQQDPILRWTVDQLDRGRLTNLRKDLAAYRSSRERSSEHHNTARAFIEASAAHALLGIELLHRTDFAAAADVLLHANLDPRLFIAFFPSLLRGDQVIEDAIMPAILLGSLERLRNDTSNRLQSMEELIASNLTLNYCPPLDITKDKALLQLRANLLQGSERMLRILLEGWRTASASAIANEGTTGSYFYAGSFMDEQMLVNVNTFVDSAYLTLIAERRGVSERDVVAVQDQLATFLSSKHACEPSKVEGGLKGQRFFTLLADHYERIGDIEGSLKTWTALIDGDIVDGIHATVDVPTALAKVASLLEDQTDPNLLSTYGRWLVQKDAEAGIKILTKHTARPEDDTSQKAATRSKAQELESISAQKATIEELRGIDDDAATKYLEAVALSTVKVQDEQMHRELAAALLKRVAQHLTDDVYRDKMDAVTRDYAQGSYAESFFAHLALAIGGRPREADRLKLAMLLQGSTVLDFEALLATVAPLDSLAYEKAIILGKLGRDSDALSLLAIELRDANSAEAYCSQNGEVLSPMLAASIAEDHPTLQPFAATLSRTYAQRVKAHAKATAQRGITAEQRKQELLKQLLSVYMLNGAEEKFRVATAHLLNTQALHLDNREVLELVPTDWSLQTLETFLTQSLRRQLHRRREMQMLRNIAKCRSLDAAEDLWARQRAMGGILQDTELDGGADSGGDYRADGDTETSYADWKEGVLRSESIFEGSEGEKQLRRPREAAAGKEERIESIHQGYEIPPSSAIVHAGLDDVDDLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.2
4 0.22
5 0.27
6 0.35
7 0.39
8 0.43
9 0.5
10 0.59
11 0.66
12 0.7
13 0.74
14 0.75
15 0.79
16 0.82
17 0.83
18 0.81
19 0.8
20 0.76
21 0.76
22 0.69
23 0.62
24 0.52
25 0.43
26 0.4
27 0.35
28 0.38
29 0.37
30 0.42
31 0.47
32 0.54
33 0.58
34 0.6
35 0.62
36 0.59
37 0.6
38 0.59
39 0.59
40 0.54
41 0.54
42 0.46
43 0.43
44 0.39
45 0.31
46 0.25
47 0.19
48 0.18
49 0.16
50 0.16
51 0.16
52 0.19
53 0.2
54 0.22
55 0.25
56 0.25
57 0.25
58 0.25
59 0.25
60 0.25
61 0.25
62 0.23
63 0.21
64 0.21
65 0.22
66 0.21
67 0.2
68 0.21
69 0.21
70 0.21
71 0.2
72 0.21
73 0.18
74 0.2
75 0.21
76 0.17
77 0.14
78 0.15
79 0.17
80 0.15
81 0.15
82 0.14
83 0.13
84 0.16
85 0.19
86 0.18
87 0.18
88 0.24
89 0.31
90 0.35
91 0.4
92 0.39
93 0.37
94 0.4
95 0.42
96 0.38
97 0.36
98 0.35
99 0.32
100 0.31
101 0.3
102 0.3
103 0.25
104 0.23
105 0.18
106 0.13
107 0.12
108 0.1
109 0.09
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.07
116 0.06
117 0.06
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.12
124 0.12
125 0.14
126 0.13
127 0.16
128 0.17
129 0.18
130 0.22
131 0.23
132 0.23
133 0.21
134 0.22
135 0.24
136 0.25
137 0.29
138 0.26
139 0.26
140 0.32
141 0.36
142 0.37
143 0.37
144 0.38
145 0.41
146 0.45
147 0.52
148 0.56
149 0.59
150 0.64
151 0.62
152 0.62
153 0.53
154 0.54
155 0.51
156 0.43
157 0.36
158 0.36
159 0.42
160 0.39
161 0.39
162 0.34
163 0.3
164 0.28
165 0.28
166 0.2
167 0.12
168 0.14
169 0.13
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.1
180 0.11
181 0.17
182 0.2
183 0.19
184 0.21
185 0.27
186 0.33
187 0.34
188 0.35
189 0.35
190 0.4
191 0.42
192 0.41
193 0.37
194 0.31
195 0.28
196 0.27
197 0.24
