FuNGI

R9APP1

Protein Details

Accession

R9APP1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
430-450	AEEQKKQKKTEEEKKRSDKAE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
435-448	KQKKTEEEKKRSDK

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 10, cyto 7.5, mito 3, plas 1, extr 1, pero 1, cysk 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020472 G-protein_beta_WD-40_rep IPR007582 TFIID_NTD2 IPR037264 TFIID_NTD2_sf IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003743 F:translation initiation factor activity
KEGG	wic:J056_002260 -
Pfam	View protein in Pfam PF04494 TFIID_NTD2 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd08044 TAF5_NTD2 cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MTDFVQHDPYFREWHKRNNTHASLISPAAAAGGIIDASSAQASIDDDEDNNHASDNVSIDKADAPPPQGVAPDAKKVYDQEPVPQAEREDVERAIKKDTDNKDQSDASDVKSGLAAGSAAAIAGAAGVAVAAASTDENPEPTPQHSDPHPPTAAQVDAPTILHAPKDTKVVTEVTKDESKMNTNEPVTTEAPAPTGTAEDTVVPETKEEPVTAAQPQPTNTTESTIVPEPVEKDEQKQKQEQPKEKLNAFEETPVTTPKEESPAPIAAPAPSVPSKANHPALPKGVVNLKADGPRKPEGISTPAGEHVPIYPGDTPDTPDISGKPNPVTVTVPLETVQLTDAEGTHIPVTEEGGDTTAVENAKDPKPEPISKDKVDAPIESKQKLPEEAHNAATWTTLPGPEEVPTPLRLSQRSPETPLAPSLEESPHSAEEQKKQKKTEEEKKRSDKAEEEAKAKEAQESGENKIVPPKTPEKAKFQQDQNSHLETPNAGQSTAPSMSPGNSSIKSATNLPGGYQQSPEKAGKEEEGEGQQSSSIMKSCLIKKSENHHDIVLEYLRRKGFSGAEEALKSDLTSKGINAGTNNHTQTLEELARQSADSIKNHNQDDNIPPGPSKDSVLLDLVKLASNDHLGKVTTDRLLLTDPTERERGFRDLDRWVEGSLDVYRPQLRPILFPIFVHTYLDLISLSFQKSARAMLHRHAHSLIPYHADVIAHLGSLTLPAHVKSDPLAIRWRSQKYIVRLGKAAWNLLLGWLSDALVGGPGGSSTGGTAEAKGRSLMLKIVNERLRVDVVESSTKISQEMIEESTGLISDLTITYPTIPGQRMAIAQSAQSFNNIIGELKLGLPPLDDGLRAEVDRQVAVNDAMEREEGMEIDPQQQKPQQPPPQQEQPQQQPQSQQPSDQGAQSAEATPTPNPPNAYAPGAAPAGTPQDATAPPPPAAGEIRDENHLLAPTRADLPPLPVFRTADVRREVEKVFDSRKRINLGVELEKSTNGVEETIKSKVNLPSICAFTLQDVGDELNCSTFSPDSSILAAGLSDSTVRLWNLRNESFTGLRDDFDREHPPSSMKKLKLDTGLKDIKFVGHSGPVFGLSFDPSFGTPVQPRHLISSSADSTVRLWSLETYSNLAVYRGHRDPVWDCEWGPFGIYFATASRDRTARLWSAERPNALRIFAGHLGDVETVKFHPNSLYLATGSQDRTARLWDVQRGACVRIFIGHQAPLSTMALSPDGKYLATASDDLSISLWDLGSGKRIKKMLGHTAQINSLNFDANSNLLISSSSDCSIRCWDILTSNTERPDNSTSDLLETFHSKNSPAYHVKFTPRNLCLAALDGGNIAAD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.63
3	0.67
4	0.73
5	0.75
6	0.76
7	0.72
8	0.69
9	0.61
10	0.54
11	0.47
12	0.39
13	0.28
14	0.22
15	0.16
16	0.13
17	0.1
18	0.06
19	0.05
20	0.04
21	0.04
22	0.04
23	0.04
24	0.04
25	0.05
26	0.04
27	0.04
28	0.05
29	0.06
30	0.08
31	0.09
