Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9AL33

Protein Details
Accession R9AL33    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-37VEKIATYSTRTDKRKRKRASLSSEYEAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-27KRKRKR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 7, mito 1, plas 1, pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003150  DNA-bd_RFX  
IPR039779  RFX-like  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
KEGG wic:J056_003501  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02257  RFX_DNA_binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51526  RFX_DBD  
Amino Acid Sequences MSEAAKEGSVEKIATYSTRTDKRKRKRASLSSEYEAASAGTDGKPMPVSIPAVSSAVSSAQVAREWLLDNFAECEGCEDSSVPRQQVYASYTSFCVSHNTPPAACRIFGKIVRKLFPHVFIRRLGSRAVSIYHYCGITHRSPSERKRIEMLDLQRERAILAYADSLEGIMQEQKQIHSHSPSHILPPLITDSDIMTEYTLWLHSSHCELIVHSMRVEKLTAILDELEHFWVSGRTNLNCNSFYTLNTLNIPNNPAANALSSTFIRAETRAYQDAVALLHSRLIYPLSAQGLDTFIDFIKCLKLMHRNSNCLDDNMRGSLGYFIHLMTGYIELAKRTGIMNDVFSDSSLTSAMATTWSNSYSLNSLLCGQLCDLQAPTVQCTPSDCNNAFIIAYLYSFSGVLSSLHESPTSCLVAFIDTLLDSLPESLTTPLKCSVVSQTLANLTFDDDAYLQYFTLLKIWFNEYVGMIALRYFDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.2
4 0.27
5 0.36
6 0.44
7 0.54
8 0.63
9 0.73
10 0.81
11 0.85
12 0.87
13 0.89
14 0.91
15 0.9
16 0.9
17 0.86
18 0.81
19 0.74
20 0.64
21 0.53
22 0.42
23 0.32
24 0.23
25 0.15
26 0.13
27 0.09
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.13
35 0.15
36 0.14
37 0.16
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.14
42 0.12
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.1
48 0.1
49 0.11
50 0.11
51 0.12
52 0.13
53 0.13
54 0.14
55 0.13
56 0.13
57 0.14
58 0.14
59 0.13
60 0.1
61 0.13
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.13
67 0.2
68 0.24
69 0.22
70 0.21
71 0.22
72 0.22
73 0.26
74 0.27
75 0.24
76 0.21
77 0.22
78 0.22
79 0.23
80 0.22
81 0.18
82 0.19
83 0.17
84 0.22
85 0.28
86 0.29
87 0.29
88 0.3
89 0.36
90 0.33
91 0.31
92 0.26
93 0.24
94 0.28
95 0.32
96 0.38
97 0.39
98 0.42
99 0.46
100 0.46
101 0.47
102 0.44
103 0.46
104 0.47
105 0.45
106 0.43
107 0.42
108 0.45
109 0.42
110 0.4
111 0.35
112 0.28
113 0.24
114 0.22
115 0.21
116 0.2
117 0.18
118 0.19
119 0.2
120 0.18
121 0.17
122 0.17
123 0.2
124 0.2
125 0.23
126 0.24
127 0.28
128 0.36
129 0.42
130 0.52
131 0.5
132 0.49
133 0.5
134 0.48
135 0.47
136 0.46
137 0.46
138 0.45
139 0.43
140 0.42
141 0.38
142 0.36
143 0.31
144 0.25
145 0.2
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.13
162 0.16
163 0.18
164 0.21
165 0.22
166 0.23
167 0.28
168 0.27
169 0.27
170 0.27
171 0.25
172 0.2
173 0.2
174 0.2
175 0.14
176 0.14
177 0.11
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.09
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.07
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.14
197 0.16
198 0.16
199 0.14
200 0.16
201 0.15
202 0.15
203 0.15
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.1
220 0.12
221 0.12
222 0.15
223 0.18
224 0.21
225 0.21
226 0.21
227 0.21
228 0.18
229 0.18
230 0.19
231 0.17
232 0.16
233 0.16
234 0.17
235 0.15
236 0.15
237 0.16
238 0.13
239 0.12
240 0.11
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.07
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.08
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.1
254 0.12
255 0.15
256 0.16
257 0.16
258 0.16
259 0.15
260 0.16
261 0.14
262 0.11
263 0.09
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.09
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.11
289 0.2
290 0.25
291 0.35
292 0.4
293 0.44
294 0.46
295 0.52
296 0.5
297 0.42
298 0.39
299 0.3
300 0.27
301 0.22
302 0.21
303 0.14
304 0.13
305 0.13
306 0.12
307 0.11
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.07
317 0.08
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.08
324 0.1
325 0.1
326 0.11
327 0.13
328 0.15
329 0.14
330 0.14
331 0.14
332 0.11
333 0.11
334 0.09
335 0.08
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.08
343 0.09
344 0.09
345 0.1
346 0.11
347 0.11
348 0.12
349 0.11
350 0.11
351 0.12
352 0.13
353 0.13
354 0.12
355 0.11
356 0.14
357 0.15
358 0.15
359 0.14
360 0.13
361 0.16
362 0.16
363 0.18
364 0.17
365 0.17
366 0.16
367 0.2
368 0.24
369 0.27
370 0.33
371 0.31
372 0.3
373 0.31
374 0.31
375 0.27
376 0.22
377 0.18
378 0.11
379 0.11
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.08
389 0.12
390 0.12
391 0.13
392 0.14
393 0.14
394 0.16
395 0.2
396 0.19
397 0.15
398 0.15
399 0.14
400 0.15
401 0.14
402 0.12
403 0.09
404 0.07
405 0.08
406 0.07
407 0.07
408 0.06
409 0.07
410 0.07
411 0.06
412 0.07
413 0.1
414 0.14
415 0.15
416 0.18
417 0.2
418 0.2
419 0.2
420 0.21
421 0.26
422 0.26
423 0.27
424 0.25
425 0.26
426 0.3
427 0.31
428 0.29
429 0.23
430 0.19
431 0.18
432 0.17
433 0.16
434 0.11
435 0.11
436 0.12
437 0.13
438 0.1
439 0.11
440 0.11
441 0.1
442 0.14
443 0.14
444 0.14
445 0.16
446 0.21
447 0.21
448 0.22
449 0.23
450 0.19
451 0.19
452 0.19
453 0.16
454 0.12
455 0.11