FuNGI

R9ADN3

Protein Details

Accession

R9ADN3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
26-45	GFPTPKIRSKFQSSKQKADE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 12, cyto 7, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
KEGG	wic:J056_000815 -
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MLSDIVEKDSTSTAKAPAPPTAPTKGFPTPKIRSKFQSSKQKADEAAPSTSATATATTAASSTGDSSIDSENRNVISKMSQQEISHEQADIEEKLGPKMVEFLRKRAQKSGSGDVQDNDANEQPLQTPGHDDKNELKEGAAQVQRKSVRIQTTSPPEERQEDPTQRLIREKYFPDAEYNEDQHSWLTSLPPPSSETKKDALRFDFSGDIMPQDTQAYLEGMHHHGRDQGSPGYTVDEFLILCGSINISQRILALRSLSHVLLKWYKQEYPENAAEKLNYVQLGKAVLALRFAMNDTNRSIVVAGLSGIASIFLQHLRLDRVLYDTFTYAECASPVLKVYSGQLTLKPEEMRELLSSPLAFLTFRTDLVDTLNDLLKGNAVISDDSNELKKVSSIVYALSRHSIKTASECVNTPLFLERFVRIFIEKPWPSEDQPDSLAIAALRCIASTSRSNAHAVKSEKVVDVASRYLTILPFNSSRKDSWFLAIETLKLMQTLAMYGFVQGVAVIETIGVDCAKWLSNKETSSSNNSTNFVSSLFNVLRMWTICAIDPHHTTPHHVIVWTQVESMIDFALAGLCGVQDELSLSTIWAYISVWLRGNKGITDKRGWLEEHVDVQSVRNVADIQSRVAADSILSCTLMKEDCQTAAKALNIVNSAAQLISYCGNYSLSEDLQDVLLVNISKADTVTYNYWRSGLDLVGRHLIQSEISDIKLRSALRLLSVLREGDENIMIAVFTHVLKDTPIPMISSITYFPEREVEAAKLTTVPLLLESAKLMLVDGIYAGVSVQSQDLSQISTLTIPHDTNTLLYDKWALKMTLDELSRSADSEALKNLPVDWNYSEVDLVMGGLTLQEMVDRVLPSSSSALLLQLMRIFLLELGVEGGEVFRNQRVQIALKMVLHRALSGLEEESETLEDVQEEAKAGVPFYQLFTDYVGLFESISLGDANTATMLFPPLHLADDYRRLLWVDHANCLKSIRLTWTDFPKWFVGKLLYPIEHNKDVVKAYARAISSRSLSLDMQPLLFWIALHHSALTLWNTQDETLKRDLMVSLLSSHPDVAIVVLRYGNSEKGLKLPNEANASEQEVQRRLVMLKDSNEKLLSDKLGALSTFV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.31
3	0.31
4	0.34
5	0.36
6	0.38
7	0.41
8	0.45
9	0.42
10	0.38
11	0.42
12	0.45
13	0.48
14	0.5
15	0.55
16	0.57
17	0.64
18	0.69
19	0.69
20	0.68
21	0.72
22	0.76
23	0.76
24	0.79
25	0.77
26	0.8
27	0.79
28	0.78
29	0.7
30	0.64
31	0.62
32	0.54
33	0.49
34	0.41
35	0.36
36	0.3
37	0.28
38	0.23
39	0.16
40	0.13
41	0.1
42	0.11
43	0.1
44	0.09
45	0.09
46	0.09
47	0.09
48	0.09
49	0.1
50	0.09
51	0.09
52	0.09
53	0.11
54	0.16
55	0.18
56	0.2
57	0.19
58	0.22
59	0.23
60	0.26
61	0.24
62	0.21
63	0.22
64	0.27
65	0.3
66	0.31
67	0.34
68	0.31
69	0.37
70	0.4
71	0.4
72	0.34
73	0.3
74	0.26
75	0.23
76	0.27
77	0.21
78	0.17
79	0.16
80	0.16
81	0.17
82	0.2
83	0.18
84	0.15
85	0.21
86	0.24
87	0.31
88	0.33
89	0.39
90	0.46
91	0.53
92	0.56
93	0.57
94	0.58
95	0.56
96	0.6
97	0.61
98	0.59
99	0.56
100	0.55
101	0.48
102	0.46
103	0.4
104	0.34
105	0.27
106	0.22
107	0.2
108	0.18
109	0.18
110	0.15
111	0.18
112	0.18
113	0.16
114	0.2
115	0.23
116	0.32
117	0.31
118	0.34
119	0.38
120	0.43
121	0.45
122	0.39
123	0.35
124	0.31
125	0.32
126	0.37
127	0.34
128	0.32
129	0.31
130	0.38
131	0.41
132	0.38
133	0.4
134	0.39
135	0.41
136	0.41
137	0.44
138	0.45
139	0.52
140	0.57
141	0.56
142	0.53
143	0.49
144	0.5
145	0.48
146	0.46
147	0.46
148	0.46
149	0.46
150	0.51
151	0.52
152	0.49
153	0.54
154	0.51
155	0.47
156	0.47
157	0.46
158	0.44
159	0.44
160	0.43
161	0.41
