Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R9AM41

Protein Details
Accession R9AM41    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-373DAPVNVLQPKKKQDKRKAEDQPASEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
359-365KKQDKRK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG wic:J056_004492  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MSESSSELSNITQEAHRLVSIGNYNEASNKYSDALEIVRDTHGELSVESAALLLKYAESLYLHAVSQSDVIGKSDEAGDTADTADAANAAHTAHTPSTSNASTANTANTDNLIQLSDDDDDDDNDDQGDDDNQPEQDPDHSNEDTPDDDFGAAWEVADLAKVIYQKLDGDNNKLCLADAHMLLGDIALELETFEAAALEYSSSLEIKKLILNPTSRVLAEAHFKLAISYELVPGHVRRDTALVHVQDAKEVLDGRLGELKKRVESGAPVEVSGENENNDKPALRERVERLSIEDATKEIKDIEELIGDLREKIAELEQPPPPASEDPSKSTVDVLVAEMDKAKQSVASDAPVNVLQPKKKQDKRKAEDQPASEADKKVKSDPHAHPGKKTETENEETPN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.16
4 0.15
5 0.15
6 0.18
7 0.22
8 0.22
9 0.23
10 0.23
11 0.23
12 0.26
13 0.28
14 0.25
15 0.2
16 0.2
17 0.18
18 0.18
19 0.17
20 0.16
21 0.15
22 0.15
23 0.15
24 0.15
25 0.15
26 0.15
27 0.15
28 0.15
29 0.15
30 0.13
31 0.12
32 0.13
33 0.13
34 0.12
35 0.11
36 0.1
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.05
41 0.04
42 0.05
43 0.05
44 0.06
45 0.07
46 0.08
47 0.11
48 0.12
49 0.12
50 0.12
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.11
55 0.1
56 0.1
57 0.11
58 0.11
59 0.1
60 0.11
61 0.11
62 0.11
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.09
68 0.08
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.05
78 0.05
79 0.08
80 0.08
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.16
85 0.17
86 0.17
87 0.16
88 0.17
89 0.18
90 0.18
91 0.18
92 0.15
93 0.15
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.11
98 0.1
99 0.09
100 0.08
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.11
109 0.11
110 0.09
111 0.08
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.11
124 0.14
125 0.16
126 0.2
127 0.2
128 0.2
129 0.21
130 0.22
131 0.19
132 0.16
133 0.14
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.07
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.06
145 0.05
146 0.03
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.08
153 0.1
154 0.17
155 0.16
156 0.21
157 0.23
158 0.25
159 0.25
160 0.24
161 0.22
162 0.15
163 0.16
164 0.13
165 0.11
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.05
172 0.03
173 0.03
174 0.02
175 0.02
176 0.02
177 0.02
178 0.02
179 0.02
180 0.02
181 0.02
182 0.02
183 0.02
184 0.02
185 0.02
186 0.03
187 0.03
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.06
194 0.08
195 0.11
196 0.13
197 0.17
198 0.18
199 0.2
200 0.22
201 0.22
202 0.2
203 0.18
204 0.16
205 0.14
206 0.16
207 0.15
208 0.14
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.1
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.12
222 0.12
223 0.11
224 0.1
225 0.12
226 0.12
227 0.14
228 0.19
229 0.18
230 0.18
231 0.21
232 0.2
233 0.19
234 0.19
235 0.15
236 0.11
237 0.11
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.16
243 0.16
244 0.16
245 0.2
246 0.22
247 0.21
248 0.22
249 0.22
250 0.17
251 0.2
252 0.22
253 0.23
254 0.21
255 0.2
256 0.2
257 0.19
258 0.2
259 0.19
260 0.15
261 0.1
262 0.12
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.11
267 0.1
268 0.17
269 0.22
270 0.23
271 0.28
272 0.31
273 0.39
274 0.41
275 0.4
276 0.36
277 0.35
278 0.35
279 0.3
280 0.26
281 0.19
282 0.19
283 0.18
284 0.15
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.11
295 0.1
296 0.09
297 0.08
298 0.07
299 0.08
300 0.09
301 0.12
302 0.14
303 0.19
304 0.22
305 0.24
306 0.25
307 0.24
308 0.26
309 0.23
310 0.25
311 0.28
312 0.3
313 0.32
314 0.35
315 0.35
316 0.33
317 0.32
318 0.28
319 0.21
320 0.18
321 0.14
322 0.13
323 0.12
324 0.12
325 0.13
326 0.13
327 0.12
328 0.12
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.15
333 0.16
334 0.18
335 0.19
336 0.19
337 0.21
338 0.2
339 0.2
340 0.21
341 0.25
342 0.27
343 0.33
344 0.42
345 0.51
346 0.59
347 0.69
348 0.75
349 0.81
350 0.83
351 0.87
352 0.88
353 0.88
354 0.87
355 0.79
356 0.76
357 0.69
358 0.67
359 0.61
360 0.53
361 0.49
362 0.46
363 0.46
364 0.44
365 0.46
366 0.46
367 0.51
368 0.56
369 0.6
370 0.65
371 0.65
372 0.66
373 0.67
374 0.69
375 0.66
376 0.63
377 0.61
378 0.57
379 0.61