198 0.16
199 0.13
200 0.13
201 0.12
202 0.12
203 0.12
204 0.11
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.09
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.11
221 0.13
222 0.14
223 0.18
224 0.2
225 0.27
226 0.31
227 0.34
228 0.33
229 0.34
230 0.34
231 0.32
232 0.31
233 0.23
234 0.19
235 0.15
236 0.11
237 0.09
238 0.08
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.08
244 0.1
245 0.1
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.13
251 0.1
252 0.1
253 0.11
254 0.1
255 0.1
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.11
261 0.15
262 0.15
263 0.16
264 0.15
265 0.14
266 0.14
267 0.14
268 0.14
269 0.11
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.1
282 0.1
283 0.12
284 0.15
285 0.15
286 0.14
287 0.15
288 0.16
289 0.18
290 0.18
291 0.16
292 0.15
293 0.16
294 0.15
295 0.16
296 0.15
297 0.15
298 0.16
299 0.16
300 0.15
301 0.15
302 0.15
303 0.15
304 0.13
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.08
310 0.07
311 0.06
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.1
318 0.12
319 0.14
320 0.14
321 0.18
322 0.2
323 0.2
324 0.22
325 0.22
326 0.23
327 0.21
328 0.21
329 0.19
330 0.22
331 0.23
332 0.24
333 0.23
334 0.21
335 0.2
336 0.2
337 0.17
338 0.14
339 0.16
340 0.15
341 0.15
342 0.15
343 0.15
344 0.15
345 0.14
346 0.15
347 0.11
348 0.09
349 0.08
350 0.07
351 0.08
352 0.07
353 0.09
354 0.07
355 0.1
356 0.13
357 0.14
358 0.15
359 0.17
360 0.22
361 0.21
362 0.23
363 0.22
364 0.22
365 0.24
366 0.32
367 0.33
368 0.33
369 0.33
370 0.32
371 0.35
372 0.36
373 0.35
374 0.29
375 0.28
376 0.25
377 0.25
378 0.24
379 0.2
380 0.15
381 0.13
382 0.1
383 0.08
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.08
388 0.08
389 0.1
390 0.11
391 0.12
392 0.13
393 0.13
394 0.13
395 0.13
396 0.13
397 0.11
398 0.1
399 0.09
400 0.08
401 0.08
402 0.09
403 0.13
404 0.13
405 0.14
406 0.15
407 0.16
408 0.16
409 0.23
410 0.24
411 0.2
412 0.2
413 0.21
414 0.24
415 0.23
416 0.24
417 0.18
418 0.2
419 0.2
420 0.24
421 0.21
422 0.2
423 0.23
424 0.22
425 0.21
426 0.2
427 0.23
428 0.22
429 0.28
430 0.27
431 0.3
432 0.32
433 0.34
434 0.32
435 0.29
436 0.28
437 0.22
438 0.2
439 0.14
440 0.13
441 0.11
442 0.11
443 0.1
444 0.09
445 0.1
446 0.08
447 0.09
448 0.08
449 0.09
450 0.11
451 0.12
452 0.12
453 0.11
454 0.12
455 0.13
456 0.13
457 0.12
458 0.11
459 0.1
460 0.12
461 0.11
462 0.1
463 0.09
464 0.1
465 0.11
466 0.13
467 0.12
468 0.11
469 0.12
470 0.13