162	0.39
163	0.39
164	0.38
165	0.38
166	0.33
167	0.29
168	0.29
169	0.24
170	0.23
171	0.18
172	0.13
173	0.14
174	0.15
175	0.19
176	0.19
177	0.2
178	0.22
179	0.27
180	0.33
181	0.34
182	0.35
183	0.36
184	0.43
185	0.47
186	0.5
187	0.48
188	0.47
189	0.44
190	0.42
191	0.38
192	0.31
193	0.29
194	0.23
195	0.2
196	0.16
197	0.15
198	0.13
199	0.11
200	0.11
201	0.08
202	0.09
203	0.08
204	0.08
205	0.09
206	0.11
207	0.14
208	0.17
209	0.17
210	0.17
211	0.21
212	0.22
213	0.22
214	0.23
215	0.23
216	0.21
217	0.22
218	0.22
219	0.21
220	0.2
221	0.19
222	0.15
223	0.12
224	0.1
225	0.09
226	0.09
227	0.06
228	0.06
229	0.05
230	0.06
231	0.09
232	0.11
233	0.13
234	0.12
235	0.13
236	0.14
237	0.16
238	0.16
239	0.14
240	0.12
241	0.11
242	0.14
243	0.16
244	0.15
245	0.15
246	0.14
247	0.18
248	0.22
249	0.23
250	0.27
251	0.28
252	0.31
253	0.33
254	0.4
255	0.39
256	0.41
257	0.46
258	0.43
259	0.41
260	0.39
261	0.35
262	0.3
263	0.27
264	0.21
265	0.16
266	0.13
267	0.12
268	0.12
269	0.13
270	0.11
271	0.13
272	0.13
273	0.12
274	0.12
275	0.13
276	0.12
277	0.11
278	0.12
279	0.13
280	0.12
281	0.14
282	0.15
283	0.16
284	0.15
285	0.15
286	0.15
287	0.11
288	0.1
289	0.08
290	0.07
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.05
299	0.04
300	0.06
301	0.07
302	0.09
303	0.11
304	0.12
305	0.12
306	0.12
307	0.16
308	0.16
309	0.16
310	0.15
311	0.13
312	0.13
313	0.13
314	0.14
315	0.1
316	0.1
317	0.09
318	0.09
319	0.08
320	0.08
321	0.09
322	0.08
323	0.08
324	0.08
325	0.1
326	0.12
327	0.14
328	0.14
329	0.16
330	0.19
331	0.2
332	0.23
333	0.21
334	0.19
335	0.2
336	0.2
337	0.18
338	0.16
339	0.16
340	0.13
341	0.14
342	0.13
343	0.11
344	0.1
345	0.09
346	0.07
347	0.07
348	0.11
349	0.11
350	0.11
351	0.13
352	0.13
353	0.13
354	0.14
355	0.15
356	0.1
357	0.11
358	0.12
359	0.11
360	0.11
361	0.1
362	0.09
363	0.08
364	0.08
365	0.07
366	0.06
367	0.07
368	0.07
369	0.09
370	0.09
371	0.1
372	0.11
373	0.1
374	0.1
375	0.09
376	0.09
377	0.09
378	0.08
379	0.09
380	0.09
381	0.1
382	0.14
383	0.15
384	0.15
385	0.18
386	0.18
387	0.16
388	0.17
389	0.17
390	0.13
391	0.16
392	0.21
393	0.2
394	0.21
395	0.21
396	0.23
397	0.23
398	0.22
399	0.19
400	0.18
401	0.15
402	0.15
403	0.16
404	0.14
405	0.14
406	0.15
407	0.15
408	0.12
409	0.13
410	0.14
411	0.22
412	0.22
413	0.23
414	0.26
415	0.28
416	0.28
417	0.33
418	0.31
419	0.24
420	0.24
421	0.23
422	0.19
423	0.16
424	0.16
425	0.1
426	0.08
427	0.06
428	0.06
429	0.05
430	0.05
431	0.06
432	0.05
433	0.08
434	0.1
435	0.13
436	0.15
437	0.17
438	0.19
439	0.2
440	0.22
441	0.25
442	0.25
443	0.24
444	0.24
445	0.24
446	0.22
447	0.21
448	0.2
449	0.14
450	0.13
451	0.12
452	0.1
453	0.09
454	0.09
455	0.09
456	0.09
457	0.09
458	0.08
459	0.1
460	0.13
461	0.14
462	0.16
463	0.18
464	0.18
465	0.21
466	0.24
467	0.22
468	0.22
469	0.22
470	0.2
471	0.22
472	0.21
473	0.18
474	0.14
475	0.14
476	0.12
477	0.09
