FuNGI

R9P9P9

Protein Details

Accession

R9P9P9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
329-351	IEENNARRLRKRRRTGKFPLPPA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
335-345	RRLRKRRRTGK
462-466	RSRRS

Subcellular Location(s)

mito 12, nucl 8.5, cyto_nucl 8, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSYSNGTGAGSGASTAASSSRSKRELIDRVRYPNPIPVPPYPPKLVKIPTEPSRYANPHFADRLASQQPIPMVVDLHAGMHIDLANFQNLWEGDLSEVTAPASASLDAKDLDDVDAFLLQDFATNLPPAAASSSAAGAIGLITSLKATDDPASQATLQAALQQRHTQSLGPGAKAALAADDVTWLRRTEYLSAQQKAAQQQVQKPKVAERIDVSREAQLAKIEKSFTDAQMPLRSLVHPHKKGVKAVQVFDFLPDPETWATDYQVVRFIDHPGRIVNGVPQSDPRLDVALLRPVSAADGEQRVSYYLPAGEDVPEDPEEPMTLIDNRDIEENNARRLRKRRRTGKFPLPPAADDQDDENPSQPKLLKKDHATPYKLSRDYVPKDTAESAHDVLLLTLDDGIPDADPDADIDPIKGVKSAPTQDGEDDDDDLFGDDDDDAQDAASARLDSTLPPQSEFERQKRSRRSAATKGKERSEQPDGDGITSQSRPKARAYYHKVGMRFTLRVWRSRFANNEKLRNRDRRYPGKWDAVVLSNRQLEEREKLRRLHARSQVDDVGELDPYDPEDEFEEALAEDDGDVEAAANDAVADVFDEDKEAEDDADGEVDDVDRPRANDADDQADEQVEDDGGDDGSDDDDDDDEDEDDDEDGTVDGDEELAALRAEAGEAGEDLEEDGQGGARRSRSRRSGAAATGSDAVAAAMDEDDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.06
2	0.06
3	0.06
4	0.09
5	0.13
6	0.18
7	0.26
8	0.28
9	0.3
10	0.35
11	0.44
12	0.51
13	0.57
14	0.62
15	0.61
16	0.66
17	0.7
18	0.68
19	0.61
20	0.59
21	0.56
22	0.51
23	0.49
24	0.47
25	0.51
26	0.53
27	0.57
28	0.54
29	0.53
30	0.51
31	0.53
32	0.53
33	0.51
34	0.53
35	0.55
36	0.58
37	0.62
38	0.61
39	0.57
40	0.6
41	0.6
42	0.56
43	0.55
44	0.5
45	0.48
46	0.48
47	0.45
48	0.4
49	0.35
50	0.38
51	0.33
52	0.32
53	0.26
54	0.27
55	0.26
56	0.24
57	0.24
58	0.17
59	0.15
60	0.13
61	0.15
62	0.13
63	0.13
64	0.11
65	0.1
66	0.09
67	0.09
68	0.1
69	0.07
70	0.09
71	0.1
72	0.11
73	0.11
74	0.11
75	0.14
76	0.13
77	0.15
78	0.13
79	0.12
80	0.12
81	0.12
82	0.13
83	0.08
84	0.09
85	0.07
86	0.08
87	0.07
88	0.07
89	0.08
90	0.07
91	0.08
92	0.08
93	0.1
94	0.1
95	0.1
96	0.1
97	0.1
98	0.1
99	0.1
100	0.09
101	0.08
102	0.09
103	0.08
104	0.08
105	0.07
106	0.06
107	0.07
108	0.07
109	0.08
110	0.09
111	0.09
112	0.09
113	0.09
114	0.09
115	0.08
116	0.09
117	0.09
118	0.07
119	0.08
120	0.08
121	0.08
122	0.08
123	0.07
124	0.06
125	0.05
126	0.04
127	0.03
128	0.03
129	0.03
130	0.03
131	0.03
132	0.04
133	0.04
134	0.06
135	0.08
136	0.1
137	0.12
138	0.13
139	0.15
140	0.14
141	0.15
142	0.14
143	0.13
144	0.11
145	0.15
146	0.19
147	0.19
148	0.22
149	0.25
150	0.26
151	0.27
152	0.29
153	0.24
154	0.2
155	0.28
156	0.28
157	0.24
158	0.24
159	0.21
160	0.2
161	0.19
162	0.18
