FuNGI

R9NYA4

Protein Details

Accession

R9NYA4

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
32-59	ESQAQALYKERERKRRQLRAANQQVWRS	Hydrophilic
1182-1214	SLSHLHRQRQQEHWQRQQEQQQRQQQQREQAAT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 3, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR003890 MIF4G-like_typ-3 IPR039762 Nmd2/UPF2 IPR007193 Upf2/Nmd2_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF02854 MIF4G PF04050 Upf2

Amino Acid Sequences

MAPATTSSAEAVALSKPSSSIASPAPPHSKDESQAQALYKERERKRRQLRAANQQVWRSGPAPISKALDSNLKKNTAFVKRVKQSIALDARDQLLKDLPLLNLEKYLQELIQAIPEGLARCVTAKDCFAAAETLSAFHVRFGGEAFSSPLTAALEQALAPPSKTTYQNAAADQKERDETARIARQKPLLRAVAELAIVEAVGHSTENTGSSWLFVLLKNLLATDKEHSNVPLLIAVLKGLGQSILASPESQQADAALTLGDAINADQIDQLDPSSAPLVSSEWQAKFRKLFETYFQTLARRIVKEHQRLQDQDRKNHEAYIRSGEIFEDRQHNYERMTKSFERVRDWGRVLSELLAVPMPELESSGSSSNAVGLGVNLDSKSAFERADEEFATDQSPWEDQDSQKFYQDILDLGDIIPPAILAQTTGIVATASTTTDTVDGPKESSVPIEAAESSTAPSSPRLDGDPTTEEAMNAGPAAQLATLMAKLPDMTNRSMIDSAAVDFAFIATKPARRKLVKHLASLPRNRIDLAPYYARLAAILTRYMPDVGAGLTALLEDEFRYLQRKKNIDLTETRAKNARFISELTKFKVTPTHAIFHCLKTCLEDFSGPNIDVLASLLEGCGRYLLRTEETSAHMRSMLEMLRRKRAAANLDSRQLLLLNNAYYQCNPPQRKAIEQKTRQPMELYIRHLIYHVLQKKTIDTVVLQLRKLPWDDKDVHGWLKDAFTRAWRIRYSHIHLLAILIYDLDRFHPAFSVEVIDQVLENIRIGMEENIFKHNQRRVATICYLGELYNYRLINSGIVFEQLWSLATFGHPNGRPWPGQVAPLDAPDDFFRIRLICSLLDTCGACFDRGSLRKKLDDFLAFLNVYVLCKHQPLPMDVDFMLTETLETLRPEWKWKKVFNEAAAALDELLAANRLKTAQTEAEEDTEEQSSDEDQARTGASGQDGDGQEKRRKARHGADHASSDDTSSDETESSASSPSSDSSSSTDSPSDSESSDTASASGGEESEDEQDEMNRHRKDEELALRKEADDEFDRELAKMMAELGSSSGAPVPSANSATSYQRAHVFSRTALPSGNAGGHSHVHSSNSSGGLSEIGLPLRRRPSEQAAEEGDTSHMRFALLSKKGSKQVTHEVHVPSTASIAINTRTKQLKEEAERKQLKEKVLAYERSSESQQGEGGLPSLSHLHRQRQQEHWQRQQEQQQRQQQQREQAATSKENQKRAAGDFKIWTSHGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.11
3	0.11
4	0.12
5	0.14
6	0.14
7	0.16
8	0.18
9	0.25
10	0.28
11	0.35
12	0.41
13	0.41
14	0.45
15	0.48
16	0.48
17	0.44
18	0.49
19	0.48
20	0.44
21	0.47
22	0.44
23	0.42
24	0.43
25	0.46
26	0.46
27	0.49
28	0.54
29	0.61
30	0.68
31	0.74
32	0.8
33	0.85
34	0.88
35	0.89
36	0.9
37	0.91
38	0.93
39	0.9
40	0.86
41	0.79
42	0.72
43	0.63
44	0.57
45	0.46
46	0.39
47	0.36
48	0.34
49	0.33
50	0.33
51	0.35
52	0.32
53	0.33
54	0.31
55	0.36
56	0.34
57	0.39
58	0.42
59	0.42
60	0.41
61	0.44
62	0.51
63	0.5
64	0.54
65	0.55
66	0.59
67	0.61
68	0.67
69	0.65
70	0.62
71	0.56
72	0.58
73	0.58
74	0.5
75	0.45
76	0.42
77	0.42
78	0.38
79	0.35
80	0.27
81	0.23
82	0.2
83	0.2
84	0.21
85	0.19
86	0.22
87	0.24
88	0.23
89	0.22
90	0.22
91	0.2
92	0.19
93	0.21
94	0.15
95	0.14
96	0.15
97	0.13
98	0.15
99	0.15
100	0.13
101	0.12
102	0.14
103	0.14
104	0.13
105	0.13
106	0.1
107	0.11
108	0.13
109	0.14
110	0.15
111	0.15
112	0.16
113	0.16
114	0.16
115	0.16
116	0.16
117	0.14
118	0.14
119	0.12
120	0.12
121	0.12
122	0.13
123	0.12
124	0.11
125	0.12
126	0.09
127	0.09
128	0.1
129	0.11
130	0.1
131	0.11
132	0.13
133	0.12
134	0.12
135	0.12
136	0.12
137	0.11
138	0.11
139	0.1
140	0.09
141	0.09
142	0.08
143	0.1
144	0.12
145	0.11
146	0.12
147	0.12
148	0.14
149	0.18
150	0.21
151	0.23
152	0.26
153	0.32
154	0.36
155	0.4
156	0.44
157	0.42
158	0.44
159	0.41
160	0.38
161	0.33
162	0.3
163	0.28
164	0.25
165	0.25
166	0.29
167	0.37
168	0.4
169	0.41
170	0.45
171	0.51
172	0.54
173	0.56
174	0.55
175	0.51
176	0.46
177	0.44
178	0.41
179	0.35
180	0.29
181	0.23
182	0.16
183	0.11
184	0.1
185	0.08
186	0.05
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.05
192	0.05
193	0.07
194	0.07
195	0.08
196	0.08
197	0.09
198	0.09
199	0.1
200	0.11
201	0.1
202	0.13
203	0.12
204	0.14
205	0.13
206	0.13
207	0.13
208	0.12
209	0.14
210	0.15
211	0.17
212	0.16
213	0.18
214	0.18
215	0.2
216	0.19
217	0.18
218	0.15
219	0.13
220	0.12
221	0.11
222	0.1
223	0.07
224	0.07
225	0.07
226	0.05
227	0.05
228	0.04
229	0.05
230	0.05
231	0.08
232	0.08
233	0.08
234	0.09
235	0.15
236	0.16
237	0.16
238	0.15
239	0.13
240	0.14
241	0.14
242	0.13
243	0.07
244	0.05
245	0.06
246	0.06
247	0.05
248	0.04
249	0.04
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.07
255	0.08
256	0.08
257	0.08
258	0.08
259	0.08
260	0.09
261	0.09
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.1
266	0.1
267	0.13
268	0.17
269	0.18
270	0.25
271	0.28
272	0.31
273	0.33
274	0.34
275	0.37
276	0.35
277	0.36
278	0.36
279	0.41
280	0.41
281	0.41
282	0.41
283	0.36
284	0.34
285	0.38
286	0.37
287	0.29
288	0.29
289	0.34
290	0.42
291	0.5
292	0.56
293	0.57
294	0.59
295	0.62
296	0.67
297	0.67
298	0.65
299	0.64
300	0.64
301	0.64
302	0.57
303	0.58
304	0.53
305	0.48
306	0.44
307	0.43
308	0.37
309	0.31
310	0.3
311	0.25
312	0.25
313	0.22
314	0.21
315	0.2
316	0.19
317	0.22
318	0.25
319	0.25
320	0.26
321	0.31
322	0.32
323	0.29
324	0.35
325	0.34
326	0.37
327	0.42
328	0.42
329	0.4
330	0.42
331	0.43
332	0.42
333	0.43
334	0.4
335	0.36
336	0.34
337	0.29
338	0.25
339	0.22
340	0.15
341	0.13
342	0.11
343	0.09
344	0.08
345	0.07
346	0.06
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.06
351	0.08
352	0.09
353	0.09
354	0.09
355	0.09
356	0.09
357	0.08
358	0.08
359	0.06
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.06
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.08
369	0.08
370	0.08
371	0.08
372	0.11
373	0.13
374	0.16
375	0.15
376	0.15
377	0.14
378	0.15
379	0.16
380	0.13
381	0.11
382	0.09
383	0.1