478	0.09
479	0.05
480	0.05
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.04
490	0.04
491	0.03
492	0.03
493	0.03
494	0.03
495	0.03
496	0.03
497	0.03
498	0.03
499	0.02
500	0.02
501	0.03
502	0.05
503	0.05
504	0.07
505	0.1
506	0.15
507	0.16
508	0.17
509	0.2
510	0.21
511	0.28
512	0.29
513	0.3
514	0.27
515	0.28
516	0.27
517	0.24
518	0.22
519	0.16
520	0.13
521	0.1
522	0.12
523	0.1
524	0.11
525	0.1
526	0.1
527	0.1
528	0.1
529	0.11
530	0.08
531	0.08
532	0.08
533	0.09
534	0.11
535	0.12
536	0.14
537	0.14
538	0.17
539	0.16
540	0.18
541	0.19
542	0.21
543	0.18
544	0.17
545	0.15
546	0.16
547	0.18
548	0.16
549	0.14
550	0.11
551	0.1
552	0.1
553	0.1
554	0.07
555	0.04
556	0.03
557	0.03
558	0.03
559	0.03
560	0.03
561	0.02
562	0.02
563	0.02
564	0.02
565	0.02
566	0.02
567	0.03
568	0.03
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.05
574	0.05
575	0.04
576	0.04
577	0.07
578	0.08
579	0.09
580	0.12
581	0.13
582	0.14
583	0.15
584	0.15
585	0.13
586	0.19
587	0.21
588	0.22
589	0.23
590	0.24
591	0.24
592	0.26
593	0.26
594	0.21
595	0.2
596	0.19
597	0.19
598	0.17
599	0.17
600	0.14
601	0.14
602	0.14
603	0.11
604	0.1
605	0.08
606	0.08
607	0.08
608	0.12
609	0.12
610	0.11
611	0.12
612	0.12
613	0.12
614	0.11
615	0.11
616	0.06
617	0.06
618	0.07
619	0.06
620	0.06
621	0.06
622	0.06
623	0.07
624	0.07
625	0.07
626	0.08
627	0.08
628	0.1
629	0.11
630	0.11
631	0.11
632	0.13
633	0.13
634	0.13
635	0.12
636	0.13
637	0.12
638	0.12
639	0.11
640	0.09
641	0.09
642	0.07
643	0.06
644	0.04
645	0.05
646	0.05
647	0.06
648	0.05
649	0.06
650	0.07
651	0.07
652	0.08
653	0.09
654	0.08
655	0.09
656	0.09
657	0.09
658	0.08
659	0.08
660	0.07
661	0.05
662	0.06
663	0.05
664	0.05
665	0.05
666	0.05
667	0.05
668	0.05
669	0.06
670	0.05
671	0.08
672	0.12
673	0.15
674	0.17
675	0.18
676	0.18
677	0.18
678	0.18
679	0.17
680	0.14
681	0.14
682	0.13
683	0.15
684	0.17
685	0.17
686	0.15
687	0.15
688	0.14
689	0.1
690	0.09
691	0.1
692	0.08
693	0.09
694	0.12
695	0.12
696	0.12
697	0.15
698	0.15
699	0.13
700	0.15
701	0.15
702	0.13
703	0.16
704	0.16
705	0.14
706	0.15
707	0.14
708	0.13
709	0.13
710	0.12
711	0.1
712	0.1
713	0.08
714	0.06
715	0.06
716	0.05
717	0.05
718	0.05
719	0.04
720	0.04
721	0.05
722	0.05
723	0.05
724	0.06
725	0.07
726	0.08
727	0.09
728	0.1
729	0.1
730	0.1
731	0.11
732	0.11
733	0.12
734	0.11
735	0.12
736	0.13
737	0.13
738	0.13
739	0.14
740	0.14
741	0.13
742	0.15
743	0.13
744	0.13
745	0.13
746	0.13
747	0.11
748	0.11
749	0.1
750	0.08
751	0.07
752	0.05
753	0.07
754	0.07
755	0.07
756	0.07
757	0.07
758	0.07
759	0.07
760	0.06
761	0.05
762	0.04
763	0.04
764	0.04
765	0.04
766	0.03
767	0.03
768	0.03
769	0.03
770	0.03
771	0.04
772	0.04
773	0.04
774	0.04
775	0.05
776	0.06
777	0.06
778	0.07
779	0.07
780	0.07
781	0.07
782	0.08
783	0.08
784	0.1
785	0.1
786	0.1
787	0.11
788	0.11
789	0.11
790	0.12
791	0.12
792	0.1
