Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9ARI6

Protein Details
Accession R9ARI6    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
266-304DSSDSDSKSKKRKRKNSKSKEKKKKRSKRRDSSDEDDASBasic
310-367SEDERRAKKKSKSESRSRSRSKKKDESDESEQSDNSEEEKPRKKSKKNKNSSSEEESSHydrophilic
373-415SESEEDTKKRKKSSKSKKKDKKSKKSKKSKKSKKEESDDEDLVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
273-295KSKKRKRKNSKSKEKKKKRSKRR
314-333RRAKKKSKSESRSRSRSKKK
349-358KPRKKSKKNK
380-406KKRKKSSKSKKKDKKSKKSKKSKKSKK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007832  RNA_pol_Rpc34  
IPR016049  RNA_pol_Rpc34-like  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
KEGG wic:J056_000006  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05158  RNA_pol_Rpc34  
Amino Acid Sequences MPKTTKLESQIYTHALRAKDQTFSNDELSDKLFTDKDMKDKLDAINKLLNKNLIQLVTLSTGSSGYKAVSKESAKKYKEMDNDEQLAYQYIDASGNEGIWTKTLKMKTNLHQTVVNRVLKSLEGRGSIKVVKSVKHPTRKIYMISSLNPSVELTGGPWYTDNELDTEFVNQLKGAVLSFIRDRSYPKIKASNKPIYSISKSQYPSVAKVHKWVMGAGVTPIELDLGHIQSLLDVLMFDGELERLPALSLARSSSEDEDYSESDSSDSSDSDSKSKKRKRKNSKSKEKKKKRSKRRDSSDEDDASESDSDSEDERRAKKKSKSESRSRSRSKKKDESDESEQSDNSEEEKPRKKSKKNKNSSSEEESSESENESESEEDTKKRKKSSKSKKKDKKSKKSKKSKKSKKEESDDEDLVSVGGDSEEEQKLEMKQADPFSNSVYRAVKNTDSDDVGPVVGWTEAPCGRCPVFDFCAQDGPVNASKCQYFDTWLQGEGDDDMDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.35
3 0.36
4 0.38
5 0.34
6 0.35
7 0.35
8 0.37
9 0.37
10 0.4
11 0.39
12 0.34
13 0.33
14 0.29
15 0.3
16 0.25
17 0.21
18 0.21
19 0.18
20 0.18
21 0.25
22 0.26
23 0.31
24 0.36
25 0.37
26 0.37
27 0.41
28 0.45
29 0.46
30 0.45
31 0.41
32 0.42
33 0.44
34 0.44
35 0.43
36 0.41
37 0.33
38 0.35
39 0.35
40 0.28
41 0.25
42 0.23
43 0.22
44 0.2
45 0.2
46 0.15
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.12
51 0.1
52 0.08
53 0.12
54 0.13
55 0.15
56 0.21
57 0.26
58 0.34
59 0.44
60 0.53
61 0.51
62 0.55
63 0.57
64 0.59
65 0.62
66 0.61
67 0.59
68 0.56
69 0.58
70 0.54
71 0.5
72 0.42
73 0.35
74 0.27
75 0.2
76 0.13
77 0.09
78 0.1
79 0.09
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.11
88 0.1
89 0.16
90 0.21
91 0.27
92 0.33
93 0.41
94 0.48
95 0.58
96 0.59
97 0.55
98 0.56
99 0.5
100 0.53
101 0.54
102 0.5
103 0.38
104 0.36
105 0.34
106 0.31
107 0.32
108 0.27
109 0.22
110 0.21
111 0.22
112 0.23
113 0.25
114 0.26
115 0.25
116 0.26
117 0.25
118 0.24
119 0.29
120 0.38
121 0.44
122 0.51
123 0.54
124 0.53
125 0.58
126 0.6
127 0.56
128 0.5
129 0.49
130 0.43
131 0.42
132 0.42
133 0.36
134 0.32
135 0.3
136 0.26
137 0.18
138 0.14
139 0.12
140 0.07
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.12
148 0.11
