Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PII2

Protein Details
Accession A0A1D8PII2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
233-258SSNIPSTPPPPPKKKKKVSHGHSSSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
242-249PPPKKKKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR007526  SWIRM  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:1990483  C:Clr6 histone deacetylase complex I''  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0070210  C:Rpd3L-Expanded complex  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG cal:CAALFM_C209880CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04433  SWIRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50934  SWIRM  
Amino Acid Sequences MSFIYPQPMSYYNHSNSSSDNITNNNTTTTTMSIDIPNCLTPTINLEDQLKLMKQQLSSNSNSNSTSTTSLTKTNTNTNTTNSHVSSPSETLQPLSPPLSPYQRNATLFSIKQPLPQLPACNPNSKSYLKTGNHEFNLENFNDYKLTIDIKPIAKNYYHNQLDFLNKYDIKRNSSHTVANVASLPTRKYKKRLVYDSNDDITFATDVERVRTRRVARSSGGSGKLATDDDDESSNIPSTPPPPPKKKKKVSHGHSSSSPSTPIMALQQQLIDESIPDYSPDVTTTLPPNNSKCLKIEWKGQPMDLSNDPNLNKLTHPAEILLASILRLPVAVYLDSKRRLFYEKVSRLRQGKGFRRTDAQKACRIDVNKASRLFAAFEKVGWLNDELFEKYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.4
3 0.38
4 0.4
5 0.38
6 0.32
7 0.32
8 0.28
9 0.31
10 0.33
11 0.32
12 0.28
13 0.25
14 0.24
15 0.23
16 0.21
17 0.19
18 0.18
19 0.19
20 0.21
21 0.22
22 0.22
23 0.22
24 0.22
25 0.2
26 0.19
27 0.17
28 0.13
29 0.17
30 0.2
31 0.19
32 0.2
33 0.22
34 0.22
35 0.23
36 0.26
37 0.22
38 0.19
39 0.23
40 0.24
41 0.24
42 0.29
43 0.36
44 0.38
45 0.41
46 0.45
47 0.42
48 0.41
49 0.4
50 0.36
51 0.3
52 0.27
53 0.26
54 0.21
55 0.22
56 0.21
57 0.25
58 0.26
59 0.29
60 0.29
61 0.36
62 0.38
63 0.4
64 0.4
65 0.39
66 0.41
67 0.39
68 0.41
69 0.34
70 0.32
71 0.28
72 0.28
73 0.28
74 0.27
75 0.25
76 0.22
77 0.21
78 0.2
79 0.2
80 0.19
81 0.18
82 0.17
83 0.17
84 0.16
85 0.2
86 0.26
87 0.27
88 0.29
89 0.34
90 0.39
91 0.39
92 0.41
93 0.41
94 0.38
95 0.37
96 0.37
97 0.37
98 0.31
99 0.32
100 0.32
101 0.3
102 0.29
103 0.31
104 0.31
105 0.27
106 0.36
107 0.35
108 0.4
109 0.4
110 0.38
111 0.41
112 0.39
113 0.37
114 0.33
115 0.41
116 0.35
117 0.38
118 0.42
119 0.44
120 0.43
121 0.43
122 0.39
123 0.31
124 0.33
125 0.28
126 0.23
127 0.16
128 0.16
129 0.14
130 0.14
131 0.13
132 0.1
133 0.12
134 0.11
135 0.13
136 0.17
137 0.19
138 0.22
139 0.22
140 0.23
141 0.22
142 0.25
143 0.26
144 0.31
145 0.31
146 0.28
147 0.28
148 0.28
149 0.32
150 0.29
151 0.29
152 0.24
153 0.23
154 0.24
155 0.31
156 0.31
157 0.31
158 0.33
159 0.35
160 0.34
161 0.35
162 0.35
163 0.28
164 0.29
165 0.25
166 0.23
167 0.19
168 0.15
169 0.14
170 0.13
171 0.14
172 0.16
173 0.22
174 0.24
175 0.29
176 0.37
177 0.44
178 0.52
179 0.59
180 0.61
181 0.62
182 0.66
183 0.65
184 0.59
185 0.5
186 0.41
187 0.32
188 0.25
189 0.18
190 0.11
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.1
195 0.15
196 0.15
197 0.17
198 0.23
199 0.25
200 0.31
201 0.35
202 0.36
203 0.33
204 0.37
205 0.39
206 0.38
207 0.37
208 0.3
209 0.26
210 0.22
211 0.21
212 0.17
213 0.13
214 0.1
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.1
221 0.1
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.1
226 0.18
227 0.26
228 0.34
229 0.44
230 0.54
231 0.65
232 0.76
233 0.83
234 0.85
235 0.87
236 0.9
237 0.87
238 0.88
239 0.83
240 0.77
241 0.71
242 0.67
243 0.59
244 0.49
245 0.42
246 0.31
247 0.25
248 0.2
249 0.16
250 0.14
251 0.13
252 0.12
253 0.12
254 0.13
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.08
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.11
271 0.14
272 0.18
273 0.21
274 0.25
275 0.26
276 0.33
277 0.35
278 0.34
279 0.33
280 0.36
281 0.4
282 0.41
283 0.48
284 0.49
285 0.55
286 0.55
287 0.54
288 0.49
289 0.43
290 0.44
291 0.38
292 0.34
293 0.27
294 0.3
295 0.3
296 0.29
297 0.29
298 0.25
299 0.22
300 0.23
301 0.23
302 0.2
303 0.2
304 0.18
305 0.18
306 0.17
307 0.17
308 0.12
309 0.1
310 0.08
311 0.09
312 0.08
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.09
318 0.09
319 0.11
320 0.15
321 0.22
322 0.28
323 0.28
324 0.28
325 0.29
326 0.34
327 0.34
328 0.4
329 0.45
330 0.49
331 0.57
332 0.62
333 0.67
334 0.66
335 0.69
336 0.67
337 0.67
338 0.67
339 0.68
340 0.68
341 0.64
342 0.68
343 0.67
344 0.7
345 0.7
346 0.67
347 0.65
348 0.64
349 0.63
350 0.61
351 0.58
352 0.55
353 0.54
354 0.55
355 0.55
356 0.52
357 0.5
358 0.45
359 0.44
360 0.4
361 0.33
362 0.31
363 0.24
364 0.23
365 0.25
366 0.25
367 0.24
368 0.23
369 0.23
370 0.17
371 0.19
372 0.22