FuNGI

R9PCB5

Protein Details

Accession

R9PCB5

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
228-253	GITPPMQWARKRRFRKRAARRAIETT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
237-249	RKRRFRKRAARRA

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 5, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR037817 TAF7 IPR006751 TAFII55_prot_cons_reg
Gene Ontology	GO:0005669 C:transcription factor TFIID complex GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF04658 TAFII55_N
CDD	cd08047 TAF7

Amino Acid Sequences

MSEASGSASPAPGASAAELGPGGTRPKRAVRPTAKALLAREQSPEGWEHGGSRRSQPSRPIRTSSGARPQIKLKMKASGGGTAAGTGQGPKTHAYMQSYDRELDSEDDETGQGLAFEEQLIFRMPEGPECDKLRESIQKRQLGDDVWFKFKDSRRAVVHAGDSLFSAKLVDLPTITEAHKTLDNRQFFKVADIAQMLVVEGKIADEAQASSSSGGKGFNIEDFIYPHGITPPMQWARKRRFRKRAARRAIETTEKEVERLLKADKKAEQVEYEMIDAAEEDGSEDDDDDQRRGQGRRGATSPGGSQAETPMPDGSDVGSQDEGLDDGDAEDGEQGYRRRVDLDEDGVERGYDDQDLDDDDVDEDLAAELDAALEEEEDDDDDGSTRGANSEAQSRASDQEDLWDDDDDDDADEADEEDEDEEDENDEEKEQRVREAQLEAECRELETLVRRKQADVDGTMNLIIKNRHQQALRKLTTERDMKRNQLSDLKQARKERKEADQAASAAAAAQAGQATADSPNADEPAQPRSADDYSMHPPSQPQSGPNAEPALGATAAVVNGDAKLTSQNRGMPPPALPASRNTVQPTTLASQLTEAGPGDSDLWDDDEEEDEDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.09
3	0.08
4	0.09
5	0.09
6	0.08
7	0.09
8	0.1
9	0.15
10	0.17
11	0.21
12	0.25
13	0.34
14	0.43
15	0.5
16	0.59
17	0.63
18	0.69
19	0.73
20	0.76
21	0.71
22	0.66
23	0.62
24	0.61
25	0.55
26	0.47
27	0.43
28	0.37
29	0.34
30	0.32
31	0.3
32	0.23
33	0.21
34	0.2
35	0.21
36	0.25
37	0.29
38	0.29
39	0.35
40	0.42
41	0.44
42	0.48
43	0.55
44	0.59
45	0.65
46	0.68
47	0.68
48	0.63
49	0.65
50	0.67
51	0.66
52	0.66
53	0.65
54	0.62
55	0.59
56	0.59
57	0.62
58	0.65
59	0.63
60	0.55
61	0.54
62	0.52
63	0.54
64	0.5
65	0.45
66	0.37
67	0.31
68	0.28
69	0.2
70	0.19
71	0.15
72	0.13
73	0.09
74	0.09
75	0.09
76	0.11
77	0.12
78	0.14
79	0.18
80	0.21
81	0.24
82	0.27
83	0.3
84	0.35
85	0.36
86	0.35
87	0.31
88	0.29
89	0.26
90	0.24
91	0.22
92	0.16
93	0.14
94	0.14
95	0.13
96	0.13
97	0.11
98	0.09
99	0.07
100	0.06
101	0.06
102	0.06
103	0.06
104	0.06
105	0.06
106	0.07
107	0.08
108	0.08
109	0.08
110	0.12
111	0.12
112	0.16
113	0.22
114	0.24
115	0.29
116	0.31
117	0.34
118	0.31
119	0.32
120	0.34
121	0.38
122	0.39
123	0.44
124	0.5
125	0.52
126	0.53
127	0.54
128	0.51
129	0.43
130	0.42
131	0.4
132	0.35
133	0.34
134	0.33
135	0.31
136	0.36
137	0.39
138	0.45
139	0.41
140	0.45
141	0.44
142	0.49
143	0.5
144	0.47
145	0.44
146	0.36
147	0.32
148	0.25
149	0.21
150	0.18
151	0.15
152	0.11
153	0.1
154	0.06
155	0.09
156	0.09
157	0.09
158	0.08
159	0.09
160	0.11
161	0.12
162	0.13
163	0.11
164	0.11
165	0.13
166	0.16
167	0.17
168	0.24
169	0.3
170	0.35
171	0.37
172	0.38
173	0.38
174	0.35
175	0.35
176	0.3
177	0.23
178	0.2
179	0.17
180	0.16
181	0.13
182	0.13
183	0.11
184	0.08
185	0.07
186	0.05
187	0.04
188	0.04
189	0.03
190	0.03
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.06
195	0.06
196	0.07
197	0.07
198	0.08
199	0.08
200	0.08
201	0.08
202	0.07
203	0.08
204	0.08
205	0.08
206	0.09
207	0.1
208	0.1
209	0.11
210	0.12
211	0.12
212	0.11
213	0.11
214	0.1
215	0.11
216	0.1
217	0.1
218	0.18
219	0.22
220	0.25
221	0.29
222	0.37
223	0.47
224	0.56
225	0.66
226	0.68
227	0.73
228	0.8
229	0.87
230	0.9
231	0.91