149 0.09
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.08
165 0.09
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.14
170 0.2
171 0.28
172 0.3
173 0.33
174 0.42
175 0.47
176 0.54
177 0.61
178 0.64
179 0.57
180 0.56
181 0.55
182 0.51
183 0.5
184 0.47
185 0.4
186 0.37
187 0.36
188 0.34
189 0.37
190 0.33
191 0.31
192 0.33
193 0.35
194 0.29
195 0.32
196 0.33
197 0.31
198 0.29
199 0.26
200 0.21
201 0.16
202 0.16
203 0.12
204 0.1
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.11
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.1
256 0.1
257 0.15
258 0.19
259 0.24
260 0.34
261 0.43
262 0.5
263 0.58
264 0.69
265 0.76
266 0.83
267 0.89
268 0.9
269 0.93
270 0.96
271 0.96
272 0.97
273 0.97
274 0.96
275 0.96
276 0.96
277 0.95
278 0.96
279 0.96
280 0.95
281 0.94
282 0.93
283 0.9
284 0.85
285 0.82
286 0.72
287 0.62
288 0.52
289 0.41
290 0.32
291 0.24
292 0.18
293 0.1
294 0.08
295 0.07
296 0.08
297 0.09
298 0.1
299 0.15
300 0.2
301 0.25
302 0.3
303 0.37
304 0.44
305 0.52
306 0.6
307 0.67
308 0.71
309 0.77
310 0.83
311 0.85
312 0.88
313 0.88
314 0.88
315 0.88
316 0.89
317 0.88
318 0.87
319 0.85
320 0.85
321 0.83
322 0.81
323 0.78
324 0.74
325 0.68
326 0.59
327 0.51
328 0.41
329 0.35
330 0.27
331 0.21
332 0.2
333 0.19
334 0.26
335 0.35
336 0.4
337 0.49
338 0.59
339 0.66
340 0.71
341 0.8
342 0.83
343 0.86
344 0.9
345 0.89
346 0.88
347 0.85
348 0.83
349 0.75
350 0.67
351 0.58
352 0.49
353 0.42
354 0.34
355 0.27
356 0.19
357 0.15
358 0.13
359 0.12
360 0.11
361 0.09
362 0.13
363 0.14
364 0.19
365 0.25
366 0.33
367 0.37
368 0.45
369 0.53
370 0.59
371 0.69
372 0.76
373 0.8
374 0.84
375 0.9
376 0.92
377 0.96
378 0.96
379 0.96
380 0.96
381 0.96
382 0.96
383 0.96
384 0.97
385 0.96
386 0.96
387 0.96
388 0.96
389 0.96
390 0.95
391 0.96
392 0.95
393 0.94
394 0.92
395 0.88
396 0.84
397 0.74
398 0.64
399 0.53
400 0.42
401 0.32
402 0.22
403 0.14
404 0.06
405 0.05
406 0.04
407 0.05
408 0.09
409 0.1
410 0.1
411 0.11
412 0.13
413 0.14
414 0.19
415 0.21
416 0.18
417 0.22
418 0.27
419 0.3
420 0.3
421 0.3
422 0.3
423 0.32
424 0.31
425 0.31
426 0.3
427 0.29
428 0.3
429 0.34
430 0.33
431 0.32
432 0.35
433 0.33
434 0.32
435 0.31
436 0.3
437 0.26
438 0.22
439 0.19
440 0.15
441 0.12
442 0.09
443 0.08
444 0.07
445 0.11
446 0.14
447 0.16
448 0.17
449 0.22
450 0.22
451 0.24
452 0.27
453 0.29
454 0.3
455 0.33
456 0.37
457 0.34
458 0.4
459 0.39
460 0.37
461 0.31
462 0.33
463 0.34
464 0.31
465 0.29
466 0.26
467 0.27
468 0.26
469 0.28
470 0.24
471 0.22
472 0.24
473 0.31
474 0.3
475 0.3
476 0.3
477 0.27
478 0.27
479 0.23