32	0.1
33	0.1
34	0.12
35	0.14
36	0.15
37	0.14
38	0.13
39	0.12
40	0.12
41	0.13
42	0.14
43	0.14
44	0.13
45	0.13
46	0.14
47	0.16
48	0.18
49	0.22
50	0.22
51	0.22
52	0.23
53	0.24
54	0.24
55	0.23
56	0.22
57	0.25
58	0.26
59	0.31
60	0.31
61	0.3
62	0.32
63	0.34
64	0.35
65	0.34
66	0.32
67	0.31
68	0.37
69	0.41
70	0.41
71	0.4
72	0.38
73	0.34
74	0.35
75	0.31
76	0.28
77	0.25
78	0.31
79	0.34
80	0.35
81	0.36
82	0.37
83	0.37
84	0.43
85	0.48
86	0.51
87	0.52
88	0.54
89	0.54
90	0.53
91	0.5
92	0.48
93	0.42
94	0.34
95	0.34
96	0.3
97	0.25
98	0.24
99	0.23
100	0.16
101	0.15
102	0.12
103	0.06
104	0.06
105	0.05
106	0.04
107	0.04
108	0.04
109	0.03
110	0.03
111	0.03
112	0.02
113	0.02
114	0.02
115	0.02
116	0.02
117	0.02
118	0.02
119	0.02
120	0.03
121	0.04
122	0.07
123	0.07
124	0.09
125	0.11
126	0.13
127	0.15
128	0.17
129	0.25
130	0.24
131	0.28
132	0.3
133	0.39
134	0.41
135	0.47
136	0.45
137	0.38
138	0.38
139	0.37
140	0.35
141	0.26
142	0.22
143	0.16
144	0.16
145	0.16
146	0.15
147	0.13
148	0.12
149	0.12
150	0.13
151	0.14
152	0.15
153	0.21
154	0.2
155	0.2
156	0.22
157	0.25
158	0.26
159	0.28
160	0.28
161	0.28
162	0.31
163	0.31
164	0.32
165	0.31
166	0.33
167	0.32
168	0.34
169	0.34
170	0.32
171	0.33
172	0.31
173	0.34
174	0.29
175	0.28
176	0.25
177	0.19
178	0.19
179	0.18
180	0.16
181	0.11
182	0.11
183	0.1
184	0.09
185	0.09
186	0.09
187	0.1
188	0.12
189	0.13
190	0.12
191	0.12
192	0.13
193	0.15
194	0.15
195	0.14
196	0.14
197	0.15
198	0.17
199	0.19
200	0.22
201	0.22
202	0.24
203	0.25
204	0.27
205	0.27
206	0.29
207	0.26
208	0.26
209	0.24
210	0.22
211	0.25
212	0.23
213	0.23
214	0.19
215	0.21
216	0.19
217	0.22
218	0.26
219	0.23
220	0.27
221	0.36
222	0.43
223	0.47
224	0.53
225	0.58
226	0.62
227	0.72
228	0.76
229	0.74
230	0.77
231	0.78
232	0.73
233	0.7
234	0.63
235	0.56
236	0.48
237	0.44
238	0.35
239	0.3
240	0.28
241	0.24
242	0.24
243	0.2
244	0.2
245	0.18
246	0.22
247	0.21
248	0.22
249	0.23
250	0.23
251	0.23
252	0.23
253	0.21
254	0.16
255	0.17
256	0.15
257	0.15
258	0.14
259	0.16
260	0.15
261	0.17
262	0.22
263	0.28
264	0.32
265	0.31
266	0.34
267	0.37
268	0.39
269	0.41
270	0.35
271	0.31
272	0.32
273	0.33
274	0.31
275	0.29
276	0.29
277	0.32
278	0.34
279	0.35
280	0.35
281	0.34
282	0.33
283	0.32
284	0.31
285	0.28
286	0.3
287	0.28
288	0.25
289	0.23
290	0.24
291	0.23
292	0.2
293	0.17
294	0.13
295	0.13
296	0.11
297	0.12
298	0.12
299	0.12
300	0.15
301	0.15
302	0.17
