Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9ADT4

Protein Details
Accession R9ADT4    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-30AANSTKSPTKTPKGSKKDVKEVKQDESHydrophilic
192-216STTPAPKKPAEKKPKQDTKEEKKIAHydrophilic
235-258ETAPASKTSKPKKEEKQPEPAQESHydrophilic
292-313PEPQPEPPKKAAKKESGKKSKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
195-249PAPKKPAEKKPKQDTKEEKKIAKDEPKSSKATASKMDEKKETAPASKTSKPKKEE
298-313PPKKAAKKESGKKSKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG wic:J056_000880  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MAVAANSTKSPTKTPKGSKKDVKEVKQDESDKKQSPQTSNKRSADGSPKEEKPPIEHTPLENALFETLANTARTMDSQLRVIKKIFYDNDRDLQLTKKSLKPLKDPEAPKRPASAYLLFQNDMRLKKDPSQTQPQFMSQVGKEWNSIDPAEKEKYNKKYQKSIDVFEQQRDEYVKSGREALWRKKGENEGFSTTPAPKKPAEKKPKQDTKEEKKIAKDEPKSSKATASKMDEKKETAPASKTSKPKKEEKQPEPAQESEESSESESGSGSSESDSSGSGSSESDSSESESEPEPQPEPPKKAAKKESGKKSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.69
3 0.74
4 0.83
5 0.85
6 0.85
7 0.87
8 0.87
9 0.85
10 0.84
11 0.8
12 0.77
13 0.76
14 0.74
15 0.71
16 0.7
17 0.71
18 0.65
19 0.64
20 0.64
21 0.62
22 0.63
23 0.66
24 0.68
25 0.69
26 0.75
27 0.74
28 0.7
29 0.65
30 0.63
31 0.63
32 0.59
33 0.56
34 0.53
35 0.54
36 0.55
37 0.57
38 0.52
39 0.46
40 0.47
41 0.45
42 0.43
43 0.42
44 0.39
45 0.41
46 0.43
47 0.39
48 0.32
49 0.27
50 0.21
51 0.19
52 0.17
53 0.1
54 0.08
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.1
60 0.1
61 0.13
62 0.15
63 0.15
64 0.19
65 0.25
66 0.27
67 0.29
68 0.29
69 0.29
70 0.27
71 0.33
72 0.32
73 0.31
74 0.35
75 0.37
76 0.4
77 0.38
78 0.37
79 0.31
80 0.31
81 0.3
82 0.28
83 0.29
84 0.29
85 0.35
86 0.4
87 0.43
88 0.48
89 0.53
90 0.56
91 0.6
92 0.62
93 0.63
94 0.69
95 0.67
96 0.6
97 0.55
98 0.48
99 0.42
100 0.41
101 0.34
102 0.27
103 0.28
104 0.29
105 0.26
106 0.25
107 0.26
108 0.26
109 0.25
110 0.25
111 0.23
112 0.24
113 0.3
114 0.37
115 0.39
116 0.41
117 0.5
118 0.49
119 0.51
120 0.5
121 0.45
122 0.4
123 0.34
124 0.31
125 0.2
126 0.22
127 0.19
128 0.17
129 0.17
130 0.16
131 0.16
132 0.14
133 0.14
134 0.12
135 0.12
136 0.15
137 0.17
138 0.17
139 0.2
140 0.26
141 0.32
142 0.41
143 0.45
144 0.45
145 0.52
146 0.54
147 0.61
148 0.57
149 0.52
150 0.48
151 0.5
152 0.48
153 0.41
154 0.4
155 0.29
156 0.28
157 0.27
158 0.21
159 0.15
160 0.16
161 0.16
162 0.14
163 0.17
164 0.16
165 0.22
166 0.29
167 0.34
168 0.41
169 0.42
170 0.42
171 0.45
172 0.51
173 0.48
174 0.45
175 0.42
176 0.38
177 0.36
178 0.36
179 0.33
180 0.28
181 0.28
182 0.25
183 0.24
184 0.21
185 0.3
186 0.38
187 0.47
188 0.56
189 0.61
190 0.7
191 0.78
192 0.86
193 0.8
194 0.81
195 0.81
196 0.81
197 0.82
198 0.79
199 0.72
200 0.67
201 0.69
202 0.67
203 0.65
204 0.61
205 0.59
206 0.61
207 0.62
208 0.6
209 0.56
210 0.55
211 0.49
212 0.47
213 0.45
214 0.43
215 0.48
216 0.49
217 0.53
218 0.48
219 0.47
220 0.47
221 0.47
222 0.43
223 0.38
224 0.36
225 0.37
226 0.42
227 0.46
228 0.52
229 0.55
230 0.6
231 0.61
232 0.68
233 0.72
234 0.76
235 0.8
236 0.78
237 0.8
238 0.79
239 0.82
240 0.77
241 0.68
242 0.6
243 0.51
244 0.47
245 0.38
246 0.31
247 0.23
248 0.2
249 0.2
250 0.16
251 0.15
252 0.12
253 0.1
254 0.1
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.13
273 0.13
274 0.13
275 0.14
276 0.15
277 0.19
278 0.21
279 0.23
280 0.22
281 0.26
282 0.35
283 0.41
284 0.46
285 0.5
286 0.57
287 0.62
288 0.71
289 0.76
290 0.77
291 0.8
292 0.84
293 0.87