163	0.09
164	0.07
165	0.06
166	0.05
167	0.07
168	0.07
169	0.09
170	0.1
171	0.1
172	0.11
173	0.13
174	0.15
175	0.16
176	0.22
177	0.3
178	0.37
179	0.38
180	0.38
181	0.39
182	0.41
183	0.41
184	0.41
185	0.35
186	0.32
187	0.38
188	0.47
189	0.48
190	0.47
191	0.45
192	0.45
193	0.49
194	0.46
195	0.41
196	0.34
197	0.37
198	0.37
199	0.38
200	0.35
201	0.28
202	0.28
203	0.25
204	0.23
205	0.19
206	0.18
207	0.17
208	0.18
209	0.17
210	0.16
211	0.2
212	0.21
213	0.18
214	0.21
215	0.21
216	0.22
217	0.25
218	0.26
219	0.23
220	0.22
221	0.21
222	0.21
223	0.28
224	0.36
225	0.34
226	0.38
227	0.44
228	0.46
229	0.5
230	0.51
231	0.5
232	0.44
233	0.44
234	0.42
235	0.37
236	0.34
237	0.31
238	0.27
239	0.18
240	0.16
241	0.13
242	0.13
243	0.1
244	0.11
245	0.11
246	0.11
247	0.12
248	0.14
249	0.15
250	0.13
251	0.19
252	0.18
253	0.18
254	0.18
255	0.21
256	0.21
257	0.21
258	0.22
259	0.16
260	0.17
261	0.16
262	0.16
263	0.15
264	0.14
265	0.14
266	0.14
267	0.15
268	0.16
269	0.16
270	0.17
271	0.14
272	0.12
273	0.12
274	0.13
275	0.13
276	0.17
277	0.16
278	0.16
279	0.15
280	0.13
281	0.14
282	0.12
283	0.11
284	0.06
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.09
290	0.09
291	0.08
292	0.07
293	0.06
294	0.06
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.08
301	0.08
302	0.09
303	0.08
304	0.08
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.06
309	0.07
310	0.07
311	0.08
312	0.08
313	0.08
314	0.09
315	0.09
316	0.1
317	0.16
318	0.17
319	0.22
320	0.27
321	0.27
322	0.32
323	0.42
324	0.51
325	0.54
326	0.63
327	0.68
328	0.72
329	0.81
330	0.84
331	0.85
332	0.82
333	0.77
334	0.74
335	0.64
336	0.56
337	0.5
338	0.42
339	0.32
340	0.24
341	0.2
342	0.16
343	0.16
344	0.15
345	0.14
346	0.13
347	0.13
348	0.14
349	0.15
350	0.16
351	0.21
352	0.25
353	0.29
354	0.32
355	0.41
356	0.48
357	0.53
358	0.52
359	0.49
360	0.52
361	0.54
362	0.51
363	0.43
364	0.38
365	0.39
366	0.4
367	0.42
368	0.38
369	0.3
370	0.31
371	0.31
372	0.28
373	0.21
374	0.2
375	0.15
376	0.13
377	0.13
378	0.11
379	0.1
380	0.09
381	0.07
382	0.05
383	0.04
384	0.04
385	0.03
386	0.03
387	0.04
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.04
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.06
398	0.06
399	0.06
400	0.07
401	0.07
402	0.06
403	0.08
404	0.12
405	0.15
406	0.16
407	0.18
408	0.18
409	0.18
410	0.2
411	0.19
412	0.16
413	0.14
414	0.12
415	0.1
416	0.09
417	0.09
418	0.08
419	0.05
420	0.05
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.05