303	0.18
304	0.19
305	0.18
306	0.17
307	0.18
308	0.2
309	0.23
310	0.22
311	0.21
312	0.22
313	0.22
314	0.23
315	0.23
316	0.2
317	0.23
318	0.21
319	0.2
320	0.18
321	0.18
322	0.16
323	0.14
324	0.12
325	0.07
326	0.07
327	0.06
328	0.06
329	0.08
330	0.08
331	0.09
332	0.08
333	0.09
334	0.09
335	0.08
336	0.09
337	0.08
338	0.08
339	0.07
340	0.08
341	0.07
342	0.07
343	0.08
344	0.09
345	0.08
346	0.08
347	0.1
348	0.14
349	0.17
350	0.19
351	0.19
352	0.24
353	0.31
354	0.35
355	0.38
356	0.43
357	0.48
358	0.47
359	0.51
360	0.47
361	0.46
362	0.44
363	0.4
364	0.35
365	0.35
366	0.38
367	0.35
368	0.34
369	0.31
370	0.31
371	0.34
372	0.32
373	0.31
374	0.35
375	0.36
376	0.36
377	0.33
378	0.31
379	0.27
380	0.25
381	0.18
382	0.12
383	0.1
384	0.09
385	0.09
386	0.09
387	0.1
388	0.11
389	0.12
390	0.12
391	0.13
392	0.14
393	0.15
394	0.18
395	0.21
396	0.22
397	0.24
398	0.28
399	0.34
400	0.35
401	0.39
402	0.38
403	0.36
404	0.36
405	0.35
406	0.31
407	0.24
408	0.22
409	0.19
410	0.17
411	0.16
412	0.16
413	0.16
414	0.15
415	0.15
416	0.19
417	0.2
418	0.27
419	0.36
420	0.44
421	0.47
422	0.49
423	0.54
424	0.61
425	0.68
426	0.7
427	0.71
428	0.72
429	0.77
430	0.83
431	0.83
432	0.76
433	0.69
434	0.62
435	0.56
436	0.55
437	0.49
438	0.43
439	0.38
440	0.37
441	0.35
442	0.32
443	0.28
444	0.19
445	0.16
446	0.19
447	0.21
448	0.22
449	0.25
450	0.24
451	0.23
452	0.28
453	0.28
454	0.24
455	0.26
456	0.29
457	0.29
458	0.38
459	0.42
460	0.44
461	0.51
462	0.57
463	0.59
464	0.6
465	0.63
466	0.58
467	0.6
468	0.56
469	0.52
470	0.46
471	0.38
472	0.33
473	0.25
474	0.23
475	0.21
476	0.16
477	0.12
478	0.11
479	0.11
480	0.14
481	0.15
482	0.13
483	0.1
484	0.1
485	0.11
486	0.12
487	0.14
488	0.14
489	0.13
490	0.15
491	0.15
492	0.17
493	0.17
494	0.18
495	0.18
496	0.17
497	0.17
498	0.16
499	0.21
500	0.21
501	0.2
502	0.21
503	0.2
504	0.18
505	0.22
506	0.22
507	0.18
508	0.17
509	0.18
510	0.17
511	0.17
512	0.17
513	0.16
514	0.17
515	0.16
516	0.15
517	0.14
518	0.12
519	0.1
520	0.09
521	0.08
522	0.07
523	0.06
524	0.08
525	0.12
526	0.16
527	0.22
528	0.24
529	0.26
530	0.3
531	0.38
532	0.47
533	0.46
534	0.44
535	0.38
536	0.36
537	0.33
538	0.31
539	0.25
540	0.17
541	0.14
542	0.17
543	0.17
544	0.17
545	0.17
546	0.17
547	0.17
548	0.16
549	0.2
550	0.18
551	0.19
552	0.19
553	0.19
554	0.17
555	0.15
556	0.13
557	0.1
558	0.09
559	0.09
560	0.09
561	0.09
562	0.13
563	0.14
564	0.15
565	0.14
