Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9P1H8

Protein Details
Accession R9P1H8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-135GVAPRAKMNQQRSRRFRAAKEAREKHEHydrophilic
409-431DDIFRRRKEDEDRRENNRKRREEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
120-133RSRRFRAAKEAREK
421-429RRENNRKRR
956-977KRGSPDNRGRGRGRGGHRGGPG
1233-1255GPPARGGGGGRGGRGSGRGGPGR
Subcellular Location(s) mito 11cyto 11cyto_mito 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSKKYPRIVSSVQEEDPKTAPGPDGTEITLPLDTSTPNPNGEEFDCLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEEEMMVEVFAYTERVVNMVRPRRLLMMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAKEAREKHEEKEAALAEWKAKGLPVTDDALESKKAWDSNAITPGTPFMDLLAASLRYWVAQKINTDPGWKDVQVIISDASVPGEGEHKIMEHIRRQRSHPEHDPNTKHVIYGLDADLIMLSLATHEPYFKVLREDVFAADNKPKTCNICGQPGHFAASCTGAAKKKSGEHDEIAPTPPEKKPFIFLDVATLREYLEVELNIPQLPFAFDLERAIDDWVFLIFFVGNDFLPHLPSLEIRDGAIDTLLRIWKKELPAMGGYLTNHGRVELGRAQLILSGLASEEDDIFRRRKEDEDRRENNRKRREEMQQRREKELDEGNFGNGSMVEVMSKKRPAHETEKPAFNGVSAQEARDQANTSNKSYDPRKKAVVLGGDNNQVVRDRNAARQANMDAAEALKAELMGGAPSEQDGANEEPPVKKVKTESGAEATAASTDNAGDGDDKTSSTAAGTKRKADHVEDGTSVGESAAKTEAGDVRGDGEATAAEADADADGDADADGDADADAAADEGDDNDDVEGNEDVDPVTTVKKRKVNADGTVDYEDTVKMWEPGYRERYYREKFGVDLSDTDFRRQVVKSYIEGLCWVLAYYYQGVPSWQWYYPFHFSPFAADFEDLESLDINFDLGSPFKPFEQLMGVLPADSRASIPSAFHPLMTESSSEIIDFYPSEFEIDMNGKKMAWQGVALLPFIDEKRLLDALKEKYPLLSEDEVRRNGFGNNTMFVGNESRLYDFLCEEIYAKKPVSDDGDKPAPIPVNPALSGGITGFVKPDPVCVPGSTFNSPLTSQALHDIHNDRSISVLYDFPEQKTPHRSILLKGLKPPKRVLSAAEIDWVKRGSPDNRGRGRGRGGHRGGPGRDFHRNDNGQQRNGGNGGGGENGHGGSSYRGGGANGGGGGGHGSYGGGGGYGGHAGHSQDHQQQYSQSGGGGYGNYGGYGGYGSGGGYGPSAGRDGGAYYGGYGGGGGGGAAYASAPAYPPAGGYDPYAGYGAAPPSGYGGYGGSAPSYPPGPNRGDRYAAYTQPSAHVGPAPGAGRGGSARHPHPAPPQPQQGYAGLPSLGGPPPPAAAAPPAAYGGYGGAAPPAGGAGYGGYGTGGGYGGYGAPAQGYGAPPPGPPARGGGGGRGGRGSGRGGPGRGGNNGASYGGHGGAYGSFY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.61
3 0.64
4 0.64
5 0.62
6 0.61
7 0.59
8 0.54
9 0.5
10 0.49
11 0.45
12 0.41
13 0.37
14 0.3
15 0.26
16 0.25
17 0.2
18 0.23
19 0.22
20 0.22
21 0.22
22 0.22
23 0.21
24 0.21
25 0.19
26 0.15
27 0.14
28 0.13
29 0.12
30 0.14
31 0.2
32 0.2
33 0.22
34 0.23
35 0.23
36 0.26
37 0.26
38 0.29
39 0.24
40 0.24
41 0.22
42 0.21
43 0.21
44 0.17
45 0.16
46 0.11
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.1
53 0.13
54 0.17
55 0.2
56 0.2
57 0.27
58 0.33
59 0.36
60 0.41
61 0.41
62 0.4
63 0.39
64 0.42
65 0.36
66 0.33
67 0.28
68 0.24
69 0.22
70 0.17
71 0.14
72 0.1
73 0.09
74 0.06
75 0.07
76 0.06
77 0.08
78 0.08
79 0.1
80 0.1
81 0.16
82 0.25
83 0.33
84 0.37
85 0.38
86 0.4
87 0.42
88 0.43
89 0.39
90 0.32
91 0.29
92 0.26
93 0.24
94 0.23
95 0.2
96 0.19
97 0.18
98 0.16
99 0.1
100 0.13
101 0.19
102 0.27
103 0.37
104 0.46
105 0.55
106 0.66
107 0.74
108 0.8
109 0.83
110 0.82
111 0.77
112 0.79
113 0.79
114 0.78
115 0.81
116 0.8
117 0.77
118 0.79
119 0.75
120 0.67
121 0.66
122 0.57
123 0.47
124 0.45
125 0.4
126 0.32
127 0.34
128 0.32
129 0.24
130 0.24
131 0.23
132 0.16
133 0.16
134 0.16
135 0.14
136 0.16
137 0.17
138 0.18
139 0.18
140 0.19
141 0.2
142 0.21
143 0.21
144 0.19
145 0.18
146 0.19
147 0.19
148 0.18
149 0.24
150 0.25
151 0.3
152 0.36
153 0.36
154 0.32
155 0.31
156 0.32
157 0.27
158 0.23
159 0.16
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.1
164 0.11
165 0.11
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.1
170 0.12
171 0.14
172 0.15
173 0.17
174 0.2
175 0.25
176 0.32
177 0.33
178 0.35
179 0.33
180 0.34
181 0.35
182 0.32
183 0.29
184 0.24
185 0.25
186 0.22
187 0.23
188 0.19
189 0.14
190 0.15
191 0.12
192 0.11
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.11
202 0.15
203 0.2
204 0.26
205 0.35
206 0.43
207 0.47
208 0.51
209 0.6
210 0.63
211 0.67
212 0.69
213 0.7
214 0.7
215 0.76
216 0.77
217 0.7
218 0.7
219 0.61
220 0.51
221 0.42
222 0.35
223 0.26
224 0.25
225 0.21
226 0.14
227 0.14
228 0.14
229 0.12
230 0.1
231 0.08
232 0.04
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.1
241 0.13
242 0.13
243 0.17
244 0.18
245 0.19
246 0.21
247 0.22
248 0.2
249 0.21
250 0.21
251 0.2
252 0.24
253 0.27
254 0.25
255 0.26
256 0.28
257 0.29
258 0.31
259 0.37
260 0.34
261 0.4
262 0.42
263 0.43
264 0.46
265 0.43
266 0.43
267 0.34
268 0.31
269 0.22
270 0.22
271 0.19
272 0.15
273 0.18
274 0.19
275 0.2
276 0.22
277 0.24
278 0.27
279 0.34
280 0.39
281 0.4
282 0.39
283 0.43
284 0.44
285 0.43
286 0.4
287 0.34
288 0.29
289 0.27
290 0.28
291 0.27
292 0.25
293 0.24
294 0.27
295 0.28
296 0.32
297 0.31
298 0.28
299 0.32
300 0.3
301 0.31
302 0.26
303 0.23
304 0.19
305 0.17
306 0.17
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.09
311 0.11
312 0.12
313 0.12
314 0.11
315 0.1
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.11
324 0.12
325 0.11
326 0.12
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.06
338 0.05
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.09
347 0.12
348 0.13
349 0.13
350 0.12
351 0.13
352 0.12
353 0.12
354 0.12
355 0.08
356 0.06
357 0.08
358 0.12
359 0.11
360 0.12
361 0.14
362 0.17
363 0.19
364 0.22
365 0.21
366 0.21
367 0.22
368 0.22
369 0.21
370 0.19
371 0.17
372 0.18
373 0.18
374 0.15
375 0.14
376 0.13
377 0.13
378 0.11
379 0.16
380 0.16
381 0.16
382 0.15
383 0.16
384 0.15
385 0.16
386 0.16
387 0.11
388 0.07
389 0.06
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.04
394 0.05
395 0.05
396 0.07
397 0.1
398 0.12
399 0.12
400 0.14
401 0.15
402 0.21
