Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

R9ARW0

Protein Details
Accession R9ARW0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
411-430TFIGNKSKRSKKLDDRLDKEHydrophilic
494-519VMTGRRATLKEEKKRNQEETKKEMNTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG wic:J056_000335  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15534  PHD2_PHF12_Rco1  
Amino Acid Sequences MSNSLETEIMPAPPPPPGKQGSNLYHKLEKLEEAKWVKGDDEDAAPAYAPHSPSPPPEARAGEGQGEGEREREMEQKQKQQQREGEQGEAMPYNASAVMPQAYPARYTKPSTSLAPHVKKSARKQTQTNAHTLNNNHEWCDACGGEGRVIMCDGCDSSFHASCFDPPMDMGEVELGEDAAWYCRTCAHAKSQSHPHSNSNSTQPSHWVGQLCHARDTSNPTSFSLPVGIRNYFVGVETAHDGSYSTSNDSKPVKTDRFGAALTEREAYPTRDKNGGVVRCYRCQGTAAPALSESGDVESGGSVNSNSKSNSKDTPNNTSKHNTHPLITTPSSTNAAHTQWRKMVSCDYCNCYWHLDCLSPPITHIPSLARMWMCPLHAEHAKSMHMEMKNRIPKEHVKEVNKKLERSDSVTFIGNKSKRSKKLDDRLDKEKFHIPERSIQLAFWDKLYDKSGRRSRLSYSKSFLDDEPTINAVDGLMALSKPTASETRKLVRRVMTGRRATLKEEKKRNQEETKKEMNTMNMPNATNTTNKMNNKEREREGEGQEISDSSSLSSVPMSDDEKEKPPHYVDHARYNKLSTIERLLHLKGEKETIEFLSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.29
4 0.33
5 0.36
6 0.42
7 0.51
8 0.53
9 0.59
10 0.62
11 0.61
12 0.62
13 0.58
14 0.55
15 0.47
16 0.45
17 0.4
18 0.36
19 0.39
20 0.38
21 0.4
22 0.38
23 0.37
24 0.31
25 0.28
26 0.28
27 0.22
28 0.2
29 0.19
30 0.18
31 0.17
32 0.16
33 0.15
34 0.14
35 0.15
36 0.14
37 0.14
38 0.16
39 0.18
40 0.21
41 0.29
42 0.33
43 0.32
44 0.36
45 0.37
46 0.37
47 0.39
48 0.38
49 0.32
50 0.29
51 0.27
52 0.22
53 0.22
54 0.2
55 0.16
56 0.14
57 0.13
58 0.14
59 0.19
60 0.21
61 0.28
62 0.36
63 0.45
64 0.54
65 0.62
66 0.66
67 0.7
68 0.73
69 0.72
70 0.74
71 0.68
72 0.61
73 0.53
74 0.48
75 0.41
76 0.34
77 0.26
78 0.16
79 0.12
80 0.1
81 0.09
82 0.08
83 0.06
84 0.07
85 0.08
86 0.08
87 0.1
88 0.13
89 0.13
90 0.16
91 0.18
92 0.22
93 0.25
94 0.29
95 0.32
96 0.33
97 0.36
98 0.37
99 0.4
100 0.44
101 0.5
102 0.52
103 0.51
104 0.53
105 0.55
106 0.59
107 0.64
108 0.66
109 0.66
110 0.66
111 0.71
112 0.73
113 0.78
114 0.74
115 0.71
116 0.65
117 0.58
118 0.57
119 0.51
120 0.49
121 0.46
122 0.43
123 0.37
124 0.33
125 0.32
126 0.28
127 0.29
128 0.22
129 0.14
130 0.17
131 0.17
132 0.16
133 0.16
134 0.15
135 0.12
136 0.13
137 0.12
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.06
142 0.07
143 0.08
144 0.13
145 0.15
146 0.15
147 0.16
148 0.16
149 0.17
150 0.21
151 0.19
152 0.15
153 0.12
154 0.15
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.06
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.08
171 0.11
172 0.14
173 0.16
174 0.24
175 0.32
176 0.34
177 0.4
178 0.5
179 0.55
180 0.59
181 0.59
182 0.55
183 0.52
184 0.54
185 0.51
186 0.47
187 0.44
188 0.38
189 0.36
190 0.34
191 0.32
192 0.3
193 0.29
194 0.25
195 0.2
196 0.27
197 0.32
198 0.3
199 0.29
200 0.27
201 0.25
202 0.24
203 0.32
204 0.3
205 0.29
206 0.29
207 0.28
208 0.3
209 0.29
210 0.28
211 0.23
212 0.18
213 0.18
214 0.2
215 0.19
216 0.17
217 0.17
218 0.17
219 0.13
220 0.13
221 0.09
222 0.07
223 0.07
224 0.09
225 0.09
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.12
234 0.12
235 0.17
236 0.19
237 0.18
238 0.2
