Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9ARF9

Protein Details
Accession R9ARF9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-29TDAVTFKKPSRKGRPTGLRQKSPPKESSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-24KKPSRKGRPTGLRQKSP
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039971  CWC24-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
IPR004181  Znf_MIZ  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG wic:J056_000164  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PF11789  zf-Nse  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd16539  RING-HC_RNF113A_B  
Amino Acid Sequences MTDAVTFKKPSRKGRPTGLRQKSPPKESSEEVEKSSVATVKDRRSVTQAKAESHKQGAARKRNIDVSHVEDDESGGGVVDVAWSATNSSDNTMNRNTAVVDTDAETIDGPQLKKYKEGDEVDANDLEDDGLYKGLQSYTSHIKKKPDSAQSDKFKAGPVRAPTNIRQITITDFQPDVCKDYKETGWCGFGDTCKFLHDRSDYMAGWQLDQAWNKMQAQKSGAAAFEDDSDESEDEDMPFACLITREPFVDPVVTKCGHYFEKSAALKRFQKTPKCYACGAATGGIFNKPKQLIKKLKERAAKEEEEAQEGDSDSGAIEGLEEKHDNETN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.85
3 0.86
4 0.89
5 0.89
6 0.87
7 0.85
8 0.89
9 0.87
10 0.84
11 0.79
12 0.75
13 0.7
14 0.64
15 0.63
16 0.6
17 0.54
18 0.48
19 0.45
20 0.37
21 0.32
22 0.32
23 0.28
24 0.2
25 0.24
26 0.28
27 0.33
28 0.4
29 0.41
30 0.41
31 0.45
32 0.5
33 0.48
34 0.51
35 0.5
36 0.48
37 0.52
38 0.55
39 0.52
40 0.48
41 0.47
42 0.41
43 0.44
44 0.49
45 0.53
46 0.56
47 0.56
48 0.57
49 0.61
50 0.58
51 0.55
52 0.49
53 0.45
54 0.42
55 0.38
56 0.34
57 0.27
58 0.26
59 0.21
60 0.17
61 0.1
62 0.05
63 0.05
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.03
68 0.03
69 0.03
70 0.03
71 0.04
72 0.04
73 0.06
74 0.07
75 0.09
76 0.14
77 0.14
78 0.18
79 0.2
80 0.21
81 0.19
82 0.2
83 0.18
84 0.14
85 0.15
86 0.12
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.1
93 0.08
94 0.1
95 0.12
96 0.11
97 0.14
98 0.18
99 0.19
100 0.24
101 0.26
102 0.28
103 0.32
104 0.34
105 0.34
106 0.35
107 0.37
108 0.34
109 0.32
110 0.28
111 0.2
112 0.17
113 0.13
114 0.08
115 0.06
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.05
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.1
125 0.19
126 0.26
127 0.3
128 0.33
129 0.39
130 0.41
131 0.48
132 0.52
133 0.51
134 0.52
135 0.56
136 0.62
137 0.62
138 0.62
139 0.56
140 0.48
141 0.43
142 0.38
143 0.32
144 0.27
145 0.25
146 0.26
147 0.27
148 0.3
149 0.29
150 0.36
151 0.35
152 0.31
153 0.28
154 0.24
155 0.25
156 0.25
157 0.23
158 0.15
159 0.14
160 0.14
161 0.16
162 0.16
163 0.15
164 0.14
165 0.14
166 0.13
167 0.16
168 0.18
169 0.18
170 0.21
171 0.19
172 0.19
173 0.19
174 0.2
175 0.17
176 0.17
177 0.16
178 0.15
179 0.13
180 0.13
181 0.14
182 0.12
183 0.17
184 0.17
185 0.16
186 0.18
187 0.22
188 0.2
189 0.21
190 0.26
191 0.2
192 0.19
193 0.18
194 0.16
195 0.15
196 0.16
197 0.17
198 0.14
199 0.16
200 0.18
201 0.22
202 0.23
203 0.23
204 0.24
205 0.25
206 0.24
207 0.23
208 0.22
209 0.17
210 0.16
211 0.13
212 0.12
213 0.1
214 0.08
215 0.08
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.08
230 0.1
231 0.11
232 0.12
233 0.13
234 0.15
235 0.16
236 0.18
237 0.17
238 0.16
239 0.2
240 0.19
241 0.18
242 0.18
243 0.21
244 0.21
245 0.23
246 0.22
247 0.2
248 0.29
249 0.32
250 0.38
251 0.39
252 0.44
253 0.49
254 0.5
255 0.57
256 0.56
257 0.62
258 0.63
259 0.68
260 0.7
261 0.67
262 0.65
263 0.6
264 0.54
265 0.47
266 0.41
267 0.34
268 0.25
269 0.22
270 0.22
271 0.23
272 0.22
273 0.2
274 0.24
275 0.25
276 0.31
277 0.37
278 0.46
279 0.51
280 0.57
281 0.68
282 0.71
283 0.76
284 0.78
285 0.76
286 0.74
287 0.72
288 0.67
289 0.6
290 0.59
291 0.52
292 0.47
293 0.43
294 0.35
295 0.28
296 0.26
297 0.23
298 0.14
299 0.12
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.05
304 0.05
305 0.07
306 0.08
307 0.11
308 0.12
309 0.13