403 0.31
404 0.4
405 0.48
406 0.57
407 0.63
408 0.71
409 0.81
410 0.83
411 0.82
412 0.81
413 0.76
414 0.7
415 0.7
416 0.72
417 0.73
418 0.76
419 0.77
420 0.77
421 0.75
422 0.75
423 0.69
424 0.6
425 0.52
426 0.48
427 0.39
428 0.34
429 0.31
430 0.26
431 0.24
432 0.23
433 0.19
434 0.12
435 0.1
436 0.06
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.08
441 0.11
442 0.16
443 0.16
444 0.2
445 0.24
446 0.29
447 0.37
448 0.44
449 0.5
450 0.51
451 0.56
452 0.53
453 0.5
454 0.44
455 0.36
456 0.29
457 0.2
458 0.2
459 0.14
460 0.15
461 0.16
462 0.17
463 0.18
464 0.17
465 0.18
466 0.14
467 0.23
468 0.24
469 0.23
470 0.24
471 0.24
472 0.29
473 0.36
474 0.43
475 0.41
476 0.43
477 0.45
478 0.44
479 0.46
480 0.44
481 0.42
482 0.36
483 0.33
484 0.32
485 0.31
486 0.29
487 0.26
488 0.22
489 0.17
490 0.15
491 0.13
492 0.15
493 0.15
494 0.19
495 0.28
496 0.29
497 0.28
498 0.3
499 0.3
500 0.27
501 0.25
502 0.21
503 0.13
504 0.11
505 0.11
506 0.08
507 0.07
508 0.05
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.03
513 0.03
514 0.03
515 0.03
516 0.03
517 0.03
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.07
522 0.09
523 0.09
524 0.1
525 0.11
526 0.11
527 0.12
528 0.17
529 0.15
530 0.14
531 0.15
532 0.2
533 0.24
534 0.25
535 0.27
536 0.25
537 0.26
538 0.24
539 0.23
540 0.17
541 0.12
542 0.11
543 0.08
544 0.05
545 0.04
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.04
551 0.05
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.06
558 0.1
559 0.13
560 0.2
561 0.21
562 0.25
563 0.27
564 0.3
565 0.32
566 0.3
567 0.33
568 0.29
569 0.29
570 0.26
571 0.25
572 0.21
573 0.19
574 0.16
575 0.1
576 0.08
577 0.05
578 0.06
579 0.06
580 0.05
581 0.05
582 0.07
583 0.08
584 0.08
585 0.08
586 0.07
587 0.08
588 0.08
589 0.09
590 0.07
591 0.06
592 0.05
593 0.05
594 0.05
595 0.03
596 0.03
597 0.03
598 0.03
599 0.02
600 0.03
601 0.02
602 0.02
603 0.02
604 0.03
605 0.03
606 0.03
607 0.03
608 0.03
609 0.03
610 0.03
611 0.03
612 0.02
613 0.02
614 0.02
615 0.02
616 0.02
617 0.02
618 0.02
619 0.02
620 0.02
621 0.03
622 0.03
623 0.03
624 0.03
625 0.03
626 0.03
627 0.05
628 0.04
629 0.05
630 0.05
631 0.05
632 0.05
633 0.05
634 0.05
635 0.04
636 0.07
637 0.1
638 0.12
639 0.18
640 0.22
641 0.24
642 0.29
643 0.37
644 0.39
645 0.42
646 0.46
647 0.41
648 0.39
649 0.39
650 0.34
651 0.26
652 0.21
653 0.16
654 0.09
655 0.09
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.08
660 0.09
661 0.16
662 0.21
663 0.22
664 0.23
665 0.26
666 0.35
667 0.36
668 0.38
669 0.35
670 0.3
671 0.29
672 0.3
673 0.28
674 0.2
675 0.18
676 0.17
677 0.2
678 0.2
679 0.2
680 0.19
681 0.17
682 0.19
683 0.18
684 0.18
685 0.18
686 0.2
687 0.2
688 0.23
689 0.23
690 0.21
691 0.21
692 0.18
693 0.13
694 0.11
695 0.09
696 0.05
697 0.04
698 0.05
699 0.06
700 0.06
701 0.07
702 0.07
703 0.07
704 0.07
705 0.1
706 0.11
707 0.11
708 0.13
709 0.14
710 0.19
711 0.23
712 0.24
713 0.23
714 0.22
715 0.21
716 0.23
717 0.23
718 0.19
719 0.16
720 0.15
721 0.13
722 0.13
723 0.13
724 0.09
725 0.08
726 0.07
727 0.06
728 0.05
729 0.05
730 0.04
731 0.03
732 0.03
733 0.04
734 0.04
735 0.05
736 0.06
737 0.07
738 0.07
739 0.09
740 0.09
741 0.09
742 0.11
743 0.11
744 0.1
745 0.12
746 0.12
747 0.1
748 0.1
749 0.1
750 0.08
751 0.07
752 0.06
753 0.05
754 0.06
755 0.07
756 0.07
757 0.09
758 0.15
759 0.14
760 0.14
761 0.14
762 0.14
763 0.15
764 0.15
765 0.14
766 0.09
767 0.1
768 0.1
769 0.09
770 0.08
771 0.07
772 0.07
773 0.06
774 0.06
775 0.06
776 0.06
777 0.07
778 0.06
779 0.06
780 0.08
781 0.1
782 0.11
783 0.11
784 0.12
785 0.11
786 0.12
787 0.14
788 0.13
789 0.11
790 0.1
791 0.1
792 0.13
793 0.14
794 0.13
795 0.11
796 0.1
797 0.1
798 0.1
799 0.1
800 0.07
801 0.07
802 0.1
803 0.11
804 0.11
805 0.12
806 0.18
807 0.21
808 0.25
809 0.26
810 0.23
811 0.22
812 0.23
813 0.23
814 0.21
815 0.2
816 0.19
817 0.25
818 0.3
819 0.32
820 0.32
821 0.31
822 0.27
823 0.26
824 0.24
825 0.22
826 0.18
827 0.17
828 0.17
829 0.17
830 0.16
831 0.16
832 0.16
833 0.11
834 0.11
835 0.11
836 0.11
837 0.11
838 0.12
839 0.11
840 0.09
841 0.09
842 0.08
843 0.07
844 0.08
845 0.1
846 0.12
847 0.14
848 0.14
849 0.15
850 0.14
851 0.16
852 0.22
853 0.24
854 0.23
855 0.27
856 0.32
857 0.31
858 0.31
859 0.31
860 0.26
861 0.22
862 0.24
863 0.2
864 0.18
865 0.18
866 0.19
867 0.16
868 0.15
869 0.15
870 0.11
871 0.1
872 0.07
873 0.07
874 0.07
875 0.07
876 0.09
877 0.09
878 0.11
879 0.11
880 0.13
881 0.14
882 0.14
883 0.17
884 0.19
885 0.24
886 0.23
887 0.23
888 0.22
889 0.22
890 0.22
891 0.21
892 0.19
893 0.15
894 0.13
895 0.19
896 0.19
897 0.18
898 0.22
899 0.24
900 0.23
901 0.27
902 0.26
903 0.19
904 0.19
905 0.19
906 0.16
907 0.14
908 0.14
909 0.11
910 0.18
911 0.19
912 0.19
913 0.26
914 0.26
915 0.29
916 0.34
917 0.36
918 0.34
919 0.39
920 0.39
921 0.34
922 0.44
923 0.48
924 0.43
925 0.48
926 0.54
927 0.54
928 0.56
929 0.58
930 0.54
931 0.5
932 0.49
933 0.44
934 0.41
935 0.39
936 0.36
937 0.37
938 0.32
939 0.27
940 0.28
941 0.25
942 0.18
943 0.16
944 0.21
945 0.19
946 0.29
947 0.37
948 0.45
949 0.51
950 0.58
951 0.58
952 0.58
953 0.61
954 0.59
955 0.56
956 0.56
957 0.54
958 0.53
959 0.56
960 0.57
961 0.53
962 0.48
963 0.47
964 0.42
965 0.47
966 0.44
967 0.43
968 0.46
969 0.47
970 0.49
971 0.55
972 0.56
973 0.49
974 0.51
975 0.47
976 0.4
977 0.38
978 0.32
979 0.22
980 0.16
981 0.14
982 0.11
983 0.1
984 0.08
985 0.07
986 0.07
987 0.07
988 0.06
989 0.06
990 0.06
991 0.08
992 0.08
993 0.08
994 0.09
995 0.09
996 0.1
997 0.09
998 0.09
999 0.07
1000 0.07
1001 0.06
1002 0.05
1003 0.05
1004 0.04
1005 0.04
1006 0.03
1007 0.03
1008 0.03
1009 0.03
1010 0.03
1011 0.03
1012 0.03
1013 0.03
1014 0.03
1015 0.04
1016 0.04
1017 0.05
1018 0.06
1019 0.06
1020 0.08
1021 0.1
1022 0.14
1023 0.2
1024 0.24
1025 0.25
1026 0.25
1027 0.27
1028 0.27
1029 0.28
1030 0.23
1031 0.17
1032 0.14
1033 0.14
1034 0.13
1035 0.11
1036 0.09
1037 0.09
1038 0.08
1039 0.08
1040 0.07
1041 0.07
1042 0.06
1043 0.06
1044 0.05
1045 0.04
1046 0.04
1047 0.04
1048 0.05
1049 0.05
1050 0.05
1051 0.05
1052 0.06
1053 0.05
1054 0.06
1055 0.07
1056 0.06
1057 0.06
1058 0.06
1059 0.07
1060 0.08
1061 0.09
1062 0.08
1063 0.07
1064 0.08
1065 0.07
1066 0.07
1067 0.06
1068 0.05
1069 0.04
1070 0.03
1071 0.03
1072 0.02
1073 0.02
1074 0.02
1075 0.02
1076 0.02
1077 0.02
1078 0.03
1079 0.03
1080 0.04
1081 0.05
1082 0.06
1083 0.06
1084 0.06
1085 0.09
1086 0.11
1087 0.12
1088 0.13
1089 0.15
1090 0.14
1091 0.15
1092 0.16
1093 0.13
1094 0.11
1095 0.13
1096 0.12
1097 0.1
1098 0.1
1099 0.09
1100 0.1
1101 0.11
1102 0.1
1103 0.08
1104 0.08
1105 0.07
1106 0.08
1107 0.08
1108 0.07
1109 0.08
1110 0.08
1111 0.09
1112 0.11
1113 0.12
1114 0.14
1115 0.2
1116 0.25
1117 0.31
1118 0.37
1119 0.4
1120 0.42
1121 0.41
1122 0.46
1123 0.46
1124 0.44
1125 0.42
1126 0.37
1127 0.34
1128 0.32
1129 0.34
1130 0.27
1131 0.23
1132 0.22
1133 0.18
1134 0.17
1135 0.21
1136 0.19
1137 0.16
1138 0.16
1139 0.14
1140 0.13
1141 0.14
1142 0.15
1143 0.17
1144 0.22
1145 0.24
1146 0.3
1147 0.32
1148 0.35
1149 0.43
1150 0.51
1151 0.52
1152 0.55
1153 0.63
1154 0.59
1155 0.6
1156 0.59
1157 0.51
1158 0.45
1159 0.39
1160 0.32
1161 0.22
1162 0.19
1163 0.17
1164 0.17
1165 0.16
1166 0.13
1167 0.13
1168 0.12
1169 0.13
1170 0.13
1171 0.13
1172 0.11
1173 0.12
1174 0.14
1175 0.14
1176 0.14
1177 0.14
1178 0.13
1179 0.13
1180 0.12
1181 0.1
1182 0.08
1183 0.07
1184 0.06
1185 0.05
1186 0.05
1187 0.05
1188 0.05
1189 0.05
1190 0.04
1191 0.04
1192 0.04
1193 0.04
1194 0.04
1195 0.04
1196 0.04
1197 0.04
1198 0.04
1199 0.04
1200 0.05
1201 0.04
1202 0.04
1203 0.04
1204 0.04
1205 0.05
1206 0.05
1207 0.05
1208 0.05
1209 0.05
1210 0.05
1211 0.06
1212 0.08
1213 0.09
1214 0.1
1215 0.14
1216 0.15
1217 0.15
1218 0.2
1219 0.23
1220 0.23
1221 0.22
1222 0.24
1223 0.24
1224 0.29
1225 0.29
1226 0.28
1227 0.33
1228 0.33
1229 0.33
1230 0.29
1231 0.27
1232 0.22
1233 0.23
1234 0.22
1235 0.19
1236 0.24
1237 0.27
1238 0.28
1239 0.3
1240 0.35
1241 0.37
1242 0.36
1243 0.34
1244 0.29
1245 0.26
1246 0.26
1247 0.24
1248 0.18
1249 0.17
1250 0.16
1251 0.14
1252 0.12
1253 0.1
1254 0.1