232	0.91
233	0.89
234	0.82
235	0.78
236	0.72
237	0.68
238	0.58
239	0.52
240	0.46
241	0.38
242	0.34
243	0.28
244	0.26
245	0.19
246	0.19
247	0.19
248	0.18
249	0.2
250	0.24
251	0.26
252	0.28
253	0.3
254	0.29
255	0.26
256	0.23
257	0.24
258	0.2
259	0.17
260	0.13
261	0.1
262	0.08
263	0.07
264	0.06
265	0.04
266	0.03
267	0.03
268	0.03
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.07
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.1
278	0.14
279	0.15
280	0.18
281	0.21
282	0.22
283	0.24
284	0.26
285	0.27
286	0.23
287	0.24
288	0.21
289	0.2
290	0.18
291	0.15
292	0.14
293	0.12
294	0.13
295	0.12
296	0.12
297	0.08
298	0.08
299	0.08
300	0.08
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.04
311	0.04
312	0.03
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.03
318	0.03
319	0.03
320	0.06
321	0.06
322	0.08
323	0.09
324	0.09
325	0.11
326	0.12
327	0.15
328	0.15
329	0.18
330	0.18
331	0.18
332	0.19
333	0.17
334	0.16
335	0.13
336	0.11
337	0.08
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.04
351	0.03
352	0.03
353	0.03
354	0.02
355	0.02
356	0.02
357	0.02
358	0.02
359	0.02
360	0.02
361	0.02
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.05
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.05
374	0.05
375	0.07
376	0.07
377	0.13
378	0.14
379	0.16
380	0.16
381	0.17
382	0.19
383	0.19
384	0.19
385	0.13
386	0.16
387	0.17
388	0.18
389	0.18
390	0.16
391	0.15
392	0.14
393	0.15
394	0.1
395	0.08
396	0.06
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.06
413	0.07
414	0.08
415	0.09
416	0.13
417	0.13
418	0.15
419	0.17
420	0.19
421	0.2
422	0.21
423	0.23
424	0.24
425	0.27
426	0.25
427	0.25
428	0.23
429	0.2
430	0.19
431	0.16
432	0.13
433	0.18
434	0.25
435	0.29
436	0.34
437	0.35
438	0.35
439	0.39
440	0.43
441	0.38
442	0.33
443	0.31
444	0.26
445	0.26
446	0.26
447	0.23
448	0.18
449	0.16
450	0.14
451	0.15
452	0.23
453	0.26
454	0.3
455	0.33
456	0.4
457	0.48
458	0.57
459	0.56
460	0.51
461	0.49
462	0.48
463	0.53
464	0.54
465	0.49
466	0.48
467	0.51
468	0.54
469	0.6
470	0.59
471	0.55
472	0.55
473	0.52
474	0.53
475	0.58
476	0.59
477	0.59
478	0.65
479	0.71
480	0.69
481	0.73
482	0.68
483	0.67
484	0.7
485	0.68
486	0.64
487	0.59
488	0.53
489	0.47
490	0.41
491	0.31
492	0.21
493	0.16
494	0.11
495	0.05
496	0.05
497	0.04
498	0.04
499	0.04
500	0.04
501	0.05
502	0.05
503	0.06
504	0.06
505	0.07
506	0.09
507	0.1
508	0.11
509	0.12
510	0.13
511	0.17
512	0.2
513	0.19
514	0.19
515	0.23
516	0.24
517	0.24
518	0.24
519	0.24
520	0.27
521	0.32
522	0.32
523	0.26
524	0.28
525	0.28
526	0.34
527	0.3
528	0.27
529	0.29
530	0.34
531	0.35
532	0.36
533	0.36
534	0.29
535	0.27
536	0.26
537	0.21
538	0.15
539	0.14
540	0.1
541	0.09
542	0.08
543	0.08
544	0.08
545	0.05
546	0.05
547	0.06
548	0.06
549	0.05
550	0.13
551	0.15
552	0.18
553	0.22
554	0.28
555	0.32
556	0.37
557	0.39
558	0.34
559	0.34
560	0.38
561	0.39
562	0.36
563	0.33
564	0.32
565	0.37
566	0.38
567	0.41
568	0.39
569	0.36
570	0.34
571	0.34
572	0.36
573	0.31
574	0.31
575	0.27
576	0.22
577	0.21
578	0.23
579	0.22
580	0.18
581	0.15
582	0.12
583	0.12
584	0.12
585	0.12
586	0.1
587	0.1
588	0.1
589	0.12
590	0.11
591	0.12
592	0.12
593	0.13

R9PCB5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer