Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9AB36

Protein Details
Accession R9AB36    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-47DTAKGQKKQMAQKHQMSKITHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031774  SF3A3_dom  
IPR024598  SF3a60/Prp9_C  
IPR021966  SF3a60_bindingd  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG wic:J056_001883  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16837  SF3A3  
PF12108  SF3a60_bindingd  
PF11931  SF3a60_Prp9_C  
Amino Acid Sequences MNTVIEDERNAHAEIDKYEDYLVELFLDTAKGQKKQMAQKHQMSKITSRMIARREFLKKSYKSNEREEELTIIGTSQVADDLNGFYDRLSSIKDYHRNNPNTPIDPFAMELDGFTEELDNDAISSVFSGEEAYGKYLDLHLPHEQYINLKNIPKRLNYLEFLDDYEQVEDLPLLVKRQSSYADYLNSLVSYLESFLHRSRPLDDYSAIQADALSKFDEQWKSGTAPGWSKQEDESVEQGIWDPVMQRTYTNVNVYNNVKKSKKYQNALKRLEQSGESTQPSSADSHTPPHTHGDKLSLLRKSKDRTLASQEALIRLYATILAGVRKDTKAEVERKSALTAREREQELEEAEYEEYKANPMEQVVEEEKDDEGKIYNPLKLPLGWDGKPIPFWLFKLHGLGVEYECEICSGKVYNGRKNFEKHFQEGTHAYGMRALGLPNTKHFHEITKIADALALAEKLKLQGRQESQASATVEEMEDDQGNVYDIKTYNQLKKQGLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.25
3 0.23
4 0.21
5 0.21
6 0.2
7 0.19
8 0.17
9 0.16
10 0.1
11 0.1
12 0.09
13 0.09
14 0.1
15 0.08
16 0.14
17 0.19
18 0.21
19 0.23
20 0.29
21 0.36
22 0.45
23 0.55
24 0.6
25 0.64
26 0.71
27 0.79
28 0.81
29 0.79
30 0.73
31 0.69
32 0.66
33 0.62
34 0.56
35 0.52
36 0.51
37 0.51
38 0.52
39 0.49
40 0.5
41 0.52
42 0.52
43 0.52
44 0.56
45 0.55
46 0.59
47 0.66
48 0.67
49 0.66
50 0.71
51 0.73
52 0.68
53 0.65
54 0.58
55 0.5
56 0.41
57 0.35
58 0.26
59 0.18
60 0.13
61 0.11
62 0.09
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.11
77 0.12
78 0.16
79 0.25
80 0.33
81 0.37
82 0.46
83 0.55
84 0.58
85 0.59
86 0.64
87 0.62
88 0.58
89 0.55
90 0.49
91 0.41
92 0.36
93 0.33
94 0.25
95 0.19
96 0.15
97 0.13
98 0.1
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.09
123 0.09
124 0.11
125 0.11
126 0.14
127 0.17
128 0.18
129 0.19
130 0.19
131 0.19
132 0.2
133 0.23
134 0.23
135 0.23
136 0.26
137 0.28
138 0.34
139 0.38
140 0.36
141 0.38
142 0.39
143 0.4
144 0.38
145 0.39
146 0.34
147 0.31
148 0.3
149 0.27
150 0.22
151 0.18
152 0.16
153 0.13
154 0.1
155 0.09
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.11
165 0.13
166 0.14
167 0.16
168 0.18
169 0.19
170 0.19
171 0.19
172 0.18
173 0.16
174 0.13
175 0.1
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.09
182 0.1
183 0.14
184 0.15
185 0.16
186 0.18
187 0.2
188 0.21
189 0.21
190 0.21
191 0.19
192 0.2
193 0.2
194 0.17
195 0.14
196 0.12
197 0.11
198 0.1
199 0.09
200 0.08
201 0.07
202 0.08
203 0.13
204 0.14
205 0.14
206 0.14
207 0.16
208 0.16
209 0.18
210 0.19
211 0.16
212 0.18
213 0.2
214 0.23
215 0.22
216 0.22
217 0.21
218 0.22
219 0.21
220 0.2
221 0.18
222 0.15
223 0.14
224 0.13
225 0.13
226 0.1
227 0.08
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.08
235 0.12
236 0.14
237 0.15
238 0.17
239 0.16
240 0.2
241 0.23
242 0.27
243 0.27
244 0.3
245 0.3
246 0.29
247 0.36
248 0.43
249 0.48
250 0.5
251 0.56
252 0.61
253 0.7
254 0.74
255 0.72
256 0.66
257 0.59
258 0.53
259 0.44
260 0.38
261 0.31
262 0.29
263 0.24
264 0.2
265 0.18
266 0.17
267 0.17
268 0.15
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.16
273 0.18
274 0.19
275 0.19
276 0.24
277 0.25
278 0.23
279 0.22
280 0.22
281 0.23
282 0.26
283 0.3
284 0.3
285 0.31
286 0.33
287 0.38
288 0.38
289 0.4
290 0.45
291 0.42
292 0.42
293 0.48
294 0.49
295 0.44
296 0.44
297 0.39
298 0.32
299 0.3
300 0.25
301 0.16
302 0.11
303 0.1
304 0.07
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.06
310 0.08
311 0.1
312 0.11
313 0.12
314 0.11
315 0.16
316 0.23
317 0.29
318 0.32
319 0.35
320 0.37
321 0.37
322 0.39
323 0.37
324 0.34
325 0.34
326 0.35
327 0.33
328 0.37
329 0.37
330 0.36
331 0.35
332 0.34
333 0.27
334 0.25
335 0.21
336 0.16
337 0.15
338 0.14
339 0.12
340 0.11
341 0.1
342 0.09
343 0.09
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.1
349 0.14
350 0.15
351 0.16
352 0.16
353 0.16
354 0.16
355 0.14
356 0.14
357 0.1
358 0.09
359 0.09
360 0.15
361 0.17
362 0.2
363 0.2
364 0.22
365 0.23
366 0.23
367 0.24
368 0.25
369 0.28
370 0.25
371 0.28
372 0.29
373 0.29
374 0.29
375 0.28
376 0.24
377 0.2
378 0.21
379 0.23
380 0.23
381 0.23
382 0.26
383 0.25
384 0.23
385 0.22
386 0.23
387 0.19
388 0.17
389 0.16
390 0.12
391 0.12
392 0.11
393 0.11
394 0.09
395 0.09
396 0.1
397 0.12
398 0.2
399 0.26
400 0.34
401 0.41
402 0.47
403 0.51
404 0.56
405 0.59
406 0.61
407 0.62
408 0.59
409 0.58
410 0.53
411 0.53
412 0.49
413 0.46
414 0.42
415 0.36
416 0.31
417 0.26
418 0.25
419 0.21
420 0.2
421 0.16
422 0.14
423 0.2
424 0.21
425 0.25
426 0.29
427 0.28
428 0.3
429 0.31
430 0.32
431 0.31
432 0.34
433 0.32
434 0.33
435 0.32
436 0.29
437 0.29
438 0.24
439 0.21
440 0.19
441 0.16
442 0.11
443 0.11
444 0.12
445 0.15
446 0.19
447 0.21
448 0.22
449 0.3
450 0.34
451 0.41
452 0.43
453 0.42
454 0.4
455 0.42
456 0.4
457 0.32
458 0.28
459 0.22
460 0.19
461 0.17
462 0.17
463 0.13
464 0.12
465 0.11
466 0.11
467 0.1
468 0.11
469 0.11
470 0.1
471 0.13
472 0.13
473 0.15
474 0.23
475 0.3
476 0.37
477 0.44
478 0.52