471 0.15
472 0.17
473 0.16
474 0.18
475 0.2
476 0.2
477 0.19
478 0.24
479 0.31
480 0.33
481 0.36
482 0.34
483 0.33
484 0.35
485 0.35
486 0.3
487 0.23
488 0.21
489 0.18
490 0.15
491 0.17
492 0.18
493 0.18
494 0.18
495 0.17
496 0.14
497 0.13
498 0.13
499 0.17
500 0.16
501 0.2
502 0.2
503 0.24
504 0.25
505 0.26
506 0.25
507 0.24
508 0.26
509 0.28
510 0.29
511 0.24
512 0.24
513 0.25
514 0.27
515 0.27
516 0.28
517 0.24
518 0.24
519 0.3
520 0.32
521 0.31
522 0.29
523 0.27
524 0.26
525 0.34
526 0.4
527 0.39
528 0.41
529 0.43
530 0.41
531 0.41
532 0.38
533 0.29
534 0.21
535 0.15
536 0.13
537 0.1
538 0.11
539 0.09
540 0.08
541 0.08
542 0.08
543 0.07
544 0.05
545 0.05
546 0.04
547 0.03
548 0.03
549 0.04
550 0.03
551 0.04
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.06
557 0.05
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.04
564 0.03
565 0.04
566 0.05
567 0.05
568 0.04
569 0.05
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.08
574 0.08
575 0.08
576 0.09
577 0.1
578 0.1
579 0.09
580 0.1
581 0.07
582 0.07
583 0.07
584 0.07
585 0.06
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.04
590 0.04
591 0.03
592 0.03
593 0.02
594 0.02
595 0.02
596 0.02
597 0.03
598 0.05
599 0.06
600 0.06
601 0.08
602 0.09
603 0.12
604 0.13
605 0.18
606 0.21
607 0.26
608 0.26
609 0.26
610 0.25
611 0.23
612 0.24
613 0.18
614 0.14
615 0.09
616 0.09
617 0.07
618 0.07
619 0.07
620 0.04
621 0.04
622 0.04
623 0.04
624 0.05
625 0.05
626 0.05
627 0.05
628 0.07
629 0.09
630 0.11
631 0.16
632 0.18
633 0.19
634 0.2
635 0.24
636 0.24
637 0.25
638 0.24
639 0.25
640 0.23
641 0.22
642 0.22
643 0.18
644 0.16
645 0.13
646 0.12
647 0.1
648 0.11
649 0.09
650 0.09
651 0.09
652 0.09
653 0.08
654 0.1
655 0.09
656 0.09
657 0.09
658 0.1
659 0.1
660 0.1
661 0.1
662 0.08
663 0.07
664 0.07
665 0.07
666 0.07
667 0.07
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.05
672 0.04
673 0.05
674 0.04
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.06
679 0.05
680 0.07
681 0.07
682 0.07
683 0.07
684 0.07
685 0.07
686 0.06
687 0.08
688 0.07
689 0.06
690 0.06
691 0.05
692 0.06
693 0.06
694 0.05
695 0.04
696 0.04
697 0.04
698 0.04
699 0.04
700 0.04
701 0.05
702 0.06
703 0.06
704 0.07
705 0.07
706 0.09
707 0.11
708 0.12
709 0.12
710 0.15
711 0.15
712 0.15
713 0.15
714 0.14
715 0.12
716 0.12
717 0.1
718 0.08
719 0.07
720 0.06
721 0.07
722 0.07
723 0.07
724 0.07
725 0.1
726 0.09
727 0.1
728 0.13
729 0.18
730 0.18