239 0.27
240 0.27
241 0.26
242 0.31
243 0.28
244 0.29
245 0.28
246 0.25
247 0.2
248 0.19
249 0.19
250 0.16
251 0.13
252 0.13
253 0.14
254 0.16
255 0.2
256 0.21
257 0.23
258 0.25
259 0.25
260 0.27
261 0.33
262 0.32
263 0.29
264 0.34
265 0.35
266 0.34
267 0.36
268 0.32
269 0.25
270 0.24
271 0.22
272 0.18
273 0.2
274 0.18
275 0.17
276 0.17
277 0.17
278 0.15
279 0.14
280 0.09
281 0.05
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.05
291 0.06
292 0.08
293 0.09
294 0.11
295 0.13
296 0.16
297 0.21
298 0.24
299 0.3
300 0.33
301 0.42
302 0.45
303 0.45
304 0.46
305 0.47
306 0.44
307 0.44
308 0.48
309 0.39
310 0.34
311 0.34
312 0.34
313 0.34
314 0.32
315 0.27
316 0.2
317 0.2
318 0.22
319 0.2
320 0.19
321 0.16
322 0.17
323 0.21
324 0.22
325 0.23
326 0.24
327 0.27
328 0.26
329 0.25
330 0.31
331 0.28
332 0.33
333 0.33
334 0.34
335 0.33
336 0.33
337 0.33
338 0.29
339 0.25
340 0.21
341 0.19
342 0.16
343 0.15
344 0.18
345 0.2
346 0.16
347 0.17
348 0.18
349 0.18
350 0.17
351 0.17
352 0.14
353 0.15
354 0.16
355 0.18
356 0.14
357 0.13
358 0.16
359 0.17
360 0.15
361 0.14
362 0.14
363 0.15
364 0.18
365 0.2
366 0.18
367 0.19
368 0.2
369 0.19
370 0.19
371 0.2
372 0.2
373 0.22
374 0.24
375 0.31
376 0.37
377 0.38
378 0.37
379 0.36
380 0.42
381 0.46
382 0.53
383 0.51
384 0.53
385 0.62
386 0.69
387 0.75
388 0.72
389 0.65
390 0.58
391 0.58
392 0.52
393 0.48
394 0.43
395 0.35
396 0.32
397 0.35
398 0.32
399 0.27
400 0.33
401 0.29
402 0.32
403 0.38
404 0.45
405 0.49
406 0.56
407 0.64
408 0.66
409 0.74
410 0.8
411 0.81
412 0.79
413 0.8
414 0.79
415 0.7
416 0.63
417 0.6
418 0.52
419 0.46
420 0.46
421 0.39
422 0.4
423 0.44
424 0.46
425 0.4
426 0.37
427 0.36
428 0.36
429 0.34
430 0.26
431 0.24
432 0.19
433 0.21
434 0.25
435 0.26
436 0.24
437 0.34
438 0.41
439 0.46
440 0.49
441 0.49
442 0.53
443 0.57
444 0.6
445 0.56
446 0.53
447 0.5
448 0.49
449 0.49
450 0.42
451 0.38
452 0.34
453 0.29
454 0.27
455 0.23
456 0.2
457 0.18
458 0.17
459 0.1
460 0.09
461 0.07
462 0.05
463 0.05
464 0.04
465 0.04
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.08
470 0.14
471 0.17
472 0.22
473 0.28
474 0.37
475 0.44
476 0.47
477 0.5
478 0.49
479 0.54
480 0.57
481 0.61
482 0.61
483 0.6
484 0.62
485 0.64
486 0.6
487 0.58
488 0.61
489 0.61
490 0.61
491 0.67
492 0.71
493 0.74
494 0.8
495 0.83
496 0.84
497 0.83
498 0.83
499 0.8
500 0.81
501 0.73
502 0.68
503 0.63
504 0.57
505 0.54
506 0.5
507 0.48
508 0.42
509 0.4
510 0.38
511 0.37
512 0.34
513 0.29
514 0.27
515 0.28
516 0.31
517 0.36
518 0.43
519 0.5
520 0.57
521 0.64
522 0.69
523 0.67
524 0.67
525 0.69
526 0.68
527 0.63
528 0.61
529 0.53
530 0.46
531 0.41
532 0.34
533 0.28
534 0.21
535 0.17
536 0.09
537 0.09
538 0.08
539 0.08
540 0.08
541 0.07
542 0.09
543 0.11
544 0.13
545 0.15
546 0.2
547 0.23
548 0.3
549 0.36
550 0.35
551 0.37
552 0.38
553 0.4
554 0.45
555 0.51
556 0.49
557 0.55
558 0.61
559 0.62
560 0.61
561 0.59
562 0.55
563 0.5
564 0.48
565 0.41
566 0.42
567 0.4
568 0.42
569 0.43
570 0.4
571 0.41
572 0.4
573 0.39
574 0.34
575 0.35
576 0.33
577 0.3
578 0.32