Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9AFX6

Protein Details
Accession R9AFX6    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
227-249NQSNEPKKASKKQKIPIRTANSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
211-213KRR
280-286KKMKHKK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG wic:J056_002617  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MTDYRIDDDGWRIPVKTNDSPNAPSSAYKIVETSLRLSIPPIFANDPKSGALEMLDSLVMRYVPALRAVLLTHINTQFKQSAGLIIDESPFSVTDVQFTALVWSPTIGQRMRGKVTLCSPDHISLLVHHTFNVTIPREFIDCQTFKYANDSATENSGGGRWLHTSSTQVLAEQGRDVDFSVIERNTTNGMLTLTGSILNSHLKDGVKDTKKRRKSGTSSSTKDDQANQSNEPKKASKKQKIPIRTANSSDERTESSSNESSSSSSNDDAQQPSSAAVEAKKMKHKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.38
3 0.41
4 0.44
5 0.45
6 0.49
7 0.51
8 0.5
9 0.48
10 0.41
11 0.35
12 0.31
13 0.31
14 0.28
15 0.25
16 0.23
17 0.21
18 0.23
19 0.24
20 0.23
21 0.2
22 0.19
23 0.19
24 0.2
25 0.21
26 0.2
27 0.2
28 0.2
29 0.21
30 0.23
31 0.27
32 0.27
33 0.26
34 0.24
35 0.24
36 0.21
37 0.17
38 0.15
39 0.11
40 0.1
41 0.09
42 0.08
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.07
50 0.08
51 0.1
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.11
56 0.13
57 0.13
58 0.14
59 0.16
60 0.2
61 0.21
62 0.21
63 0.24
64 0.23
65 0.2
66 0.21
67 0.17
68 0.16
69 0.15
70 0.16
71 0.13
72 0.12
73 0.13
74 0.11
75 0.11
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.09
85 0.09
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.09
90 0.08
91 0.09
92 0.1
93 0.15
94 0.13
95 0.16
96 0.21
97 0.25
98 0.27
99 0.29
100 0.28
101 0.27
102 0.31
103 0.34
104 0.3
105 0.29
106 0.29
107 0.27
108 0.26
109 0.24
110 0.19
111 0.12
112 0.16
113 0.15
114 0.13
115 0.12
116 0.12
117 0.11
118 0.12
119 0.16
120 0.13
121 0.12
122 0.12
123 0.13
124 0.14
125 0.14
126 0.15
127 0.16
128 0.14
129 0.16
130 0.19
131 0.19
132 0.18
133 0.22
134 0.21
135 0.16
136 0.17
137 0.17
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.11
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.1
152 0.11
153 0.14
154 0.13
155 0.12
156 0.13
157 0.13
158 0.13
159 0.11
160 0.11
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.07
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.12
189 0.12
190 0.13
191 0.17
192 0.26
193 0.32
194 0.4
195 0.5
196 0.57
197 0.65
198 0.71
199 0.74
200 0.74
201 0.75
202 0.78
203 0.78
204 0.78
205 0.74
206 0.73
207 0.69
208 0.62
209 0.56
210 0.5
211 0.47
212 0.45
213 0.44
214 0.42
215 0.47
216 0.5
217 0.5
218 0.49
219 0.48
220 0.48
221 0.54
222 0.62
223 0.63
224 0.67
225 0.75
226 0.8
227 0.83
228 0.84
229 0.84
230 0.81
231 0.77
232 0.72
233 0.7
234 0.66
235 0.6
236 0.52
237 0.45
238 0.39
239 0.37
240 0.34
241 0.28
242 0.29
243 0.29
244 0.28
245 0.27
246 0.25
247 0.22
248 0.23
249 0.25
250 0.21
251 0.19
252 0.21
253 0.23
254 0.27
255 0.28
256 0.28
257 0.26
258 0.23
259 0.23
260 0.21
261 0.18
262 0.16
263 0.14
264 0.2
265 0.25
266 0.31