731 0.2
732 0.24
733 0.25
734 0.28
735 0.27
736 0.24
737 0.2
738 0.24
739 0.29
740 0.27
741 0.24
742 0.21
743 0.21
744 0.22
745 0.2
746 0.17
747 0.14
748 0.13
749 0.15
750 0.17
751 0.17
752 0.16
753 0.15
754 0.14
755 0.11
756 0.11
757 0.07
758 0.05
759 0.08
760 0.07
761 0.08
762 0.08
763 0.08
764 0.07
765 0.08
766 0.07
767 0.05
768 0.05
769 0.05
770 0.06
771 0.06
772 0.06
773 0.06
774 0.06
775 0.05
776 0.04
777 0.04
778 0.02
779 0.02
780 0.03
781 0.03
782 0.03
783 0.03
784 0.03
785 0.03
786 0.04
787 0.04
788 0.04
789 0.03
790 0.04
791 0.04
792 0.05
793 0.05
794 0.05
795 0.06
796 0.07
797 0.07
798 0.07
799 0.08
800 0.07
801 0.07
802 0.07
803 0.07
804 0.07
805 0.07
806 0.11
807 0.11
808 0.13
809 0.13
810 0.14
811 0.17
812 0.18
813 0.19
814 0.17
815 0.17
816 0.17
817 0.16
818 0.16
819 0.14
820 0.14
821 0.13
822 0.12
823 0.14
824 0.14
825 0.18
826 0.24
827 0.3
828 0.29
829 0.34
830 0.38
831 0.39
832 0.42
833 0.41
834 0.37
835 0.32
836 0.32
837 0.29
838 0.28
839 0.26
840 0.3
841 0.31
842 0.35
843 0.37
844 0.36
845 0.38
846 0.37
847 0.36
848 0.3
849 0.29
850 0.23
851 0.2
852 0.18
853 0.14
854 0.12
855 0.12
856 0.12
857 0.11
858 0.12
859 0.12
860 0.14
861 0.14
862 0.14
863 0.11
864 0.09
865 0.09
866 0.09
867 0.09
868 0.08
869 0.07
870 0.07
871 0.07
872 0.07
873 0.06
874 0.05
875 0.06
876 0.07
877 0.07
878 0.08
879 0.08
880 0.08
881 0.09
882 0.09
883 0.14
884 0.18
885 0.23
886 0.24
887 0.24
888 0.24
889 0.24
890 0.23
891 0.18
892 0.18
893 0.14
894 0.12
895 0.12
896 0.13
897 0.13
898 0.15
899 0.15
900 0.11
901 0.12
902 0.14
903 0.15
904 0.16
905 0.17
906 0.17
907 0.19
908 0.18
909 0.17
910 0.15
911 0.14
912 0.17
913 0.17
914 0.2
915 0.21
916 0.21
917 0.23
918 0.23
919 0.21
920 0.18
921 0.16
922 0.14
923 0.12
924 0.12
925 0.1
926 0.09
927 0.1
928 0.1
929 0.09
930 0.07
931 0.05
932 0.06
933 0.05
934 0.06
935 0.05
936 0.07
937 0.07
938 0.07
939 0.08
940 0.09
941 0.17
942 0.18
943 0.21
944 0.23
945 0.26
946 0.26
947 0.27
948 0.26
949 0.21
950 0.21
951 0.17
952 0.13
953 0.11
954 0.11
955 0.09
956 0.09
957 0.06
958 0.05
959 0.05
960 0.05
961 0.04
962 0.04
963 0.04
964 0.04
965 0.04
966 0.04
967 0.04
968 0.03
969 0.03
970 0.03
971 0.03
972 0.05
973 0.05
974 0.06
975 0.06
976 0.06
977 0.09
978 0.1
979 0.1
980 0.1
981 0.12
982 0.13
983 0.15
984 0.16
985 0.14
986 0.13
987 0.14
988 0.14
989 0.14
990 0.12
991 0.09
992 0.09
993 0.09
994 0.09
995 0.08
996 0.07
997 0.06
998 0.07
999 0.08
1000 0.08