384	0.08
385	0.11
386	0.13
387	0.13
388	0.21
389	0.26
390	0.26
391	0.28
392	0.27
393	0.24
394	0.24
395	0.24
396	0.16
397	0.13
398	0.12
399	0.1
400	0.1
401	0.11
402	0.08
403	0.07
404	0.07
405	0.05
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.03
410	0.03
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.04
419	0.04
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.06
424	0.06
425	0.07
426	0.09
427	0.09
428	0.09
429	0.1
430	0.1
431	0.09
432	0.1
433	0.09
434	0.08
435	0.07
436	0.08
437	0.07
438	0.07
439	0.08
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.1
447	0.1
448	0.11
449	0.12
450	0.14
451	0.14
452	0.18
453	0.18
454	0.18
455	0.19
456	0.18
457	0.16
458	0.14
459	0.13
460	0.1
461	0.07
462	0.06
463	0.04
464	0.04
465	0.04
466	0.03
467	0.03
468	0.03
469	0.04
470	0.04
471	0.04
472	0.04
473	0.04
474	0.04
475	0.05
476	0.09
477	0.11
478	0.12
479	0.15
480	0.15
481	0.17
482	0.17
483	0.16
484	0.14
485	0.11
486	0.11
487	0.09
488	0.08
489	0.06
490	0.06
491	0.06
492	0.05
493	0.05
494	0.07
495	0.07
496	0.12
497	0.15
498	0.2
499	0.27
500	0.3
501	0.33
502	0.42
503	0.51
504	0.52
505	0.53
506	0.57
507	0.58
508	0.63
509	0.64
510	0.59
511	0.51
512	0.47
513	0.44
514	0.35
515	0.29
516	0.24
517	0.24
518	0.2
519	0.18
520	0.18
521	0.18
522	0.17
523	0.15
524	0.12
525	0.09
526	0.08
527	0.08
528	0.07
529	0.07
530	0.08
531	0.08
532	0.07
533	0.06
534	0.05
535	0.05
536	0.04
537	0.04
538	0.03
539	0.03
540	0.03
541	0.03
542	0.03
543	0.03
544	0.03
545	0.03
546	0.04
547	0.04
548	0.1
549	0.12
550	0.17
551	0.24
552	0.27
553	0.29
554	0.37
555	0.39
556	0.38
557	0.39
558	0.41
559	0.43
560	0.41
561	0.4
562	0.36
563	0.34
564	0.34
565	0.32
566	0.26
567	0.18
568	0.19
569	0.24
570	0.26
571	0.28
572	0.27
573	0.28
574	0.26
575	0.25
576	0.29
577	0.25
578	0.25
579	0.25
580	0.28
581	0.26
582	0.31
583	0.32
584	0.29
585	0.29
586	0.24
587	0.21
588	0.18
589	0.18
590	0.15
591	0.14
592	0.14
593	0.13
594	0.14
595	0.16
596	0.14
597	0.13
598	0.11
599	0.1
600	0.09
601	0.08
602	0.05
603	0.03
604	0.03
605	0.03
606	0.03
607	0.03
608	0.03
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.05
613	0.07
614	0.08
615	0.09
616	0.11
617	0.12
618	0.15
619	0.18
620	0.17
621	0.16
622	0.15
623	0.15
624	0.13
625	0.13
626	0.12
627	0.14
628	0.2
629	0.22
630	0.28
631	0.28
632	0.29
633	0.29
634	0.31
635	0.31
636	0.32
637	0.38
638	0.34
639	0.37
640	0.36
641	0.33
642	0.29
643	0.25
644	0.19
645	0.12
646	0.1
647	0.08
648	0.09
649	0.1
650	0.1
651	0.1
652	0.12
653	0.16
654	0.24
655	0.25
656	0.26
657	0.32
658	0.33
659	0.4
660	0.48
661	0.53
662	0.54
663	0.58
664	0.65
665	0.67
666	0.67