566	0.17
567	0.18
568	0.22
569	0.23
570	0.19
571	0.18
572	0.18
573	0.17
574	0.18
575	0.15
576	0.12
577	0.12
578	0.11
579	0.11
580	0.11
581	0.11
582	0.11
583	0.14
584	0.14
585	0.2
586	0.26
587	0.31
588	0.32
589	0.32
590	0.28
591	0.28
592	0.3
593	0.29
594	0.24
595	0.19
596	0.18
597	0.18
598	0.19
599	0.17
600	0.15
601	0.12
602	0.11
603	0.12
604	0.14
605	0.13
606	0.11
607	0.11
608	0.11
609	0.09
610	0.08
611	0.07
612	0.06
613	0.08
614	0.09
615	0.08
616	0.09
617	0.08
618	0.09
619	0.1
620	0.11
621	0.09
622	0.09
623	0.09
624	0.09
625	0.1
626	0.1
627	0.1
628	0.12
629	0.12
630	0.15
631	0.17
632	0.16
633	0.16
634	0.19
635	0.2
636	0.19
637	0.2
638	0.2
639	0.21
640	0.22
641	0.23
642	0.21
643	0.18
644	0.16
645	0.14
646	0.13
647	0.1
648	0.1
649	0.08
650	0.09
651	0.12
652	0.12
653	0.13
654	0.15
655	0.14
656	0.15
657	0.18
658	0.21
659	0.19
660	0.19
661	0.21
662	0.2
663	0.2
664	0.19
665	0.15
666	0.11
667	0.11
668	0.11
669	0.08
670	0.05
671	0.05
672	0.06
673	0.07
674	0.08
675	0.08
676	0.09
677	0.09
678	0.11
679	0.12
680	0.15
681	0.16
682	0.21
683	0.28
684	0.28
685	0.29
686	0.28
687	0.26
688	0.24
689	0.25
690	0.19
691	0.14
692	0.14
693	0.13
694	0.12
695	0.11
696	0.1
697	0.1
698	0.09
699	0.06
700	0.06
701	0.06
702	0.05
703	0.06
704	0.06
705	0.04
706	0.05
707	0.05
708	0.07
709	0.07
710	0.07
711	0.07
712	0.12
713	0.12
714	0.14
715	0.2
716	0.2
717	0.24
718	0.31
719	0.33
720	0.3
721	0.35
722	0.39
723	0.37
724	0.47
725	0.45
726	0.4
727	0.39
728	0.38
729	0.36
730	0.32
731	0.27
732	0.16
733	0.14
734	0.12
735	0.11
736	0.11
737	0.06
738	0.05
739	0.05
740	0.05
741	0.04
742	0.04
743	0.04
744	0.03
745	0.03
746	0.03
747	0.03
748	0.02
749	0.03
750	0.03
751	0.03
752	0.02
753	0.03
754	0.04
755	0.04
756	0.05
757	0.08
758	0.08
759	0.09
760	0.09
761	0.09
762	0.09
763	0.09
764	0.11
765	0.12
766	0.14
767	0.16
768	0.23
769	0.26
770	0.26
771	0.26
772	0.25
773	0.22
774	0.2
775	0.19
776	0.14
777	0.13
778	0.14
779	0.14
780	0.14
781	0.15
782	0.15
783	0.13
784	0.12
785	0.1
786	0.09
787	0.11
788	0.1
789	0.09
790	0.09
791	0.09
792	0.08
793	0.08
794	0.06
795	0.05
796	0.03
797	0.04
798	0.04
799	0.04
800	0.04
801	0.04
802	0.05
803	0.06
804	0.07
805	0.09
806	0.09
807	0.1
808	0.1
809	0.11
810	0.12
811	0.12
812	0.13
813	0.11
814	0.11
815	0.13
816	0.14
817	0.12
818	0.12
819	0.11
820	0.1
821	0.11
822	0.1
823	0.08
824	0.06
825	0.07
826	0.07
827	0.07
828	0.08
829	0.07
830	0.06
