Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9APB6

Protein Details
Accession R9APB6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-51GDKNAVSDSKPKRSNKKDSKPAEKGGSKHydrophilic
58-104KDKADKTDNKNRKQQTQPKQQKATPSPSKPKEEAKPTKKRKLEQSGEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-117KPKRSNKKDSKPAEKGGSKKTPTANKDKADKTDNKNRKQQTQPKQQKATPSPSKPKEEAKPTKKRKLEQSGEQKNVNKGDKKKAE
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 12.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007823  RRP8  
IPR042036  RRP8_N  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0032259  P:methylation  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG wic:J056_002155  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05148  Methyltransf_8  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
Amino Acid Sequences MTNDIKSAESNLGKLMAKMQSIDGDKNAVSDSKPKRSNKKDSKPAEKGGSKKTPTANKDKADKTDNKNRKQQTQPKQQKATPSPSKPKEEAKPTKKRKLEQSGEQKNVNKGDKKKAEKIEGDGNTSLQAKMKKSLSGARFRWINETLYTTDSQEAHELMQDDPSIFNEYHEGFVEQTKSWPQNPVEVIAKSLSSLPTSSTLIVDLGSGPATLAKALPKHRVLSYDLVEAENGAVVECDIAKKVPLPTASVDRVVFCLSLMGSNWVGAITEAERILVAKGKVHIAEVKSRFSSINEFVELVSHFGLKLVDKDESNTHFANLVFTNGGKKDMVNMKELTDKGKNILKPCLYKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.26
3 0.23
4 0.22
5 0.22
6 0.23
7 0.25
8 0.28
9 0.29
10 0.25
11 0.24
12 0.23
13 0.23
14 0.23
15 0.18
16 0.16
17 0.24
18 0.3
19 0.37
20 0.46
21 0.54
22 0.63
23 0.72
24 0.82
25 0.84
26 0.87
27 0.88
28 0.89
29 0.92
30 0.89
31 0.86
32 0.85
33 0.8
34 0.75
35 0.75
36 0.74
37 0.66
38 0.64
39 0.64
40 0.64
41 0.64
42 0.68
43 0.67
44 0.64
45 0.7
46 0.69
47 0.67
48 0.67
49 0.69
50 0.67
51 0.69
52 0.72
53 0.72
54 0.76
55 0.76
56 0.77
57 0.79
58 0.81
59 0.81
60 0.82
61 0.85
62 0.86
63 0.88
64 0.81
65 0.8
66 0.77
67 0.76
68 0.75
69 0.73
70 0.74
71 0.73
72 0.77
73 0.71
74 0.71
75 0.69
76 0.7
77 0.72
78 0.72
79 0.76
80 0.79
81 0.85
82 0.84
83 0.82
84 0.81
85 0.81
86 0.79
87 0.77
88 0.79
89 0.79
90 0.76
91 0.75
92 0.68
93 0.62
94 0.61
95 0.57
96 0.53
97 0.49
98 0.55
99 0.59
100 0.62
101 0.66
102 0.66
103 0.67
104 0.62
105 0.6
106 0.59
107 0.51
108 0.48
109 0.4
110 0.33
111 0.28
112 0.26
113 0.22
114 0.16
115 0.18
116 0.16
117 0.21
118 0.22
119 0.22
120 0.23
121 0.31
122 0.33
123 0.39
124 0.39
125 0.39
126 0.4
127 0.39
128 0.42
129 0.36
130 0.32
131 0.24
132 0.25
133 0.21
134 0.21
135 0.21
136 0.17
137 0.17
138 0.15
139 0.15
140 0.13
141 0.12
142 0.09
143 0.1
144 0.11
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.1
152 0.08
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.1
159 0.08
160 0.1
161 0.11
162 0.09
163 0.1
164 0.12
165 0.14
166 0.14
167 0.19
168 0.18
169 0.21
170 0.22
171 0.23
172 0.23
173 0.21
174 0.22
175 0.17
176 0.16
177 0.12
178 0.12
179 0.1
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.07
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.07
201 0.11
202 0.14
203 0.21
204 0.23
205 0.25
206 0.26
207 0.28
208 0.3
209 0.3
210 0.29
211 0.26
212 0.24
213 0.21
214 0.2
215 0.17
216 0.14
217 0.1
218 0.07
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.08
229 0.09
230 0.13
231 0.14
232 0.16
233 0.18
234 0.24
235 0.26
236 0.26
237 0.25
238 0.22
239 0.22
240 0.21
241 0.18
242 0.11
243 0.1
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.08
253 0.07
254 0.08
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.12
263 0.11
264 0.13
265 0.14
266 0.17
267 0.17
268 0.19
269 0.23
270 0.21
271 0.3
272 0.3
273 0.33
274 0.31
275 0.32
276 0.31
277 0.29
278 0.32
279 0.28
280 0.28
281 0.25
282 0.24
283 0.23
284 0.24
285 0.22
286 0.18
287 0.14
288 0.11
289 0.09
290 0.1
291 0.11
292 0.1
293 0.12
294 0.13
295 0.16
296 0.16
297 0.19
298 0.24
299 0.27
300 0.31
301 0.29
302 0.26
303 0.26
304 0.26
305 0.27
306 0.21
307 0.19
308 0.16
309 0.16
310 0.2
311 0.18
312 0.21
313 0.17
314 0.17
315 0.23
316 0.3
317 0.32
318 0.31
319 0.32
320 0.32
321 0.39
322 0.4
323 0.38
324 0.35
325 0.35
326 0.35
327 0.41
328 0.44
329 0.41
330 0.5
331 0.51
332 0.55