793	0.1
794	0.14
795	0.14
796	0.16
797	0.18
798	0.16
799	0.15
800	0.16
801	0.18
802	0.18
803	0.18
804	0.17
805	0.15
806	0.18
807	0.18
808	0.17
809	0.16
810	0.13
811	0.13
812	0.15
813	0.16
814	0.15
815	0.15
816	0.15
817	0.15
818	0.17
819	0.16
820	0.18
821	0.16
822	0.18
823	0.18
824	0.18
825	0.17
826	0.13
827	0.12
828	0.09
829	0.08
830	0.04
831	0.04
832	0.03
833	0.03
834	0.03
835	0.03
836	0.03
837	0.03
838	0.03
839	0.04
840	0.07
841	0.07
842	0.08
843	0.09
844	0.09
845	0.1
846	0.11
847	0.11
848	0.09
849	0.09
850	0.09
851	0.11
852	0.11
853	0.1
854	0.1
855	0.1
856	0.09
857	0.08
858	0.08
859	0.06
860	0.07
861	0.05
862	0.04
863	0.05
864	0.04
865	0.04
866	0.04
867	0.04
868	0.05
869	0.05
870	0.06
871	0.08
872	0.1
873	0.1
874	0.13
875	0.16
876	0.18
877	0.21
878	0.25
879	0.26
880	0.27
881	0.29
882	0.28
883	0.28
884	0.25
885	0.22
886	0.18
887	0.15
888	0.13
889	0.12
890	0.11
891	0.09
892	0.09
893	0.09
894	0.1
895	0.09
896	0.09
897	0.08
898	0.07
899	0.07
900	0.07
901	0.07
902	0.07
903	0.07
904	0.07
905	0.1
906	0.1
907	0.11
908	0.12
909	0.13
910	0.13
911	0.14
912	0.15
913	0.12
914	0.13
915	0.14
916	0.15
917	0.13
918	0.13
919	0.12
920	0.1
921	0.09
922	0.09
923	0.07
924	0.06
925	0.06
926	0.06
927	0.05
928	0.06
929	0.06
930	0.06
931	0.06
932	0.06
933	0.05
934	0.06
935	0.08
936	0.07
937	0.07
938	0.1
939	0.1
940	0.12
941	0.12
942	0.14
943	0.17
944	0.25
945	0.27
946	0.24
947	0.25
948	0.24
949	0.24
950	0.28
951	0.33
952	0.27
953	0.32
954	0.36
955	0.36
956	0.36
957	0.37
958	0.33
959	0.25
960	0.25
961	0.25
962	0.26
963	0.3
964	0.35
965	0.43
966	0.47
967	0.47
968	0.48
969	0.46
970	0.43
971	0.39
972	0.36
973	0.31
974	0.28
975	0.33
976	0.35
977	0.31
978	0.33
979	0.39
980	0.42
981	0.4
982	0.38
983	0.34
984	0.31
985	0.31
986	0.32
987	0.3
988	0.26
989	0.25
990	0.3
991	0.29
992	0.27
993	0.28
994	0.28
995	0.26
996	0.25
997	0.25
998	0.23
999	0.23
1000	0.25
1001	0.29
1002	0.25
1003	0.23
1004	0.21
1005	0.2
1006	0.18
1007	0.17
1008	0.14
1009	0.09
1010	0.13
1011	0.14
1012	0.15
1013	0.14
1014	0.13
1015	0.13
1016	0.16
1017	0.17
1018	0.16
1019	0.15
1020	0.16
1021	0.17
1022	0.18
1023	0.24
1024	0.23
1025	0.25
1026	0.26
1027	0.27
1028	0.25
1029	0.25
1030	0.25
1031	0.2
1032	0.19
1033	0.16
1034	0.15
1035	0.15
1036	0.16
1037	0.16
1038	0.15
1039	0.14
1040	0.13
1041	0.11
1042	0.1
1043	0.12
1044	0.11
1045	0.12
1046	0.13
1047	0.13
1048	0.16
1049	0.18
1050	0.18
1051	0.18
1052	0.19
1053	0.19
1054	0.25
1055	0.32
1056	0.3
1057	0.34
1058	0.36
1059	0.39
1060	0.42
1061	0.42
1062	0.38
1063	0.33
1064	0.38
1065	0.36
1066	0.35
1067	0.35
1068	0.32
1069	0.33
1070	0.32
1071	0.32
1072	0.27
1073	0.27
1074	0.31
1075	0.31
1076	0.35
1077	0.43
1078	0.44
1079	0.45
1080	0.45
1081	0.42
1082	0.38
1083	0.37
1084	0.33
1085	0.26
1086	0.25
1087	0.23
1088	0.24

R9ADN3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer