Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PDH5

Protein Details
Accession A0A1D8PDH5    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-61TNTEETKQKQLTKKEQRRKEKEAILEQKRHydrophilic
340-368KDREELATKKRTWKKEKKMEDLNDRRAAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
348-356KKRTWKKEK
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 6, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041661  ZN622/Rei1/Reh1_Znf-C2H2  
IPR040025  Znf622/Rei1/Reh1  
Gene Ontology GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
KEGG cal:CAALFM_C105060WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12756  zf-C2H2_2  
Amino Acid Sequences MKSEWHRYNLKRRVAQLPPITEDLFNSKVSTLTNTEETKQKQLTKKEQRRKEKEAILEQKRQILEQAKKAMLAKMQENGGELPSLKEEFSNTDSNKEQQQQQKDEDDKDGDKLEEEEEITPEQHEEKMLAQKLANKLEIPPTTCLFAHPKYNHNFDTIDENIEHMFKQHGLYIPERKYLIDKQGLLEYLGEKIGFGFCIVCNYQGRTAEAAREHMQQKRHMRIPYETEDEKLEISKFYDFSSTYDNNVVVVDGNGEEEDGDWEDVSGEEDDDEDDDEELPPVERDAIYQHGNELHLPSGAVVGHRSMARYYRQNLAPDRELSEGQGTVIAAETRHMLTLKDREELATKKRTWKKEKKMEDLNDRRAAKFINNQPHFRDPLLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.74
3 0.71
4 0.68
5 0.62
6 0.59
7 0.55
8 0.46
9 0.4
10 0.37
11 0.31
12 0.26
13 0.23
14 0.19
15 0.19
16 0.19
17 0.22
18 0.19
19 0.21
20 0.26
21 0.27
22 0.3
23 0.36
24 0.39
25 0.43
26 0.46
27 0.5
28 0.52
29 0.59
30 0.68
31 0.72
32 0.79
33 0.82
34 0.86
35 0.89
36 0.91
37 0.9
38 0.88
39 0.85
40 0.83
41 0.83
42 0.83
43 0.8
44 0.79
45 0.72
46 0.69
47 0.61
48 0.52
49 0.47
50 0.46
51 0.45
52 0.44
53 0.49
54 0.43
55 0.45
56 0.46
57 0.43
58 0.37
59 0.34
60 0.29
61 0.25
62 0.26
63 0.24
64 0.24
65 0.22
66 0.19
67 0.16
68 0.14
69 0.12
70 0.12
71 0.13
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.14
76 0.18
77 0.24
78 0.23
79 0.26
80 0.28
81 0.3
82 0.35
83 0.35
84 0.38
85 0.39
86 0.47
87 0.48
88 0.5
89 0.56
90 0.55
91 0.53
92 0.49
93 0.45
94 0.37
95 0.34
96 0.31
97 0.23
98 0.2
99 0.18
100 0.15
101 0.12
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.08
113 0.11
114 0.17
115 0.19
116 0.19
117 0.2
118 0.24
119 0.29
120 0.31
121 0.29
122 0.23
123 0.22
124 0.28
125 0.29
126 0.26
127 0.24
128 0.22
129 0.23
130 0.22
131 0.23
132 0.22
133 0.21
134 0.27
135 0.27
136 0.34
137 0.36
138 0.41
139 0.4
140 0.37
141 0.36
142 0.28
143 0.31
144 0.25
145 0.22
146 0.17
147 0.16
148 0.15
149 0.14
150 0.13
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.09
156 0.12
157 0.14
158 0.18
159 0.25
160 0.26
161 0.27
162 0.27
163 0.25
164 0.26
165 0.27
166 0.29
167 0.25
168 0.24
169 0.23
170 0.24
171 0.24
172 0.21
173 0.18
174 0.12
175 0.09
176 0.09
177 0.07
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.07
186 0.07
187 0.09
188 0.1
189 0.11
190 0.14
191 0.14
192 0.15
193 0.15
194 0.15
195 0.16
196 0.16
197 0.18
198 0.17
199 0.21
200 0.23
201 0.25
202 0.28
203 0.33
204 0.4
205 0.43
206 0.48
207 0.45
208 0.46
209 0.46
210 0.48
211 0.46
212 0.45
213 0.38
214 0.33
215 0.31
216 0.29
217 0.25
218 0.2
219 0.15
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.12
226 0.11
227 0.12
228 0.19
229 0.18
230 0.18
231 0.19
232 0.19
233 0.17
234 0.16
235 0.15
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.09
273 0.13
274 0.15
275 0.15
276 0.16
277 0.17
278 0.18
279 0.18
280 0.17
281 0.13
282 0.12
283 0.12
284 0.1
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.1
291 0.11
292 0.12
293 0.12
294 0.16
295 0.21
296 0.28
297 0.3
298 0.36
299 0.4
300 0.46
301 0.5
302 0.53
303 0.52
304 0.47
305 0.47
306 0.42
307 0.37
308 0.33
309 0.29
310 0.22
311 0.17
312 0.16
313 0.13
314 0.1
315 0.11
316 0.1
317 0.07
318 0.08
319 0.1
320 0.09
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.17
325 0.25
326 0.27
327 0.27
328 0.27
329 0.28
330 0.34
331 0.38
332 0.4
333 0.41
334 0.43
335 0.51
336 0.6
337 0.69
338 0.74
339 0.79
340 0.83
341 0.84
342 0.9
343 0.9
344 0.92
345 0.91
346 0.91
347 0.9
348 0.88
349 0.86
350 0.78
351 0.69
352 0.61
353 0.54
354 0.49
355 0.48
356 0.48
357 0.51
358 0.55
359 0.59
360 0.62
361 0.67
362 0.64