Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9PCX2

Protein Details
Accession R9PCX2    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
361-385SSSTSSRPVGRRKRRAQERQTGLSRHydrophilic
527-546KMREEAKRKAREEQERQERLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
371-375RRKRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033865  Ataxin-3  
IPR006155  Josephin  
IPR003903  UIM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004843  F:cysteine-type deubiquitinase activity  
GO:0016579  P:protein deubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF02099  Josephin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50957  JOSEPHIN  
PS50330  UIM  
Amino Acid Sequences MSSSSPQQQLIAYIHHERQEAGSMLCAQHALNALLQGQYYDPSQLSQIATELDQLEASELGLSQADIAARDRSSLNMDDTGFFSVSVLERALQVWGISISSWRSAEMRARHDAPEREAAFVLNLNSHWFTIRSFGTTSKFWYNLNSFLAEPQWIGNNYLGTLLHTAESEGYSVFVVQASEGSAGQGLRESDADQIADHLPPPGAPSASNSSNSASLGLQPAATSQTPPMAPVSNASEFRSPAPSFGLGGDEDDAELQAALSASLLQHTSSATAPDTPSRSRVRQVRGGSAEDTAGGNSFMGETDADIDAIAPSRRRHRAGFPDPVDDDLRRAMEASLSSSSSRPSGAGGSFQGPVATSSSSSSTSSRPVGRRKRRAQERQTGLSRDDAIDLDDSRGDDTLSSDVEELHPSSLSHRSPFLSPAMAAANLNNEDVEEIVDDDDEIASDDDLIDPFSVPGAPEASAVIGPRQDRHYDDEDAELQAALAASLGDTEAAARFTAENPNYRNATRRSEEQQTAIPDDVDRITKMREEAKRKAREEQERQERLARGEPVEEQGSSSNANASSGGGPGAGDADDDEDEESEAEEVSAEEMRRRRLARFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.34
3 0.34
4 0.3
5 0.3
6 0.32
7 0.29
8 0.24
9 0.23
10 0.22
11 0.22
12 0.21
13 0.2
14 0.14
15 0.15
16 0.17
17 0.15
18 0.14
19 0.15
20 0.15
21 0.15
22 0.15
23 0.13
24 0.11
25 0.11
26 0.11
27 0.12
28 0.11
29 0.12
30 0.13
31 0.16
32 0.16
33 0.15
34 0.15
35 0.14
36 0.14
37 0.16
38 0.15
39 0.12
40 0.12
41 0.11
42 0.11
43 0.09
44 0.09
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.05
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.09
55 0.12
56 0.12
57 0.14
58 0.14
59 0.15
60 0.19
61 0.2
62 0.21
63 0.21
64 0.22
65 0.22
66 0.23
67 0.23
68 0.19
69 0.17
70 0.14
71 0.12
72 0.12
73 0.12
74 0.11
75 0.09
76 0.09
77 0.1
78 0.1
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.09
86 0.1
87 0.12
88 0.12
89 0.13
90 0.13
91 0.16
92 0.24
93 0.29
94 0.32
95 0.36
96 0.38
97 0.41
98 0.47
99 0.48
100 0.45
101 0.48
102 0.43
103 0.39
104 0.36
105 0.33
106 0.26
107 0.24
108 0.2
109 0.12
110 0.11
111 0.12
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.12
116 0.12
117 0.15
118 0.16
119 0.15
120 0.16
121 0.19
122 0.21
123 0.22
124 0.26
125 0.27
126 0.27
127 0.25
128 0.3
129 0.29
130 0.3
131 0.31
132 0.28
133 0.23
134 0.22
135 0.23
136 0.17
137 0.15
138 0.12
139 0.14
140 0.13
141 0.14
142 0.14
143 0.14
144 0.13
145 0.14
146 0.13
147 0.1
148 0.11
149 0.09
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.08
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.1
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.12
193 0.16
194 0.18
195 0.2
196 0.19
197 0.19
198 0.19
199 0.19
200 0.17
201 0.12
202 0.11
203 0.12
204 0.11
205 0.09
206 0.08
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.08