831	0.06
832	0.06
833	0.07
834	0.07
835	0.06
836	0.06
837	0.08
838	0.09
839	0.09
840	0.09
841	0.1
842	0.1
843	0.1
844	0.1
845	0.08
846	0.09
847	0.09
848	0.09
849	0.08
850	0.07
851	0.08
852	0.07
853	0.07
854	0.07
855	0.07
856	0.06
857	0.06
858	0.08
859	0.08
860	0.15
861	0.19
862	0.19
863	0.22
864	0.26
865	0.28
866	0.33
867	0.43
868	0.46
869	0.49
870	0.55
871	0.59
872	0.65
873	0.68
874	0.68
875	0.67
876	0.66
877	0.68
878	0.65
879	0.6
880	0.56
881	0.55
882	0.58
883	0.5
884	0.43
885	0.36
886	0.38
887	0.37
888	0.32
889	0.28
890	0.19
891	0.19
892	0.18
893	0.16
894	0.11
895	0.1
896	0.11
897	0.11
898	0.15
899	0.17
900	0.18
901	0.18
902	0.2
903	0.23
904	0.24
905	0.25
906	0.2
907	0.18
908	0.18
909	0.17
910	0.16
911	0.12
912	0.1
913	0.1
914	0.1
915	0.1
916	0.07
917	0.1
918	0.1
919	0.13
920	0.17
921	0.17
922	0.17
923	0.17
924	0.17
925	0.16
926	0.17
927	0.15
928	0.15
929	0.15
930	0.16
931	0.18
932	0.18
933	0.17
934	0.17
935	0.18
936	0.15
937	0.13
938	0.12
939	0.12
940	0.14
941	0.14
942	0.14
943	0.12
944	0.17
945	0.22
946	0.23
947	0.24
948	0.23
949	0.24
950	0.24
951	0.33
952	0.3
953	0.3
954	0.32
955	0.33
956	0.33
957	0.35
958	0.34
959	0.28
960	0.3
961	0.28
962	0.32
963	0.34
964	0.38
965	0.4
966	0.44
967	0.45
968	0.44
969	0.41
970	0.38
971	0.38
972	0.39
973	0.36
974	0.33
975	0.3
976	0.28
977	0.27
978	0.21
979	0.17
980	0.11
981	0.1
982	0.08
983	0.1
984	0.12
985	0.15
986	0.16
987	0.15
988	0.2
989	0.23
990	0.29
991	0.27
992	0.28
993	0.3
994	0.32
995	0.32
996	0.27
997	0.24
998	0.18
999	0.21
1000	0.17
1001	0.13
1002	0.11
1003	0.11
1004	0.1
1005	0.11
1006	0.1
1007	0.08
1008	0.08
1009	0.08
1010	0.08
1011	0.08
1012	0.08
1013	0.11
1014	0.12
1015	0.12
1016	0.13
1017	0.13
1018	0.12
1019	0.11
1020	0.1
1021	0.07
1022	0.06
1023	0.05
1024	0.04
1025	0.04
1026	0.05
1027	0.07
1028	0.08
1029	0.1
1030	0.13
1031	0.19
1032	0.26
1033	0.28
1034	0.29
1035	0.29
1036	0.33
1037	0.33
1038	0.31
1039	0.31
1040	0.25
1041	0.23
1042	0.23
1043	0.24
1044	0.22
1045	0.25
1046	0.3
1047	0.26
1048	0.28
1049	0.28
1050	0.31
1051	0.33
1052	0.39
1053	0.43
1054	0.4
1055	0.45
1056	0.46
1057	0.5
1058	0.55
1059	0.56
1060	0.5
1061	0.51
1062	0.56
1063	0.49
1064	0.47
1065	0.43
1066	0.36
1067	0.31
1068	0.28
1069	0.21
1070	0.18
1071	0.18
1072	0.18
1073	0.18
1074	0.17
1075	0.16
1076	0.15
1077	0.14
1078	0.11
1079	0.11
1080	0.1
1081	0.11
1082	0.1
1083	0.11
1084	0.12
1085	0.15
1086	0.17
