Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9AQ49

Protein Details
Accession R9AQ49    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-113SQQDLKQCHRVCKRWRRSQVINYIWFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
197-208LKGRKPRSKGVR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001199  Cyt_B5-like_heme/steroid-bd  
IPR036400  Cyt_B5-like_heme/steroid_sf  
IPR036047  F-box-like_dom_sf  
IPR001810  F-box_dom  
IPR034012  Zn_ribbon_RPB9_C  
IPR001222  Znf_TFIIS  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
KEGG wic:J056_002263  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00173  Cyt-b5  
PF12937  F-box-like  
PF01096  TFIIS_C  
CDD cd09917  F-box_SF  
cd10508  Zn-ribbon_RPB9  
Amino Acid Sequences MTSPSLHAVMESQKKHADEFWKLFHKAKIHSDAPSEDGEDDVVSVYTGSGISTPNRRRDRSEERIGPERDPMKIFTHDISTNIFRRLSQQDLKQCHRVCKRWRRSQVINYIWFEIYRQRFFDGESTQSLQGKWTRRESRQDWKLMYKSANRRPFESAVVEQLERSITPSQIREAQWDAEANKPPPTKNEQREEYKLLKGRKPRSKGVRGENTSKGEDRERRVLLFACRNCNFEEAAVEARVYRNDLMTQSKEEAGVTQDLGKDPTLPRTSIECPKCTTNQVVFFQDQSKRTETRMTLFFRSFSVDQLADFNGRNGKDIYLAVNGLVFDVSSNPRIYGPGGMYHAAVAKDAARAFVTNCFKDQPTHDLRGLTEKELSQVKGWQSFFDNHPKYMLVGGIFSLITLSDDSTDWHGRYPGHRPRCAYP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.39
3 0.42
4 0.41
5 0.42
6 0.46
7 0.5
8 0.53
9 0.55
10 0.58
11 0.58
12 0.56
13 0.53
14 0.56
15 0.56
16 0.51
17 0.52
18 0.52
19 0.49
20 0.45
21 0.4
22 0.33
23 0.25
24 0.22
25 0.18
26 0.14
27 0.12
28 0.09
29 0.08
30 0.06
31 0.06
32 0.05
33 0.05
34 0.05
35 0.05
36 0.06
37 0.08
38 0.12
39 0.22
40 0.29
41 0.38
42 0.47
43 0.5
44 0.55
45 0.63
46 0.69
47 0.69
48 0.73
49 0.71
50 0.69
51 0.75
52 0.71
53 0.63
54 0.6
55 0.53
56 0.46
57 0.4
58 0.37
59 0.32
60 0.33
61 0.34
62 0.27
63 0.3
64 0.28
65 0.27
66 0.28
67 0.3
68 0.29
69 0.3
70 0.29
71 0.24
72 0.29
73 0.32
74 0.35
75 0.36
76 0.41
77 0.46
78 0.54
79 0.59
80 0.63
81 0.62
82 0.64
83 0.66
84 0.68
85 0.7
86 0.73
87 0.79
88 0.8
89 0.87
90 0.86
91 0.86
92 0.86
93 0.86
94 0.83
95 0.79
96 0.7
97 0.63
98 0.54
99 0.45
100 0.37
101 0.34
102 0.31
103 0.27
104 0.26
105 0.25
106 0.25
107 0.26
108 0.3
109 0.25
110 0.22
111 0.23
112 0.25
113 0.25
114 0.26
115 0.24
116 0.23
117 0.26
118 0.3
119 0.32
120 0.39
121 0.45
122 0.49
123 0.58
124 0.61
125 0.66
126 0.67
127 0.68
128 0.62
129 0.62
130 0.59
131 0.54
132 0.53
133 0.5
134 0.52
135 0.55
136 0.61
137 0.55
138 0.55
139 0.56
140 0.53
141 0.48
142 0.42
143 0.33
144 0.28
145 0.29
146 0.26
147 0.21
148 0.19
149 0.16
150 0.12
151 0.13
152 0.11
153 0.1
154 0.12
155 0.13
156 0.15
157 0.2
158 0.21
159 0.21
160 0.22
161 0.21
162 0.2
163 0.21
164 0.21
165 0.2
166 0.24
167 0.22
168 0.26
169 0.26
170 0.26
171 0.28
172 0.34
173 0.38
174 0.42
175 0.49
176 0.49
177 0.53
178 0.57
179 0.59
180 0.54
181 0.5
182 0.49
183 0.46
184 0.44
185 0.47
186 0.52
187 0.55
188 0.57
189 0.6
190 0.64
191 0.68
192 0.71
193 0.72
194 0.73
195 0.68
196 0.68
197 0.65
198 0.58
199 0.51
200 0.45
201 0.37
202 0.33
203 0.34
204 0.32
205 0.33
206 0.31
207 0.29
208 0.3
209 0.31
210 0.29
211 0.32
212 0.31
213 0.32
214 0.32
215 0.33
216 0.32
217 0.31
218 0.27
219 0.19
220 0.17
221 0.11
222 0.12
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.09
230 0.08
231 0.09
232 0.11
233 0.14
234 0.16
235 0.17
236 0.17
237 0.17
238 0.17
239 0.16
240 0.14
241 0.12
242 0.11
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.12
250 0.12
251 0.19
252 0.19
253 0.19
254 0.2
255 0.23
256 0.28
257 0.34
258 0.37
259 0.32
260 0.33
261 0.36
262 0.37
263 0.36
264 0.36
265 0.32
266 0.35
267 0.36
268 0.37
269 0.34
270 0.33
271 0.36
272 0.36
273 0.33
274 0.3
275 0.31
276 0.29
277 0.3
278 0.35
279 0.31
280 0.31
281 0.35
282 0.36
283 0.37
284 0.36
285 0.35
286 0.3
287 0.33
288 0.28
289 0.23
290 0.22
291 0.17
292 0.17
293 0.18
294 0.18
295 0.15
296 0.15
297 0.15
298 0.16
299 0.16
300 0.18
301 0.17
302 0.16
303 0.16
304 0.17
305 0.17
306 0.14
307 0.14
308 0.12
309 0.12
310 0.11
311 0.1
312 0.09
313 0.06
314 0.05
315 0.07
316 0.09
317 0.11
318 0.12
319 0.13
320 0.13
321 0.14
322 0.15
323 0.16
324 0.15
325 0.16
326 0.18
327 0.18
328 0.18
329 0.17
330 0.19
331 0.16
332 0.15
333 0.12
334 0.1
335 0.13
336 0.13
337 0.13
338 0.11
339 0.12
340 0.13
341 0.21
342 0.27
343 0.25
344 0.27
345 0.29
346 0.29
347 0.32
348 0.35
349 0.35
350 0.36
351 0.4
352 0.41
353 0.39
354 0.39
355 0.45
356 0.43
357 0.36
358 0.33
359 0.27
360 0.29
361 0.32
362 0.32
363 0.25
364 0.28
365 0.3
366 0.34
367 0.34
368 0.33
369 0.32
370 0.35
371 0.38
372 0.44
373 0.43
374 0.37
375 0.38
376 0.37
377 0.33
378 0.3
379 0.27
380 0.17
381 0.14
382 0.13
383 0.13
384 0.12
385 0.11
386 0.09
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.08
391 0.07
392 0.08
393 0.1
394 0.16
395 0.2
396 0.2
397 0.22
398 0.24
399 0.27
400 0.32
401 0.4
402 0.45
403 0.51
404 0.56