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.12
216 0.11
217 0.11
218 0.12
219 0.16
220 0.17
221 0.18
222 0.2
223 0.2
224 0.19
225 0.21
226 0.24
227 0.2
228 0.17
229 0.18
230 0.16
231 0.15
232 0.15
233 0.15
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.09
261 0.11
262 0.14
263 0.14
264 0.19
265 0.22
266 0.24
267 0.29
268 0.35
269 0.37
270 0.42
271 0.43
272 0.45
273 0.43
274 0.43
275 0.37
276 0.31
277 0.26
278 0.19
279 0.17
280 0.1
281 0.07
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.04
296 0.06
297 0.07
298 0.08
299 0.1
300 0.16
301 0.21
302 0.24
303 0.26
304 0.33
305 0.42
306 0.47
307 0.54
308 0.5
309 0.49
310 0.47
311 0.46
312 0.41
313 0.3
314 0.24
315 0.16
316 0.15
317 0.1
318 0.11
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.1
325 0.11
326 0.1
327 0.11
328 0.1
329 0.1
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.08
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.1
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.09
347 0.1
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.15
352 0.18
353 0.23
354 0.28
355 0.36
356 0.46
357 0.55
358 0.65
359 0.71
360 0.79
361 0.84
362 0.89
363 0.88
364 0.88
365 0.85
366 0.82
367 0.78
368 0.7
369 0.6
370 0.51
371 0.43
372 0.33
373 0.26
374 0.18
375 0.14
376 0.12
377 0.12
378 0.1
379 0.1
380 0.09
381 0.08
382 0.08
383 0.07
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.08
392 0.09
393 0.09
394 0.08
395 0.09
396 0.08
397 0.11
398 0.16
399 0.17
400 0.17
401 0.18
402 0.19
403 0.2
404 0.22
405 0.21
406 0.17
407 0.15
408 0.15
409 0.15
410 0.14
411 0.13
412 0.11
413 0.12
414 0.11
415 0.11
416 0.1
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.04
429 0.05
430 0.05
431 0.04
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.06
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.09
451 0.09
452 0.11
453 0.11
454 0.14
455 0.17
456 0.19
457 0.21
458 0.27
459 0.3
460 0.31
461 0.31
462 0.32
463 0.3
464 0.28
465 0.25
466 0.19
467 0.14
468 0.11
469 0.1
470 0.06
471 0.05
472 0.04
473 0.03
474 0.03
475 0.04
476 0.03
477 0.03
478 0.04
479 0.04
480 0.05
481 0.05
482 0.06
483 0.07
484 0.09
485 0.17
486 0.19
487 0.25
488 0.27
489 0.33
490 0.36
491 0.37
492 0.42
493 0.39
494 0.44
495 0.43
496 0.46
497 0.47
498 0.52
499 0.54
500 0.49
501 0.5
502 0.46
503 0.44
504 0.39
505 0.33
506 0.24
507 0.24
508 0.22
509 0.19
510 0.16
511 0.15
512 0.16
513 0.18
514 0.21
515 0.28
516 0.35
517 0.41
518 0.5
519 0.59
520 0.67
521 0.67
522 0.74
523 0.75
524 0.77
525 0.79
526 0.8
527 0.81
528 0.76
529 0.77
530 0.74
531 0.68
532 0.61
533 0.57
534 0.5
535 0.41
536 0.38
537 0.37
538 0.34
539 0.33
540 0.29
541 0.23
542 0.2
543 0.2
544 0.19
545 0.17
546 0.16
547 0.14
548 0.14
549 0.13
550 0.14
551 0.13
552 0.13
553 0.12
554 0.09
555 0.09
556 0.08
557 0.09
558 0.07
559 0.06
560 0.05
561 0.08
562 0.08
563 0.08
564 0.09
565 0.08
566 0.09
567 0.09
568 0.09
569 0.07
570 0.07
571 0.06
572 0.06
573 0.06
574 0.07
575 0.1
576 0.11
577 0.16
578 0.21
579 0.26
580 0.34
581 0.36