1087	0.21
1088	0.25
1089	0.28
1090	0.28
1091	0.32
1092	0.33
1093	0.31
1094	0.29
1095	0.32
1096	0.29
1097	0.28
1098	0.28
1099	0.22
1100	0.22
1101	0.22
1102	0.2
1103	0.13
1104	0.12
1105	0.11
1106	0.14
1107	0.17
1108	0.18
1109	0.19
1110	0.19
1111	0.2
1112	0.2
1113	0.19
1114	0.19
1115	0.17
1116	0.23
1117	0.22
1118	0.23
1119	0.22
1120	0.26
1121	0.29
1122	0.33
1123	0.34
1124	0.29
1125	0.27
1126	0.28
1127	0.3
1128	0.26
1129	0.24
1130	0.17
1131	0.14
1132	0.12
1133	0.12
1134	0.1
1135	0.08
1136	0.13
1137	0.13
1138	0.15
1139	0.19
1140	0.2
1141	0.21
1142	0.23
1143	0.28
1144	0.28
1145	0.32
1146	0.34
1147	0.38
1148	0.47
1149	0.5
1150	0.52
1151	0.49
1152	0.5
1153	0.46
1154	0.42
1155	0.35
1156	0.26
1157	0.28
1158	0.26
1159	0.24
1160	0.19
1161	0.17
1162	0.18
1163	0.18
1164	0.17
1165	0.12
1166	0.1
1167	0.1
1168	0.14
1169	0.14
1170	0.13
1171	0.14
1172	0.15
1173	0.17
1174	0.18
1175	0.19
1176	0.16
1177	0.17
1178	0.17
1179	0.19
1180	0.19
1181	0.21
1182	0.21
1183	0.2
1184	0.21
1185	0.23
1186	0.25
1187	0.26
1188	0.31
1189	0.32
1190	0.37
1191	0.37
1192	0.41
1193	0.4
1194	0.4
1195	0.36
1196	0.31
1197	0.26
1198	0.21
1199	0.21
1200	0.2
1201	0.22
1202	0.22
1203	0.21
1204	0.21
1205	0.21
1206	0.21
1207	0.21
1208	0.17
1209	0.14
1210	0.13
1211	0.15
1212	0.15
1213	0.15
1214	0.15
1215	0.15
1216	0.14
1217	0.14
1218	0.13
1219	0.12
1220	0.13
1221	0.13
1222	0.12
1223	0.15
1224	0.15
1225	0.15
1226	0.14
1227	0.13
1228	0.12
1229	0.11
1230	0.1
1231	0.07
1232	0.08
1233	0.09
1234	0.16
1235	0.22
1236	0.24
1237	0.29
1238	0.31
1239	0.33
1240	0.38
1241	0.46
1242	0.49
1243	0.51
1244	0.53
1245	0.52
1246	0.53
1247	0.56
1248	0.54
1249	0.46
1250	0.38
1251	0.31
1252	0.29
1253	0.24
1254	0.22
1255	0.18
1256	0.14
1257	0.14
1258	0.12
1259	0.11
1260	0.09
1261	0.09
1262	0.1
1263	0.12
1264	0.14
1265	0.14
1266	0.15
1267	0.15
1268	0.18
1269	0.23
1270	0.24
1271	0.21
1272	0.22
1273	0.23
1274	0.26
1275	0.3
1276	0.33
1277	0.34
1278	0.36
1279	0.4
1280	0.39
1281	0.38
1282	0.38
1283	0.39
1284	0.36
1285	0.33
1286	0.31
1287	0.28
1288	0.3
1289	0.3
1290	0.26
1291	0.24
1292	0.25
1293	0.23
1294	0.24
1295	0.24
1296	0.22
1297	0.26
1298	0.29
1299	0.35
1300	0.39
1301	0.42
1302	0.46
1303	0.51
1304	0.59
1305	0.61
1306	0.64
1307	0.66
1308	0.59
1309	0.59
1310	0.53
1311	0.49
1312	0.4
1313	0.37
1314	0.31
1315	0.22
1316	0.2
1317	0.15

R9APP1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer