Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9AKN4

Protein Details
Accession R9AKN4    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-103RSPSPPPRPSPPPPRRRNENPPEPNEHydrophilic
234-270DWRGSGSRRSPPPRRRYSRSPPPRRYRDYSPPPPRAGBasic
278-312RSPPPRGGYARRSPPPRRFSRSPPPRRYSPSPMRDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-94SPPRSPSPPPRPSPPPPRRR
202-304RFDRPPPRGGGGGYRGGPPPRPPPRRGYYDRDDWRGSGSRRSPPPRRRYSRSPPPRRYRDYSPPPPRAGGYGRPRSRSPPPRGGYARRSPPPRRFSRSPPPRR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG wic:J056_000451  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12363  RRM_TRA2  
Amino Acid Sequences MADTEIREEFKGENQAEDAGWGLKQENNEDDDGWGFKGDDTQNGWEESKQEDNPGTQGAPGTQNPQPQSPHLPRSPPRSPSPPPRPSPPPPRRRNENPPEPNETLGVFGLSIRTREIDLEDEFNRFGRVDKVTIVYDQRSDRSRGFGFIKMASIEDADKCIQALNGVEIHGRNIRVDFSATKRPHSPTPGQYMGVKRFDDRRFDRPPPRGGGGGYRGGPPPRPPPRRGYYDRDDWRGSGSRRSPPPRRRYSRSPPPRRYRDYSPPPPRAGGYGRPRSRSPPPRGGYARRSPPPRRFSRSPPPRRYSPSPMRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.24
4 0.23
5 0.19
6 0.12
7 0.11
8 0.1
9 0.11
10 0.11
11 0.13
12 0.17
13 0.19
14 0.21
15 0.22
16 0.22
17 0.21
18 0.21
19 0.2
20 0.17
21 0.15
22 0.12
23 0.11
24 0.17
25 0.16
26 0.19
27 0.21
28 0.24
29 0.26
30 0.28
31 0.29
32 0.23
33 0.24
34 0.24
35 0.26
36 0.23
37 0.25
38 0.24
39 0.24
40 0.25
41 0.25
42 0.22
43 0.16
44 0.16
45 0.15
46 0.17
47 0.17
48 0.19
49 0.21
50 0.26
51 0.27
52 0.31
53 0.31
54 0.31
55 0.39
56 0.41
57 0.46
58 0.45
59 0.51
60 0.53
61 0.59
62 0.63
63 0.59
64 0.59
65 0.59
66 0.63
67 0.65
68 0.7
69 0.7
70 0.67
71 0.7
72 0.71
73 0.72
74 0.76
75 0.76
76 0.76
77 0.77
78 0.81
79 0.82
80 0.83
81 0.86
82 0.85
83 0.85
84 0.83
85 0.79
86 0.78
87 0.7
88 0.62
89 0.52
90 0.41
91 0.31
92 0.22
93 0.17
94 0.09
95 0.07
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.1
104 0.11
105 0.12
106 0.15
107 0.15
108 0.15
109 0.15
110 0.15
111 0.14
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.12
116 0.12
117 0.13
118 0.15
119 0.15
120 0.17
121 0.18
122 0.15
123 0.17
124 0.17
125 0.19
126 0.19
127 0.21
128 0.2
129 0.23
130 0.22
131 0.23
132 0.24
133 0.24
134 0.23
135 0.21
136 0.21
137 0.16
138 0.16
139 0.12
140 0.1
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.1
158 0.1
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.11
164 0.12
165 0.14
166 0.24
167 0.24
168 0.26
169 0.29
170 0.32
171 0.35
172 0.38
173 0.4
174 0.36
175 0.43
176 0.42
177 0.4
178 0.4
179 0.41
180 0.41
181 0.38
182 0.34
183 0.28
184 0.34
185 0.36
186 0.41
187 0.41
188 0.44
189 0.47
190 0.55
191 0.62
192 0.6
193 0.62
194 0.58
195 0.56
196 0.49
197 0.42
198 0.39
199 0.34
200 0.32
201 0.27
202 0.24
203 0.24
204 0.24
205 0.26
206 0.25
207 0.31
208 0.39
209 0.44
210 0.46
211 0.52
212 0.58
213 0.65
214 0.67
215 0.65
216 0.61
217 0.65
218 0.68
219 0.65
220 0.6
221 0.51
222 0.49
223 0.48
224 0.43
225 0.41
226 0.4
227 0.43
228 0.51
229 0.6
230 0.65
231 0.69
232 0.77
233 0.8
234 0.84
235 0.84
236 0.85
237 0.86
238 0.87
239 0.88
240 0.89
241 0.89
242 0.9
243 0.92
244 0.9
245 0.86
246 0.84
247 0.84
248 0.83
249 0.84
250 0.83
251 0.81
252 0.76
253 0.71
254 0.63
255 0.57
256 0.51
257 0.49
258 0.49
259 0.52
260 0.55
261 0.57
262 0.59
263 0.6
264 0.66
265 0.67
266 0.66
267 0.65
268 0.63
269 0.68
270 0.74
271 0.76
272 0.74
273 0.74
274 0.75
275 0.73
276 0.79
277 0.79
278 0.81
279 0.83
280 0.83
281 0.82
282 0.8
283 0.81
284 0.83
285 0.84
286 0.86
287 0.86
288 0.84
289 0.84
290 0.85
291 0.84
292 0.84