Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9PDQ5

Protein Details
Accession R9PDQ5    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-25GSSWRNAVQRRNHKERSQPVGRAHydrophilic
34-57KDYVLRAKDHHKKRDMLKRLSEKABasic
317-337DEEGEKVKPKKLYKFSKERKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
39-51RAKDHHKKRDMLK
322-337KVKPKKLYKFSKERKR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MEGSSWRNAVQRRNHKERSQPVGRAKLGLLEKHKDYVLRAKDHHKKRDMLKRLSEKAAMRNKDEFYFGMINSSTRNGVHQHARPSEQLDNDVVALLKTQDVGYVRGQIIAEKKRIKGLVERIAPSVAGLKSEWLDEKDNRRATLQRAGLLEEGSKKGPKRQGSGLIGAQGKKTVWLDDADALRSYQSASASSSTLPSDHIDEGLDRSWIDDLPSDASDIEDDLTTPTTSSPSSSSSSLKKGNKHLGYLTTELASRYSRLDQLQLAAEKLNLVRALMTHKGGSSRVVKAKKKESLTDAVMKGKMTSNGLALQDTDDEDEEGEKVKPKKLYKFSKERKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.78
3 0.83
4 0.84
5 0.83
6 0.81
7 0.8
8 0.79
9 0.79
10 0.73
11 0.65
12 0.56
13 0.53
14 0.48
15 0.46
16 0.43
17 0.39
18 0.4
19 0.4
20 0.42
21 0.36
22 0.35
23 0.38
24 0.4
25 0.41
26 0.43
27 0.51
28 0.6
29 0.68
30 0.74
31 0.72
32 0.72
33 0.75
34 0.81
35 0.81
36 0.8
37 0.8
38 0.8
39 0.79
40 0.76
41 0.72
42 0.65
43 0.64
44 0.64
45 0.58
46 0.53
47 0.52
48 0.5
49 0.45
50 0.44
51 0.34
52 0.3
53 0.29
54 0.24
55 0.22
56 0.2
57 0.19
58 0.18
59 0.19
60 0.15
61 0.12
62 0.15
63 0.14
64 0.19
65 0.26
66 0.3
67 0.36
68 0.39
69 0.41
70 0.41
71 0.43
72 0.42
73 0.36
74 0.33
75 0.26
76 0.23
77 0.2
78 0.19
79 0.14
80 0.09
81 0.08
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.07
87 0.09
88 0.11
89 0.12
90 0.16
91 0.16
92 0.17
93 0.17
94 0.17
95 0.23
96 0.25
97 0.31
98 0.31
99 0.31
100 0.34
101 0.36
102 0.35
103 0.35
104 0.39
105 0.41
106 0.41
107 0.42
108 0.39
109 0.37
110 0.35
111 0.28
112 0.24
113 0.15
114 0.12
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.11
119 0.12
120 0.1
121 0.14
122 0.18
123 0.24
124 0.32
125 0.34
126 0.34
127 0.35
128 0.35
129 0.35
130 0.39
131 0.34
132 0.29
133 0.27
134 0.28
135 0.26
136 0.24
137 0.21
138 0.15
139 0.14
140 0.12
141 0.14
142 0.14
143 0.19
144 0.24
145 0.27
146 0.29
147 0.32
148 0.39
149 0.39
150 0.42
151 0.37
152 0.35
153 0.33
154 0.3
155 0.25
156 0.18
157 0.15
158 0.13
159 0.13
160 0.09
161 0.08
162 0.09
163 0.1
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.13
168 0.12
169 0.11
170 0.1
171 0.09
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.09
188 0.09
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.11
219 0.14
220 0.16
221 0.19
222 0.22
223 0.27
224 0.34
225 0.37
226 0.4
227 0.45
228 0.53
229 0.52
230 0.52
231 0.49
232 0.45
233 0.45
234 0.41
235 0.34
236 0.25
237 0.23
238 0.21
239 0.2
240 0.16
241 0.13
242 0.13
243 0.14
244 0.17
245 0.18
246 0.2
247 0.19
248 0.21
249 0.25
250 0.23
251 0.22
252 0.19
253 0.17
254 0.16
255 0.15
256 0.16
257 0.11
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.15
262 0.17
263 0.18
264 0.16
265 0.17
266 0.19
267 0.19
268 0.24
269 0.23
270 0.28
271 0.34
272 0.43
273 0.49
274 0.55
275 0.64
276 0.67
277 0.68
278 0.66
279 0.64
280 0.62
281 0.61
282 0.61
283 0.55
284 0.52
285 0.48
286 0.42
287 0.37
288 0.34
289 0.31
290 0.26
291 0.24
292 0.21
293 0.24
294 0.25
295 0.24
296 0.21
297 0.19
298 0.17
299 0.17
300 0.16
301 0.12
302 0.12
303 0.11
304 0.12
305 0.11
306 0.12
307 0.13
308 0.18
309 0.21
310 0.26
311 0.34
312 0.41
313 0.51
314 0.6
315 0.69
316 0.73
317 0.81