Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9A9C9

Protein Details
Accession R9A9C9    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
90-116QIAPQCSQKKRIRRTLKDPKHPKPAIPHydrophilic
192-215RKAGRPRQLRHPLKRHKLAKPQKDBasic
220-246AAPPPPPRKKRSESRCRGRPRNEAMHSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
98-120KKRIRRTLKDPKHPKPAIPRPRN
191-240PRKAGRPRQLRHPLKRHKLAKPQKDAINSAAPPPPPRKKRSESRCRGRPR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG wic:J056_002766  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MKQTLLEKLLQDGKHDYKGEYNMLDDLFYMEVKEGEMERDNEYDHEYNHEYEDENVNENKNKNKNENEGKQCNADHHQRLLDKFQHIQNQIAPQCSQKKRIRRTLKDPKHPKPAIPRPRNAWIIYRSHKSKELREAAVSQPTNRPDSRAISATVSDLWQKEAEEVKEKFTELAKDEKRMHRTLWPDYKYQPRKAGRPRQLRHPLKRHKLAKPQKDAINSAAPPPPPRKKRSESRCRGRPRNEAMHSRAQSDVLTVKKPLYNPNVVYNPPVTPIPPTMLTHLLTTTPIANDTLPILDSLPSSPLPYQPGFWESPLGSPPSIYPSSQSEYLNSPRDLNIAISALEYSPTDVNVNDASDLFADIEALFNKQQTNHDQASCFFNVSQII
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.44
3 0.39
4 0.38
5 0.42
6 0.43
7 0.36
8 0.33
9 0.28
10 0.27
11 0.25
12 0.19
13 0.16
14 0.13
15 0.12
16 0.1
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.1
21 0.09
22 0.12
23 0.16
24 0.18
25 0.2
26 0.21
27 0.21
28 0.2
29 0.26
30 0.24
31 0.21
32 0.25
33 0.25
34 0.25
35 0.25
36 0.25
37 0.2
38 0.21
39 0.26
40 0.22
41 0.23
42 0.24
43 0.26
44 0.3
45 0.33
46 0.39
47 0.41
48 0.46
49 0.5
50 0.55
51 0.62
52 0.67
53 0.74
54 0.76
55 0.74
56 0.7
57 0.67
58 0.6
59 0.55
60 0.51
61 0.5
62 0.45
63 0.42
64 0.45
65 0.44
66 0.46
67 0.48
68 0.47
69 0.42
70 0.42
71 0.43
72 0.46
73 0.43
74 0.43
75 0.4
76 0.43
77 0.41
78 0.39
79 0.35
80 0.33
81 0.42
82 0.43
83 0.49
84 0.48
85 0.56
86 0.63
87 0.74
88 0.78
89 0.77
90 0.84
91 0.86
92 0.89
93 0.9
94 0.91
95 0.88
96 0.88
97 0.81
98 0.76
99 0.75
100 0.76
101 0.76
102 0.74
103 0.71
104 0.66
105 0.72
106 0.7
107 0.61
108 0.57
109 0.5
110 0.5
111 0.49
112 0.51
113 0.47
114 0.45
115 0.51
116 0.49
117 0.5
118 0.52
119 0.53
120 0.47
121 0.46
122 0.46
123 0.41
124 0.45
125 0.4
126 0.32
127 0.3
128 0.3
129 0.32
130 0.29
131 0.29
132 0.24
133 0.27
134 0.29
135 0.26
136 0.25
137 0.21
138 0.22
139 0.19
140 0.17
141 0.14
142 0.13
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.1
147 0.12
148 0.15
149 0.15
150 0.21
151 0.21
152 0.23
153 0.23
154 0.23
155 0.21
156 0.19
157 0.21
158 0.16
159 0.24
160 0.23
161 0.28
162 0.34
163 0.39
164 0.42
165 0.41
166 0.41
167 0.37
168 0.4
169 0.43
170 0.46
171 0.43
172 0.4
173 0.43
174 0.52
175 0.53
176 0.53
177 0.53
178 0.48
179 0.54
180 0.62
181 0.68
182 0.67
183 0.72
184 0.7
185 0.72
186 0.79
187 0.8
188 0.79
189 0.79
190 0.8
191 0.78
192 0.85
193 0.82
194 0.79
195 0.81
196 0.81
197 0.8
198 0.78
199 0.75
200 0.7
201 0.65
202 0.59
203 0.51
204 0.48
205 0.38
206 0.32
207 0.29
208 0.25
209 0.26
210 0.31
211 0.38
212 0.39
213 0.44
214 0.5
215 0.54
216 0.64
217 0.72
218 0.76
219 0.77
220 0.8
221 0.85
222 0.87
223 0.89
224 0.86
225 0.84
226 0.81
227 0.8
228 0.76
229 0.73
230 0.68
231 0.68
232 0.61
233 0.54
234 0.46
235 0.36
236 0.3
237 0.24
238 0.23
239 0.16
240 0.16
241 0.15
242 0.17
243 0.18
244 0.2
245 0.26
246 0.28
247 0.32
248 0.32
249 0.39
250 0.41
251 0.39
252 0.39
253 0.34
254 0.28
255 0.24
256 0.22
257 0.16
258 0.14
259 0.15
260 0.16
261 0.16
262 0.17
263 0.18
264 0.21
265 0.21
266 0.2
267 0.19
268 0.16
269 0.14
270 0.14
271 0.12
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.1
286 0.1
287 0.12
288 0.12
289 0.14
290 0.18
291 0.18
292 0.19
293 0.19
294 0.23
295 0.23
296 0.23
297 0.24
298 0.2
299 0.21
300 0.23
301 0.23
302 0.18
303 0.17
304 0.17
305 0.2
306 0.21
307 0.19
308 0.19
309 0.22
310 0.26
311 0.29
312 0.29
313 0.25
314 0.29
315 0.36
316 0.39
317 0.36
318 0.33
319 0.3
320 0.31
321 0.29
322 0.25
323 0.2
324 0.15
325 0.14
326 0.12
327 0.12
328 0.11
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.09
333 0.1
334 0.11
335 0.1
336 0.13
337 0.13
338 0.14
339 0.13
340 0.12
341 0.12
342 0.11
343 0.12
344 0.1
345 0.08
346 0.08
347 0.07
348 0.09
349 0.09
350 0.12
351 0.12
352 0.13
353 0.15
354 0.18
355 0.23
356 0.27
357 0.35
358 0.38
359 0.41
360 0.41
361 0.41
362 0.45
363 0.41
364 0.37
365 0.29