1001 0.09
1002 0.09
1003 0.09
1004 0.1
1005 0.13
1006 0.15
1007 0.14
1008 0.14
1009 0.14
1010 0.15
1011 0.15
1012 0.15
1013 0.12
1014 0.1
1015 0.1
1016 0.09
1017 0.09
1018 0.06
1019 0.06
1020 0.05
1021 0.05
1022 0.07
1023 0.07
1024 0.08
1025 0.08
1026 0.09
1027 0.11
1028 0.13
1029 0.13
1030 0.1
1031 0.1
1032 0.09
1033 0.12
1034 0.14
1035 0.13
1036 0.12
1037 0.16
1038 0.19
1039 0.2
1040 0.24
1041 0.27
1042 0.3
1043 0.34
1044 0.41
1045 0.43
1046 0.46
1047 0.49
1048 0.48
1049 0.49
1050 0.5
1051 0.51
1052 0.51
1053 0.44
1054 0.4
1055 0.39
1056 0.38
1057 0.39
1058 0.4
1059 0.38
1060 0.37
1061 0.39
1062 0.39
1063 0.39
1064 0.42
1065 0.43
1066 0.4
1067 0.38
1068 0.35
1069 0.33
1070 0.33
1071 0.32
1072 0.27
1073 0.18
1074 0.17
1075 0.14
1076 0.13
1077 0.14
1078 0.13
1079 0.13
1080 0.13
1081 0.14
1082 0.1
1083 0.1
1084 0.11
1085 0.11
1086 0.17
1087 0.18
1088 0.23
1089 0.24
1090 0.25
1091 0.25
1092 0.25
1093 0.24
1094 0.18
1095 0.16
1096 0.13
1097 0.12
1098 0.13
1099 0.14
1100 0.14
1101 0.15
1102 0.14
1103 0.13
1104 0.14
1105 0.13
1106 0.12
1107 0.12
1108 0.11
1109 0.12
1110 0.11
1111 0.12
1112 0.1
1113 0.1
1114 0.1
1115 0.1
1116 0.1
1117 0.1
1118 0.1
1119 0.1
1120 0.14
1121 0.15
1122 0.19
1123 0.27
1124 0.32
1125 0.36
1126 0.45
1127 0.55
1128 0.62
1129 0.71
1130 0.73
1131 0.7
1132 0.75
1133 0.79
1134 0.78
1135 0.76
1136 0.75
1137 0.7
1138 0.69
1139 0.67
1140 0.59
1141 0.55
1142 0.46
1143 0.41
1144 0.36
1145 0.32
1146 0.28
1147 0.3
1148 0.29
1149 0.28
1150 0.29
1151 0.26
1152 0.27
1153 0.28
1154 0.25
1155 0.21
1156 0.21
1157 0.18
1158 0.19
1159 0.21
1160 0.17
1161 0.17
1162 0.17
1163 0.17
1164 0.15
1165 0.14
1166 0.12
1167 0.1
1168 0.08
1169 0.06
1170 0.05
1171 0.05
1172 0.05
1173 0.05
1174 0.05
1175 0.06
1176 0.06
1177 0.06
1178 0.07
1179 0.08
1180 0.09
1181 0.09
1182 0.1
1183 0.11
1184 0.11
1185 0.13
1186 0.11
1187 0.13
1188 0.13
1189 0.13
1190 0.11
1191 0.1
1192 0.15
1193 0.17
1194 0.19
1195 0.2
1196 0.22
1197 0.23
1198 0.25
1199 0.25
1200 0.21
1201 0.19
1202 0.17
1203 0.17
1204 0.16
1205 0.19
1206 0.19
1207 0.22
1208 0.24
1209 0.29
1210 0.38
1211 0.44
1212 0.48
1213 0.46
1214 0.47
1215 0.54
1216 0.58
1217 0.57
1218 0.58
1219 0.57
1220 0.52
1221 0.55
1222 0.51
1223 0.42
1224 0.38
1225 0.35
1226 0.29
1227 0.26
1228 0.27
1229 0.22
1230 0.23
1231 0.23
1232 0.28
1233 0.27
1234 0.24
1235 0.2
1236 0.19
1237 0.21
1238 0.2
1239 0.21
1240 0.14
1241 0.13
1242 0.11
1243 0.12
1244 0.1
1245 0.09