667	0.6
668	0.52
669	0.45
670	0.42
671	0.41
672	0.36
673	0.29
674	0.28
675	0.28
676	0.27
677	0.24
678	0.18
679	0.22
680	0.24
681	0.23
682	0.23
683	0.24
684	0.24
685	0.25
686	0.23
687	0.16
688	0.1
689	0.14
690	0.2
691	0.22
692	0.21
693	0.21
694	0.22
695	0.23
696	0.24
697	0.21
698	0.16
699	0.19
700	0.22
701	0.22
702	0.26
703	0.26
704	0.26
705	0.25
706	0.24
707	0.19
708	0.18
709	0.17
710	0.14
711	0.13
712	0.14
713	0.2
714	0.22
715	0.26
716	0.26
717	0.27
718	0.31
719	0.37
720	0.41
721	0.41
722	0.4
723	0.36
724	0.34
725	0.32
726	0.27
727	0.2
728	0.13
729	0.06
730	0.04
731	0.05
732	0.05
733	0.05
734	0.06
735	0.06
736	0.07
737	0.08
738	0.08
739	0.08
740	0.09
741	0.1
742	0.08
743	0.09
744	0.09
745	0.08
746	0.07
747	0.07
748	0.07
749	0.05
750	0.05
751	0.04
752	0.04
753	0.04
754	0.05
755	0.06
756	0.07
757	0.09
758	0.1
759	0.14
760	0.15
761	0.16
762	0.21
763	0.24
764	0.29
765	0.28
766	0.31
767	0.31
768	0.36
769	0.36
770	0.33
771	0.29
772	0.24
773	0.23
774	0.19
775	0.17
776	0.13
777	0.13
778	0.15
779	0.15
780	0.14
781	0.15
782	0.15
783	0.15
784	0.14
785	0.13
786	0.08
787	0.09
788	0.09
789	0.08
790	0.08
791	0.06
792	0.07
793	0.06
794	0.06
795	0.05
796	0.06
797	0.07
798	0.07
799	0.14
800	0.14
801	0.16
802	0.2
803	0.23
804	0.23
805	0.23
806	0.28
807	0.22
808	0.25
809	0.23
810	0.24
811	0.21
812	0.22
813	0.22
814	0.16
815	0.16
816	0.13
817	0.15
818	0.11
819	0.1
820	0.1
821	0.1
822	0.1
823	0.11
824	0.12
825	0.1
826	0.12
827	0.13
828	0.12
829	0.13
830	0.13
831	0.11
832	0.14
833	0.14
834	0.12
835	0.11
836	0.12
837	0.18
838	0.25
839	0.3
840	0.32
841	0.35
842	0.39
843	0.4
844	0.41
845	0.38
846	0.34
847	0.31
848	0.27
849	0.28
850	0.23
851	0.22
852	0.21
853	0.16
854	0.14
855	0.12
856	0.12
857	0.09
858	0.11
859	0.12
860	0.13
861	0.16
862	0.18
863	0.23
864	0.23
865	0.25
866	0.23
867	0.23
868	0.2
869	0.18
870	0.16
871	0.1
872	0.08
873	0.06
874	0.07
875	0.07
876	0.07
877	0.08
878	0.12
879	0.13
880	0.22
881	0.28
882	0.35
883	0.41
884	0.46
885	0.52
886	0.58
887	0.63
888	0.57
889	0.58
890	0.49
891	0.44
892	0.39
893	0.32
894	0.22
895	0.16
896	0.13
897	0.06
898	0.06
899	0.06
900	0.05
901	0.05
902	0.06
903	0.07
904	0.07
905	0.08
906	0.12
907	0.14
908	0.16
909	0.19
910	0.2
911	0.21
912	0.22
913	0.21
914	0.19
915	0.16
916	0.14
917	0.11
918	0.1
919	0.09
920	0.1
921	0.13
922	0.12
923	0.11
924	0.12
925	0.12
926	0.12
927	0.12
928	0.11
929	0.09
930	0.09
931	0.09
932	0.15
933	0.15
934	0.18
935	0.21
936	0.25
937	0.3
938	0.35
939	0.41
940	0.41
941	0.46
942	0.51
943	0.57
944	0.62
945	0.67
946	0.69
947	0.67
948	0.64
949	0.6
950	0.54
951	0.44
952	0.34
953	0.24
954	0.17
955	0.14