428	0.05
429	0.05
430	0.06
431	0.05
432	0.05
433	0.06
434	0.07
435	0.06
436	0.1
437	0.16
438	0.16
439	0.17
440	0.18
441	0.2
442	0.28
443	0.34
444	0.37
445	0.42
446	0.47
447	0.55
448	0.64
449	0.68
450	0.68
451	0.7
452	0.72
453	0.72
454	0.77
455	0.77
456	0.77
457	0.75
458	0.71
459	0.68
460	0.62
461	0.58
462	0.54
463	0.46
464	0.38
465	0.38
466	0.34
467	0.3
468	0.28
469	0.22
470	0.18
471	0.19
472	0.18
473	0.18
474	0.2
475	0.21
476	0.24
477	0.3
478	0.32
479	0.41
480	0.49
481	0.52
482	0.57
483	0.6
484	0.58
485	0.52
486	0.52
487	0.45
488	0.36
489	0.29
490	0.32
491	0.3
492	0.35
493	0.38
494	0.38
495	0.38
496	0.43
497	0.5
498	0.48
499	0.57
500	0.57
501	0.63
502	0.63
503	0.68
504	0.7
505	0.72
506	0.7
507	0.7
508	0.72
509	0.73
510	0.74
511	0.75
512	0.74
513	0.73
514	0.67
515	0.59
516	0.52
517	0.48
518	0.45
519	0.37
520	0.35
521	0.29
522	0.28
523	0.27
524	0.26
525	0.23
526	0.27
527	0.32
528	0.35
529	0.39
530	0.41
531	0.49
532	0.55
533	0.59
534	0.61
535	0.64
536	0.63
537	0.6
538	0.63
539	0.58
540	0.5
541	0.43
542	0.35
543	0.26
544	0.19
545	0.16
546	0.11
547	0.08
548	0.08
549	0.09
550	0.08
551	0.08
552	0.09
553	0.1
554	0.1
555	0.1
556	0.09
557	0.08
558	0.09
559	0.08
560	0.06
561	0.05
562	0.05
563	0.05
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.03
568	0.04
569	0.04
570	0.03
571	0.03
572	0.03
573	0.03
574	0.03
575	0.03
576	0.04
577	0.05
578	0.05
579	0.06
580	0.06
581	0.07
582	0.08
583	0.08
584	0.08
585	0.07
586	0.08
587	0.07
588	0.08
589	0.07
590	0.06
591	0.06
592	0.06
593	0.08
594	0.08
595	0.1
596	0.11
597	0.12
598	0.15
599	0.16
600	0.18
601	0.21
602	0.23
603	0.27
604	0.26
605	0.27
606	0.25
607	0.24
608	0.21
609	0.17
610	0.15
611	0.08
612	0.07
613	0.06
614	0.06
615	0.06
616	0.06
617	0.06
618	0.05
619	0.06
620	0.06
621	0.06
622	0.06
623	0.06
624	0.07
625	0.07
626	0.08
627	0.08
628	0.08
629	0.08
630	0.08
631	0.08
632	0.08
633	0.07
634	0.07
635	0.06
636	0.06
637	0.06
638	0.06
639	0.05
640	0.05
641	0.05
642	0.04
643	0.05
644	0.05
645	0.05
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.05
650	0.05
651	0.05
652	0.05
653	0.05
654	0.06
655	0.06
656	0.06
657	0.06
658	0.06
659	0.06
660	0.06
661	0.06
662	0.07
663	0.09
664	0.12
665	0.15
666	0.21
667	0.3
668	0.35
669	0.44
670	0.5
671	0.56
672	0.6
673	0.64
674	0.65
675	0.62
676	0.64
677	0.56
678	0.5
679	0.45
680	0.38
681	0.3
682	0.22
683	0.17
684	0.09
685	0.08
686	0.06

R9P9P9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer