Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9AFI3

Protein Details
Accession R9AFI3    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
111-130HSCYRPRRTGERRRKSVRGCBasic
212-233VTPQRLQRRRHLRSVARRNTESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-124ERRR
161-173KRLGPKRATKIRK
188-223IRREVQPKKEGAKPYTKAPKIQRLVTPQRLQRRRHL
251-267EKKEKLAEIRQQKAAKK
Subcellular Location(s) mito 14.5, mito_nucl 11.999, nucl 8, cyto_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014401  Ribosomal_S6_euk  
IPR001377  Ribosomal_S6e  
IPR018282  Ribosomal_S6e_CS  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG wic:J056_004806  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01092  Ribosomal_S6e  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00578  RIBOSOMAL_S6E  
Amino Acid Sequences MLLHATNAVESRHKSVSNLHSIQISLISLTVKLNIANPQTGLQKTINIDDERRFRVFLEKRMSQEVPADSIGDEWKGYIFRITGGNDKQGFPMKQGVLLPHRVKLLLKAGHSCYRPRRTGERRRKSVRGCIVNTDIAVLSVAIVKQGEQEIPGLTDATLPKRLGPKRATKIRKFFNLSKEDDVRKFVIRREVQPKKEGAKPYTKAPKIQRLVTPQRLQRRRHLRSVARRNTESQKEVVAEYQQILAKRQAEKKEKLAEIRQQKAAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.35
3 0.41
4 0.46
5 0.46
6 0.42
7 0.39
8 0.38
9 0.37
10 0.3
11 0.22
12 0.12
13 0.11
14 0.1
15 0.09
16 0.09
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.12
21 0.17
22 0.19
23 0.2
24 0.2
25 0.22
26 0.26
27 0.26
28 0.27
29 0.22
30 0.24
31 0.24
32 0.27
33 0.3
34 0.27
35 0.3
36 0.32
37 0.37
38 0.38
39 0.38
40 0.35
41 0.3
42 0.38
43 0.4
44 0.42
45 0.44
46 0.44
47 0.45
48 0.51
49 0.51
50 0.42
51 0.41
52 0.34
53 0.29
54 0.25
55 0.22
56 0.16
57 0.16
58 0.15
59 0.11
60 0.1
61 0.07
62 0.08
63 0.07
64 0.08
65 0.08
66 0.07
67 0.08
68 0.12
69 0.14
70 0.19
71 0.2
72 0.26
73 0.26
74 0.27
75 0.28
76 0.31
77 0.3
78 0.25
79 0.29
80 0.23
81 0.24
82 0.24
83 0.26
84 0.23
85 0.3
86 0.29
87 0.26
88 0.26
89 0.24
90 0.23
91 0.22
92 0.26
93 0.22
94 0.22
95 0.24
96 0.27
97 0.32
98 0.33
99 0.36
100 0.38
101 0.42
102 0.44
103 0.44
104 0.51
105 0.56
106 0.66
107 0.71
108 0.73
109 0.76
110 0.79
111 0.82
112 0.76
113 0.75
114 0.72
115 0.68
116 0.59
117 0.53
118 0.49
119 0.42
120 0.37
121 0.29
122 0.2
123 0.12
124 0.11
125 0.07
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.08
143 0.08
144 0.1
145 0.14
146 0.13
147 0.16
148 0.23
149 0.26
150 0.31
151 0.36
152 0.44
153 0.5
154 0.6
155 0.67
156 0.67
157 0.74
158 0.74
159 0.76
160 0.73
161 0.7
162 0.68
163 0.66
164 0.61
165 0.58
166 0.57
167 0.53
168 0.48
169 0.45
170 0.39
171 0.37
172 0.35
173 0.32
174 0.36
175 0.35
176 0.41
177 0.49
178 0.56
179 0.56
180 0.59
181 0.61
182 0.55
183 0.58
184 0.57
185 0.52
186 0.52
187 0.5
188 0.55
189 0.6
190 0.58
191 0.6
192 0.61
193 0.66
194 0.61
195 0.64
196 0.61
197 0.6
198 0.67
199 0.69
200 0.69
201 0.66
202 0.71
203 0.74
204 0.72
205 0.73
206 0.74
207 0.71
208 0.74
209 0.77
210 0.76
211 0.79
212 0.86
213 0.86
214 0.83
215 0.79
216 0.76
217 0.75
218 0.72
219 0.64
220 0.54
221 0.48
222 0.41
223 0.39
224 0.35
225 0.28
226 0.23
227 0.2
228 0.22
229 0.21
230 0.21
231 0.23
232 0.25
233 0.28
234 0.34
235 0.41
236 0.47
237 0.54
238 0.59
239 0.65
240 0.69
241 0.69
242 0.7
243 0.71
244 0.7
245 0.71
246 0.72
247 0.72