956	0.12
957	0.11
958	0.08
959	0.08
960	0.08
961	0.09
962	0.09
963	0.09
964	0.08
965	0.08
966	0.09
967	0.09
968	0.11
969	0.11
970	0.12
971	0.14
972	0.19
973	0.19
974	0.2
975	0.2
976	0.18
977	0.19
978	0.2
979	0.18
980	0.14
981	0.15
982	0.13
983	0.16
984	0.16
985	0.15
986	0.12
987	0.11
988	0.11
989	0.1
990	0.1
991	0.07
992	0.06
993	0.07
994	0.08
995	0.09
996	0.1
997	0.09
998	0.09
999	0.11
1000	0.14
1001	0.19
1002	0.26
1003	0.26
1004	0.26
1005	0.27
1006	0.29
1007	0.3
1008	0.37
1009	0.42
1010	0.43
1011	0.44
1012	0.46
1013	0.46
1014	0.44
1015	0.43
1016	0.33
1017	0.28
1018	0.22
1019	0.23
1020	0.23
1021	0.24
1022	0.24
1023	0.22
1024	0.23
1025	0.18
1026	0.15
1027	0.12
1028	0.09
1029	0.08
1030	0.08
1031	0.08
1032	0.07
1033	0.08
1034	0.07
1035	0.08
1036	0.09
1037	0.08
1038	0.08
1039	0.08
1040	0.09
1041	0.11
1042	0.13
1043	0.12
1044	0.13
1045	0.16
1046	0.19
1047	0.24
1048	0.23
1049	0.23
1050	0.27
1051	0.3
1052	0.3
1053	0.32
1054	0.3
1055	0.28
1056	0.34
1057	0.34
1058	0.29
1059	0.27
1060	0.26
1061	0.23
1062	0.22
1063	0.22
1064	0.16
1065	0.14
1066	0.16
1067	0.17
1068	0.17
1069	0.19
1070	0.18
1071	0.18
1072	0.18
1073	0.2
1074	0.21
1075	0.2
1076	0.18
1077	0.15
1078	0.15
1079	0.13
1080	0.13
1081	0.12
1082	0.1
1083	0.11
1084	0.16
1085	0.17
1086	0.22
1087	0.3
1088	0.31
1089	0.34
1090	0.39
1091	0.46
1092	0.51
1093	0.53
1094	0.53
1095	0.49
1096	0.5
1097	0.46
1098	0.4
1099	0.33
1100	0.25
1101	0.23
1102	0.18
1103	0.14
1104	0.11
1105	0.11
1106	0.13
1107	0.2
1108	0.24
1109	0.28
1110	0.32
1111	0.38
1112	0.45
1113	0.5
1114	0.5
1115	0.47
1116	0.53
1117	0.55
1118	0.54
1119	0.54
1120	0.5
1121	0.47
1122	0.45
1123	0.39
1124	0.29
1125	0.23
1126	0.2
1127	0.14
1128	0.12
1129	0.14
1130	0.17
1131	0.22
1132	0.23
1133	0.29
1134	0.33
1135	0.34
1136	0.37
1137	0.42
1138	0.47
1139	0.51
1140	0.6
1141	0.62
1142	0.67
1143	0.73
1144	0.72
1145	0.75
1146	0.7
1147	0.64
1148	0.63
1149	0.58
1150	0.57
1151	0.58
1152	0.6
1153	0.54
1154	0.57
1155	0.56
1156	0.51
1157	0.49
1158	0.43
1159	0.36
1160	0.32
1161	0.3
1162	0.24
1163	0.22
1164	0.19
1165	0.17
1166	0.14
1167	0.12
1168	0.11
1169	0.16
1170	0.15
1171	0.22
1172	0.27
1173	0.36
1174	0.42
1175	0.52
1176	0.57
1177	0.61
1178	0.71
1179	0.73
1180	0.78
1181	0.79
1182	0.83
1183	0.79
1184	0.81
1185	0.82
1186	0.81
1187	0.81
1188	0.8
1189	0.8
1190	0.8
1191	0.84
1192	0.85
1193	0.82
1194	0.82
1195	0.81
1196	0.76
1197	0.69
1198	0.65
1199	0.63
1200	0.57
1201	0.58
1202	0.59
1203	0.56
1204	0.58
1205	0.58
1206	0.56
1207	0.54
1208	0.55
1209	0.57
1210	0.5
1211	0.5
1212	0.48
1213	0.47
1214	0.46

R9NYA4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer